Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MIKFIGGASKVTGSAFLLETAKILIDCGIENEIIEKKINEIGKADICILTHAHLDHSGLVPLLVKKRKVNKIISTPATKE
LCRLLFNDFQRIQEENNDIPLYSYDDIESSFEIWDEIDDRNTIELFDTKITFYNNSHIIGSVSVFIETHNGNYLFSGDIG
SKLQQLMDYPPDMPDGNVDYLILESTYGNKSHDRDRLLEIAKTTCGKVLIPSFAIGRLQEVLYTFSNYNFNFPVYIDSPM
GSKVTNLIKEYNIYLKKKLRDDLFNNKYIAINTSNQSKELSNSKEPAVIISARILNHLEQIKTLIFVGYQRIEKLNSFSA
HADQDELIDYIERLKYTPYKVFLVHGEKEQREILAKRIISKKIRVELPILIEKKVVLNINTDNMCNFASYRLMPFSGFIV
EKDDRIEINDKNWFDMIWNLPDMSHDKIIENIEYLFNIKILSKNRIKEFWEEFCKGQKAAIKYITQVHRKNPNTGRRNWN
PPEGDFTDNEIEKLYETAYNTLLSLIKYDKNKVYNILINFNPKL

The query sequence (length=524) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8yhe:H 524 524 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 8yhd:H
2 8z99:H 582 582 0.9885 0.8900 0.8900 0.0 8yhd:I, 8yhd:L, 8yhe:I, 8yhe:L, 8z4j:H, 8z4j:I, 8z4j:L, 8z4l:H, 8z4l:I, 8z4l:L, 8z99:I, 8z99:L, 8z9c:H, 8z9c:I, 8z9c:L, 8z9e:I, 8z9e:L
3 8z9e:H 553 560 0.9752 0.9241 0.9125 0.0
4 8z99:K 372 225 0.3779 0.5323 0.8800 5.99e-134 8yhd:K, 8yhe:K, 8z4j:K, 8z4l:K, 8z9c:K, 8z9e:K
5 8z99:K 372 186 0.2863 0.4032 0.8065 6.85e-85 8yhd:K, 8yhe:K, 8z4j:K, 8z4l:K, 8z9c:K, 8z9e:K
6 3a4y:A 431 408 0.2195 0.2668 0.2819 4.29e-41 3a4y:B, 3a4y:C, 3a4y:D, 2dkf:A, 2dkf:B, 2dkf:C, 2dkf:D, 3idz:A, 3idz:B, 3idz:C, 3idz:D, 3ie0:A, 3ie0:B, 3ie0:C, 3ie0:D, 3ie1:A, 3ie1:B, 3ie1:C, 3ie1:D, 3ie2:A, 3ie2:B, 3ie2:C, 3ie2:D, 3iek:A, 3iek:B, 3iek:C, 3iek:D, 3iel:A, 3iel:B, 3iel:C, 3iel:D, 3iem:A, 3iem:B, 3iem:D, 3iem:C
7 3af5:A 638 435 0.2252 0.1850 0.2713 4.49e-39 3af6:A
8 9bct:M 648 435 0.2233 0.1806 0.2690 1.57e-35 9bct:J, 9bcu:J, 9bcu:M
9 2xr1:B 611 460 0.2481 0.2128 0.2826 1.84e-34 2xr1:A
10 2ycb:B 635 451 0.2328 0.1921 0.2705 2.13e-30 2ycb:A
11 6q55:A 461 428 0.2156 0.2451 0.2640 6.52e-30 6q5a:A
12 6v4x:H 499 425 0.2233 0.2345 0.2753 6.78e-30 6m8q:A, 6m8q:B
13 2i7v:A 433 414 0.2233 0.2702 0.2826 3.27e-28 8t1q:A, 8t1r:A
14 2i7t:A 404 398 0.2176 0.2822 0.2864 4.99e-28
15 6i1d:A 458 428 0.1985 0.2271 0.2430 8.34e-24
16 8rbx:k 552 406 0.1908 0.1812 0.2463 4.20e-21 7pks:k, 8rbz:k
17 7ycx:K 590 435 0.1947 0.1729 0.2345 3.52e-19 7cun:K, 8r22:C, 8r23:C, 8r2d:C, 8rc4:k, 8uib:K
18 7sn8:K 588 435 0.1927 0.1718 0.2322 1.49e-13 8uic:K
19 5hab:B 463 380 0.1737 0.1965 0.2395 1.43e-05 5haa:A, 5haa:B, 5hab:A, 6llb:A, 6llb:B, 5ws2:A, 5ws2:B
20 3adr:A 259 147 0.0706 0.1429 0.2517 5.23e-04 3adr:B
21 6v4x:I 510 149 0.0611 0.0627 0.2148 0.001
22 7wnu:B 554 236 0.1031 0.0975 0.2288 0.004 7wnt:A, 7wnu:A
23 7l0b:A 202 52 0.0458 0.1188 0.4615 0.006 7l0b:B, 7l0b:C, 7l0b:D
24 5a0t:A 454 346 0.1469 0.1696 0.2225 0.007 5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
25 2zwr:B 207 187 0.0821 0.2077 0.2299 0.011 2zwr:A, 2zzi:A, 2zzi:B
26 3t3o:A 553 331 0.1450 0.1374 0.2296 0.061 3bk1:A, 3bk2:A, 3t3n:A
27 7r3e:A 545 173 0.0763 0.0734 0.2312 0.34 8b4a:A, 8b4a:B, 8b4a:C, 8b4a:D, 3dh8:A, 8dq0:C, 8dq0:D, 8dq1:C, 8dq1:D, 5hio:A, 5hip:A, 5hiq:A, 5his:A, 7kgw:A, 7kgx:A, 2q0i:A, 2q0j:A, 2q0j:B, 7r3e:B, 7r3f:A, 7r3j:A, 7r3j:B, 7r3j:C, 7r3j:D, 7tz9:A, 7tza:A, 7u6g:A, 2vw8:A
28 7u2r:A 244 50 0.0382 0.0820 0.4000 0.35
29 6k6s:A 443 111 0.0592 0.0700 0.2793 0.42 6k6s:B
30 5aeb:B 266 147 0.0649 0.1278 0.2313 0.61 5aeb:A
31 7fct:B 239 67 0.0496 0.1088 0.3881 0.88 7fct:A
32 7sgl:D 406 122 0.0687 0.0887 0.2951 1.1 7abs:A, 7af1:A, 7afs:A, 7afu:A, 7agi:A, 7apv:A, 6tt5:AAA, 6wnl:A, 6wnl:B, 6wo0:A
33 7jsa:J 88 61 0.0344 0.2045 0.2951 1.1 7jsl:J, 7jsl:E, 7jsl:H, 7jsl:L
34 4ge1:A 195 78 0.0496 0.1333 0.3333 1.6 4ge1:B, 4ge1:C, 4ge1:D
35 4xww:A 545 186 0.0878 0.0844 0.2473 1.6 4xwt:A, 4xwt:B, 4xww:B
36 5u8o:B 360 62 0.0363 0.0528 0.3065 1.6 5i0p:C, 5i0p:D, 5u8o:A, 5u8o:C, 5u8o:D
37 2yg3:B 450 90 0.0458 0.0533 0.2667 1.6 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
38 6u10:A 269 85 0.0420 0.0818 0.2588 2.0 7l52:A, 7l91:A, 6u0y:A, 6u0y:B, 6u0y:C, 6u0y:D, 6u0z:A, 6u13:A, 6u2y:A, 6u2z:A, 6uac:A, 6uaf:A, 6uah:A, 7uhh:A, 7uhi:A, 7uhj:A, 7uhk:A, 7uhl:A, 7uhm:A, 7uhn:A, 7uho:A, 7uhp:A, 7uhq:A, 7uhr:A, 7uht:A
39 8gyg:B 305 147 0.0668 0.1148 0.2381 2.8 8gyg:A
40 6vph:A 284 101 0.0515 0.0951 0.2673 2.9 5aad:A, 5aae:A, 5aaf:A, 5aag:A, 7ayh:A, 7ayi:A, 4b0g:A, 2bmc:A, 2bmc:B, 2bmc:C, 2bmc:D, 2bmc:E, 2bmc:F, 4bn1:A, 4byi:A, 4byj:A, 8c14:A, 8c15:A, 8c1d:A, 8c1e:A, 8c1f:A, 8c1g:A, 8c1h:A, 8c1i:A, 8c1k:A, 8c1m:A, 6c2r:A, 6c2t:A, 4c3p:A, 4c3p:D, 4c3r:A, 2c6d:A, 2c6e:A, 2c6e:B, 6c83:A, 6c83:B, 4ceg:A, 3coh:A, 3coh:B, 6cpf:A, 6cpg:A, 6cpg:D, 3d14:A, 3d15:A, 3d2i:A, 3d2k:A, 3daj:A, 4dea:A, 4deb:A, 4ded:A, 4dee:A, 4dhf:A, 4dhf:B, 3dj5:A, 3dj6:A, 3dj7:A, 5dn3:A, 5dnr:A, 5dos:A, 5dpv:A, 5dr2:A, 5dr6:A, 5dr9:A, 5drd:A, 5dt0:A, 5dt3:A, 5dt4:A, 2dwb:A, 3e5a:A, 5ew9:A, 3fdn:A, 7fic:A, 5g15:A, 5g1x:A, 6gra:A, 8guw:A, 8guw:B, 8guw:C, 3h0y:A, 3h0z:A, 3h0z:B, 3h0z:C, 3h10:A, 3h10:B, 3h10:D, 3ha6:A, 6hjj:A, 6hjk:A, 6i2u:A, 2j4z:A, 2j4z:B, 2j50:A, 2j50:B, 4j8m:A, 4jai:A, 4jaj:A, 4jbo:A, 4jbp:A, 4jbq:A, 8jf4:A, 8jg8:A, 8jmx:A, 3k5u:A, 5l8j:A, 5l8k:A, 5l8l:A, 3lau:A, 5lxm:A, 3m11:A, 1mq4:A, 1muo:A, 3myg:A, 2np8:A, 3nrm:A, 4o0s:A, 4o0u:A, 4o0w:A, 7o2v:A, 3o50:A, 3o50:B, 3o51:A, 5obj:A, 5obr:A, 5odt:A, 8of5:A, 1ol5:A, 1ol6:A, 1ol7:A, 5one:A, 5orl:A, 5orn:A, 5oro:A, 5orp:A, 5orr:A, 5ors:A, 5ort:A, 5orv:A, 5orw:A, 5orx:A, 5ory:A, 5orz:A, 5os0:A, 5os1:A, 5os2:A, 5os3:A, 5os4:A, 5os5:A, 5os6:A, 5osd:A, 5ose:A, 5osf:A, 3p9j:A, 4prj:A, 8pr7:D, 8pr7:A, 3qbn:A, 3r21:A, 3r22:A, 6r49:A, 6r4a:A, 6r4b:A, 6r4c:A, 6r4d:A, 8sso:A, 8sso:D, 8ssp:A, 3unz:A, 3unz:B, 3uo4:A, 3uo5:A, 3uo6:A, 3uo6:B, 3uod:A, 3uoh:A, 3uoh:B, 3uoj:A, 3uoj:B, 3uok:A, 3uok:B, 3uol:A, 3uol:B, 3up2:A, 3up7:A, 4uyn:A, 4uzd:A, 4uzd:B, 4uzh:A, 3vap:A, 6vpg:A, 6vpi:A, 6vpj:A, 6vpl:B, 6vpl:A, 6vpm:B, 6vpm:A, 2w1c:A, 2w1d:A, 2w1e:A, 2w1f:A, 2w1g:A, 3w10:A, 3w16:A, 2wtv:A, 2wtv:B, 2wtv:C, 2wtv:D, 2wtw:A, 2x6d:A, 2x6e:A, 2x81:A, 2xne:A, 2xng:A, 2xru:A, 6z4y:A, 5zan:A, 4zs0:A, 4ztq:A, 4ztr:A, 4zts:A, 7ztl:A
41 8w4g:A 876 78 0.0439 0.0263 0.2949 2.9 8w4i:A, 8w4n:A, 8x8g:A
42 2cbn:A 306 156 0.0744 0.1275 0.2500 3.1
43 2fp4:B 393 96 0.0439 0.0585 0.2396 3.9 2fpg:B, 7jfp:B, 7jkr:B, 7jmk:B, 7msr:B, 6wcv:B
44 7xgt:B 275 122 0.0630 0.1200 0.2705 4.0 7xgt:A
45 3zq4:A 550 111 0.0592 0.0564 0.2793 4.0 3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
46 2xf4:A 210 50 0.0344 0.0857 0.3600 4.8
47 7vwt:A 326 116 0.0611 0.0982 0.2759 5.3 7vwt:B
48 2m5c:A 227 82 0.0496 0.1145 0.3171 5.9 1bc2:A, 1bc2:B, 2bc2:A, 2bc2:B, 3bc2:A, 2bfk:A, 2bfk:B, 2bfl:A, 2bfl:B, 2bfz:A, 2bfz:B, 2bg2:A, 2bg2:B, 2bg6:A, 2bg6:B, 2bg7:A, 2bg7:B, 2bg8:A, 2bg8:B, 2bga:A, 2bga:B, 1bmc:A, 1bvt:A, 4c09:A, 4c1c:A, 4c1h:A, 6dja:A, 1dxk:A, 6eum:A, 6ewe:A, 6f2n:A, 3fcz:A, 3fcz:B, 5fqa:A, 5fqb:A, 3i11:A, 3i13:A, 3i14:A, 3i15:A, 5jmx:A, 3knr:A, 3knr:B, 3knr:C, 3knr:D, 3kns:A, 3kns:B, 3kns:C, 3kns:D, 2m5d:A, 4nq4:A, 4nq5:A, 4nq6:A, 2nxa:A, 2nyp:A, 2nze:A, 2nze:B, 2nzf:A, 4tyt:A, 2uyx:A, 5w8w:A
49 7dd9:A 1129 55 0.0305 0.0142 0.2909 6.6 7dd9:C, 7dd9:E, 7dd9:G, 6lz1:A, 6lz1:B, 6lz1:C, 6lz1:D
50 2p8u:A 462 102 0.0534 0.0606 0.2745 7.0 2p8u:B
51 3pr8:A 218 98 0.0592 0.1422 0.3163 7.3 3pr8:B, 3pr8:C, 3pr8:D
52 6h3r:A 121 26 0.0267 0.1157 0.5385 8.6 6h3r:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218