BioLiP

>protein
MKFQYKEDHPFEYRKKEGEKIRKKYPDRVPVIVEKARVPDLDKRKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRPEDALFFFVNNT
IPPTSATMGQLYEDNHEEDYFLYVAYSDESVYGK

The query sequence (length=114) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5yip:A	123	117	1.0000	0.9268	0.9744	1.14e-78	7aa7:A, 7aa7:B, 7aa9:A, 7aa9:E, 7aa9:C, 7aa9:I, 7aa9:G, 7aa9:K, 7cdb:A, 7cdb:B, 6hoi:B, 6hoi:A, 6hol:A, 6hol:B, 7jhx:A, 7jhx:B, 2l8j:A, 5lxh:A, 5lxh:B, 5lxh:C, 5lxi:D, 5lxi:B, 8x8a:A, 6yoo:A
2	3dow:A	119	116	0.8596	0.8235	0.8448	2.11e-68	6a9x:D, 8afi:E, 8afi:G, 8afi:A, 8afi:I, 8afi:M, 8afi:O, 8afi:C, 8afi:K, 7bv4:A, 7bv4:E, 7bv4:B, 7bv4:G, 3d32:A, 3d32:B, 7ea7:B, 7fb5:A, 8t2n:A, 8t2n:C, 8t31:A, 8t31:C, 8t31:E, 8t31:G, 8t31:I, 8t32:A, 8t33:A, 7vec:A, 7vec:B, 7vec:C, 7vec:D, 7vec:E, 7vec:F, 7vec:G, 7vec:H, 7vec:I, 7vec:J, 7vec:L, 8w6a:A, 8w6a:G, 8w6a:B, 8w6a:D, 3wim:A, 4xc2:A, 4xc2:B, 4xc2:C, 4xc2:D, 5yir:D, 5yir:A, 5yir:B, 7zkr:A, 7zl7:C, 7zl7:A
3	5azf:A	119	116	0.7807	0.7479	0.7672	4.69e-61	5azf:B, 5azg:A, 5azg:B, 8tgf:A
4	6h8c:A	116	116	0.6140	0.6034	0.6034	1.79e-46
5	7brn:A	133	115	0.5526	0.4737	0.5478	2.30e-42	3vxw:A, 6wy6:A, 6wy6:B, 2zpn:A, 2zpn:D, 2zpn:B, 2zpn:C
6	5l83:B	112	110	0.5439	0.5536	0.5636	2.77e-42	5l83:A
7	6aaf:A	112	110	0.5351	0.5446	0.5545	1.00e-40
8	3h9d:B	116	113	0.4649	0.4569	0.4690	2.80e-35
9	5dpw:A	115	113	0.3772	0.3739	0.3805	4.94e-24	5dpw:C, 5dpw:E, 5dpw:G, 5dpw:I, 5dpw:K, 5dpw:M, 5dpw:O
10	4eoy:A	124	117	0.4123	0.3790	0.4017	5.59e-24	4eoy:B, 4eoy:C
11	5cx3:A	119	114	0.3421	0.3277	0.3421	7.44e-21	5cx3:B, 5cx3:C, 5cx3:D, 7r9w:A, 7r9z:A, 7ra0:A, 6tbe:A
12	5e6o:A	117	114	0.3509	0.3419	0.3509	5.03e-19	5e6o:B, 5e6o:C, 5e6o:D
13	7elg:A	122	113	0.3158	0.2951	0.3186	6.18e-18	5d94:A, 7ga8:A, 7ga9:A, 7gaa:A, 7gab:A, 7gac:A, 7gad:A, 7gae:A, 7gaf:A, 7gag:A, 7gah:A, 7gai:A, 7gaj:A, 7gak:A, 7gal:A, 7gam:A, 7gan:A, 7gao:A, 7gaq:A, 7gar:A, 7gas:A, 5gmv:B, 5gmv:A, 2k6q:A, 2lue:A, 2n9x:A, 8q7k:A, 8q7k:B, 5wrd:A, 5wrd:B, 5xad:A, 5xad:B, 5yiq:A, 5yis:B, 5yis:A, 2zjd:A, 2zjd:C
14	4naw:A	88	76	0.1754	0.2273	0.2632	0.11	4naw:E, 4naw:I, 4naw:M
15	1j78:B	447	31	0.1053	0.0268	0.3871	1.0	1j7e:A, 1j7e:B
16	5zz9:B	114	83	0.2018	0.2018	0.2771	1.9	1i7a:A, 1i7a:B, 1i7a:D, 5zz9:A, 5zz9:C
17	4ar9:A	392	70	0.1842	0.0536	0.3000	3.2	4ar8:A, 4ar8:B, 4ar9:B
18	7mjy:A	448	73	0.1754	0.0446	0.2740	3.7	7mjv:A, 7mjw:A, 7mjw:B, 7mjx:B, 7mjx:A, 7mjz:A
19	1glc:F	161	36	0.1053	0.0745	0.3333	6.4	1f3z:A, 1gle:F, 2mp0:B, 1o2f:A
20	4fix:A	629	49	0.1579	0.0286	0.3673	7.1	4fix:B, 4fiy:A, 4fiy:B
21	2vn0:A	464	32	0.1053	0.0259	0.3750	8.0	2nnh:A, 2nnh:B, 2nni:A, 2nnj:A, 1pq2:A, 1pq2:B
22	1ec9:D	444	18	0.0877	0.0225	0.5556	9.4	1ec7:A, 1ec7:B, 1ec7:C, 1ec7:D, 1ec8:A, 1ec8:B, 1ec8:C, 1ec8:D, 1ec9:A, 1ec9:B, 1ec9:C, 1ecq:A, 1ecq:B, 1ecq:C, 1ecq:D, 4gyp:A, 4gyp:B, 1jct:A, 1jct:B, 1jdf:A, 1jdf:B, 1jdf:C, 1jdf:D, 3pwg:A, 3pwg:B, 3pwg:C, 3pwg:D, 3pwi:A, 3pwi:B

[Back]