BioLiP

>protein
MISGLSHITLIVKDLNKTTAFLQNIFNAEEIYSSGDKTFSLSKEKFFLIAGLWICIMEGDSLQERTYNHIAFQIQSEEVD
EYTERIKALGVEMKPERPRVQGEGRSIYFYDFDNHLFELHAGTLEERLKRY

The query sequence (length=131) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2p7p:A	131	131	1.0000	1.0000	1.0000	4.22e-96	2p7o:A, 2p7o:B, 2p7p:B, 2p7p:C, 2p7p:D, 2p7p:E, 2p7p:F, 2p7q:A, 2p7q:B, 2p7q:C, 2p7q:D, 2p7q:E, 2p7q:F
2	1r9c:A	125	130	0.5649	0.5920	0.5692	1.78e-53	1r9c:B
3	4jd1:B	148	135	0.3359	0.2973	0.3259	1.75e-18	5f6q:A, 5f6q:B, 4ir0:A, 4ir0:B, 4jd1:A
4	7n7g:A	138	135	0.3282	0.3116	0.3185	3.88e-17	7n7g:B
5	8dtd:A	138	135	0.2901	0.2754	0.2815	2.86e-15	8dtd:B, 8e7q:A, 8e7q:B, 8e7r:A, 8e7r:B, 8g7f:A, 8g7f:B, 8g7g:A, 8g7g:B, 8g7h:A, 8g7h:B, 8g7i:A, 8g7i:B, 4jh1:A, 4jh1:B, 4jh2:A, 4jh2:B, 4jh3:A, 4jh3:B, 4jh4:A, 4jh4:B, 4jh5:A, 4jh5:B, 4jh6:A, 4jh6:B, 4jh7:A, 4jh7:B, 4jh8:A, 4jh8:B, 4jh9:A, 4jh9:B
6	5vb0:C	143	133	0.3359	0.3077	0.3308	3.44e-15	5vb0:A, 5vb0:B, 5vb0:D, 5vb0:E, 5vb0:F, 5vb0:G, 5vb0:H, 5wep:A, 5wep:B
7	5wew:B	141	134	0.3435	0.3191	0.3358	8.72e-15	6c3u:A, 6c3u:B, 6c3u:C, 6c3u:D, 8r37:B, 8r37:A, 5v3d:A, 5v3d:B, 5v91:A, 5v91:B, 5wew:A, 5wew:C, 5wew:D, 5wew:F, 5wew:G, 5wew:H
8	4naz:A	130	134	0.3282	0.3308	0.3209	1.64e-12	4nay:A, 4nb0:A, 4nb0:B, 4nb1:B, 4nb1:A
9	1lqk:A	134	133	0.3206	0.3134	0.3158	4.18e-12	1lqk:B, 1lqo:A, 1lqo:B, 1lqp:A, 1lqp:B, 1nki:A, 1nki:B, 1nnr:A, 1nnr:B
10	5wew:E	119	128	0.3130	0.3445	0.3203	4.82e-10
11	6a4z:A	127	122	0.2366	0.2441	0.2541	3.10e-04	6a4z:B, 7w5e:A, 7w5e:B, 7w5e:C, 7w5e:D, 7wb2:A, 7wb2:B, 7wb2:C, 7wb2:D
12	1xqa:A	112	95	0.1908	0.2232	0.2632	4.90e-04	1xqa:B
13	8he6:B	120	59	0.1679	0.1833	0.3729	0.005
14	3oaj:A	310	119	0.2290	0.0968	0.2521	0.035	3oaj:B
15	7ax0:A	317	107	0.2137	0.0883	0.2617	0.11	7ax2:A
16	7ax0:A	317	107	0.2137	0.0883	0.2617	0.11	7ax2:A
17	5ify:A	293	58	0.1298	0.0580	0.2931	0.22	5ify:B, 5ify:C, 5ify:D, 5ify:E, 5ify:F
18	6qh4:C	138	29	0.0916	0.0870	0.4138	0.22	6qh4:A, 6qh4:B, 6qh4:D, 3rmu:A, 3rmu:B, 3rmu:C, 3rmu:D
19	3kol:A	146	132	0.2366	0.2123	0.2348	0.34
20	6a52:B	125	58	0.1298	0.1360	0.2931	0.38	6a52:A
21	6n0u:A	295	54	0.1298	0.0576	0.3148	0.38	6n0u:B, 6n0u:C, 6n0u:D
22	4ho9:A	294	33	0.0992	0.0442	0.3939	0.66	4ho3:A, 4ho4:A, 4ho5:A, 4ho5:B, 4ho6:A, 4ho8:A, 4ho8:B, 4ho8:C, 4ho8:D, 4ho9:B, 4hoc:A, 4hoc:B
23	8w7m:5	529	110	0.2214	0.0548	0.2636	0.68
24	3vmp:A	632	34	0.1069	0.0222	0.4118	1.4	3vmo:A
25	1mc3:A	291	44	0.0992	0.0447	0.2955	1.6	1mc3:B
26	6bge:A	323	34	0.1221	0.0495	0.4706	2.0	6bge:B, 1g6o:A, 1g6o:B, 1nly:A, 1nly:B
27	3uvf:A	255	73	0.1527	0.0784	0.2740	3.1	3uvf:B
28	5x51:M	1386	63	0.1450	0.0137	0.3016	5.3	5x4z:A, 5x51:A, 8yfr:A
29	4mh1:B	514	20	0.0763	0.0195	0.5000	5.3
30	6g88:C	597	47	0.1069	0.0235	0.2979	5.4	6g88:B
31	8a90:B	530	59	0.1221	0.0302	0.2712	5.7	8a90:A
32	6t7j:B	632	31	0.0916	0.0190	0.3871	6.2	6t7j:A, 6t7j:D
33	1ibq:A	325	53	0.1145	0.0462	0.2830	6.4	1ibq:B
34	8xd5:A	419	26	0.0840	0.0263	0.4231	6.7	8hho:A, 8hiq:A, 8hiz:A, 8hj9:A, 8xco:A, 8xcp:A, 8xcq:A, 8xcr:A, 8xcs:A, 8xct:A, 8xcu:A, 8xcv:A, 8xcw:A, 8xcx:A, 8xcy:A, 8xcz:A, 8xd0:A, 8xd1:A, 8xd2:A, 8xd3:A, 8xd4:A, 8xd6:A, 8znb:A, 8znc:A, 8znd:A, 8zne:A, 8zng:A

[Back]