BioLiP

>protein
MKFDPQKYRELAEKDFEAAWKAGKEILAERSPNELYPRVGFSFGKEHPLFATIQRLREAYLSIGFSEVVNPLIVEDVHVK
KQFGREALAVLDRCFYLATLPKPNLKPISSTLTLRSHMTTGWFITLSHIADKLPLPIKLFSIDRCFRREQGEDATRLYTY
FSASCVLVDEELSVDDGKAVAEALLRQFGFENFRFRKDEKRSKYYIPDTQTEVFAFHPKLVGSSTKYSDGWIEIATFGIY
SPTALAEYDIPYPVMNLGLGVERLAMILYGYDDVRKMVYPQIHGEIKLSDLDIAREIKVKEVPQTAVGLKIAQSIVETAE
KHASEPSPCSFLAFEGEMMGRNVRVYVVEEEENTKLCGPAYANEVVVYKGDIYGIPKTKKWRSFFEEGVPTGIRYIDGFA
YYAARKVEEAAMREQEEVKVKARIVENLSDINLYIHENVRRYILWKKGKIDVRGPLFVTVKAEIE

The query sequence (length=465) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2du4:A	466	466	0.9957	0.9936	0.9936	0.0	2du3:B, 2du5:B, 2du6:B
2	2du3:A	534	380	0.7871	0.6854	0.9632	0.0	2du5:A, 2du6:A
3	2du3:A	534	105	0.2237	0.1948	0.9905	2.10e-65	2du5:A, 2du6:A
4	5x6c:A	539	376	0.4344	0.3748	0.5372	4.83e-125	5x6c:B
5	5x6c:A	539	105	0.1183	0.1020	0.5238	1.24e-31	5x6c:B
6	3l4g:C	508	170	0.1161	0.1063	0.3176	4.86e-15	3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
7	2rhs:C	271	255	0.1333	0.2288	0.2431	5.25e-14	2rhq:A, 2rhs:A
8	4p72:D	244	238	0.1204	0.2295	0.2353	2.85e-11	4p72:C, 4p73:C, 4p73:D, 4p74:C, 4p74:D, 4p75:C, 4p75:D
9	7by6:A	299	173	0.0989	0.1538	0.2659	2.32e-09
10	3pco:C	323	239	0.1204	0.1734	0.2343	1.82e-08	6oz5:A, 6oz5:C, 6p24:A, 6p26:A, 6p26:C, 3pco:A
11	7dpi:C	292	146	0.0796	0.1267	0.2534	1.10e-07	7dpi:A
12	6p8t:H	326	271	0.1419	0.2025	0.2435	3.77e-07	6p8t:C, 6p8t:D, 6p8t:G
13	7k98:A	343	258	0.1355	0.1837	0.2442	5.87e-06	7daw:A, 7db7:A, 7db8:A, 7k98:D, 7k9m:A, 7ka0:A, 7ka0:D, 7kab:A
14	2zni:A	279	226	0.1247	0.2079	0.2566	1.64e-05	2zni:B
15	1eiy:A	345	289	0.1419	0.1913	0.2284	2.93e-04	2akw:A, 2aly:A, 2amc:A, 1b70:A, 1b7y:A, 3hfz:A, 2iy5:A, 1jjc:A, 3teh:A, 4tva:A
16	7u0r:B	278	151	0.0753	0.1259	0.2318	0.029	8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
17	8dqj:A	251	150	0.0753	0.1394	0.2333	0.031
18	7v8u:A	258	49	0.0452	0.0814	0.4286	0.091
19	8cwp:A	327	63	0.0452	0.0642	0.3333	0.13
20	4cs3:A	270	229	0.0946	0.1630	0.1921	0.22	6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A
21	3q2t:A	205	62	0.0430	0.0976	0.3226	0.23	3bho:A, 3mdg:A, 3mdi:A, 3p6y:A, 3p6y:B, 3p6y:E, 3p6y:I, 3p6y:M, 3p6y:N, 3p6y:F, 3q2t:B, 5r4p:A, 5r4p:B, 5r4q:A, 5r4q:B, 5r4r:A, 5r4r:B, 5r4s:A, 5r4s:B, 5r4t:A, 5r4t:B, 5r4u:A, 5r4u:B, 5r64:A, 5r64:B, 5r65:A, 5r65:B, 5r66:A, 5r66:B, 5r67:A, 5r67:B
22	3fr8:B	517	91	0.0581	0.0522	0.2967	0.30	3fr7:A, 3fr7:B, 3fr8:A
23	6ynx:g	256	58	0.0387	0.0703	0.3103	0.84	6ynx:G, 6yny:g, 6yny:G, 6ynz:g, 6ynz:G, 6ynz:g3, 6ynz:G3
24	5mgu:A	407	49	0.0409	0.0467	0.3878	1.1	3cmq:A, 3hfv:A, 5mgh:A, 5mgw:A, 8p8x:A, 3teg:A, 3tup:A
25	3ial:B	505	122	0.0667	0.0614	0.2541	1.2	3ial:A
26	4bjh:B	291	85	0.0495	0.0790	0.2706	1.7	3d6n:B
27	3m4p:A	435	30	0.0344	0.0368	0.5333	1.8	3m4p:B, 3m4p:C, 3m4p:D
28	1xe8:A	189	56	0.0387	0.0952	0.3214	2.0
29	3a74:A	484	37	0.0323	0.0310	0.4054	2.0	3a74:B, 3a74:C, 3a74:D, 3e9h:A, 3e9h:B, 3e9h:C, 3e9h:D, 3e9i:A, 3e9i:B, 3e9i:C, 3e9i:D
30	5vyj:A	918	33	0.0301	0.0153	0.4242	2.0	1jqo:A, 1jqo:B, 6mgi:A, 6mgi:B, 5vyj:B, 5vyj:C, 5vyj:D
31	5hgq:B	482	37	0.0323	0.0311	0.4054	2.1	5hgq:A, 5hgq:D, 5hgq:C
32	5zh2:A	464	67	0.0387	0.0388	0.2687	2.3
33	3lnc:A	188	119	0.0710	0.1755	0.2773	2.9	3lnc:B
34	3rgl:A	292	63	0.0409	0.0651	0.3016	3.5	3rgl:B, 3ufg:A, 3ufg:B
35	7zhh:A	219	51	0.0323	0.0685	0.2941	3.8
36	4up7:A	529	37	0.0280	0.0246	0.3514	4.1	4up9:A, 4upa:A
37	3qis:A	293	56	0.0387	0.0614	0.3214	5.0
38	1c0a:A	585	70	0.0430	0.0342	0.2857	5.7	1il2:A, 1il2:B
39	4bxc:A	929	30	0.0280	0.0140	0.4333	6.7	4bxc:B, 3zgb:A, 3zgb:B, 3zge:A, 3zge:B
40	8hyj:A	1141	84	0.0409	0.0167	0.2262	6.8
41	7uy5:I	528	42	0.0280	0.0246	0.3095	7.3
42	7uy7:A	552	42	0.0280	0.0236	0.3095	7.9
43	4o6h:B	204	40	0.0280	0.0637	0.3250	8.2	8cnl:B, 8cnl:A, 8cnl:C, 8cnl:D, 8cnl:E, 8cnl:F, 8cnl:G, 8cnl:H, 4o6h:A, 4o6h:C, 4o6h:D, 4o6h:E, 4o6h:F, 4o6h:G, 4o6h:H, 4o6i:A, 4o6i:B
44	6wbd:B	485	29	0.0258	0.0247	0.4138	8.6	6wbd:A

[Back]