Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MINAKLMQLVINASNDGIVVAEREGKDKPLIYVNPAFERLTGYTLDEILYQDCRFLQSGDRDQPALMAIRETLESGGACR
EILRNYRKDGSHFWNELSLSTVYNEADKQTYFVGVQKDVTLQVKAQQRVGQLEAELNQVKAELAALKATS

The query sequence (length=150) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7yx0:A 166 148 0.9867 0.8916 1.0000 8.21e-110 7yx0:C
2 7r5n:B 151 150 0.7333 0.7285 0.7333 1.55e-75 7r5n:A
3 7a6p:A 149 140 0.5933 0.5973 0.6357 1.70e-65 7a6p:B
4 8a6x:B 368 140 0.5733 0.2337 0.6143 2.17e-60 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
5 7r56:A 137 134 0.5400 0.5912 0.6045 1.29e-57 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
6 6hmj:A 359 133 0.3867 0.1616 0.4361 5.17e-32 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
7 8c05:A 305 126 0.3333 0.1639 0.3968 2.98e-31
8 4gcz:B 378 130 0.3333 0.1323 0.3846 3.88e-26 4gcz:A
9 8pm1:A 109 104 0.3000 0.4128 0.4327 1.72e-25 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
10 2mwg:A 261 125 0.3133 0.1801 0.3760 1.74e-24 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
11 8qi8:A 110 103 0.2933 0.4000 0.4272 2.67e-24 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
12 2z6c:A 121 104 0.2800 0.3471 0.4038 2.20e-22 2z6c:B
13 6t74:B 141 108 0.2800 0.2979 0.3889 1.68e-21 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
14 6ph4:B 460 121 0.3000 0.0978 0.3719 3.89e-21 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
15 4r3a:A 318 129 0.3000 0.1415 0.3488 3.92e-21 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
16 6i21:A 135 103 0.2600 0.2889 0.3786 6.52e-21 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
17 7oo9:A 106 104 0.3000 0.4245 0.4327 1.26e-20 7oo9:B
18 6gb3:A 120 102 0.2733 0.3417 0.4020 1.43e-19 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
19 5svu:B 135 116 0.2733 0.3037 0.3534 1.35e-18 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
20 2z6d:A 118 103 0.2267 0.2881 0.3301 1.57e-18 2z6d:B
21 3ue6:E 138 103 0.2467 0.2681 0.3592 1.77e-18 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
22 4hj6:B 178 110 0.2733 0.2303 0.3727 3.87e-18 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
23 7wa4:B 107 101 0.2733 0.3832 0.4059 8.77e-18
24 4r3a:B 278 129 0.3000 0.1619 0.3488 1.87e-17
25 8j68:A 129 95 0.2133 0.2481 0.3368 6.19e-16 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
26 2wkp:A 320 116 0.2600 0.1219 0.3362 8.79e-16 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
27 4hhd:A 152 107 0.2400 0.2368 0.3364 1.03e-15 4hhd:B
28 8a5r:AAA 206 147 0.3267 0.2379 0.3333 1.05e-15 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
29 7qf2:AAA 117 101 0.2333 0.2991 0.3465 5.06e-15 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
30 1g28:A 104 102 0.2267 0.3269 0.3333 6.87e-15 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
31 7tbq:A 375 107 0.2333 0.0933 0.3271 1.86e-14 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
32 5hzi:A 476 115 0.2533 0.0798 0.3304 2.12e-14 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
33 5hzh:A 320 116 0.2533 0.1187 0.3276 2.22e-14
34 4eeu:A 109 99 0.2267 0.3119 0.3434 2.99e-14 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
35 7tcd:A 436 94 0.2200 0.0757 0.3511 1.94e-13 4wf0:A, 4wf0:B
36 4wuj:C 145 99 0.1867 0.1931 0.2828 9.90e-13 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
37 3hjk:A 150 111 0.2133 0.2133 0.2883 2.53e-11 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
38 3ewk:A 227 121 0.2400 0.1586 0.2975 7.80e-10
39 3ewk:A 227 108 0.1667 0.1101 0.2315 1.12e-08
40 2gj3:A 119 91 0.1800 0.2269 0.2967 2.81e-09 2gj3:B
41 7yid:A 660 122 0.2067 0.0470 0.2541 1.64e-08 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
42 1s66:L 119 96 0.1933 0.2437 0.3021 2.08e-06 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
43 8dik:A 127 65 0.1267 0.1496 0.2923 7.94e-06 8dik:B
44 5xgd:A 548 40 0.0933 0.0255 0.3500 0.054 8pps:A, 8pps:B, 5xge:A
45 8js5:B 253 55 0.1133 0.0672 0.3091 0.075 2cmn:A, 1dp6:A, 1dp8:A, 1dp9:A, 1drm:A, 8js5:A, 8js5:C, 8js5:D, 8js5:E, 8js5:F, 8js5:G, 8js5:H, 8js5:I, 8js5:J, 8js6:A, 8js6:B, 8js6:C, 8js6:D, 8js6:E, 8js6:F, 8js6:G, 8js6:H, 8js6:I, 8js6:J, 8js7:A, 8js7:B, 8js7:C, 8js7:D, 8js7:E, 8js7:F, 8js7:G, 8js7:H, 8js7:I, 8js7:J, 1lsv:A, 1lsw:A, 1lsx:A, 1lt0:A, 2owh:A, 2owj:A, 2vv6:A, 2vv6:D, 2vv6:B, 2vv6:C, 2vv7:A, 2vv7:B, 2vv7:C, 2vv7:D, 2vv8:A, 2vv8:D, 2vv8:B, 2vv8:C, 1xj2:A, 1xj3:A, 1xj4:A, 1xj4:B, 1xj6:A, 1xj6:B, 1y28:A
46 5jqk:A 631 73 0.1467 0.0349 0.3014 0.57 5jqk:B, 5jr6:A
47 3dws:B 304 54 0.1133 0.0559 0.3148 0.93 3dwr:A, 3dws:A
48 1ix1:A 169 31 0.0733 0.0651 0.3548 2.5 1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
49 5e7g:A 446 66 0.1267 0.0426 0.2879 2.9
50 6jex:A 172 27 0.0733 0.0640 0.4074 4.3 6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218