BioLiP

>protein
MIKQRTLKRIVQATGVGLHTGKKVTLTLRPAPANTGVIYRRTDLNPPVDFPADAKSVRDTMLCTCLVNEHDVRISTVEHL
NAALAGLGIDNIVIEVNAPEIPIMDGSAAPFVYLLLDAGIDELNCAKKFVRIKETVRVEDGDKWAEFKPYNGFSLDFTID
FNHPAIDSSNQRYAMNFSADAFMRQISRARTFGFMRDIEYLQSRGLCLGGSFDCAIVVDDYRVLNEDGLRFEDEFVRHKM
LDAIGDLFMCGHNIIGAFTAYKSGHALNNKLLQAVLAKQEAWEYVTFQDDAELPLAFKAPSA

The query sequence (length=302) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4mqy:A	302	302	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4is9:A, 4is9:B, 4isa:A, 4mdt:A, 4mdt:B, 4mdt:C, 4mdt:D, 3nzk:A, 3nzk:B, 3p3g:A, 7phj:A, 3ps1:A, 3ps2:A, 3ps3:A, 8v24:B, 8v24:D
2	6mo5:A	303	299	0.5762	0.5743	0.5819	1.70e-130	6c9c:A, 6cax:A, 7ci4:A, 7ci4:B, 7ci5:A, 7ci5:B, 7ci5:C, 7ci5:D, 7ci6:A, 7ci6:B, 7ci7:A, 7ci8:A, 7ci8:B, 7ci9:A, 7cia:A, 7cib:A, 7cic:A, 7cic:B, 7cid:A, 7cie:A, 7cie:B, 7del:A, 7dem:A, 7den:A, 5drq:A, 5drr:A, 6dui:A, 8e4a:A, 6e54:A, 4fw3:A, 4fw3:B, 4fw3:C, 4fw3:D, 4fw4:A, 4fw4:B, 4fw4:C, 4fw4:D, 4fw5:A, 4fw5:B, 4fw5:C, 4fw5:D, 4fw6:A, 4fw6:B, 4fw6:C, 4fw6:D, 4fw7:A, 4fw7:B, 4fw7:C, 4fw7:D, 6i46:AAA, 6i47:AAA, 6i48:AAA, 6i49:AAA, 6i49:BBB, 6i4a:AAA, 4j3d:A, 4j3d:B, 7k99:A, 7k99:C, 7k9a:A, 7k9a:C, 4lcf:A, 4lcg:A, 4lch:A, 6mae:A, 6mo4:A, 6mod:A, 6moo:A, 5n8c:A, 5n8c:B, 4okg:A, 4okg:B, 3p3e:A, 7phn:A, 7pj2:A, 7pjg:A, 7pk8:A, 7pkk:A, 7pkm:A, 7pzs:A, 7pzu:A, 7pzv:A, 7pzw:A, 7pzx:A, 7q01:A, 3u1y:A, 3u1y:B, 5u39:A, 5u3b:A, 5u3b:B, 3uhm:A, 5upg:A, 2ves:A, 2ves:B, 2ves:C, 5vwm:A
3	3p3c:A	272	277	0.3013	0.3346	0.3285	3.25e-39	5dro:A, 5dro:B, 5drp:A, 5drp:B, 2go3:A, 2go3:B, 2go4:A, 2go4:B, 2ier:A, 2ier:B, 2ies:A, 2ies:B, 6ih0:A, 2j65:A, 2j65:B, 2jt2:A, 2o3z:A, 2o3z:B, 4oze:A, 4oze:B, 1p42:A, 1p42:B, 3p76:A, 4u3b:A, 4u3d:A, 5u86:A, 1xxe:A, 1yh8:A, 1yh8:B, 1yhc:A, 1yhc:B
4	8esq:m	572	145	0.1358	0.0717	0.2828	0.053	8esr:m, 8etg:m, 8eti:m, 8eug:m, 8eui:m
5	5tjg:D	1475	54	0.0662	0.0136	0.3704	0.68
6	4xln:J	1367	54	0.0662	0.0146	0.3704	0.77	3aoh:D, 3aoh:N, 3aoi:D, 3aoi:N, 6asg:D, 4gzy:D, 4gzz:D, 5i2d:D, 5i2d:O, 4mq9:D, 7rdq:D, 4wqt:D, 4wqt:I, 4wqt:N, 4xlp:J, 4xlq:J, 4xlr:J, 4xls:J
7	1hqm:D	1175	80	0.0861	0.0221	0.3250	1.1	1i6v:D
8	8g6e:L	211	88	0.0828	0.1185	0.2841	2.1	8g6e:Z, 8g6f:L, 8g6f:Z, 7lxt:L, 7lxt:Z, 7lxu:L, 7lxu:Z, 8w2f:L, 8w2f:Z
9	4gvq:A	315	88	0.0728	0.0698	0.2500	2.2	4gvq:B, 4gvs:B
10	1nr9:A	211	47	0.0530	0.0758	0.3404	2.5	1nr9:B, 1nr9:C, 1nr9:D
11	6uc2:A	453	105	0.0828	0.0552	0.2381	4.7	6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
12	7qhm:C	233	53	0.0464	0.0601	0.2642	6.0	7q21:C, 7q21:c, 7qhm:P, 7qho:C, 7qho:P
13	1b3o:B	410	105	0.0828	0.0610	0.2381	6.9
14	1axk:B	394	155	0.0993	0.0761	0.1935	6.9	1axk:A
15	8odw:A	612	35	0.0497	0.0245	0.4286	8.8	8odw:B
16	5me6:A	175	100	0.0861	0.1486	0.2600	8.8	5me6:D

[Back]