Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKILSLRLKNLNSLKGEWKIDFTREPFASNGLFAITGPTGAGKTTLLDAICLALYHETPRLSNVSQSQNDLMTRDTAECL
AEVEFEVKGEAYRAFWSQNRARNQPDGNLQVPRVELARCADGKILADKVKDKLELTATLTGLDYGRFTRSMLLSQGQFAA
FLNAKPKERAELLEELTGTEIYGQISAMVFEQHKSARTELETQQVEDWGYLNSLIGSKEGDKFRKFAQGLTLDNLVHLAN
QQLTRLHGRYLLQRKASEALEVEVVDTWQADAVRDTRTLSGGESFLVSLALALALSDLVSHKTRIDSLFLDEGFGTLDSE
TLDTALDALDALNASGKTIGVISHVEAMKERIPVQIKVKKINGLGYSKLESTFAV

The query sequence (length=375) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6s85:D 375 375 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6s6v:C, 6s6v:D, 6s85:C, 7yzo:C, 7yzo:D, 7z03:D, 7z03:C
2 7yzp:C 448 449 0.8107 0.6786 0.6771 0.0 7yzp:D
3 3qf7:A 357 343 0.2133 0.2241 0.2332 1.06e-16 3qf7:B, 3tho:A, 4w9m:C, 4w9m:I, 4w9m:E, 4w9m:K
4 3auy:A 366 354 0.2320 0.2377 0.2458 1.26e-15 3aux:A, 3auy:B, 3av0:B, 5dny:D, 5dny:B, 5f3w:D, 5f3w:B
5 7q2x:B 388 360 0.2347 0.2268 0.2444 1.43e-05 7q2y:B
6 3qkt:A 339 344 0.2107 0.2330 0.2297 4.48e-05 4ncj:C, 4ncj:D, 3qkt:C
7 3qku:A 359 354 0.2027 0.2117 0.2147 8.49e-05 1f2u:A, 1f2u:D, 1f2u:C, 1f2u:B, 3qks:A, 3qks:B
8 6qpw:A 183 180 0.1253 0.2568 0.2611 1.37e-04
9 7q2x:A 431 154 0.1067 0.0928 0.2597 2.08e-04 7q2y:A
10 3qkt:B 319 341 0.2000 0.2351 0.2199 2.17e-04 4ncj:A, 4ncj:B, 3qkt:D, 3qku:B
11 7qen:A 465 154 0.1067 0.0860 0.2597 2.55e-04
12 1w1w:A 274 53 0.0507 0.0693 0.3585 0.001
13 8roa:A 339 325 0.2027 0.2242 0.2338 0.001
14 8roa:C 364 172 0.1307 0.1346 0.2849 0.001 8p0a:A, 8pq5:A, 8rob:A, 8roe:A, 8rof:A, 8rog:A
15 1w1w:B 327 53 0.0507 0.0581 0.3585 0.001 1w1w:C, 1w1w:D
16 6zz6:A 360 53 0.0507 0.0528 0.3585 0.001
17 6yuf:C 456 149 0.1093 0.0899 0.2752 0.002
18 7w1m:A 399 172 0.1307 0.1228 0.2849 0.002 6wge:A
19 6wg3:A 561 172 0.1307 0.0873 0.2849 0.003 6wg6:A, 6wg6:C
20 7qen:B 419 376 0.2347 0.2100 0.2340 0.004
21 4u00:A 241 124 0.1013 0.1577 0.3065 0.005
22 1b0u:A 258 66 0.0640 0.0930 0.3636 0.007
23 6yuf:A 384 57 0.0560 0.0547 0.3684 0.016
24 2pcl:A 223 77 0.0667 0.1121 0.3247 0.022
25 5h68:B 332 168 0.1093 0.1235 0.2440 0.055 5h68:A
26 3c41:J 242 95 0.0747 0.1157 0.2947 0.066 3c41:K, 3c4j:A, 3c4j:B, 2olj:A, 2olj:B, 2olk:A, 2olk:B, 2olk:C, 2olk:D, 2q0h:A, 2q0h:B
27 5xg3:B 374 162 0.1093 0.1096 0.2531 0.069 5h67:A, 5xg3:A
28 8fpf:D 666 114 0.0853 0.0480 0.2807 0.089 8fhk:D, 8fmv:D, 7m33:D, 8szc:D, 8t1p:D, 8t3k:D
29 7zoa:B 570 37 0.0453 0.0298 0.4595 0.11 7znu:A, 7znu:B, 7zo9:A, 7zo9:B, 7zoa:A
30 3d31:A 348 93 0.0880 0.0948 0.3548 0.12 3d31:B
31 3d31:A 348 44 0.0480 0.0517 0.4091 0.89 3d31:B
32 8ee7:A 456 55 0.0560 0.0461 0.3818 0.12 8ee4:A, 8ee4:B, 8ee4:C, 8ee4:D, 8ee4:E, 8ee4:F, 8ee7:B, 8eea:A, 8eea:B, 8eea:C, 8eea:D, 8eea:E, 8eea:F, 8sux:A, 8sux:B, 8sux:C, 8sux:D, 8sux:E, 8sux:F
33 8dk2:C 723 75 0.0667 0.0346 0.3333 0.13 8dk2:D
34 8q72:A 750 44 0.0507 0.0253 0.4318 0.16 8q72:B, 8q72:F, 8q72:G
35 4fju:A 338 53 0.0453 0.0503 0.3208 0.17 4fju:B, 4h8a:A, 4h8a:B
36 8as8:A 597 44 0.0507 0.0318 0.4318 0.17 8as8:B, 8bfn:A, 8bfn:B, 8bfn:F, 8bfn:G
37 8dk3:A 455 75 0.0667 0.0549 0.3333 0.18 8dk3:B
38 5xu1:B 226 66 0.0587 0.0973 0.3333 0.18 5xu1:A
39 5xu1:B 226 21 0.0267 0.0442 0.4762 4.4 5xu1:A
40 6qpw:C 377 287 0.1547 0.1538 0.2021 0.26
41 7r8e:A 548 32 0.0480 0.0328 0.5625 0.31 7fdv:A, 7fdv:D, 7oz1:A, 7oz1:B, 7r8d:A, 7r8d:B, 7r8e:B
42 6e10:1 719 45 0.0400 0.0209 0.3333 0.37 6e10:2, 6e10:3, 6e10:4, 6e10:5, 6e10:6, 6e11:1, 6e11:3, 6e11:2, 6e11:4, 6e11:5, 6e11:6
43 7tve:E 461 26 0.0347 0.0282 0.5000 0.39
44 8a8j:B 341 93 0.0800 0.0880 0.3226 0.40 8a8j:A, 8a93:A, 8a93:B, 8bpr:A, 8bpr:B
45 5ws4:A 650 66 0.0640 0.0369 0.3636 0.40 5ws4:B
46 4ymu:J 240 66 0.0507 0.0792 0.2879 0.50 4ymu:A, 4ymv:J, 4ymv:A
47 3tr0:A 201 24 0.0347 0.0647 0.5417 0.51
48 6zz6:B 423 203 0.1147 0.1017 0.2118 0.52
49 8rok:A 381 320 0.1973 0.1942 0.2313 0.56 8pq5:B
50 4ux3:A 436 73 0.0613 0.0528 0.3151 0.81
51 5och:C 537 67 0.0667 0.0466 0.3731 0.91
52 7msm:x 553 55 0.0507 0.0344 0.3455 1.1 7msc:x, 7msh:x, 7msz:x, 7mu0:A, 7mu0:B
53 5och:E 576 67 0.0667 0.0434 0.3731 1.2 7ehl:A, 7ehl:B, 5och:A, 5och:B, 5och:D, 5och:F, 5och:G, 5och:H
54 8dzg:A 420 76 0.0667 0.0595 0.3289 1.3 8dze:A, 8dze:B, 8dze:C, 8dze:D, 8dze:E, 8dze:F, 8dzf:A, 8dzf:B, 8dzf:C, 8dzf:D, 8dzf:E, 8dzf:F, 8dzg:B, 8dzg:C, 8dzg:D, 8dzg:E, 8dzg:F
55 6ojz:D 361 20 0.0347 0.0360 0.6500 1.3 6ojx:A, 6ojx:B, 6ojx:C, 6ojz:A, 6ojz:B, 6ojz:C, 6ojz:E, 6ojz:F, 6ok2:A, 6ok2:B, 6ok2:C, 6ok2:D, 6ok2:E, 6ok2:F, 6okv:A, 6okv:B, 6okv:C, 6okv:D, 6okv:E, 6okv:F, 6olm:A, 6olm:B, 6olm:C, 6olm:D, 6olm:E, 6olm:F
56 3jvv:C 337 29 0.0373 0.0415 0.4828 1.4 3jvv:A, 3jvv:B
57 1oxu:A 353 88 0.0773 0.0822 0.3295 1.4 1oxu:B, 1oxu:C, 1oxv:A, 1oxv:B, 1oxv:D
58 1oxu:A 353 19 0.0293 0.0312 0.5789 6.1 1oxu:B, 1oxu:C, 1oxv:A, 1oxv:B, 1oxv:D
59 7yq0:A 173 16 0.0320 0.0694 0.7500 1.6 7yq0:B, 7yq1:A, 7yq1:B, 7yq1:C, 7yq1:D, 7yq1:E, 7yq1:F
60 6hbu:A 584 20 0.0347 0.0223 0.6500 1.7 8bht:A, 8bht:B, 8bi0:A, 8bi0:B, 6eti:A, 6eti:B, 6feq:A, 6feq:B, 6ffc:A, 6ffc:B, 6hbu:B, 6hco:A, 6hco:B, 6hij:A, 6hij:B, 6hzm:A, 6hzm:B, 7neq:A, 7neq:B, 7nez:A, 7nez:B, 7nfd:A, 7nfd:B, 7oj8:A, 7oj8:B, 7ojh:B, 7ojh:A, 7oji:A, 7oji:B, 6vxh:A, 6vxh:B, 6vxi:A, 6vxi:B, 6vxj:A, 6vxj:B
61 8po7:A 594 109 0.0853 0.0539 0.2936 1.8
62 5fl3:A 354 51 0.0453 0.0480 0.3333 1.9
63 8swn:A 1135 31 0.0373 0.0123 0.4516 1.9
64 2d4v:A 427 101 0.0880 0.0773 0.3267 1.9 2d4v:B, 2d4v:C, 2d4v:D
65 8bjf:A 1195 31 0.0373 0.0117 0.4516 1.9 8bwp:A, 8bwq:A, 8bwr:A, 8sx7:A, 8sx8:A, 8sxb:A
66 8i4a:A 1218 31 0.0373 0.0115 0.4516 2.1 8bwo:A, 8i4c:A, 8j3w:A, 8j3z:A, 8xol:A, 8xom:A
67 8iza:A 1246 31 0.0373 0.0112 0.4516 2.1 8iz7:A, 8iz9:A, 8xok:A
68 6w6i:F 605 44 0.0373 0.0231 0.3182 2.6 6w6j:F
69 6w6h:C 636 44 0.0373 0.0220 0.3182 2.6 6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
70 7l6n:C 675 44 0.0373 0.0207 0.3182 2.6 7l6n:A, 7l6n:B, 6w6e:A
71 6dju:F 531 44 0.0373 0.0264 0.3182 2.7 6w6g:F
72 6ha8:V 541 84 0.0640 0.0444 0.2857 2.7
73 6ha8:V 541 18 0.0320 0.0222 0.6667 3.3
74 4jf7:A 501 104 0.0747 0.0559 0.2692 2.8 4jf7:D, 4jf7:B, 4jf7:C, 1z4v:A, 1z4w:A, 1z4x:A, 1z4y:A, 1z4z:A, 1z50:A
75 1f3o:A 232 51 0.0480 0.0776 0.3529 2.9 1l2t:A, 1l2t:B, 3tif:A, 3tif:B
76 6djv:C 615 44 0.0373 0.0228 0.3182 2.9 6dju:A, 6dju:B, 6dju:C, 6djv:A, 6djv:B
77 7abr:F 536 45 0.0347 0.0243 0.2889 3.6
78 5lil:A 615 95 0.0747 0.0455 0.2947 3.7 5lil:B, 5lj6:A, 5lj7:B
79 5lj7:A 592 95 0.0747 0.0473 0.2947 3.7
80 7abr:D 586 45 0.0347 0.0222 0.2889 3.8 7abr:A, 7abr:B, 7abr:C, 7abr:E
81 6r5k:H 394 60 0.0560 0.0533 0.3500 4.2 6r5k:D, 6r5k:F
82 7z6h:K 439 24 0.0320 0.0273 0.5000 4.5
83 4hlu:C 249 73 0.0587 0.0884 0.3014 4.5 4hlu:D, 4zir:B
84 4pht:B 442 21 0.0293 0.0249 0.5238 4.8 1p9r:A, 1p9w:A, 4pht:A, 4pht:C
85 4pj3:A 1335 52 0.0427 0.0120 0.3077 4.9 7a5p:U, 6icz:Q, 6id1:Q, 7w59:Q, 7w5a:Q, 7w5b:Q, 5xjc:Q
86 6gwu:A 208 49 0.0427 0.0769 0.3265 5.1 6gwu:B, 6gwu:C, 6gwu:D
87 7d08:B 263 46 0.0507 0.0722 0.4130 5.2 7d08:E, 7d09:B, 7d09:E, 7d0a:B, 7d0a:E, 6z5u:K, 6z5u:L
88 4hlu:A 265 66 0.0613 0.0868 0.3485 5.4 4hlu:B, 4zir:A
89 6w6j:D 707 44 0.0373 0.0198 0.3182 5.7 6dju:D, 6dju:E, 6djv:D, 6djv:E, 6djv:F, 7l6n:D, 7l6n:E, 7l6n:F, 6w6e:D, 6w6e:E, 6w6e:F, 6w6g:D, 6w6g:E, 6w6h:D, 6w6h:E, 6w6i:D, 6w6i:E, 6w6j:E
90 8egl:C 203 23 0.0267 0.0493 0.4348 6.0 8egl:A, 8egl:B, 8egl:D, 8egl:E, 8egl:F, 8egl:G, 8egl:H, 8egl:I, 8egl:J, 8egl:K, 8egl:L, 7u5f:A, 7u5f:B, 7u5f:C, 7u5f:D
91 4hi0:E 196 50 0.0373 0.0714 0.2800 6.1 4hi0:F
92 1xex:A 166 29 0.0373 0.0843 0.4828 6.3 3kta:A, 3kta:C
93 8xon:O 593 45 0.0373 0.0236 0.3111 6.3 8xon:S, 8xon:R, 8xon:Q, 8xon:P, 8xon:T, 8xoo:R, 8xoo:Q, 8xoo:P, 8xoo:T, 8xoo:S
94 5eg1:B 576 19 0.0240 0.0156 0.4737 6.3 5eg1:A, 5ofr:A, 5ofr:B, 4pl0:A, 4pl0:B, 8px9:A, 8px9:B
95 8xoo:O 572 45 0.0373 0.0245 0.3111 6.4
96 1g6h:A 254 74 0.0587 0.0866 0.2973 6.5 1g9x:A, 1g9x:B, 1g9x:C
97 4aim:A 698 52 0.0427 0.0229 0.3077 6.5 4aid:A, 4aid:B, 4aid:C, 4am3:A, 4am3:C, 4am3:B
98 8wm7:C 658 43 0.0533 0.0304 0.4651 7.0 8w9m:C
99 8e2l:C 461 23 0.0320 0.0260 0.5217 7.3 8e2l:A, 8e2l:B, 8e2l:D, 8e2l:E, 8e2l:F
100 6zww:C 749 109 0.0827 0.0414 0.2844 7.6 8po7:B, 8po8:A, 8po8:B, 6zww:A, 6zww:E, 6zww:G
101 8a8w:F 552 32 0.0320 0.0217 0.3750 7.7 8a8u:F, 8a8v:F
102 6rxt:CI 822 27 0.0347 0.0158 0.4815 8.4 6rxu:CI, 6rxv:CI, 6rxx:CI, 6rxy:CI, 6rxz:CI
103 6mfu:A 216 65 0.0560 0.0972 0.3231 8.9 6mfu:B, 6mfu:C, 6mfu:D
104 8a8w:D 577 45 0.0347 0.0225 0.2889 9.0 8a8u:B, 8a8u:C, 8a8u:D, 8a8u:E, 8a8u:A, 8a8v:B, 8a8v:C, 8a8v:D, 8a8v:E, 8a8v:A, 8a8w:A, 8a8w:B, 8a8w:C, 8a8w:E
105 7p06:A 1350 22 0.0400 0.0111 0.6818 9.0
106 8i3a:A 562 17 0.0267 0.0178 0.5882 9.2 8i39:A, 8i39:B, 8i3a:B, 8i3b:A, 8i3b:B, 8i3c:A, 8i3c:B, 8iwn:A, 8iwn:C, 8wam:A, 8wam:B, 8wba:A, 8wba:B
107 2ewv:A 343 21 0.0267 0.0292 0.4762 9.4 2eww:A, 2gsz:F
108 7jyp:A 305 44 0.0400 0.0492 0.3409 9.4
109 7p04:A 1353 22 0.0400 0.0111 0.6818 9.4 7p05:A
110 8ipr:A 504 18 0.0293 0.0218 0.6111 9.5 8ipr:D
111 1mv5:A 242 37 0.0453 0.0702 0.4595 9.6 1mv5:B, 1mv5:C, 1mv5:D
112 8xfc:D 517 80 0.0773 0.0561 0.3625 9.6 8wdb:D
113 5oql:Z 639 27 0.0347 0.0203 0.4815 9.9

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218