Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSNERGDGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDINFENMSNDDAVRVLRDIVHK
PGPIVLTVAKLEHHH

The query sequence (length=95) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1l6o:A 95 95 1.0000 1.0000 1.0000 1.14e-65 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
2 2kaw:A 90 89 0.8316 0.8778 0.8876 4.44e-53 6lcb:A, 2mx6:A
3 6zbq:A 89 89 0.8421 0.8989 0.8989 1.45e-51 6zc4:A
4 8bq8:C 93 65 0.2737 0.2796 0.4000 5.30e-10 8bq8:A, 8bq8:B
5 2exg:A 101 90 0.3684 0.3465 0.3889 5.55e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
6 7p73:A 420 65 0.2737 0.0619 0.4000 1.29e-09 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
7 8bp4:A 93 94 0.3474 0.3548 0.3511 2.25e-09 8bp4:C, 8bp4:B
8 7pc3:A 405 65 0.2737 0.0642 0.4000 4.40e-09 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
9 2m0z:A 97 65 0.2737 0.2680 0.4000 5.39e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 2ka9:A 189 65 0.2842 0.1429 0.4154 1.28e-08 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
11 2ka9:A 189 74 0.2632 0.1323 0.3378 2.89e-05 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 2koh:A 111 96 0.3368 0.2883 0.3333 1.29e-07 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
13 8cn1:H 101 74 0.2632 0.2475 0.3378 4.90e-07 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
14 8bv7:A 95 49 0.1895 0.1895 0.3673 1.83e-06 8buw:A, 8buw:B
15 1b8q:A 127 80 0.2842 0.2126 0.3375 1.85e-05
16 6xa7:B 96 64 0.2316 0.2292 0.3438 4.27e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
17 3jxt:A 96 61 0.2316 0.2292 0.3607 8.34e-05 3jxt:B
18 4wyu:A 201 70 0.2526 0.1194 0.3429 9.15e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
19 3tsz:A 341 50 0.1789 0.0499 0.3400 1.56e-04 3shw:A
20 5heb:A 119 62 0.2421 0.1933 0.3710 2.20e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
21 8c1t:A 90 64 0.2316 0.2444 0.3438 2.26e-04 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
22 4xh7:A 110 58 0.2105 0.1818 0.3448 0.001
23 1n7t:A 103 77 0.2526 0.2330 0.3117 0.001 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
24 7qqm:A 413 75 0.2526 0.0581 0.3200 0.001
25 7pc5:A 405 89 0.3053 0.0716 0.3258 0.002
26 7x2e:A 163 47 0.1789 0.1043 0.3617 0.002 2kbs:A
27 4xhv:A 94 66 0.2316 0.2340 0.3333 0.002
28 3cyy:B 81 40 0.1684 0.1975 0.4000 0.003 3cyy:A
29 5zys:A 90 82 0.2947 0.3111 0.3415 0.004
30 8b82:A 108 77 0.2737 0.2407 0.3377 0.005 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
31 5f67:A 98 72 0.2842 0.2755 0.3750 0.005 5f67:B
32 3ch8:A 190 69 0.2316 0.1158 0.3188 0.007 2qbw:A
33 5n7d:A 423 63 0.1895 0.0426 0.2857 0.008 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
34 2kpl:A 129 63 0.1895 0.1395 0.2857 0.012
35 7qct:A 90 44 0.1684 0.1778 0.3636 0.012 7qct:B
36 6gbe:A 119 83 0.2526 0.2017 0.2892 0.014
37 1n7f:A 86 74 0.2421 0.2674 0.3108 0.014 1n7f:B
38 7weg:B 96 89 0.2842 0.2812 0.3034 0.015 7weg:A
39 7qqn:C 414 89 0.2632 0.0604 0.2809 0.022 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
40 7p70:A 407 61 0.2211 0.0516 0.3443 0.029 7pc4:A, 7qql:A
41 7pcb:A 415 70 0.2105 0.0482 0.2857 0.048 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
42 2qt5:A 194 76 0.2211 0.1082 0.2763 0.051 2qt5:B
43 2qt5:A 194 73 0.1895 0.0928 0.2466 0.057 2qt5:B
44 2l4t:A 124 52 0.1684 0.1290 0.3077 0.055 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
45 6kz1:A 97 62 0.1895 0.1856 0.2903 0.078 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
46 6q0m:B 94 77 0.2211 0.2234 0.2727 0.12
47 4wsi:A 372 47 0.1474 0.0376 0.2979 0.13 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
48 2ejy:A 85 70 0.1789 0.2000 0.2429 0.15
49 2i0i:A 81 49 0.1895 0.2222 0.3673 0.20 2i0i:B, 2i0i:C
50 2pdz:A 86 71 0.2421 0.2674 0.3239 0.23
51 1zub:A 109 78 0.1895 0.1651 0.2308 0.27
52 6avo:X 213 92 0.2421 0.1080 0.2500 0.31 6avo:S, 8cvr:M, 8cvr:a, 8cvs:L, 8cvs:Z, 8cvt:S, 1iru:M, 1iru:1, 5ley:L, 5ley:Z, 5lez:L, 5lez:Z, 5lf0:L, 5lf0:Z, 5lf4:L, 5lf4:Z, 5m32:L, 4r67:M, 4r67:1, 4r67:o, 4r67:a, 8ud9:M, 8ud9:a, 8yvp:X, 8yvp:S
53 6nid:B 88 45 0.1263 0.1364 0.2667 0.33 6nid:A, 6nid:C
54 2jk8:A 291 39 0.1474 0.0481 0.3590 0.34 5nh2:A
55 3vqg:A 85 50 0.1684 0.1882 0.3200 0.44
56 6ar4:B 87 73 0.1895 0.2069 0.2466 0.46 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
57 6q55:A 461 35 0.1053 0.0217 0.2857 1.5 6q5a:A
58 6gua:A 821 37 0.1368 0.0158 0.3514 1.8 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
59 3r0h:D 199 56 0.1789 0.0854 0.3036 2.0 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
60 8sxg:A 366 49 0.1789 0.0464 0.3469 2.2 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
61 8blu:B 195 48 0.1579 0.0769 0.3125 2.5 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
62 2r4h:C 98 46 0.1053 0.1020 0.2174 3.2
63 1ihj:B 95 80 0.2105 0.2105 0.2500 3.5 1ihj:A
64 7w93:A 307 77 0.2000 0.0619 0.2468 4.4 7vsk:A, 7vte:A, 7vte:B, 7vte:C, 7vte:D, 7vtf:A, 7vtf:B, 7vtf:C, 7vtf:D, 7vtg:A, 7vtg:B, 7vtg:C, 7vtg:D, 7vva:A, 7vva:B, 7vva:C, 7vva:D
65 1u38:A 89 58 0.1895 0.2022 0.3103 5.2
66 2m0u:A 117 51 0.1684 0.1368 0.3137 6.2
67 1xtp:A 246 44 0.1158 0.0447 0.2500 7.8
68 5ocs:A 369 58 0.1789 0.0461 0.2931 8.0 5ocs:C
69 7a23:C 693 42 0.1579 0.0216 0.3571 9.0 7a24:C, 7aqr:G, 7ar7:G, 7ar8:G, 7arb:G, 8bed:G, 8bpx:G, 8bq5:G, 8bq6:G

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218