BioLiP

>protein
MIKTEYNPKHSPIIEIEKEGELYKITIEVGKEVKHPNEPSHHIQWVDLYFEPEGKEPTHIARIEFKAHGEYNNYTEPKAI
VYAKLEGKGKLIAISYCTLHGLWKTEKEL

The query sequence (length=109) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6gq8:A	109	109	1.0000	1.0000	1.0000	1.56e-75	6gq8:B, 6gq8:C, 6gq8:D
2	2hvb:B	115	102	0.4771	0.4522	0.5098	1.48e-33	2hvb:A, 2hvb:C, 2hvb:D
3	1do6:A	124	109	0.5046	0.4435	0.5046	1.62e-31	1do6:B, 1dqi:A, 1dqi:B, 1dqi:C, 1dqi:D, 1dqk:A, 1dqk:B, 1dqk:C, 1dqk:D
4	4bfk:B	125	110	0.4587	0.4000	0.4545	2.58e-27	4bff:A, 4bff:B, 4bff:C, 4bff:D, 4bff:E, 4bff:F, 4bff:G, 4bff:H, 4bff:I, 4bff:J, 4bff:K, 4bff:L, 4bff:M, 4bff:N, 4bff:O, 4bff:P, 4bfj:A, 4bfj:B, 4bfk:A, 4bfk:C, 4bfk:D, 4bgl:A, 4bgl:B, 4bgl:C, 4bgl:D, 4c4b:A, 4c4b:B, 4c4u:A, 4c4u:B, 4c4u:C, 4c4u:D, 4c4u:E, 4c4u:F, 4c4u:G, 4c4u:H, 4c4u:I, 4c4u:J, 4c4u:K, 4c4u:L, 4c4u:M, 4c4u:N, 4c4u:O, 4c4u:P
5	2amu:A	132	112	0.4128	0.3409	0.4018	2.24e-24	3qzb:A
6	4brj:A	124	106	0.3853	0.3387	0.3962	9.99e-19	4bk8:A, 4brv:A, 4brv:B, 4brv:C, 4brv:D
7	2ji2:A	126	98	0.2844	0.2460	0.3163	2.01e-05	2ji1:A, 2ji1:B, 2ji1:C, 2ji1:D, 2ji2:B, 2ji2:C, 2ji2:D, 2ji3:A, 2ji3:B, 2ji3:C, 2ji3:D, 1vzg:A, 1vzg:B, 1vzh:A, 1vzh:B, 1vzi:A, 1vzi:B
8	4d7p:A	96	87	0.2385	0.2708	0.2989	1.99e-04
9	1dfx:A	125	99	0.2661	0.2320	0.2929	0.001
10	1y07:C	124	96	0.2477	0.2177	0.2812	0.005	1y07:A, 1y07:B, 1y07:D
11	6dsz:B	1072	62	0.2018	0.0205	0.3548	2.6
12	7ukn:A	1059	62	0.2018	0.0208	0.3548	2.6
13	8bu1:D	827	62	0.2018	0.0266	0.3548	3.6	8bu1:A, 8bu1:G, 8bu2:A, 8bu2:D, 8bu2:G, 8bu3:A, 8bu3:D, 8bu3:G, 8bu4:A, 8bu4:D, 8bu4:G, 8bu5:A, 8bu5:D, 8bu5:G, 8bu6:G, 8bu6:D, 8bu6:A, 8bu7:A, 8bu7:D, 8bu7:G, 8bua:A, 8bua:D, 8bua:G, 8bub:A, 8bub:D, 8bub:G, 8buc:A, 8buc:D, 8buc:G, 8bud:A, 8bud:D, 8bud:G, 8bue:A, 8bue:D, 8bue:G, 8buf:D, 8bug:A, 8bug:D, 8bug:G, 8buh:A, 8buh:D, 8buh:G, 8bui:A, 8bui:D, 8bui:G, 8buj:A, 8buj:G, 8buk:D, 8bul:A, 8bul:D, 8bul:G, 8bum:A, 8bum:D, 8bum:G, 8bun:A, 8bun:D, 8bun:G, 8buo:A, 8buo:D, 8buo:G, 8bup:A, 8bup:D, 8bup:G, 8buq:A, 8buq:D, 8buq:G, 8bur:D, 8bur:A, 8bur:G, 8bus:D, 8bus:A, 8bus:G, 8but:A, 8but:D, 8but:G, 6td3:A, 6td3:D, 6td3:G
14	8tl6:A	798	62	0.2018	0.0276	0.3548	3.8	8g46:A
15	5nxb:A	644	50	0.1376	0.0233	0.3000	8.4	4ccc:A, 4ccd:A, 4cce:A, 5nxb:B, 4ufh:A, 4ufi:A, 4ufj:A, 4ufk:A, 4ufl:A, 4ufm:A, 6y6s:A, 6y6t:A, 3zr5:A, 3zr6:A
16	8ah3:A	375	25	0.0826	0.0240	0.3600	9.0
17	7s8k:B	278	33	0.1009	0.0396	0.3333	9.4	7s8k:A

[Back]