Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MILDTDYITEDGKPVIRIFKKENGEFKIEYDRTFEPYLYALLKDDSAIEEVKKITAERHGTVVTVKRVEKVQKKFLGRPV
EVWKLYFTHPQDVPAIMDKIREHPAVIDIYEYDIPFAIRYLIDKGLVPMEGDEELKLLAFDIETLYHEGEEFAEGPILMI
SYADEEGARVITWKNVDLPYVDVVSTEREMIKRFLRVVKEKDPDVLITYDGDNFDFAYLKKRCEKLGINFALGRDGSEPK
IQRMGDRFAVEVKGRIHFDLYPVIRRTINLPTYTLEAVYEAVFGQPKEKVYAEEITTAWETGENLERVARYSMEDAKVTY
ELGKEFLPMEAQLSRLIGQSLWDVSRSSTGNLVEWFLLRKAYERNELAPNKPDEKELARRHQSHEGGYIKEPERGLWENI
VYLDFRSLYPSIIITHNVSPDTLNREGCKEYDVAPQVGHRFCKDFPGFIPSLLGDLLEERQKIKKRMKATIDPIERKLLD
YRQRAIKILANSLYGYYGYARARWYCKECAESVIAWGREYLTMTIKEIEEKYGFKVIYSDTDGFFATIPGADAETVKKKA
MEFLKYINAKLPGALELEYEGFYKRGLFVTKKKYAVIDEEGKITTRGLEIVRRDWSEIAKETQARVLEALLKDGDVEKAV
RIVKEVTEKLSKYEVPPEKLVIHKQITRDLKDYKATGPHVAVAKRLAARGVKIRPGTVISYIVLKGSGRIVDRAIPFDEF
DPTKHKYDAEYYIEKQVLPAVERILRAFGYRKEDLR

The query sequence (length=756) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6wya:A 756 756 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6wyb:A
2 4k8x:A 759 756 0.8889 0.8854 0.8889 0.0 6is7:A, 6is7:B, 6isf:A, 6isf:B, 6isg:A, 6ish:A, 6isi:A, 4k8z:A, 5omf:A, 5omq:A, 5omv:A, 7om3:A, 7omb:A, 7omg:A, 6q4t:A, 7rsr:A, 7rss:A, 7rsu:A, 8t3x:A, 7tqw:A, 5vu6:A, 5vu7:A, 5vu9:A
3 7b0h:F 762 756 0.8889 0.8819 0.8889 0.0 7b07:A, 7b08:A, 7b0f:A, 7b0g:A, 7b0h:E, 1qqc:A, 5vu8:A, 2vwj:A, 2xhb:A
4 1d5a:A 733 756 0.8294 0.8554 0.8294 0.0
5 4flu:A 758 757 0.7950 0.7929 0.7939 0.0 4flt:A, 4flv:A, 4flw:A, 4flx:A, 4fly:A, 4flz:A, 4fm0:A, 4fm1:A, 4fm2:A
6 4ail:C 750 754 0.7698 0.7760 0.7719 0.0 2jgu:A
7 5mdn:A 761 796 0.3638 0.3614 0.3455 4.12e-125 5mdn:B
8 7kc0:A 1004 847 0.2857 0.2151 0.2550 5.26e-59 3iay:A, 6p1h:A
9 8v6g:A 1050 593 0.2381 0.1714 0.3035 2.34e-57 8v6h:A, 8v6i:A, 8v6j:A
10 6s1m:A 1010 710 0.2526 0.1891 0.2690 3.69e-57 6s1n:A, 6s1o:A, 6tny:A, 6tnz:A
11 8g99:A 1063 593 0.2354 0.1675 0.3002 6.29e-55 8g9f:A, 8g9l:A, 8g9n:A, 8g9o:A, 8ucu:A, 8ucv:A, 8ucw:A, 8v5m:A, 8v5n:A, 8v5o:A
12 7opl:A 1070 666 0.2474 0.1748 0.2808 6.68e-54 6as7:A, 9c8v:C, 8d96:C, 8d9d:C, 5exr:C, 5exr:G, 5iud:A, 5iud:D, 5iud:G, 5iud:J, 7n2m:A, 4q5v:A, 4q5v:E, 4qcl:A, 8qj7:A, 7u5c:C, 8vy3:C, 4y97:B, 4y97:D, 4y97:F, 4y97:H
13 8fok:1 1046 602 0.2235 0.1616 0.2807 1.22e-46 3flo:B, 3flo:D, 3flo:F, 3flo:H, 4fxd:A, 4fxd:B, 4fyd:A, 4fyd:B
14 8tlq:A 1283 623 0.2090 0.1231 0.2536 2.95e-43 8tlt:A, 6v93:A
15 7s0t:A 1231 613 0.2024 0.1243 0.2496 8.29e-41
16 3k57:A 782 704 0.2328 0.2251 0.2500 1.30e-40 3k58:A, 3k59:A, 3k5l:A, 3k5m:A, 3maq:A
17 8v1q:A 1097 638 0.2235 0.1541 0.2649 3.65e-40 8exx:A, 7luf:A, 7luf:B, 8oj6:A, 8oj7:A, 8ojb:A, 8ojd:A, 8v1r:A, 8v1s:A, 8vq2:A, 8vq2:B
18 3k5n:A 759 685 0.2288 0.2279 0.2526 1.31e-39
19 7lxd:A 1190 607 0.2037 0.1294 0.2537 2.41e-39 6v8p:A
20 1s5j:A 727 700 0.2487 0.2586 0.2686 2.69e-39
21 8v1t:A 1064 638 0.2222 0.1579 0.2633 3.16e-39
22 9enp:A 1072 629 0.2143 0.1511 0.2576 8.29e-35 9enq:A, 8oja:A
23 8d0b:F 915 542 0.1878 0.1552 0.2620 1.21e-33 8d0k:F
24 7uy7:E 783 456 0.1667 0.1609 0.2763 4.22e-32
25 8wpe:A 1006 330 0.1071 0.0805 0.2455 2.80e-17 8hg1:A, 8hpa:A, 8j86:A, 8j8f:A, 8j8g:A, 8k8s:A, 8k8u:A, 5n2g:A, 8wpf:A, 8wpk:A, 8wpp:A
26 8wpe:A 1006 123 0.0450 0.0338 0.2764 0.33 8hg1:A, 8hpa:A, 8j86:A, 8j8f:A, 8j8g:A, 8k8s:A, 8k8u:A, 5n2g:A, 8wpf:A, 8wpk:A, 8wpp:A
27 6s2e:A 1006 443 0.1376 0.1034 0.2348 9.83e-16 6s2f:A
28 6s2e:A 1006 330 0.0966 0.0726 0.2212 5.92e-07 6s2f:A
29 6g0a:A 1104 464 0.1429 0.0978 0.2328 5.73e-15 8b67:A, 6fwk:B, 6i8a:B, 7r3y:B
30 6g0a:A 1104 372 0.1071 0.0734 0.2177 2.03e-06 8b67:A, 6fwk:B, 6i8a:B, 7r3y:B
31 9b8t:A 1146 481 0.1468 0.0969 0.2308 4.99e-13 9b8s:A, 9f6d:A, 9f6e:A, 9f6f:A, 9f6i:A, 9f6j:A, 9f6k:A, 9f6l:A
32 9b8t:A 1146 312 0.1085 0.0716 0.2628 1.11e-09 9b8s:A, 9f6d:A, 9f6e:A, 9f6f:A, 9f6i:A, 9f6j:A, 9f6k:A, 9f6l:A
33 4m8o:A 1126 471 0.1402 0.0941 0.2251 1.52e-12 8b6k:A, 8b6k:B, 8b76:B, 8b76:A, 8b77:A, 8b79:B, 8b79:A, 8b7e:B, 8b7e:A, 6fwk:A, 6h1v:A, 6i8a:A, 5oki:B, 4ptf:A, 6qib:A, 7r3x:A, 7r3y:A, 8tw9:E, 8twa:E
34 4m8o:A 1126 338 0.0992 0.0666 0.2219 2.67e-06 8b6k:A, 8b6k:B, 8b76:B, 8b76:A, 8b77:A, 8b79:B, 8b79:A, 8b7e:B, 8b7e:A, 6fwk:A, 6h1v:A, 6i8a:A, 5oki:B, 4ptf:A, 6qib:A, 7r3x:A, 7r3y:A, 8tw9:E, 8twa:E
35 2oyq:A 848 411 0.1270 0.1132 0.2336 2.24e-10 4i9q:A, 2oyq:B, 2p5g:B, 2p5o:B
36 8ojc:A 395 188 0.0661 0.1266 0.2660 8.94e-10
37 4i9q:B 873 435 0.1296 0.1123 0.2253 1.50e-07 4khn:B, 2p5o:A, 2p5o:C
38 3cfo:A 906 424 0.1217 0.1015 0.2170 1.64e-07 2atq:A, 3cfp:A, 3cfr:A, 1clq:A, 3cq8:A, 2dtu:A, 2dtu:B, 2dtu:C, 2dtu:D, 4dtj:A, 4dtm:A, 4dtn:A, 4dto:A, 4dtp:A, 4dtr:A, 4dts:A, 4dtu:A, 4dtx:A, 4du1:A, 4du3:A, 4du4:A, 2dy4:A, 2dy4:B, 2dy4:C, 2dy4:D, 4e3s:A, 7f4y:A, 7f4y:B, 4fj5:A, 4fj7:A, 4fj8:A, 4fj9:A, 4fjg:A, 4fjh:A, 4fji:A, 4fjj:A, 4fjk:A, 4fjl:A, 4fjm:A, 4fjn:A, 4fjx:A, 4fk0:A, 4fk2:A, 4fk4:A, 4i9l:A, 1ig9:A, 1ih7:A, 4j2a:A, 4j2b:A, 4j2d:A, 4j2e:A, 3kd1:E, 3kd5:E, 4khn:A, 4khq:A, 4khs:A, 4khu:A, 4khw:A, 4khy:A, 4ki4:A, 4ki6:A, 3l8b:A, 3l8b:B, 3lds:A, 3lzi:A, 3lzj:A, 4m3r:A, 4m3t:A, 4m3u:A, 4m3w:A, 4m3x:A, 4m3y:A, 4m3z:A, 4m41:A, 4m42:A, 4m45:A, 3nae:A, 3nci:A, 3ndk:A, 3ne6:A, 3ngi:A, 3nhg:A, 2oyq:C, 2oyq:D, 2ozm:A, 2ozs:A, 2p5g:A, 2p5g:C, 2p5g:D, 1q9x:A, 1q9x:B, 1q9x:C, 1q9x:D, 1q9y:A, 3qei:A, 3qep:A, 3qer:A, 3qes:A, 3qet:A, 3qev:A, 3qew:A, 3qex:A, 3qnn:A, 3qno:A, 3rma:A, 3rma:B, 3rma:C, 3rma:D, 3rmb:A, 3rmb:B, 3rmb:C, 3rmb:D, 3rmc:A, 3rmc:B, 3rmc:C, 3rmc:D, 3rmd:A, 3rmd:B, 3rmd:C, 3rmd:D, 3rwu:A, 3s9h:A, 3scx:A, 3si6:A, 3sjj:A, 3snn:A, 3spy:A, 3spz:A, 3sq0:A, 3sq1:A, 3sq2:A, 3sq4:A, 3sun:A, 3suo:A, 3sup:A, 3suq:A, 3tab:A, 3tab:B, 3tab:C, 3tab:D, 3tae:A, 3tae:C, 3tae:B, 3tae:D, 3taf:A, 3taf:B, 3taf:C, 3taf:D, 3tag:A, 3tag:C, 3tag:B, 3tag:D, 3uiq:A, 1waf:A, 1waf:B, 1waj:A
39 8qma:J 426 75 0.0304 0.0540 0.3067 0.69 8r5o:L, 8r6s:L, 8ras:L, 8rdj:L
40 7u1b:A 403 75 0.0344 0.0645 0.3467 1.2
41 5n28:B 443 57 0.0238 0.0406 0.3158 2.3 5n28:E, 5n2a:B
42 1noy:B 346 96 0.0278 0.0607 0.2188 2.5
43 6to1:A 566 97 0.0357 0.0477 0.2784 2.6 6tnj:A
44 6ih6:A 330 46 0.0225 0.0515 0.3696 2.7 6ih3:A, 6ih5:B, 6ih6:B
45 6geh:A 256 49 0.0172 0.0508 0.2653 3.0
46 1kzl:A 202 106 0.0344 0.1287 0.2453 3.4
47 2zxp:A 648 46 0.0238 0.0278 0.3913 3.6 1ir6:A
48 8ag6:A 896 82 0.0317 0.0268 0.2927 3.7 2o8b:A, 2o8c:A, 2o8d:A, 2o8e:A, 2o8f:A, 8olx:A, 8om9:A, 8oma:A, 8omq:A, 3thw:A, 3thx:A, 3thy:A, 3thz:A
49 8om5:A 828 82 0.0317 0.0290 0.2927 3.8 8omo:A
50 7rgf:A 418 58 0.0238 0.0431 0.3103 3.8 7jgz:A, 7rgf:B
51 5hq4:A 662 39 0.0172 0.0196 0.3333 4.2 5hqa:A, 5hqb:A, 5hqc:A
52 6tg9:B 493 27 0.0159 0.0243 0.4444 4.5 6tg9:F, 6tga:B, 6tga:F
53 1igt:B 444 103 0.0384 0.0653 0.2816 5.1 1igt:D, 2otu:B, 2otu:D, 2otu:F, 2otu:H, 2otw:B, 2otw:D, 2qhr:H, 6uqc:C, 6uqc:D, 6uqc:F, 5vaa:A, 5vaa:B, 3zo0:A
54 8c8v:A 1032 95 0.0357 0.0262 0.2842 5.5 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
55 4iw3:B 380 71 0.0265 0.0526 0.2817 8.4 4iw3:K, 4j0q:A, 4j0q:B, 4j0q:C, 4j0q:D, 4j0q:E
56 6i97:A 763 33 0.0172 0.0170 0.3939 9.3 8b43:A, 6i96:A, 6i97:B, 6i98:A, 6z8a:A
57 4c2u:A 658 181 0.0476 0.0547 0.1989 9.7 4c2t:A, 4c2t:B, 4c2t:C, 4c2t:D, 4c2u:D, 4c30:I, 4c30:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218