Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENI
EHHINDAHKGHIDAAIFNLGYVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLN
QRNHAPFICAIEKIS

The query sequence (length=175) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8h1b:B 193 187 1.0000 0.9067 0.9358 9.53e-123 8h1b:A, 8h26:A, 8h26:B, 8h26:C, 8h26:D, 8h27:B
2 8h0s:C 190 188 0.5029 0.4632 0.4681 7.16e-48 8h0s:A, 8h0t:A, 4poo:A
3 8h0s:B 171 174 0.4743 0.4854 0.4770 5.12e-45 8h0s:D, 4poo:B
4 3eey:A 195 178 0.4686 0.4205 0.4607 2.35e-42 3eey:B, 3eey:C, 3eey:D, 3eey:E, 3eey:F, 3eey:H, 3eey:I, 3eey:J
5 3lby:A 176 181 0.4286 0.4261 0.4144 9.24e-38
6 3mb5:A 255 71 0.1543 0.1059 0.3803 4.06e-04 3lga:A, 3lga:B, 3lga:C, 3lga:D, 3lhd:C, 3lhd:A, 3lhd:B, 3lhd:D
7 7wzf:A 243 117 0.1657 0.1193 0.2479 5.32e-04
8 1m6y:A 293 84 0.1257 0.0751 0.2619 0.002 1m6y:B, 1n2x:A, 1n2x:B
9 3ggd:A 243 39 0.0971 0.0700 0.4359 0.015
10 3t7s:A 246 88 0.1314 0.0935 0.2614 0.037 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
11 8jxr:C 341 87 0.1486 0.0762 0.2989 0.043
12 3sxj:A 245 94 0.1371 0.0980 0.2553 0.11 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
13 2b25:A 254 87 0.1314 0.0906 0.2644 0.14 2b25:B
14 3gu3:A 276 96 0.1657 0.1051 0.3021 0.39 3gu3:B
15 2pwy:A 251 69 0.1200 0.0837 0.3043 0.46 5c0o:E, 5c0o:F, 5c0o:G, 5c0o:H, 2pwy:B
16 1wzn:A 244 71 0.1371 0.0984 0.3380 0.46 1wzn:B, 1wzn:C
17 4dcm:A 360 93 0.1486 0.0722 0.2796 0.48
18 8r4z:A 341 87 0.0914 0.0469 0.1839 0.55 8r4z:B, 8rvc:A, 8rvc:B, 8rvs:A, 8rvs:B, 8rwm:A, 8rwm:B
19 5m58:A 230 60 0.0971 0.0739 0.2833 0.56 5m58:B
20 4cu7:A 848 35 0.0686 0.0142 0.3429 0.64 4cu8:A, 4cuc:A
21 8fky:SS 628 47 0.1029 0.0287 0.3830 0.64 8fkt:SS, 8fku:SS, 8fkv:SS, 8fkw:SS, 8fkx:SS
22 4nec:B 244 45 0.1029 0.0738 0.4000 0.70 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
23 6cx6:B 333 64 0.1200 0.0631 0.3281 0.73 6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
24 6wh0:A 524 95 0.1543 0.0515 0.2842 0.75 6wgz:B
25 2bh2:A 418 68 0.1200 0.0502 0.3088 0.89 2bh2:B, 1uwv:A
26 6hp2:A 297 57 0.1086 0.0640 0.3333 0.93
27 4hw8:A 376 68 0.1371 0.0638 0.3529 0.96 4hw8:B
28 6cu5:A 314 71 0.1371 0.0764 0.3380 1.1 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
29 3m3m:A 201 42 0.0857 0.0746 0.3571 1.3
30 6pfo:A 474 93 0.1486 0.0549 0.2796 1.3 5ii0:A, 5ii0:B, 5ii0:C, 6pfo:B, 6pgq:A
31 3n96:A 473 93 0.1486 0.0550 0.2796 1.4 3ehs:A, 3eht:A, 3n93:B, 3n93:A, 3n95:C, 3n95:D, 3n95:A, 3n95:B, 3n96:C, 3n96:D, 3n96:B
32 7omt:A 483 93 0.1486 0.0538 0.2796 1.5 6hd8:A, 6hd9:A, 6hda:A, 6hdb:A, 6hdc:A, 6swr:A, 6swr:D
33 3a3c:A 451 93 0.1486 0.0576 0.2796 1.6 2zxt:A
34 3mp8:A 513 93 0.1486 0.0507 0.2796 1.7 3mp1:A, 3mp6:A
35 3ehu:A 441 93 0.1486 0.0590 0.2796 1.7 3ehu:B
36 7tmb:A 362 49 0.0971 0.0470 0.3469 1.8 7tmb:B, 7tmb:C, 7tmb:D, 7tmb:E, 7tmb:F
37 1p91:A 268 37 0.0686 0.0448 0.3243 1.8 1p91:B
38 4my2:A 474 93 0.1486 0.0549 0.2796 1.8 5bpu:A, 5bpu:D, 5bpu:C, 5bpu:E, 5bqc:A
39 6i4y:A 429 93 0.1486 0.0606 0.2796 1.9 8ag0:B, 4xzs:A, 4xzs:B, 4xzv:A, 4xzv:C, 4xzv:E, 4xzv:G
40 3n94:A 466 93 0.1486 0.0558 0.2796 1.9
41 7vn2:C 437 93 0.1486 0.0595 0.2796 1.9 7vn2:A, 7vn3:C, 7vn3:D, 7vn3:A, 7vn3:B, 7vn4:C, 7vn4:D, 7vn4:A, 7vn4:B, 7vn5:C, 7vn5:D, 7vn5:A, 7vn5:B, 7vn6:C, 7vn6:D, 7vn6:A, 7vn6:B, 7vn7:C, 7vn7:D, 7vn7:A, 7vn7:B, 7vn8:C, 7vn8:D, 7vn8:A, 7vn8:B, 5zd4:C, 5zd4:D, 5zd4:A, 5zd4:B
42 3csb:A 464 93 0.1486 0.0560 0.2796 2.0
43 3ob4:A 474 93 0.1486 0.0549 0.2796 2.0
44 5ufm:A 225 32 0.0571 0.0444 0.3125 2.0 5ufm:B, 5ufn:A, 5ufn:B
45 3l2j:A 484 93 0.1486 0.0537 0.2796 2.0 3c4m:A, 3c4m:B, 3h3g:A, 3l2j:B
46 3py7:A 500 93 0.1486 0.0520 0.2796 2.1
47 5cfv:A 484 93 0.1486 0.0537 0.2796 2.2 5ihj:A
48 7uaj:B 512 93 0.1486 0.0508 0.2796 2.2 2fk4:A, 8gcr:A, 4giz:C, 4giz:D, 8jrn:D, 8jrn:B, 8jro:D, 8jro:B, 8jrp:B, 8jrp:D, 8jrq:B, 8jrq:D, 8jrr:B, 8jrr:D, 8r1f:B, 8r1g:B, 8r1g:E, 6siv:B, 6sja:B, 7uaj:A, 7uaj:C, 7uaj:D, 4xr8:F
49 4xa2:A 490 93 0.1486 0.0531 0.2796 2.2 4xa2:B
50 5ygs:D 458 93 0.1486 0.0568 0.2796 2.3 5ygp:A, 5ygp:B, 5ygp:C, 5ygp:D, 5ygs:A, 5ygs:B, 5ygs:C
51 3woa:A 413 93 0.1486 0.0630 0.2796 2.3
52 8iiy:A 506 93 0.1486 0.0514 0.2796 2.4 8dkb:A, 8dkb:B, 8dkb:C, 8dkb:D, 8dkb:E, 8dkb:F, 8dkb:G, 8dkb:H, 8i60:C, 8i60:D, 8iiz:A, 8ij0:A, 8ij0:B, 7jfy:B, 7jfy:A, 7jfy:C, 7jfy:D, 5r68:B, 5r68:A, 5r69:B, 5r69:A, 5vnb:A, 5vnb:B, 5vnb:D, 5xtz:A, 5y8v:D
53 3d4g:E 472 93 0.1486 0.0551 0.2796 2.4 3d4c:A, 3d4g:A, 3d4g:B, 3d4g:C, 3d4g:D, 3d4g:F, 3d4g:G, 3d4g:H, 3ef7:A, 3ef7:B, 5osq:A, 5osq:B
54 4kv3:A 456 93 0.1486 0.0570 0.2796 2.4 4kv3:B
55 4im7:A 483 61 0.0971 0.0352 0.2787 2.4
56 4edq:A 483 93 0.1486 0.0538 0.2796 2.4 4edq:B
57 2vgq:A 461 93 0.1486 0.0564 0.2796 2.5
58 1y4c:A 480 93 0.1486 0.0542 0.2796 2.5
59 6ki0:A 459 93 0.1486 0.0566 0.2796 2.5 4ifp:A, 4ifp:B, 4ifp:C, 6ki0:B
60 5h7n:B 460 93 0.1486 0.0565 0.2796 2.6 5h7n:A, 4xhs:A, 4xhs:B
61 1r6z:Z 499 93 0.1486 0.0521 0.2796 2.6 3mj0:A, 1r6z:P, 1r6z:A, 1t2r:A, 1t2s:A
62 5hz7:A 490 93 0.1486 0.0531 0.2796 2.6 4wth:A, 4wth:B, 4ys9:B
63 8bpp:A 362 46 0.0857 0.0414 0.3261 2.6 8bpp:B, 8bpp:C, 8bpq:A, 8bpq:B, 8bpq:C
64 7kd4:A 431 93 0.1486 0.0603 0.2796 2.6 7kd4:B, 7kd5:A
65 7e29:A 496 93 0.1486 0.0524 0.2796 2.7
66 1gvr:A 364 49 0.0971 0.0467 0.3469 2.7 2aba:A, 2abb:A, 3f03:K, 6gi7:A, 6gi8:A, 6gi9:A, 6gia:A, 1gvo:A, 1gvq:A, 1gvs:A, 1h50:A, 1h51:A, 1h60:A, 1h61:A, 1h62:A, 1h63:A, 3kft:A, 3kft:B, 5lgx:A, 5lgz:A, 3p62:A, 3p67:A, 3p74:A, 3p7y:A, 3p80:A, 3p81:A, 3p82:A, 3p84:A, 3p8i:A, 3p8j:A, 1vyp:X, 1vyr:A, 1vys:X
67 5c7r:A 435 93 0.1486 0.0598 0.2796 2.7 5c7r:B
68 1sqf:A 425 53 0.0800 0.0329 0.2642 2.8
69 8r2o:B 425 93 0.1486 0.0612 0.2796 2.8
70 3oai:A 488 93 0.1486 0.0533 0.2796 2.8 3oai:B
71 4exk:A 475 93 0.1486 0.0547 0.2796 2.8
72 1mg1:A 450 93 0.1486 0.0578 0.2796 2.8
73 6xdj:A 441 93 0.1486 0.0590 0.2796 2.8 6xaw:A, 6xdj:B
74 7rxc:B 439 93 0.1486 0.0592 0.2796 2.9 7rxd:B
75 4wvi:A 521 93 0.1486 0.0499 0.2796 2.9 4wvg:A, 4wvh:A, 4wvj:A
76 5ttd:A 491 93 0.1486 0.0530 0.2796 3.0
77 4evi:A 360 107 0.1486 0.0722 0.2430 3.0 4e70:A, 4e70:B, 4evi:B
78 6gfj:A 457 93 0.1486 0.0569 0.2796 3.0 6gfj:B, 6gfj:C, 6gfj:D
79 6anv:A 451 93 0.1486 0.0576 0.2796 3.1 6anv:B
80 5az7:A 434 93 0.1486 0.0599 0.2796 3.1 3awr:B, 3ax2:E, 3ax2:G, 3ax3:A, 3ax3:G, 3ax3:C, 3ax3:E, 3ax5:A, 5az6:B, 5az6:A, 5az8:A, 2v1s:A, 2v1s:B, 2v1s:C, 2v1s:F, 2v1t:B
81 5gpq:A 460 93 0.1486 0.0565 0.2796 3.1
82 5fub:A 337 45 0.0914 0.0475 0.3556 3.1 5g02:A
83 5jon:A 509 93 0.1486 0.0511 0.2796 3.2 5jon:B
84 2xz3:A 459 93 0.1486 0.0566 0.2796 3.3
85 8tlx:A 439 93 0.1486 0.0592 0.2796 3.3 2mv7:A, 2n4q:B, 8tlv:A, 8tlw:A
86 5gpp:B 462 93 0.1486 0.0563 0.2796 3.3 5gpp:A
87 4tsm:B 512 93 0.1486 0.0508 0.2796 3.4 4ogm:A, 4pe2:A, 4tsm:A, 4tsm:C
88 5z0r:B 445 93 0.1486 0.0584 0.2796 3.4 5z0r:A, 5z0v:A, 5z0v:B, 5z0v:C, 5z0v:D
89 6k7f:A 499 93 0.1486 0.0521 0.2796 3.5
90 6d67:A 514 93 0.1486 0.0506 0.2796 3.6 6apx:A
91 6smv:A 525 93 0.1486 0.0495 0.2796 3.6
92 5h7q:A 469 93 0.1486 0.0554 0.2796 3.6 5wpz:A, 5wpz:B, 5wpz:C, 5wpz:D, 5wpz:E, 5wpz:F, 5wq6:A, 5wq6:B, 5wq6:C, 5wq6:D
93 4irl:B 463 93 0.1486 0.0562 0.2796 3.7 4irl:A, 4irl:C
94 4ikm:A 463 93 0.1486 0.0562 0.2796 3.7
95 8g3s:A 518 93 0.1486 0.0502 0.2796 3.7 6b4l:A, 6b4l:B, 6b4u:A, 9bcg:A, 4bpi:A, 4bpj:A, 6bw2:A, 6bw2:B, 6bw2:C, 6bw2:D, 6bw8:A, 6bw8:B, 6bw8:C, 6bw8:D, 5c3f:A, 5c6h:A, 5c6h:C, 5c6h:I, 5c6h:E, 5c6h:G, 5c6h:K, 5c6h:M, 5c6h:O, 5c6h:Q, 5c6h:U, 5c6h:S, 5c6h:W, 3d7v:A, 6dm8:A, 6dm8:B, 6dm8:C, 6dm8:D, 6dm8:E, 6dm8:F, 6dm8:G, 6dm8:H, 8ekx:A, 8el0:A, 8el1:A, 8el1:B, 8el1:C, 8el1:D, 5fc4:A, 5fdo:A, 5fdo:B, 5fdo:C, 5fdo:D, 5fdr:A, 5fdr:B, 5fdr:C, 5fdr:D, 6fs0:A, 6fs1:A, 6fs1:B, 6fs2:A, 6fs2:B, 8g3t:A, 8g3u:A, 8g3w:A, 8g3x:A, 8g3y:A, 8h7b:A, 8h7b:B, 4hw2:A, 4hw2:B, 4hw2:C, 4hw2:D, 4hw2:E, 4hw2:F, 4hw3:A, 4hw3:B, 4hw3:C, 4hw3:D, 4hw3:E, 4hw3:F, 4hw3:G, 4hw3:H, 4hw3:I, 4hw3:J, 4hw3:K, 4hw3:L, 4hw4:A, 4hw4:B, 5iez:A, 5iez:B, 5iez:C, 5iez:D, 5if4:A, 5if4:B, 3io9:A, 8iqm:A, 3kj0:A, 3kj1:A, 3kj2:A, 5ku9:A, 5ku9:B, 3kz0:A, 3kz0:B, 5lof:A, 6mbd:A, 6mbd:B, 6mbe:A, 5mes:A, 5mev:A, 3mk8:A, 7nb4:A, 7nb7:A, 7nb7:B, 7nb7:C, 7nb7:D, 6ne5:A, 6ne5:B, 6ne5:C, 6ne5:D, 2nl9:A, 2nla:A, 6o4u:A, 6o4u:B, 6o6f:A, 6o6f:B, 6o6g:A, 4oq5:A, 4oq5:F, 4oq5:B, 4oq5:C, 4oq5:D, 4oq5:E, 4oq6:A, 4oq6:B, 6oqb:A, 6oqc:A, 6oqc:B, 6oqd:A, 6oqn:A, 6oqn:B, 6p3p:A, 3pk1:A, 3pk1:C, 2pqk:A, 6qb4:A, 6qfi:A, 6qfm:A, 6qfq:A, 6qgd:A, 8qso:A, 6qxj:A, 6qyk:A, 6qyl:A, 6qyn:A, 6qyo:A, 6qyp:A, 6qz5:A, 6qz6:A, 6qz7:A, 6qz8:A, 6qzb:A, 8svy:A, 8t6f:A, 6u63:A, 6u63:B, 6u63:C, 6u63:D, 6u64:A, 6u65:A, 6u65:B, 6u65:C, 6u65:D, 6u67:A, 6u67:B, 6u6f:A, 6u6f:B, 6u6f:C, 6ua3:A, 6uab:A, 6ud2:A, 6udi:A, 6udt:A, 6udu:A, 6udv:A, 6udx:A, 6udx:B, 6udy:A, 6udy:B, 5uum:A, 5uum:B, 6vbx:A, 8vjp:A, 5vkc:A, 5vkc:B, 5vx2:A, 5vx2:C, 5w89:A, 5w8f:A, 4wgi:A, 3wix:A, 3wix:B, 3wix:C, 3wix:D, 3wiy:A, 3wiy:B, 3wiy:C, 3wiy:D, 3wiy:E, 3wiy:F, 4wmr:A, 4wms:A, 4wmt:A, 4wmu:A, 4wmv:A, 4wmw:A, 4wmx:A, 6ybg:A, 6ybg:B, 6ybj:A, 6ybk:A, 6ybl:A, 4zbf:A, 4zbf:B, 4zbf:C, 4zbf:D, 4zbf:E, 4zbf:F, 4zbf:G, 4zbf:H, 4zbf:I, 4zbf:J, 4zbf:K, 4zbf:L, 4zbi:A, 4zbi:B, 4zbi:C, 4zbi:D, 4zbi:E, 4zbi:F, 4zbi:G, 4zbi:H, 4zbi:I, 4zbi:J, 4zbi:K, 4zbi:L, 6zie:B
96 3vd8:A 467 93 0.1486 0.0557 0.2796 4.1
97 5mgz:A 230 67 0.0971 0.0739 0.2537 4.3 5mgz:B
98 5jst:B 432 93 0.1486 0.0602 0.2796 4.4 5jst:A
99 1hsj:A 487 93 0.1486 0.0534 0.2796 4.5 1hsj:B
100 5dpl:A 520 51 0.0914 0.0308 0.3137 4.8 5doo:A, 5dpl:B
101 5dfm:A 509 93 0.1486 0.0511 0.2796 4.8 5dfm:B
102 4pqk:B 479 93 0.1486 0.0543 0.2796 4.9 4pqk:A, 4pqk:C, 4pqk:D
103 7epu:B 748 72 0.0971 0.0227 0.2361 5.1 8b0a:K, 7enn:K, 7otq:K
104 3i9f:B 169 58 0.1029 0.1065 0.3103 5.5 3i9f:A
105 5wp4:A 485 38 0.0743 0.0268 0.3421 5.6
106 5eul:A 746 49 0.0914 0.0214 0.3265 6.5
107 8pjd:A 347 36 0.0629 0.0317 0.3056 6.7 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
108 2p35:A 245 43 0.0800 0.0571 0.3256 6.7 2p35:B
109 4h1g:A 670 93 0.1486 0.0388 0.2796 6.9
110 1m74:A 802 49 0.0914 0.0200 0.3265 7.4 2ibm:A, 6itc:A, 3jv2:A, 3jv2:B, 1tf2:A, 7xha:A, 7xhb:A
111 4dsg:A 473 34 0.0857 0.0317 0.4412 7.9 4dsg:B, 4dsh:A, 4dsh:B
112 2yw2:A 423 51 0.0857 0.0355 0.2941 8.7 2yw2:B
113 3jwg:A 195 42 0.0743 0.0667 0.3095 8.8
114 2vdv:E 216 164 0.2343 0.1898 0.2500 8.9 2vdv:F
115 7wr3:A 794 93 0.1486 0.0327 0.2796 9.8 7wr3:B, 7wr5:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218