Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKKIAIFAGDGIGPEIVAAARQVLDAVDQAAHLGLRCTEGLVGGAALDASDDPLPAASLQLAMAADAVILGAVGGPRWDA
YPPAKRPEQGLLRLRKGLDLYANLRPAQIFPQLLDASPLRPELVRDVDILVVRELTGDIYFGQPRGLEVIDGKRRGFNTM
VYDEDEIRRIAHVAFRAAQGRRKQLCSVDKANVLETTRLWREVVTEVARDYPDVRLSHMYVDNAAMQLIRAPAQFDVLLT
GNMFGDILSDEASQLTGSIGMLPSASLGEGRAMYEPIHGSAPDIAGQDKANPLATILSVAMMLRHSLNAEPWAQRVEAAV
QRVLDQGLRTADIAAPGTPVIGTKAMGAAVVNALNLK

The query sequence (length=357) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1a05:A 357 357 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1a05:B
2 4iwh:A 358 358 0.6246 0.6229 0.6229 2.45e-150 4iwh:B, 4xxv:A, 4xxv:B
3 5j32:A 369 354 0.5602 0.5420 0.5650 2.05e-138 5j32:B, 5j32:C, 5j32:D, 5j33:A, 5j33:B, 5j33:C, 5j33:H, 5j33:D, 5j33:F, 5j33:E, 5j33:G, 5j34:A, 5j34:B, 5j34:C, 5j34:D
4 6xxy:A 358 355 0.5322 0.5307 0.5352 1.08e-126 6xxy:B
5 3vmk:A 369 357 0.5266 0.5095 0.5266 5.83e-124 3vmk:B, 3vml:A
6 1cnz:A 363 347 0.5042 0.4959 0.5187 1.96e-122 1cnz:B
7 2y42:D 355 322 0.5042 0.5070 0.5590 2.40e-122 4f7i:A, 4f7i:B, 4f7i:C, 4f7i:D, 1hex:A, 4wuo:A, 4wuo:B, 2y40:A, 2y40:B, 2y41:A, 2y41:B, 2y42:A, 2y42:B, 2y42:C, 2ztw:A
8 3vkz:A 364 334 0.4986 0.4890 0.5329 1.24e-118 3vl2:A, 3vl3:A, 3vl4:A, 3vl6:A, 3vl7:A, 3vmj:A, 3wzv:A, 3wzw:A, 3wzx:A, 3wzy:A
9 3asj:A 333 363 0.4006 0.4294 0.3939 6.17e-63 3asj:B, 3asj:C, 3asj:D, 4yb4:A, 4yb4:B, 4yb4:C, 4yb4:D
10 4y1p:B 336 303 0.3417 0.3631 0.4026 1.17e-58 4y1p:A
11 2g4o:A 337 358 0.3922 0.4154 0.3911 2.69e-57 2g4o:D
12 6lky:A 339 354 0.3669 0.3864 0.3701 1.11e-55 6lky:B
13 6m3s:B 338 350 0.3333 0.3521 0.3400 4.48e-52 6m3s:A
14 5hn4:A 329 305 0.3165 0.3435 0.3705 1.04e-46 5hn6:A
15 6kde:A 336 334 0.3137 0.3333 0.3353 1.92e-45 5gre:A, 5grh:A, 5gri:A, 5grl:A, 8grd:A, 8gru:A, 8gru:C, 6kde:C, 6kdy:A, 6kdy:C, 6kdy:E, 6kdy:G, 6ke3:A, 6ke3:C, 6ke3:E, 6ke3:G, 6l57:A, 6l59:A, 5yvt:A
16 3ty3:A 358 342 0.3053 0.3045 0.3187 2.57e-44 3ty3:B
17 2d1c:A 495 336 0.3137 0.2263 0.3333 1.45e-43 2d1c:B
18 3flk:A 359 371 0.3361 0.3343 0.3235 6.17e-42 3flk:B, 3flk:C, 3flk:D, 3fmx:X
19 3blw:F 347 353 0.3081 0.3170 0.3116 5.93e-37 3blw:H, 3blw:J
20 2e5m:A 403 387 0.3249 0.2878 0.2997 2.32e-36 2e5m:B
21 3blv:C 344 336 0.2969 0.3081 0.3155 4.00e-36 3blv:A, 3blv:E, 3blv:G, 3blw:A, 3blw:C, 3blw:E, 3blw:G, 3blw:I, 3blw:K, 3blw:M, 3blw:O
22 2iv0:A 412 392 0.3193 0.2767 0.2908 9.15e-35 2iv0:B
23 5grf:B 335 339 0.2745 0.2925 0.2891 4.23e-33 5gre:B, 5gri:B, 5grl:B, 6l57:B, 6l59:B, 5yvt:B
24 1tyo:A 427 373 0.2941 0.2459 0.2815 5.02e-31 1xkd:A, 1xkd:B
25 6kdy:D 342 341 0.2689 0.2807 0.2815 1.03e-28 8grd:B, 8gru:B, 8gru:D, 6kdy:B, 6kdy:F
26 4aj3:A 416 354 0.2773 0.2380 0.2797 6.17e-25 1ai2:A, 1ai3:A, 4aja:A, 4ajb:A, 4ajc:A, 4ajr:A, 4ajs:A, 1bl5:A, 1cw1:A, 1cw4:A, 1cw7:A, 1gro:A, 1grp:A, 1hj6:A, 9icd:A, 1idc:A, 1ide:A, 1ika:A, 1iso:A
27 2d4v:A 427 415 0.3333 0.2787 0.2867 2.31e-24 2d4v:B, 2d4v:C, 2d4v:D
28 6c0e:A 419 353 0.2661 0.2267 0.2691 3.49e-21 6c0e:B
29 2qfy:A 411 216 0.1513 0.1314 0.2500 3.11e-07 2qfv:A, 2qfv:B, 2qfv:C, 2qfv:D, 2qfx:A, 2qfx:B, 2qfx:C, 2qfx:D, 2qfx:E, 2qfx:F, 2qfy:B, 2qfy:C, 2qfy:D, 2qfy:E, 2qfy:F
30 6aj6:A 413 216 0.1401 0.1211 0.2315 1.22e-06 6aj6:C, 6aj8:A, 6aj8:B, 6aja:A, 6aja:B, 6aja:C, 6aja:D, 6ajb:A, 6ajb:B, 6ajb:C, 6ajb:D, 7e3n:A
31 4aou:A 401 203 0.1317 0.1172 0.2315 8.03e-05
32 6adi:A 418 198 0.1289 0.1100 0.2323 4.40e-04 6adi:B, 5h3e:B, 5h3f:A, 5h3f:B, 5i95:A, 5i96:A, 5i96:B, 4ja8:A, 4ja8:B, 5svn:A, 5svn:B, 5svo:A, 5svo:B, 6vfz:A, 6vfz:B
33 6ajc:A 413 238 0.1569 0.1356 0.2353 7.16e-04 6ajc:B, 6ajc:C, 6ajc:D, 6ajc:E, 6ajc:F, 6ajc:G, 6ajc:H
34 6adg:C 390 198 0.1289 0.1179 0.2323 0.001
35 8vhe:B 421 198 0.1289 0.1093 0.2323 0.001 6adg:A, 6adg:B, 6b0z:A, 6b0z:C, 6b0z:B, 6b0z:D, 8bay:A, 8bay:B, 8bay:C, 6bkx:C, 6bkx:B, 6bkx:A, 6bky:D, 6bky:C, 6bky:E, 6bky:A, 6bky:B, 6bky:F, 6bkz:A, 6bkz:B, 6bl0:A, 6bl0:B, 6bl0:C, 6bl1:B, 6bl1:A, 6bl1:C, 6bl2:C, 6bl2:A, 6bl2:B, 5de1:A, 5de1:B, 8hb9:AAA, 8hb9:BBB, 8hb9:CCC, 8hb9:DDD, 3inm:A, 3inm:B, 3inm:C, 6io0:A, 6io0:B, 5k10:A, 5k10:B, 5k11:A, 5k11:B, 8kib:A, 8kib:B, 8kib:C, 8kib:D, 4kzo:A, 4kzo:B, 4kzo:C, 4l03:A, 4l03:B, 4l03:C, 4l04:A, 4l04:B, 4l04:C, 4l04:D, 4l04:E, 4l04:F, 4l06:A, 4l06:B, 4l06:C, 4l06:D, 4l06:E, 4l06:F, 5l57:A, 5lge:A, 5lge:B, 5lge:C, 5lge:D, 3map:A, 3map:B, 3mar:B, 3mas:A, 3mas:B, 6o2y:A, 6o2y:B, 6o2y:C, 6o2z:A, 6o2z:B, 6pay:A, 6pay:D, 6pay:C, 7pjm:A, 7pjm:B, 7pjm:C, 7pjn:A, 7pjn:B, 7pjn:C, 7pjn:D, 6q6f:A, 6q6f:B, 5svf:A, 5svf:C, 5svf:B, 5svf:D, 1t09:A, 1t09:B, 1t0l:A, 1t0l:B, 1t0l:C, 1t0l:D, 8t7d:A, 8t7n:A, 8t7n:B, 8t7o:A, 8t7o:B, 5tqh:A, 5tqh:B, 5tqh:C, 5tqh:D, 6u4j:A, 6u4j:B, 4umx:A, 4umx:B, 6vei:A, 6vei:B, 6vg0:A, 6vg0:B, 6vg0:C, 8vh9:A, 8vh9:B, 8vha:A, 8vha:B, 8vha:C, 8vha:D, 8vhb:A, 8vhb:B, 8vhb:C, 8vhb:D, 8vhc:A, 8vhc:B, 8vhd:A, 8vhd:B, 8vhd:C, 8vhd:D, 8vhe:A, 8vhe:C, 8vhe:D, 8w49:A, 8w49:B, 8w49:C, 8w49:D, 5yfm:A, 5yfm:B, 5yfm:C, 5yfn:A, 5yzh:A, 5yzh:B, 5yzi:A, 5yzi:B
36 4hcx:A 402 132 0.0952 0.0846 0.2576 0.006 4hcx:B
37 6ixn:A 405 140 0.0868 0.0765 0.2214 0.012 7e2w:A, 6ixn:B, 6ixn:C, 6ixn:D, 6ixt:A, 6ixt:C
38 6pv7:A 387 127 0.0952 0.0879 0.2677 0.013 6pv7:D, 6pv8:A, 6pv8:D
39 2uxq:A 402 111 0.0840 0.0746 0.2703 0.15 4aov:A, 2uxr:B
40 7vcf:F 402 62 0.0476 0.0423 0.2742 1.6 7xzi:9, 7xzj:9
41 4f18:A 375 91 0.0784 0.0747 0.3077 1.7 4f19:A, 2q9t:A
42 6usf:A 464 108 0.0812 0.0625 0.2685 3.2 6cnj:A, 6cnj:D, 6cnk:A, 6cnk:B, 6cnk:D, 5kxi:A, 5kxi:D, 6ur8:A, 6ur8:D, 6usf:D
43 4inw:A 140 55 0.0420 0.1071 0.2727 4.5 4inx:A
44 2qjj:A 402 51 0.0420 0.0373 0.2941 4.6 4k1w:A, 4k1w:B, 4k1w:C, 4k1w:D, 4k8g:A, 2qjj:B, 2qjj:C, 2qjj:D, 2qjm:A, 2qjm:B, 2qjm:C, 2qjm:D, 2qjn:A, 2qjn:B, 2qjn:C, 2qjn:D
45 5fjv:B 207 90 0.0588 0.1014 0.2333 5.2 5fjv:A, 5fjv:E, 5fjv:C, 5fjv:D
46 4gx2:B 548 77 0.0616 0.0401 0.2857 6.9 4gvl:A, 4gvl:B, 4gvl:D, 4gvl:C, 4gx0:B, 4gx0:C, 4gx1:B, 4gx1:C, 4gx2:C, 4gx5:B, 4gx5:C
47 8ssz:A 393 108 0.0812 0.0738 0.2685 7.3 8ssz:D, 8st0:A, 8st0:D, 8st1:A, 8st1:B, 8st1:D, 8st2:A, 8st2:B, 8st2:D, 8st3:A, 8st3:D, 8st4:A, 8st4:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218