BioLiP

>protein
MIRDIIRMGDKRLLRVAPQVTNLGSAELHALVSDMFETMGAAHGVGLAAPQIAVDLQLMVFGFEAPAVPLTALANAQIEP
LSDEMENGWEGCLSIPGLRAVIPRYRYIRYRGFAPDGSPIEREAEGFHARVVQHEYDHLVGRLYPSRIENFDTFGFDDVL

The query sequence (length=160) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5cy7:A	171	167	1.0000	0.9357	0.9581	2.55e-114	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
2	6jfc:B	161	161	0.6625	0.6584	0.6584	3.44e-72	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
3	5kob:A	171	167	0.6125	0.5731	0.5868	3.60e-67	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
4	5hgw:A	174	167	0.5875	0.5402	0.5629	2.88e-59	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
5	1y6h:A	177	168	0.4188	0.3785	0.3988	8.70e-37	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
6	1bs4:A	168	141	0.3563	0.3393	0.4043	8.82e-28	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
7	1ix1:A	169	143	0.3375	0.3195	0.3776	2.55e-27	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
8	4dr8:A	188	162	0.3625	0.3085	0.3580	5.23e-25	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
9	6ck7:A	172	143	0.3375	0.3140	0.3776	1.21e-23	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
10	4wxl:C	165	136	0.3312	0.3212	0.3897	2.58e-23	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
11	5j46:A	169	141	0.3375	0.3195	0.3830	3.16e-23
12	6jex:A	172	140	0.3125	0.2907	0.3571	6.27e-23	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
13	1ws1:A	151	150	0.3500	0.3709	0.3733	8.35e-22
14	3fwx:A	165	141	0.3063	0.2970	0.3475	2.04e-20	3fwx:B
15	3e3u:A	196	137	0.3125	0.2551	0.3650	3.20e-20
16	6jes:A	159	144	0.3000	0.3019	0.3333	5.18e-20	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
17	3g5k:A	183	173	0.3312	0.2896	0.3064	1.33e-19	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
18	4je6:A	193	163	0.3312	0.2746	0.3252	2.33e-19	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
19	3oca:A	179	159	0.3312	0.2961	0.3333	6.42e-19	3oca:B, 3u04:A
20	3cpm:A	184	140	0.2938	0.2554	0.3357	2.06e-18	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
21	3qu1:A	168	144	0.3000	0.2857	0.3333	2.29e-18	3qu1:B
22	3uwb:A	149	142	0.3000	0.3221	0.3380	1.04e-16	3uwa:A
23	2okl:A	185	177	0.3438	0.2973	0.3107	7.78e-13	2okl:B
24	2ew5:A	166	163	0.2938	0.2831	0.2883	1.01e-12	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
25	1jym:A	179	154	0.2500	0.2235	0.2597	2.99e-12	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
26	6ow7:P	196	181	0.3500	0.2857	0.3094	2.32e-11	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
27	5mtc:A	137	115	0.2500	0.2920	0.3478	5.46e-11	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
28	1lqy:A	184	179	0.3375	0.2935	0.3017	6.90e-10
29	3cmd:B	188	173	0.3000	0.2553	0.2775	7.50e-10	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
30	2os1:A	179	175	0.3125	0.2793	0.2857	9.52e-09
31	5jex:A	203	190	0.3312	0.2611	0.2789	1.04e-08	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
32	2os3:A	205	179	0.3250	0.2537	0.2905	1.26e-08
33	3l87:A	200	175	0.3000	0.2400	0.2743	6.86e-07
34	1lm4:A	190	169	0.2750	0.2316	0.2604	2.26e-06	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
35	6y1x:A	252	65	0.1313	0.0833	0.3231	0.003	6y1x:B
36	2e1q:A	1307	69	0.1437	0.0176	0.3333	0.13	6a7x:A, 6a7x:B, 6abu:A, 6abu:B, 6ac1:A, 6ac1:B, 6ac4:A, 6ac4:B, 6ad4:A, 6ad4:B, 6adj:A, 6adj:B, 6aju:A, 6aju:F, 3an1:A, 3an1:B, 3b9j:A, 3b9j:I, 2ckj:B, 2ckj:C, 2ckj:D, 2e1q:B, 2e1q:C, 2e1q:D, 2e3t:A, 2e3t:B, 3etr:A, 3etr:L, 3eub:A, 3eub:J, 3eub:S, 3eub:2, 1fiq:A, 3nrz:A, 3nrz:J, 3ns1:A, 3ns1:J, 3nvv:A, 3nvv:J, 3nvw:A, 3nvw:J, 3nvy:A, 3nvy:J, 3nvz:A, 3nvz:J, 3sr6:A, 3sr6:J, 1wyg:A, 4yrw:A, 4yrw:B, 4ysw:A, 4ysw:B, 4yty:A, 4yty:B, 4ytz:A, 4ytz:B
37	3nfu:A	441	56	0.1250	0.0454	0.3571	1.00	3nfu:B
38	4g2c:B	463	73	0.1688	0.0583	0.3699	1.6	4g2c:A
39	8j5k:5	169	69	0.1437	0.1361	0.3333	1.9	8j5k:0, 8w4o:5
40	7zr1:D	780	116	0.1938	0.0397	0.2672	2.4	7zr1:C
41	2wg7:A	121	41	0.0875	0.1157	0.3415	2.5	2wg7:B, 2wg8:A, 2wg8:B, 2wg8:C, 2wg9:A, 2wg9:B
42	8oha:B	336	61	0.1062	0.0506	0.2787	5.5	8oha:A, 8oha:C, 8oha:D, 8oha:E, 8oha:F, 8oha:G, 8oha:H
43	2ckj:A	1264	59	0.1125	0.0142	0.3051	6.0
44	4lhd:A	952	31	0.0813	0.0137	0.4194	8.3	4lhc:A, 4lhc:B, 4lhd:B

[Back]