Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKIVIVGIGYVGLANAILFSKNNENEVVLLDIDENKIQSINNHKSPIKDKLIEKFFVQSKLHATSNIKEAYFNADFAVIA
TPTDYDENFFDTRSIENVLKDIKNINSKINVIIKSTVPIGYTKTIKQKFNMSNIVFSPEFLREGSALYDSLYPSRIIIGD
KSVLGKTIGDLFLKNIEKKNVDIFYMDSDEAESVKLFSNTYLAMRVGFFNEVDSYARKHNLNSADIIKGISADDRIGKYY
NNPSFGYGGYCLPKDTKQLLANFYNIPNSLIKAIVETNEIRKKFITQLILEKKPNILGIYRLIMKQNSDNFRNSVIIDII
KYLQEYNSNIELIIYEPLVKEKKFLNIKVENDFNVFGAKVDLIIANRFDDKLKEIKDKVFSADVFYT

The query sequence (length=387) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7kws:A 390 389 0.9974 0.9897 0.9923 0.0 7kws:B
2 3pjg:A 389 389 0.5065 0.5039 0.5039 1.62e-141 3pln:A, 3plr:A
3 1dli:A 402 404 0.5142 0.4950 0.4926 1.58e-120 1dlj:A
4 3gg2:A 431 386 0.2894 0.2599 0.2902 1.59e-41 3gg2:D, 3gg2:B, 3gg2:C
5 4a7p:A 429 391 0.2636 0.2378 0.2609 1.65e-40 4a7p:B
6 2y0c:A 461 371 0.2661 0.2234 0.2776 4.54e-39 2y0c:B, 2y0c:C, 2y0c:D, 2y0d:A, 2y0d:B, 2y0d:C, 2y0d:D, 2y0e:A, 2y0e:B, 2y0e:C, 2y0e:D
7 3vtf:A 432 362 0.2584 0.2315 0.2762 7.06e-38
8 1mfz:A 436 349 0.2481 0.2202 0.2751 1.47e-34 1mfz:B, 1mfz:C, 1mfz:D, 1muu:C, 1muu:A, 1muu:B, 1muu:D, 1mv8:B, 1mv8:A, 1mv8:C, 1mv8:D
9 6om8:D 468 378 0.2661 0.2201 0.2725 4.00e-28 6om8:A, 6om8:B, 6om8:C, 6om8:E, 6om8:F, 6om8:G, 6om8:H, 6om8:I, 6om8:J, 6om8:K, 6om8:L
10 4edf:A 431 365 0.2481 0.2227 0.2630 1.09e-25 4edf:B, 4edf:C, 4edf:D
11 3khu:B 467 377 0.2558 0.2120 0.2626 2.59e-25 6c4j:A, 6c4j:B, 6c4j:C, 6c4j:D, 6c4j:E, 6c4j:F, 6c4j:G, 6c4j:H, 6c4j:I, 6c4j:J, 6c4j:K, 6c4j:L, 6c58:A, 6c58:B, 6c58:C, 6c58:D, 6c58:E, 6c58:F, 6c5a:A, 6c5a:B, 6c5a:C, 6c5a:D, 6c5a:E, 6c5a:F, 6c5z:A, 6c5z:B, 6c5z:C, 6c5z:D, 6c5z:E, 6c5z:F, 3khu:A, 3khu:C, 3khu:D, 3khu:E, 3khu:F, 3prj:A, 3prj:B, 3prj:C, 3prj:D, 3prj:E, 3prj:F, 3ptz:A, 3ptz:B, 3ptz:C, 3ptz:D, 3ptz:E, 3ptz:F, 2q3e:A, 2q3e:B, 2q3e:C, 2q3e:D, 2q3e:E, 2q3e:F, 2q3e:G, 2q3e:H, 2q3e:I, 2q3e:J, 2q3e:K, 2q3e:L, 2qg4:A, 2qg4:B, 2qg4:C, 2qg4:D, 2qg4:E, 2qg4:F, 2qg4:G, 2qg4:H, 3tdk:A, 3tdk:B, 3tdk:G, 3tdk:H, 3tdk:L, 3tdk:K, 3tdk:F, 3tdk:E, 3tdk:D, 3tdk:C, 3tdk:J, 3tdk:I, 5tjh:A, 5tjh:B, 5tjh:C, 5tjh:D, 5tjh:E, 5tjh:F, 5vr8:A, 5vr8:B, 5vr8:C, 5vr8:D, 5vr8:E, 5vr8:F
12 4r16:A 418 363 0.2481 0.2297 0.2645 3.06e-24 4r16:B
13 3ojl:A 418 368 0.2222 0.2057 0.2337 6.73e-19 3ojl:B, 3ojo:A, 3ojo:B
14 4xr9:A 456 374 0.2119 0.1798 0.2193 7.42e-15
15 5e6i:L 242 194 0.1240 0.1983 0.2474 0.006 5e6i:B, 5e6i:Q, 5tez:J, 6vqo:E, 6vqo:J, 3vxu:E, 3vxu:J, 3w0w:E
16 1n1e:A 349 90 0.0594 0.0659 0.2556 0.012 1evz:A, 1jdj:A, 1m66:A, 1m67:A, 1n1e:B, 1n1g:A
17 1ldm:A 329 39 0.0439 0.0517 0.4359 0.053 6ldh:A
18 7dbj:A 333 39 0.0413 0.0480 0.4103 0.14 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
19 4qsm:A 332 39 0.0413 0.0482 0.4103 0.21 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
20 7epm:A 335 40 0.0439 0.0507 0.4250 0.23 7epm:B
21 1a5z:A 312 40 0.0439 0.0545 0.4250 0.43
22 6k13:A 332 39 0.0388 0.0452 0.3846 0.50 6k13:B
23 3ldh:A 329 39 0.0413 0.0486 0.4103 0.73
24 3wsw:A 316 39 0.0388 0.0475 0.3846 0.95 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
25 2wzn:A 338 155 0.0930 0.1065 0.2323 1.2 4x8i:A, 4x8i:B, 4x8i:C
26 5tc5:A 286 63 0.0517 0.0699 0.3175 1.7 1cb0:A, 1cg6:A, 6dyz:A, 6dz0:A, 6dz2:A, 6dz2:B, 6dz2:C, 6dz3:A, 6dz3:B, 6dz3:C, 5eub:A, 1k27:A, 3ozc:A, 3ozd:A, 3ozd:B, 1sd1:A, 1sd2:A, 5tc5:B, 5tc5:C, 5tc6:A, 5tc7:A, 5tc8:A
27 1szo:D 251 103 0.0801 0.1235 0.3010 1.9 1szo:A, 1szo:B, 1szo:C, 1szo:E, 1szo:F, 1szo:G, 1szo:H, 1szo:I, 1szo:J, 1szo:K, 1szo:L
28 5x51:M 1386 48 0.0439 0.0123 0.3542 1.9 5x4z:A, 5x51:A, 8yfr:A
29 2j68:A 680 117 0.0801 0.0456 0.2650 2.0 2w6d:A, 2w6d:B
30 4pa0:B 920 78 0.0646 0.0272 0.3205 3.0 8qyu:B
31 2e37:C 310 50 0.0491 0.0613 0.3800 3.1 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
32 4yed:D 255 47 0.0336 0.0510 0.2766 3.1 4d79:A, 4d79:B, 4d79:C, 4d79:D, 4d7a:A, 4d7a:B, 4d7a:D, 4rdh:A, 4rdh:B, 4rdh:C, 4rdh:D, 4rdi:A, 4rdi:B, 4rdi:C, 4rdi:D, 4yed:A, 4yed:B, 4yed:C
33 5x20:A 312 176 0.1008 0.1250 0.2216 3.2 3wfj:A, 3wfj:B, 3wfj:C, 3wfj:D, 3wfj:E, 3wfj:G, 5x20:B, 5x20:C, 5x20:D, 5x20:E
34 5n29:A 265 55 0.0465 0.0679 0.3273 3.3
35 1uxg:A 308 38 0.0388 0.0487 0.3947 3.9 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
36 7f8d:A 313 33 0.0310 0.0383 0.3636 4.1 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
37 8am6:AAA 547 29 0.0388 0.0274 0.5172 4.2 8am3:AAA, 8am3:BBB, 8am6:BaB, 8am8:BBB, 8am8:AAA
38 1t2e:A 317 34 0.0413 0.0505 0.4706 4.3 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
39 2a92:C 318 38 0.0388 0.0472 0.3947 4.7 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
40 3f3s:A 312 95 0.0698 0.0865 0.2842 6.2 3f3s:B
41 5o5e:A 381 113 0.0698 0.0709 0.2389 7.9 6bw5:A, 6bw5:B, 6bw5:C, 6bw6:A, 6bw6:B, 6bw6:C, 6bw6:D, 6fm9:A, 6fwz:A
42 4e1k:A 450 82 0.0620 0.0533 0.2927 8.1 4knr:A, 4knx:A, 4kpx:A, 4kpz:A, 4kql:A, 2v0i:A, 2v0j:A, 2v0k:A, 2v0l:A, 2vd4:A, 2w0v:A, 2w0w:A
43 1gv0:A 301 40 0.0439 0.0565 0.4250 9.0 1gv0:B
44 8ab3:A 330 235 0.1447 0.1697 0.2383 9.0 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
45 1guz:A 305 40 0.0439 0.0557 0.4250 9.8 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218