Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MKFVTASYNVGYPAYGAKFLNNDTLLVAGGGGEGNNGIPNKLTVLRVDPTKDTEKEQFHILSEFALEDNDDSPTAIDASK
GIILVGCNENSTKITQGKGNKHLRKFKYDKVNDQLEFLTSVDFDASTNADDYTKLVYISREGTVAAIASSKVPAIMRIID
PSDLTEKFEIETRGEVKDLHFSTDGKVVAYITGSSLEVISTVTGSCIARKTDFDKNWSLSKINFIADDTVLIAASLKKGK
GIVLTKISIKSGNTSVLRSKQVTNRFKGITSMDVDMKGELAVLASNDNSIALVKLKDLSMSKIFKQAHSFAITEVTISPD
STYVASVSAANTIHIIKLPLNYAN

The query sequence (length=344) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4h5j:B 347 344 1.0000 0.9914 1.0000 0.0 4h5i:A, 4h5i:B, 4h5j:A, 6x90:B
2 7d4i:BE 890 73 0.0669 0.0258 0.3151 0.28 7aju:UU, 6zqd:UU, 6zqf:UU
3 7d5s:BE 865 73 0.0669 0.0266 0.3151 0.30 7ajt:UU, 6ke6:BE, 6lqp:BE, 6lqq:BE, 6lqu:BE, 7suk:LT, 5wlc:LT, 6zqa:UU, 6zqb:UU, 6zqc:UU
4 5wyj:BE 753 73 0.0669 0.0305 0.3151 0.30 5wyk:BE
5 6lqs:BE 823 73 0.0669 0.0279 0.3151 0.31 7d63:BE, 6lqr:BE, 6lqt:BE, 6lqv:BE, 6nd4:T
6 5tzs:T 749 73 0.0669 0.0307 0.3151 0.31
7 5o9z:L 459 57 0.0494 0.0370 0.2982 0.47
8 5o9z:L 459 146 0.1047 0.0784 0.2466 8.8
9 2gje:D 147 84 0.0669 0.1565 0.2738 1.2
10 8hmc:B 1195 100 0.0756 0.0218 0.2600 2.0 8hmd:B
11 4v8m:A7 314 37 0.0407 0.0446 0.3784 3.8 8ove:A7
12 7ase:p 310 37 0.0407 0.0452 0.3784 4.2 5opt:p
13 4niy:D 195 26 0.0291 0.0513 0.3846 4.4 4niv:A
14 8fxq:B 329 98 0.0901 0.0942 0.3163 5.4 3apr:E, 4apr:E, 5apr:E, 6apr:E, 8fxq:A
15 1tgs:Z 225 26 0.0291 0.0444 0.3846 5.8 2a7h:A, 3a7t:A, 3a7v:A, 3a7w:A, 3a7x:A, 3a7y:A, 3a7z:A, 3a80:A, 3a81:A, 3a82:A, 3a83:A, 3a84:A, 3a85:A, 3a86:A, 3a87:A, 3a88:A, 3a89:A, 3a8a:A, 3a8b:A, 3a8c:A, 3a8d:A, 3aas:A, 3aau:A, 3aav:A, 3aav:B, 4ab8:A, 4ab9:A, 4aba:A, 4abb:A, 4abd:A, 4abe:A, 4abf:A, 4abg:A, 4abh:A, 4abi:A, 4abj:A, 2age:X, 2agg:X, 2agi:X, 2ah4:X, 7al8:E, 7al8:H, 7al8:Q, 7al8:T, 4aoq:A, 4aoq:B, 4aoq:C, 4aor:A, 4aor:B, 4aor:C, 1aq7:A, 3ati:A, 3atk:A, 3atl:A, 3atm:A, 1auj:A, 6avl:A, 2ayw:A, 7ays:A, 1az8:A, 4b1t:A, 4b1t:C, 4b2a:A, 4b2a:C, 4b2b:A, 4b2b:C, 4b2c:A, 4b2c:C, 6b6n:A, 6b6o:A, 6b6p:A, 6b6q:A, 6b6r:A, 6b6s:A, 6b6t:A, 6bfp:A, 1bju:A, 1bjv:A, 2blv:A, 2blw:A, 7brv:A, 7brw:A, 7brx:A, 7bry:A, 7brz:A, 7bs0:A, 7bs1:A, 7bs2:A, 7bs3:A, 7bs4:A, 7bs5:A, 7bs6:A, 7bs7:A, 7bs8:A, 7bs9:A, 7bsa:A, 1btp:A, 1btw:A, 1btx:A, 1bty:A, 1btz:A, 2btc:E, 3btd:E, 3bte:E, 3btf:E, 3btg:E, 3bth:E, 3btk:E, 3btm:E, 3btq:E, 3btt:E, 3btw:E, 6bvh:A, 2by5:X, 2by6:X, 2by7:X, 2by8:X, 2by9:X, 2bya:X, 2bza:A, 1c1n:A, 1c1o:A, 1c1p:A, 1c1q:A, 1c1r:A, 1c1s:A, 1c1t:A, 1c2d:A, 1c2e:A, 1c2f:A, 1c2g:A, 1c2h:A, 1c2i:A, 1c2j:A, 1c2k:A, 1c2l:A, 1c2m:A, 1c5p:A, 1c5q:A, 1c5r:A, 1c5s:A, 1c5t:A, 1c5u:A, 1c5v:A, 1ce5:A, 2cmy:A, 3d65:E, 2d8w:A, 6dwr:A, 6dzf:A, 6e5m:A, 3e8l:A, 3e8l:B, 6eat:A, 6eau:A, 6eav:A, 6eaw:A, 6eax:A, 1eb2:A, 5eg4:A, 1f0t:A, 1f0u:A, 1f2s:E, 2f3c:E, 5f6m:A, 2fi3:E, 2fi4:E, 2fi5:E, 6fid:A, 2ftl:E, 2ftm:A, 2fx4:A, 2fx6:A, 5fxl:A, 1g36:A, 1g3b:A, 1g3c:A, 1g3d:A, 1g3e:A, 2g55:A, 2g5n:A, 2g5v:A, 2g81:E, 2g8t:A, 1g9i:E, 1gbt:A, 1ghz:A, 1gi0:A, 1gi1:A, 1gi2:A, 1gi3:A, 1gi4:A, 1gi5:A, 1gi6:A, 5gib:A, 5gib:B, 1gj6:A, 4gux:A, 4gux:B, 4gux:C, 5gxp:A, 5gxp:B, 3gy2:A, 3gy3:A, 3gy4:A, 3gy5:A, 3gy6:A, 3gy7:A, 3gy8:A, 4hgc:A, 1hj9:A, 3i29:A, 4i8g:A, 4i8h:A, 4i8j:A, 4i8k:A, 4i8l:A, 3iti:A, 8iyv:A, 8izh:A, 8izi:A, 8izk:A, 1j8a:A, 2j9n:A, 1jir:A, 1jrs:A, 1jrt:A, 7jwx:A, 7jwx:C, 7jwx:B, 7jwx:D, 5jyi:A, 1k1i:A, 1k1j:A, 1k1l:A, 1k1m:A, 1k1n:A, 1k1o:A, 1k1p:A, 5k7r:A, 8kdu:A, 4kts:A, 4ktu:A, 5lgo:A, 5lh4:A, 5lh8:A, 3ljj:A, 3ljo:A, 1lqe:A, 3m35:A, 1max:A, 1may:A, 3mfj:A, 3mi4:A, 5mn1:A, 5mna:A, 5mnb:A, 5mnc:A, 5mne:A, 5mnf:A, 5mng:A, 5mnh:A, 5mnk:A, 5mnl:A, 5mnm:A, 5mnn:A, 5mno:A, 5mnp:A, 5mnq:A, 5mnx:A, 5mny:A, 5mnz:A, 5mo0:A, 5mo1:A, 5mo2:A, 5mon:A, 5moo:A, 5mop:A, 5moq:A, 5mor:A, 5mos:A, 6mrq:A, 1mts:A, 1mtu:A, 1mtv:A, 1mtw:A, 4mtb:A, 1n6x:A, 1n6y:A, 1nc6:A, 4ncy:A, 4niw:A, 4nix:A, 4niy:A, 4niy:B, 4niy:C, 3nk8:A, 3nkk:A, 1ntp:A, 1o2h:A, 1o2i:A, 1o2j:A, 1o2k:A, 1o2l:A, 1o2m:A, 1o2n:A, 1o2o:A, 1o2p:A, 1o2q:A, 1o2r:A, 1o2s:A, 1o2t:A, 1o2u:A, 1o2v:A, 1o2w:A, 1o2x:A, 1o2y:A, 1o2z:A, 1o30:A, 1o31:A, 1o32:A, 1o33:A, 1o34:A, 1o35:A, 1o36:A, 1o37:A, 1o38:A, 1o39:A, 1o3a:A, 1o3b:A, 1o3c:A, 1o3d:A, 1o3e:A, 1o3f:A, 1o3g:A, 1o3h:A, 1o3i:A, 1o3j:A, 1o3k:A, 1o3l:A, 1o3m:A, 1o3n:A, 1o3o:A, 2o9q:A, 2otv:A, 3otj:E, 1ox1:A, 2oxs:A, 1oyq:A, 1p2i:A, 1p2j:A, 1p2k:A, 7ph1:E, 2plx:A, 3plb:A, 3plk:A, 3plp:A, 3pm3:A, 3pmj:A, 1ppc:E, 1ppe:E, 1pph:E, 2ptc:E, 2ptn:A, 3ptb:A, 3ptn:A, 5ptp:A, 3pwb:A, 3pwc:A, 3pyh:A, 3q00:A, 7q0w:A, 7q0x:A, 1qa0:A, 1qb1:A, 1qb6:A, 1qb9:A, 1qbn:A, 1qbo:A, 1qcp:A, 6qih:A, 3qk1:A, 1ql7:A, 1ql8:A, 6ql0:A, 2qyi:A, 2qyi:C, 3rdz:A, 3rdz:B, 3ru4:T, 1rxp:A, 3rxa:A, 3rxb:A, 3rxc:A, 3rxd:A, 3rxe:A, 3rxf:A, 3rxg:A, 3rxh:A, 3rxi:A, 3rxj:A, 3rxk:A, 3rxl:A, 3rxm:A, 3rxo:A, 3rxp:A, 3rxq:A, 3rxr:A, 3rxs:A, 3rxt:A, 3rxu:A, 3rxv:A, 1s0q:A, 1s0r:A, 1sbw:A, 1sfi:A, 1smf:E, 6sux:A, 6sv0:A, 6sv6:A, 6sv8:A, 6sv9:A, 6svb:A, 6svd:A, 6svg:A, 6svi:A, 6svj:A, 6svn:A, 6svr:A, 6svu:A, 6svv:A, 6svw:A, 6svx:A, 6svz:A, 6sw0:A, 6swv:AAA, 6sy3:A, 6t0m:A, 6t0p:A, 3t25:A, 3t26:A, 3t27:A, 3t28:A, 3t29:A, 5t3h:A, 6t5w:A, 6t9u:A, 6t9v:A, 1taw:A, 1tgb:A, 1tgc:A, 1tgt:A, 2tga:A, 2tgd:A, 2tgp:Z, 2tgt:A, 1tio:A, 2tio:A, 1tld:A, 1tng:A, 1tnh:A, 1tni:A, 1tnj:A, 1tnk:A, 1tnl:A, 1tpa:E, 1tpo:A, 1tpp:A, 1tps:A, 2tpi:Z, 3tpi:Z, 4tpi:Z, 4tpy:A, 1tx7:A, 1tx8:A, 1tyn:A, 4u2w:A, 6u22:A, 3unq:A, 3uns:A, 3uop:A, 8uo7:A, 3upe:A, 3uqo:A, 3uqv:A, 1utn:A, 1uto:A, 1utp:A, 1utq:A, 8utl:A, 2uuy:A, 3uuz:A, 3uuz:B, 3uwi:A, 3uy9:A, 3uy9:B, 3uy9:C, 3uy9:D, 3uy9:E, 3uy9:F, 3uy9:G, 3uy9:H, 3uy9:I, 3uy9:J, 3uy9:K, 3uy9:L, 3uy9:M, 3uy9:N, 3uy9:O, 3uy9:P, 3v0x:A, 3v12:A, 3v13:A, 1v2j:T, 1v2k:T, 1v2l:T, 1v2m:T, 1v2n:T, 1v2o:T, 1v2p:T, 1v2q:T, 1v2r:T, 1v2s:T, 1v2t:T, 1v2u:T, 1v2v:T, 1v2w:T, 3veq:B, 7vo7:A, 7vo7:B, 3vpk:A, 6vxy:A, 7wa0:A, 7wa2:A, 7wb6:A, 7wb7:A, 7wb8:A, 7wb9:A, 7wba:A, 4xoj:A, 2xtt:B, 1xuf:A, 1xug:A, 1xuh:A, 1xui:A, 1xuj:A, 1xuk:A, 6xyg:A, 6xyk:A, 4y0y:E, 4y0z:E, 4y10:E, 4y11:E, 1y3u:A, 1y3v:A, 1y3w:A, 1y3x:A, 1y3y:A, 1y59:T, 1y5a:T, 1y5b:T, 1y5u:T, 6ydy:A, 6yis:A, 6yit:A, 6yiu:A, 6yiv:A, 6yiw:A, 6yix:A, 6yiy:A, 1yp9:A, 4yta:A, 1yyy:1, 6yza:A, 6yzc:A, 7z25:A, 7z2i:A, 2zdk:A, 2zdl:A, 2zdm:A, 2zdn:A, 2zfs:A, 2zft:A, 6zfj:A, 6zfk:A, 2zhd:A, 2zq1:A, 2zq2:A, 6zq2:A, 1zr0:A, 1zr0:C, 1zzz:A
16 7aju:UL 779 214 0.1424 0.0629 0.2290 8.5 5wyj:BB, 5wyk:BB, 6zqd:UL, 6zqe:UL, 6zqf:UL
17 4hsa:C 272 50 0.0407 0.0515 0.2800 8.8
18 6q6h:R 375 47 0.0436 0.0400 0.3191 8.9 5g04:R, 4ggd:A, 4ggd:B, 4n14:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218