Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MINAQLLQSMVDASNDGIVVAEKEGDDTILIYVNAAFEYLTGYSRDEILYQDCRFLQGDDRDQLGRARIRKAMAEGRPCR
EVLRNYRKDGSAFWNELSITPVKSDFDQRTYFIGIQKDVSRQVELERELAELRA

The query sequence (length=134) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7r56:A 137 134 0.9925 0.9708 0.9925 3.42e-96 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
2 7r5n:B 151 148 0.7463 0.6623 0.6757 3.41e-67 7r5n:A
3 7a6p:A 149 140 0.7313 0.6577 0.7000 4.48e-66 7a6p:B
4 8a6x:B 368 134 0.6791 0.2473 0.6791 9.41e-62 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
5 7yx0:A 166 134 0.6119 0.4940 0.6119 4.09e-58 7yx0:C
6 8c05:A 305 126 0.4104 0.1803 0.4365 8.10e-32
7 6hmj:A 359 136 0.4104 0.1532 0.4044 8.69e-30 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
8 2mwg:A 261 134 0.3806 0.1954 0.3806 2.32e-29 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
9 8pm1:A 109 105 0.3507 0.4312 0.4476 2.62e-29 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
10 4gcz:B 378 130 0.3507 0.1243 0.3615 2.58e-27 4gcz:A
11 8qi8:A 110 105 0.3284 0.4000 0.4190 6.11e-27 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
12 4r3a:A 318 119 0.3731 0.1572 0.4202 4.09e-26 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
13 2z6d:A 118 115 0.3209 0.3644 0.3739 1.87e-24 2z6d:B
14 2z6c:A 121 107 0.3134 0.3471 0.3925 7.79e-23 2z6c:B
15 4r3a:B 278 116 0.3507 0.1691 0.4052 1.89e-22
16 7oo9:A 106 104 0.3657 0.4623 0.4712 4.37e-22 7oo9:B
17 6t74:B 141 105 0.3209 0.3050 0.4095 2.92e-21 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
18 8j68:A 129 113 0.3209 0.3333 0.3805 1.28e-20 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
19 6i21:A 135 114 0.2910 0.2889 0.3421 1.63e-20 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
20 8a5r:AAA 206 116 0.3134 0.2039 0.3621 4.23e-20 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
21 6ph4:B 460 110 0.3358 0.0978 0.4091 1.37e-19 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
22 5svu:B 135 126 0.3358 0.3333 0.3571 1.81e-19 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
23 3ue6:E 138 103 0.2687 0.2609 0.3495 2.03e-18 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
24 4hhd:A 152 118 0.2985 0.2632 0.3390 5.86e-18 4hhd:B
25 7qf2:AAA 117 101 0.2910 0.3333 0.3861 7.42e-18 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
26 7wa4:B 107 101 0.2836 0.3551 0.3762 1.02e-17
27 6gb3:A 120 109 0.3209 0.3583 0.3945 4.21e-17 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
28 4eeu:A 109 99 0.2836 0.3486 0.3838 7.84e-17 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
29 4hj6:B 178 115 0.2985 0.2247 0.3478 1.43e-16 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
30 2wkp:A 320 117 0.2910 0.1219 0.3333 6.27e-16 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
31 1g28:A 104 102 0.2612 0.3365 0.3431 4.89e-15 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
32 5hzh:A 320 120 0.3060 0.1281 0.3417 9.32e-15
33 7tbq:A 375 105 0.2761 0.0987 0.3524 1.19e-14 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
34 5hzi:A 476 124 0.3060 0.0861 0.3306 2.01e-14 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
35 7tcd:A 436 100 0.2687 0.0826 0.3600 9.78e-14 4wf0:A, 4wf0:B
36 3hjk:A 150 125 0.2910 0.2600 0.3120 1.03e-12 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
37 4wuj:C 145 99 0.2239 0.2069 0.3030 8.28e-12 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
38 2gj3:A 119 91 0.2015 0.2269 0.2967 1.14e-11 2gj3:B
39 3ewk:A 227 121 0.2761 0.1630 0.3058 5.48e-10
40 3ewk:A 227 107 0.2313 0.1366 0.2897 6.58e-09
41 7yid:A 660 97 0.1866 0.0379 0.2577 6.81e-06 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
42 1d06:A 130 118 0.2313 0.2385 0.2627 1.20e-05 1ew0:A
43 8dik:A 127 73 0.1194 0.1260 0.2192 6.89e-04 8dik:B
44 1s66:L 119 97 0.2090 0.2353 0.2887 0.001 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
45 6pl0:B 608 101 0.1642 0.0362 0.2178 0.068 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
46 7rzw:B 864 61 0.1269 0.0197 0.2787 0.53 7rzw:A
47 5olp:A 432 40 0.1194 0.0370 0.4000 0.86 5olp:B
48 5twb:A 344 56 0.1194 0.0465 0.2857 1.7 6a4j:A, 6a4j:B, 5twc:A
49 4ebk:A 257 19 0.0597 0.0311 0.4211 3.1 4ebk:B
50 2bgg:B 394 34 0.0896 0.0305 0.3529 4.1 2w42:B
51 8ok9:A 430 34 0.0896 0.0279 0.3529 4.4 2bgg:A, 8pvv:A, 8qg0:A, 6t5t:A, 6tuo:A, 2w42:A, 6xu0:A, 6xu0:B, 6xup:A, 6xup:B, 1ytu:A, 1ytu:B
52 6a2p:B 551 89 0.1642 0.0399 0.2472 9.3 6a2k:A, 6a2k:B, 6a2l:A, 6a2m:A, 6a2m:B, 6a2n:A, 6a2n:B, 6a2o:A, 6a2o:B, 6a2p:A, 7ctw:A, 7ctw:B, 7cty:A, 7cty:B, 7ctz:A, 7ctz:B, 3dg8:A, 3dg8:B, 3dg8:C, 3dg8:D, 3dga:A, 3dga:B, 3dga:C, 3dga:D, 4dp3:A, 4dp3:B, 4dpd:A, 4dpd:B, 4dph:A, 4dph:B, 7f3y:A, 7f3y:B, 7f3z:A, 7f3z:B, 1j3i:A, 1j3i:B, 1j3i:C, 1j3i:D, 1j3j:A, 1j3j:B, 1j3j:C, 1j3j:D, 1j3k:A, 1j3k:B, 1j3k:C, 1j3k:D, 8jfb:A, 8jfb:B, 8jfc:A, 8jfc:B, 8jfd:A, 8jfd:B, 3jsu:A, 3jsu:B, 6kot:A, 6kot:B, 6kp2:B, 6kp7:A, 6kp7:B, 6kpr:A, 6kpr:B, 6leu:A, 6leu:B, 6lev:A, 6lev:B, 6lez:A, 6lez:B, 6lh9:A, 6lh9:B, 6lhi:A, 6lhi:B, 6lhj:A, 6lhj:B, 3qg2:A, 3qg2:B, 3qgt:A, 3qgt:B, 3um5:A, 3um5:B, 3um6:A, 3um6:B, 3um8:A, 3um8:B, 8wgm:A, 8wgm:B, 8yq8:A, 8yq9:A, 8yq9:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218