BioLiP

>protein
MKEVSGITALTVVVGTVIGAGIFFKPTAVYGAAGAPGLGLLAWFVAGIITIAGGLTVAEIGTIYPQTGGMMIYLEKVYGR
WLGFLVGWAQMVIYYPANIAALAIIFATQFVNLFALSDSTIVPTAILTSIFLMGVNFLGTKYSGWIQTLATILKLIPLVV
IIVAGLLYPGGGVIRLVPFSVETHPVLTSFGSALIATLFAYDGWINVGTLAGEMKNPGKMLPKVIIGGLSIVMAVYLLTN
IAYLFVLDSSQLAGTDTPAALVASHLFEGIGSKLVTIGILISVFGGINGYIISGLRVPYALATQKMLPFSDWFARINPKT
NLPINGGLVMLGIAIVMILTGQFNQLTDLIVFVIWFFITLTFIAVIILRKTQPDIERPYRVPFYPVIPLIAIIGGLYIIF
NTLIVQPKNAFIGILLTLIGIPIYFYCKKKYGS

The query sequence (length=433) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6f2w:A	433	433	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	7cmh:B	458	427	0.2887	0.2729	0.2927	1.42e-46	7b00:A, 7cmi:B
3	7dsk:B	464	434	0.3072	0.2866	0.3065	1.08e-45	7dsl:B, 7dsn:B, 7dsq:B, 8ida:B, 6irt:B, 8j8l:B, 8j8m:B, 8xpu:B
4	6li9:B	458	436	0.2771	0.2620	0.2752	1.81e-43	6li9:D
5	7p9u:B	455	412	0.2633	0.2505	0.2767	7.21e-42	7epz:B
6	6jmq:A	403	426	0.2910	0.3127	0.2958	8.88e-40
7	7nf6:B	455	438	0.2748	0.2615	0.2717	3.37e-39	7nf8:B
8	8wnt:B	463	434	0.2933	0.2743	0.2926	1.90e-36	8qey:A, 8wny:B
9	6f34:A	458	463	0.2633	0.2489	0.2462	4.77e-21	5oqt:A
10	5j4n:A	437	326	0.1848	0.1831	0.2454	5.33e-14	5j4n:B, 3l1l:A, 3ob6:A, 3ob6:B
11	5f05:C	211	116	0.0716	0.1469	0.2672	0.15	5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
12	1uoz:A	300	86	0.0531	0.0767	0.2674	1.4	1up0:A, 1up2:A, 1up3:A
13	6npl:A	861	73	0.0462	0.0232	0.2740	4.0	6nph:A, 6nph:B, 6npl:B
14	8ov6:C	217	60	0.0393	0.0783	0.2833	9.3	7aqt:A, 8bdt:A, 8bdt:E, 8bdx:A, 8bdx:E, 7c6p:A, 6c7q:A, 6c7r:A, 8cv4:B, 8cv4:A, 8cv6:A, 6duv:A, 6duv:B, 5egu:B, 5egu:C, 8ewv:D, 8ewv:H, 8ewv:L, 8ewv:P, 8ewv:T, 8ewv:X, 6ffd:A, 7fh2:B, 7fh2:C, 7fh2:D, 8g46:C, 8idh:A, 7jkz:A, 5jwm:A, 5jwm:B, 6ko2:A, 7ko0:A, 4kv4:A, 7la9:A, 7la9:D, 7la9:B, 7la9:F, 7la9:C, 7la9:E, 7mcf:A, 7mcf:B, 7oeo:AAA, 8r5h:F, 8rq9:B, 7ruh:A, 8rwz:A, 8rx0:A, 6sa3:A, 6sis:A, 6sis:E, 5t35:A, 5t35:E, 5u2c:A, 5u2c:B, 6u6l:A, 6u72:B, 6u74:C, 6u74:D, 6u8i:A, 6u8m:B, 5ueo:A, 5ueo:B, 5uep:A, 5ueq:A, 5uer:A, 5ues:A, 5uet:A, 5ueu:A, 5ueu:B, 5uev:A, 5uex:A, 5uey:A, 5uez:A, 6ulv:A, 6ulv:C, 6ulv:B, 6ulv:D, 5uoo:A, 7usj:A, 7usj:B, 3uvy:A, 5uvs:A, 5uvt:A, 5uvu:A, 5uvv:A, 5uvv:B, 5uvw:A, 5uvw:B, 5uvw:C, 5uvx:A, 5uvx:B, 5uvy:A, 5uvz:A, 3uw9:C, 3uw9:B, 3uw9:D, 6viw:A, 6viw:B, 6viw:C, 6vix:A, 6vix:C, 6vix:B, 6vix:D, 6viz:A, 6viz:B, 6viz:C, 7wjs:A, 7wjs:B, 7wjs:C, 7wky:A, 7wky:B, 7wky:C, 8wxy:A, 8wxy:B, 8wxy:C, 8wy3:A, 8wy3:B, 8wy3:C, 8wy7:A, 8wy7:B, 8wy7:C, 2yem:A, 2yem:B, 4z93:A, 5z9c:A, 7znt:H, 7znt:G

[Back]