BioLiP

>protein
MIRDIIRMGDKRLLRVAPQVTNLGSAELHALVSDMFETMGAAHGVGLAAPQIAVDLQLMVFGFEASERYPEAPAVPLTAL
ANAQIEPLSDEMENGWEGCLSIPGLRAVIPRYRYIRYRGFAPDGSPIEREAEGFHARVVQHEYDHLVGRLYPSRIENFDT
FGFDDVLSYD

The query sequence (length=170) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5cy7:A	171	170	1.0000	0.9942	1.0000	5.47e-125	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
2	5kob:A	171	167	0.6000	0.5965	0.6108	4.23e-73	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
3	6jfc:B	161	168	0.6235	0.6584	0.6310	5.17e-71	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
4	5hgw:A	174	167	0.5706	0.5575	0.5808	9.54e-65	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
5	1y6h:A	177	168	0.4176	0.4011	0.4226	1.01e-42	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
6	1bs4:A	168	148	0.3588	0.3631	0.4122	6.47e-27	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
7	1ix1:A	169	150	0.3235	0.3254	0.3667	1.59e-26	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
8	6jes:A	159	143	0.3176	0.3396	0.3776	3.27e-25	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
9	4dr8:A	188	167	0.3588	0.3245	0.3653	5.78e-25	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
10	6jex:A	172	147	0.3059	0.3023	0.3537	6.86e-23	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
11	6ck7:A	172	150	0.3176	0.3140	0.3600	6.21e-22	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
12	4wxl:C	165	143	0.3118	0.3212	0.3706	1.03e-21	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
13	5j46:A	169	148	0.3412	0.3432	0.3919	1.30e-21
14	3e3u:A	196	138	0.3059	0.2653	0.3768	2.32e-20
15	4je6:A	193	164	0.3235	0.2850	0.3354	3.44e-20	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
16	3fwx:A	165	148	0.2941	0.3030	0.3378	3.58e-20	3fwx:B
17	3g5k:A	183	173	0.3176	0.2951	0.3121	4.11e-20	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
18	1ws1:A	151	157	0.3529	0.3974	0.3822	7.16e-20
19	3oca:A	179	158	0.3000	0.2849	0.3228	2.17e-18	3oca:B, 3u04:A
20	3qu1:A	168	151	0.2882	0.2917	0.3245	3.67e-18	3qu1:B
21	3cpm:A	184	145	0.2765	0.2554	0.3241	1.11e-17	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
22	3uwb:A	149	147	0.2882	0.3289	0.3333	4.14e-17	3uwa:A
23	1jym:A	179	154	0.2471	0.2346	0.2727	1.62e-13	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
24	2ew5:A	166	170	0.2824	0.2892	0.2824	8.91e-13	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
25	2okl:A	185	182	0.3176	0.2919	0.2967	3.07e-12	2okl:B
26	6ow7:P	196	181	0.3176	0.2755	0.2983	2.82e-11	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
27	5mtc:A	137	122	0.2412	0.2993	0.3361	1.13e-10	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
28	5jex:A	203	188	0.3176	0.2660	0.2872	1.76e-10	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
29	1lqy:A	184	184	0.3235	0.2989	0.2989	3.35e-09
30	2os3:A	205	177	0.3176	0.2634	0.3051	3.60e-09
31	3cmd:B	188	180	0.2765	0.2500	0.2611	6.69e-08	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
32	3l87:A	200	175	0.2765	0.2350	0.2686	3.18e-07
33	2os1:A	179	182	0.2882	0.2737	0.2692	8.29e-07
34	1lm4:A	190	178	0.2765	0.2474	0.2640	3.89e-06	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
35	6y1x:A	252	65	0.1235	0.0833	0.3231	0.002	6y1x:B
36	5lu4:A	850	86	0.1235	0.0247	0.2442	0.73	5lu4:B
37	5jvl:A	874	86	0.1235	0.0240	0.2442	0.74	5jvj:A, 5jvl:C, 5jvl:D, 5jvn:A
38	3nfu:A	441	77	0.1471	0.0567	0.3247	0.92	3nfu:B
39	2e1q:A	1307	59	0.1176	0.0153	0.3390	1.3	6a7x:A, 6a7x:B, 6abu:A, 6abu:B, 6ac1:A, 6ac1:B, 6ac4:A, 6ac4:B, 6ad4:A, 6ad4:B, 6adj:A, 6adj:B, 6aju:A, 6aju:F, 3an1:A, 3an1:B, 3b9j:A, 3b9j:I, 2ckj:B, 2ckj:C, 2ckj:D, 2e1q:B, 2e1q:C, 2e1q:D, 2e3t:A, 2e3t:B, 3etr:A, 3etr:L, 3eub:A, 3eub:J, 3eub:S, 3eub:2, 1fiq:A, 3nrz:A, 3nrz:J, 3ns1:A, 3ns1:J, 3nvv:A, 3nvv:J, 3nvw:A, 3nvw:J, 3nvy:A, 3nvy:J, 3nvz:A, 3nvz:J, 3sr6:A, 3sr6:J, 1wyg:A, 4yrw:A, 4yrw:B, 4ysw:A, 4ysw:B, 4yty:A, 4yty:B, 4ytz:A, 4ytz:B
40	8j5k:5	169	70	0.1353	0.1361	0.3286	1.4	8j5k:0, 8w4o:5
41	5v2d:A	488	72	0.1412	0.0492	0.3333	2.3	5v2d:B, 5v2d:C, 5v2d:D
42	2wg7:A	121	41	0.0824	0.1157	0.3415	2.7	2wg7:B, 2wg8:A, 2wg8:B, 2wg8:C, 2wg9:A, 2wg9:B
43	7ooc:E	167	77	0.1118	0.1138	0.2468	6.0	7p6z:E, 7pah:E, 7pai:E, 7paj:E, 7pak:E, 7pal:E, 7pam:E, 7pan:E, 7pao:E, 7paq:E, 7par:E, 7pas:E, 7ph9:E, 7pha:E, 7phb:E, 7phc:E, 7pi8:E, 7pi9:E, 7pia:E, 7pib:E, 7pic:E, 7pio:E, 7pip:E, 7piq:E, 7pir:E, 7pis:E, 7pit:E
44	6bhu:A	1328	93	0.1706	0.0218	0.3118	6.4	5uja:A, 6uy0:A
45	8f4b:A	1182	93	0.1706	0.0245	0.3118	6.7

[Back]