Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MKILVTGAAGFIGSHLCQALLKNSAYHVVGIDHFIGPTPATLKTGNIQSLELNSRFQFIREDILNTDLSKLLQDIDVVYH
LAAIPGWGKDFQPYVTNNIMVTQQLLEACKHIKLDKFIHISTSSVYGEKSGAVSEDLLPIPLSPYGVTKLSGEHLCHVYH
KNFHIPIVILRYFTVYGPRQRPDMAFHRLIKQMLEDKPLTIFGDGTQTRDFTYIDDCIRGTVAALETKKNIIGEVINIGG
KEQASILDIISMLEKISGKSATKNFLKKQTWADISKASTLLQYSPTVSLSDGLEAEYDYIKQLYK

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6zll:A 321 315 1.0000 0.9502 0.9683 0.0 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
2 6kv9:A 299 312 0.3803 0.3880 0.3718 4.12e-62 6kvc:A
3 5u4q:A 321 326 0.3770 0.3583 0.3528 8.17e-52
4 5u4q:B 304 327 0.3639 0.3651 0.3394 1.24e-44
5 4zrn:A 309 321 0.3443 0.3398 0.3271 4.83e-40 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
6 6wj9:B 308 315 0.3311 0.3279 0.3206 4.14e-38 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
7 6dnt:A 310 289 0.3049 0.3000 0.3218 7.48e-38
8 6bwl:A 313 326 0.3574 0.3482 0.3344 3.71e-35
9 1sb8:A 341 311 0.3148 0.2815 0.3087 7.77e-35 1sb9:A
10 6pnl:A 336 326 0.3115 0.2827 0.2914 1.16e-34 6pmh:A
11 2b69:A 312 318 0.2951 0.2885 0.2830 2.60e-34 4gll:A, 4gll:B
12 6bi4:C 311 266 0.2525 0.2476 0.2895 6.79e-34 6bi4:B, 6bi4:D, 6bi4:A
13 1r66:A 322 316 0.2918 0.2764 0.2816 1.94e-33 1r6d:A
14 4lk3:B 274 303 0.2721 0.3029 0.2739 6.38e-33 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
15 3vps:A 303 285 0.2885 0.2904 0.3088 1.06e-32 3vps:B
16 3lu1:A 336 308 0.3180 0.2887 0.3149 1.97e-32 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
17 8vr2:B 321 319 0.3213 0.3053 0.3072 1.46e-31 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
18 6vlo:A 319 267 0.2918 0.2790 0.3333 5.64e-31 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
19 1keu:A 361 295 0.2984 0.2521 0.3085 2.11e-30 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
20 2c59:A 364 337 0.3049 0.2555 0.2760 3.26e-30 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
21 8du1:A 361 341 0.3115 0.2632 0.2786 2.04e-29 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
22 8sk0:B 330 304 0.2689 0.2485 0.2697 2.72e-29 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
23 7yst:A 312 319 0.3246 0.3173 0.3103 1.48e-28 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
24 1bxk:B 344 273 0.2787 0.2471 0.3114 1.52e-28 1bxk:A
25 1a9y:A 338 324 0.3213 0.2899 0.3025 1.67e-28 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
26 3ehe:A 290 280 0.2689 0.2828 0.2929 2.39e-28 3ehe:B
27 3aw9:A 304 263 0.2525 0.2533 0.2928 1.06e-27 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
28 2hun:A 329 314 0.2787 0.2584 0.2707 1.52e-27 2hun:B
29 2q1s:A 336 323 0.3016 0.2738 0.2848 6.31e-26 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
30 8wov:B 341 284 0.2820 0.2522 0.3028 1.35e-25 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
31 7k3p:A 329 341 0.3377 0.3131 0.3021 4.58e-25 7k3p:B
32 3sxp:D 314 313 0.3180 0.3089 0.3099 4.17e-24 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
33 4twr:A 325 285 0.2787 0.2615 0.2982 7.53e-24 4wok:A
34 7xpo:A 344 322 0.2918 0.2587 0.2764 7.16e-20 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
35 1gy8:C 370 323 0.2787 0.2297 0.2632 9.01e-20 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
36 3m2p:B 255 296 0.2590 0.3098 0.2669 1.12e-19
37 2p5u:A 311 277 0.2590 0.2540 0.2852 5.79e-19 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
38 2c20:A 329 279 0.2525 0.2340 0.2760 6.20e-19 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
39 1orr:A 338 352 0.3049 0.2751 0.2642 2.03e-18 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
40 4ej0:A 330 234 0.2098 0.1939 0.2735 2.13e-18 4ej0:B, 4ej0:C, 4ej0:D, 4ej0:E, 4ej0:F, 4ej0:G, 4ej0:H, 4ej0:I, 4ej0:J
41 1i3k:A 347 343 0.3148 0.2767 0.2799 2.93e-18 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
42 1ker:B 347 325 0.2951 0.2594 0.2769 3.56e-18 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
43 6k0g:A 335 332 0.2951 0.2687 0.2711 1.37e-17 6k0h:A, 6k0i:A
44 6h0n:A 377 363 0.2885 0.2334 0.2424 4.02e-17 6h0n:B, 6h0p:A, 6h0p:B
45 7us5:A 346 276 0.2590 0.2283 0.2862 4.67e-17 7us5:B, 7us5:C, 7us5:D
46 1z45:A 674 289 0.2557 0.1157 0.2699 1.85e-16
47 6x3b:A 300 269 0.2492 0.2533 0.2825 1.18e-15 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
48 7kn1:A 336 338 0.2754 0.2500 0.2485 3.59e-15 7kn1:B
49 2pk3:A 309 269 0.2393 0.2362 0.2714 4.39e-15 2pk3:B
50 6vo6:D 311 249 0.2295 0.2251 0.2811 3.96e-14 6vo6:A, 6vo6:B, 6vo6:C, 6vo8:A, 6vo8:B
51 2x6t:G 308 249 0.2131 0.2110 0.2610 9.83e-14 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
52 5z75:A 306 239 0.2098 0.2092 0.2678 2.75e-13 5z75:B, 5z75:D
53 1eq2:A 273 249 0.2164 0.2418 0.2651 7.80e-13 1eq2:C
54 4id9:B 328 287 0.2492 0.2317 0.2648 1.45e-12 4id9:A, 4idg:A, 4idg:B
55 1z7e:D 644 281 0.2525 0.1196 0.2740 2.25e-12 2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
56 3enk:A 340 295 0.2492 0.2235 0.2576 3.06e-12 3enk:B
57 8gjh:A 639 282 0.2393 0.1142 0.2589 1.14e-11 8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
58 8v4h:B 342 330 0.2754 0.2456 0.2545 1.74e-11 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
59 3a1n:A 315 187 0.1738 0.1683 0.2834 9.41e-10 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
60 7eps:A 310 277 0.2328 0.2290 0.2563 2.46e-09 7eps:B, 7eps:C, 7eps:D, 3wmx:A, 3wmx:B, 3wmx:C, 3wmx:D
61 2q1w:A 300 231 0.2033 0.2067 0.2684 4.11e-09 2q1w:B, 2q1w:C
62 7cgv:A 310 238 0.2033 0.2000 0.2605 4.40e-09 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
63 5y1f:A 311 239 0.2000 0.1961 0.2552 7.88e-09 5y1e:A, 5y1g:A
64 6d2v:A 315 271 0.2164 0.2095 0.2435 8.79e-09 6d2v:B, 6nd7:A, 6nd7:B
65 4lis:A 364 304 0.2492 0.2088 0.2500 1.59e-08 4lis:B, 4lis:C
66 6jkh:A 212 229 0.1803 0.2594 0.2402 2.49e-08 6jkh:B
67 1bsv:A 317 265 0.1934 0.1861 0.2226 4.01e-08 1bws:A, 1e6u:A, 1e7q:A, 1e7r:A, 1e7s:A, 1fxs:A
68 3wmw:B 278 232 0.1770 0.1942 0.2328 8.00e-08 3wmw:A
69 2pzm:A 316 261 0.2066 0.1994 0.2414 2.73e-07 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
70 5bju:A 340 217 0.1836 0.1647 0.2581 3.53e-07 5bju:B, 5bjv:A, 5bjv:B, 5bjw:A, 5bjw:B, 5bjx:A, 5bjx:B, 5bjy:A, 5bjy:B
71 7epr:B 310 244 0.2033 0.2000 0.2541 1.82e-06 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
72 5uzh:A 345 177 0.1672 0.1478 0.2881 5.76e-06
73 4u7w:B 394 193 0.1443 0.1117 0.2280 1.40e-05 4u7w:A
74 8gym:a9 340 267 0.2197 0.1971 0.2509 1.43e-05 8b6f:A1, 8bqs:A1, 8gym:A9, 8gzu:a9, 8gzu:A9, 7tgh:A9
75 8ewu:B 354 364 0.2393 0.2062 0.2005 1.43e-05 8ewu:A
76 8gjb:A 320 262 0.2066 0.1969 0.2405 2.33e-05 8gjb:B
77 1rkx:C 351 328 0.2525 0.2194 0.2348 2.44e-05 1rkx:A, 1rkx:B, 1rkx:D
78 4m55:E 164 82 0.0852 0.1585 0.3171 2.75e-05
79 3st7:A 369 294 0.1934 0.1599 0.2007 2.89e-05 2zkl:A
80 5k4w:C 321 255 0.2066 0.1963 0.2471 9.34e-05 5k4q:A, 5k4q:B, 5k4q:C, 5k4q:D, 5k4q:E, 5k4q:F, 5k4u:A, 5k4u:C, 5k4v:A, 5k4v:C, 5k4w:A, 5k4y:A, 5k4y:B, 5k4y:C, 5k4y:D, 5k4y:E, 5k4y:F, 5k50:A, 5k50:C, 5k50:E, 5k50:G, 5k50:I, 5k50:J, 5lc1:A, 5lc1:B, 5lc1:C, 5lc1:D, 5lc1:E, 5lc1:F
81 2gn4:A 329 235 0.1836 0.1702 0.2383 1.54e-04 2gn4:B, 2gn6:A, 2gn6:B, 2gn8:A, 2gn8:B, 2gn9:A, 2gn9:B, 2gna:A, 2gna:B
82 6jyg:D 307 243 0.1803 0.1792 0.2263 1.95e-04 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
83 6bwc:C 327 184 0.1541 0.1437 0.2554 5.79e-04 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
84 3w1v:A 347 233 0.1803 0.1585 0.2361 0.001 4g5h:A, 3vvc:A, 3w1v:B
85 5u9c:A 288 195 0.1639 0.1736 0.2564 0.003 5u9c:C
86 3sc6:D 283 182 0.1541 0.1661 0.2582 0.003 3sc6:A, 3sc6:B, 3sc6:C, 3sc6:E, 3sc6:F
87 2yy7:A 312 232 0.1836 0.1795 0.2414 0.003 2yy7:B
88 7anc:B 314 330 0.2230 0.2166 0.2061 0.005
89 3rfv:A 265 174 0.1246 0.1434 0.2184 0.006 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
90 2ggs:A 273 160 0.1410 0.1575 0.2687 0.007 2ggs:B
91 2ydx:A 312 226 0.1672 0.1635 0.2257 0.008 2ydx:C, 2ydx:B, 2ydx:D, 2ydx:E
92 5in4:A 355 206 0.1770 0.1521 0.2621 0.010 6gpj:A, 6gpj:B, 6gpj:D, 6gpj:C, 6gpk:A, 6gpk:B, 6gpk:C, 6gpk:D, 6gpl:B, 6gpl:E, 6gpl:C, 6gpl:D, 5in4:B, 5in4:C, 5in4:D, 5in5:A, 5in5:B, 5in5:C, 5in5:D, 6q94:B, 6q94:A, 6q94:C, 6q94:E, 6q94:D, 6q94:F, 6q94:G, 6q94:H, 1t2a:A, 1t2a:D, 1t2a:B, 1t2a:C
93 6nbr:A 316 302 0.2295 0.2215 0.2318 0.012 6nbr:B, 6nbr:C, 6nbr:D
94 4r1s:A 319 122 0.1049 0.1003 0.2623 0.020 4r1s:B
95 1vl0:A 281 183 0.1541 0.1673 0.2568 0.020 1vl0:B, 1vl0:C
96 3vvb:A 270 191 0.1475 0.1667 0.2356 0.029
97 1y1p:A 342 128 0.1115 0.0994 0.2656 0.059 1y1p:B
98 7c1e:A 342 112 0.1016 0.0906 0.2768 0.086 7c1e:B, 7c3v:A, 5z2x:A, 5z2x:B, 8zav:A, 8zav:B, 5zec:A, 5zec:B, 5zed:A, 5zed:B
99 7cxt:A 348 361 0.2262 0.1983 0.1911 0.093 7anc:A, 7cxt:B, 7m13:A, 7m13:B
100 4e5y:C 290 253 0.1607 0.1690 0.1937 0.10
101 4yrd:B 346 292 0.1738 0.1532 0.1815 0.11 3vhr:A, 4yrd:A
102 1i24:A 392 195 0.1541 0.1199 0.2410 0.19 1i2b:A, 1i2c:A, 1qrr:A
103 5tqm:A 315 83 0.0820 0.0794 0.3012 0.25 5tqm:B
104 3c3x:A 310 97 0.0852 0.0839 0.2680 0.56 3c3x:B, 2qw8:A, 2qw8:B, 2qx7:A, 2qx7:B, 2qzz:A, 2qzz:B, 2r2g:A, 2r2g:B, 2r6j:A, 2r6j:B
105 4pvd:A 342 30 0.0459 0.0409 0.4667 1.0 4pvd:B
106 7mdh:B 360 95 0.0918 0.0778 0.2947 1.0 7mdh:A, 7mdh:C, 7mdh:D
107 4yrb:C 249 97 0.0787 0.0964 0.2474 1.3 4yrb:A, 4yrb:D, 4yrb:E
108 7zm7:E 353 126 0.1016 0.0878 0.2460 1.5 7zmb:E, 7zmg:E
109 7ymb:A 343 88 0.0918 0.0816 0.3182 1.6
110 8fem:A 327 20 0.0393 0.0367 0.6000 1.9 8fen:A
111 4b4o:A 295 107 0.0984 0.1017 0.2804 2.3 4b4o:B, 4b4o:C, 4b4o:D, 4b4o:E, 4b4o:F, 4b4o:G, 4b4o:H
112 7b0n:P 355 118 0.0951 0.0817 0.2458 2.7 6gcs:E, 7o6y:E, 7o71:E, 6rfr:E, 6rfs:E, 6y79:E, 6yj4:P
113 6mkk:A 282 26 0.0393 0.0426 0.4615 2.8 6boq:A, 6bor:A, 6bos:A, 6bot:A, 6bou:A, 6bov:A, 6bow:A, 7cd5:A, 7cd6:A, 5cfg:A, 1de8:B, 1de8:A, 1de9:A, 1de9:B, 1dew:B, 1dew:A, 5dff:A, 5dfh:A, 5dfi:A, 5dfj:A, 5dg0:A, 4iem:A, 4iem:B, 4iem:C, 4iem:D, 2isi:A, 2isi:B, 2isi:C, 4lnd:A, 4lnd:B, 4lnd:C, 7lpg:D, 7lph:D, 7lpi:D, 7lpj:D, 7mcr:A, 7mev:A, 6p93:A, 6p94:A, 4qh9:A, 4qhe:A, 7suv:B, 7svb:B, 7tc2:A, 7tc2:B, 7tc2:C, 7tc2:D, 7tr7:A, 7u50:K, 3u8u:A, 3u8u:B, 3u8u:C, 3u8u:D, 3u8u:E, 3u8u:F, 6w0q:A, 6w2p:A, 6w3l:B, 6w3n:B, 6w3q:B, 6w3u:B, 6w43:A, 6w4i:A, 6w4i:B, 6w4t:A, 6w4t:B, 5wn0:A, 5wn1:A, 5wn2:A, 5wn3:B, 5wn4:B, 5wn5:B, 5wn5:A
114 8b9z:P 377 267 0.1541 0.1247 0.1760 2.8 8ba0:P, 8esw:A9, 8esz:A9
115 6rfq:E 263 118 0.0951 0.1103 0.2458 2.8
116 3vzs:B 249 147 0.1148 0.1406 0.2381 2.8 4n5m:A, 4n5m:B, 4n5n:A, 4n5n:B, 3vzs:A, 3vzs:C, 3vzs:D
117 5l3z:A 280 80 0.0689 0.0750 0.2625 2.9 5l4l:A
118 6kwt:A 338 30 0.0393 0.0355 0.4000 3.1
119 5vml:A 245 147 0.1180 0.1469 0.2449 4.6
120 3vkb:B 254 27 0.0295 0.0354 0.3333 5.3 3vk5:A, 3vk5:B, 3vka:A, 3vka:B, 3vkb:A, 3vkc:A, 3vkc:B, 3vkd:A, 3vkd:B
121 1i09:A 338 70 0.0721 0.0651 0.3143 5.4 4dit:A, 4iq6:A, 3l1s:A
122 4uun:B 337 84 0.0689 0.0623 0.2500 6.3 5a1t:A, 5a1t:B, 4uun:A
123 6uh2:B 255 63 0.0689 0.0824 0.3333 6.6 6uh2:A
124 2nnu:A 201 59 0.0656 0.0995 0.3390 8.4
125 4m55:F 181 31 0.0361 0.0608 0.3548 9.7

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218