Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MIITVTLNMEKYNFLGISIVGQSGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDINFENMSNDDAVRVLRDIVHKPIVLTV
AKLEHHHH

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1l6o:A 95 95 0.9886 0.9158 0.9158 1.75e-54 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
2 6zbq:A 89 83 0.8750 0.8652 0.9277 6.36e-50 6zc4:A
3 2kaw:A 90 89 0.8295 0.8111 0.8202 7.83e-44 6lcb:A, 2mx6:A
4 2exg:A 101 88 0.4091 0.3564 0.4091 8.40e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
5 8bq8:C 93 52 0.2273 0.2151 0.3846 2.70e-09 8bq8:A, 8bq8:B
6 8bp4:A 93 75 0.3182 0.3011 0.3733 1.36e-08 8bp4:C, 8bp4:B
7 7p73:A 420 65 0.2955 0.0619 0.4000 2.90e-08 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 2m0z:A 97 65 0.2727 0.2474 0.3692 6.20e-08 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
9 2ka9:A 189 64 0.2841 0.1323 0.3906 1.01e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
10 2ka9:A 189 74 0.2727 0.1270 0.3243 1.82e-04 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
11 7pc3:A 405 64 0.2727 0.0593 0.3750 1.34e-07 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
12 1b8q:A 127 76 0.2955 0.2047 0.3421 9.22e-07
13 8cn1:H 101 74 0.2841 0.2475 0.3378 1.16e-06 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
14 8bv7:A 95 55 0.2159 0.2000 0.3455 5.46e-06 8buw:A, 8buw:B
15 2koh:A 111 77 0.2841 0.2252 0.3247 7.77e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
16 5heb:A 119 77 0.2614 0.1933 0.2987 4.60e-05 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
17 3jxt:A 96 76 0.2614 0.2396 0.3026 6.46e-05 3jxt:B
18 3tsz:A 341 67 0.2159 0.0557 0.2836 1.43e-04 3shw:A
19 4xh7:A 110 67 0.2727 0.2182 0.3582 3.96e-04
20 7x2e:A 163 60 0.2500 0.1350 0.3667 5.30e-04 2kbs:A
21 4wyu:A 201 70 0.2614 0.1144 0.3286 0.001 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
22 6xa7:B 96 49 0.1818 0.1667 0.3265 0.002 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
23 4xhv:A 94 72 0.2500 0.2340 0.3056 0.002
24 8c1t:A 90 64 0.2386 0.2333 0.3281 0.002 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
25 3cyy:B 81 42 0.1932 0.2099 0.4048 0.002 3cyy:A
26 7pc5:A 405 87 0.3409 0.0741 0.3448 0.003
27 7qqn:C 414 85 0.2841 0.0604 0.2941 0.003 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
28 8b82:A 108 77 0.2727 0.2222 0.3117 0.011 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
29 5f67:A 98 71 0.2955 0.2653 0.3662 0.012 5f67:B
30 7pcb:A 415 61 0.2045 0.0434 0.2951 0.014 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
31 7p70:A 407 59 0.2386 0.0516 0.3559 0.017 7pc4:A, 7qql:A
32 1n7f:A 86 72 0.2500 0.2558 0.3056 0.023 1n7f:B
33 5n7d:A 423 61 0.1932 0.0402 0.2787 0.028 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
34 6gbe:A 119 45 0.1477 0.1092 0.2889 0.032
35 8sxg:A 366 46 0.1705 0.0410 0.3261 0.034 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
36 7qqm:A 413 75 0.2500 0.0533 0.2933 0.034
37 2pdz:A 86 80 0.3068 0.3140 0.3375 0.035
38 2qt5:A 194 54 0.1705 0.0773 0.2778 0.038 2qt5:B
39 2qt5:A 194 54 0.1591 0.0722 0.2593 1.4 2qt5:B
40 7qct:A 90 71 0.2159 0.2111 0.2676 0.044 7qct:B
41 2jk8:A 291 59 0.1932 0.0584 0.2881 0.074 5nh2:A
42 4wsi:A 372 47 0.1591 0.0376 0.2979 0.090 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
43 6ar4:B 87 71 0.2045 0.2069 0.2535 0.11 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
44 1n7t:A 103 77 0.2386 0.2039 0.2727 0.13 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
45 2kpl:A 129 61 0.1932 0.1318 0.2787 0.19
46 2i0i:A 81 46 0.1818 0.1975 0.3478 0.19 2i0i:B, 2i0i:C
47 2ejy:A 85 49 0.1364 0.1412 0.2449 0.20
48 5zys:A 90 41 0.1932 0.1889 0.4146 0.23
49 3ch8:A 190 46 0.1591 0.0737 0.3043 0.36 2qbw:A
50 6nid:B 88 45 0.1364 0.1364 0.2667 0.41 6nid:A, 6nid:C
51 8blu:B 195 36 0.1477 0.0667 0.3611 0.47 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
52 3vqg:A 85 47 0.1705 0.1765 0.3191 0.59
53 6kz1:A 97 61 0.1932 0.1753 0.2787 0.71 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
54 1zub:A 109 80 0.2045 0.1651 0.2250 0.85
55 2l4t:A 124 59 0.1818 0.1290 0.2712 1.2 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
56 6gua:A 821 37 0.1477 0.0158 0.3514 1.3 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
57 4gjp:A 497 58 0.2159 0.0382 0.3276 1.8 4gg4:A, 4gjp:B, 4gjr:A, 6jtq:A, 6jtq:B, 6jvz:A, 6jvz:B, 6jw0:A, 6jw0:B, 6jw1:A, 6jw1:B, 6jw2:A, 6jw2:B, 6jw2:E, 6jw2:H, 6jw3:A, 6jw3:B, 6jw3:E, 6jw3:H, 6jw4:A, 6jw4:B, 6jw4:E, 6jw4:H, 6jw5:A, 6jw5:B, 6jw5:E, 6jw5:H, 6lew:A, 4osh:B, 4osh:A, 4osi:A, 4osj:A, 4osj:B, 4osk:A, 4osk:B, 4osl:A, 4osl:B, 4osm:A, 4osm:B, 4osq:A, 4osr:A, 4oss:A, 4ost:B, 4ost:A, 4osv:A, 4osw:A, 4osz:B, 4osz:A, 4ot0:A, 4ot0:B, 4ot3:B, 4ot3:A, 4oto:A, 3v6t:A
58 5ocs:A 369 58 0.2273 0.0542 0.3448 2.2 5ocs:C
59 2vcg:D 375 32 0.1250 0.0293 0.3438 2.2 5g17:A, 5g17:B, 5g1a:A, 5g1a:B, 5g1b:A, 5g1b:B, 5g1c:A, 5g1c:B, 5g3w:A, 5g3w:B, 5g3w:C, 5g3w:D, 2gh6:A, 2gh6:B, 2gh6:C, 2gh6:D, 6gjk:A, 6gjk:B, 2vcg:A, 2vcg:B, 2vcg:C, 1zz0:A, 1zz0:B, 1zz0:C, 1zz0:D, 1zz1:A, 1zz1:B, 1zz1:C, 1zz1:D, 1zz3:A, 1zz3:B, 1zz3:C, 1zz3:D
60 7yiv:A 484 54 0.1818 0.0331 0.2963 2.4 7yiv:D, 7yiv:C, 7yiv:B, 7yiv:G, 7yiv:H, 7yiv:F, 7yiv:E, 7yiw:A, 7yiw:D, 7yiw:C, 7yiw:B, 7yiw:G, 7yiw:H, 7yiw:F, 7yiw:E, 7yix:A, 7yix:B
61 4jb0:A 367 28 0.1364 0.0327 0.4286 2.9 4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
62 7re7:H 212 52 0.1818 0.0755 0.3077 3.7
63 2de6:B 390 43 0.1932 0.0436 0.3953 4.1 7bug:A, 7bug:B, 7bug:C, 7bui:A, 7bui:B, 7bui:C, 2de5:A, 2de5:B, 2de5:C, 2de6:A, 2de6:C, 2de7:A, 2de7:B, 2de7:C, 6ll0:A, 6ll0:B, 6ll0:C, 6ll1:A, 6ll1:B, 6ll1:C, 6ll4:A, 6ll4:B, 6ll4:C, 6llf:A, 6llf:B, 6llf:C, 6llh:A, 6llh:B, 6llh:C, 6llk:A, 6llm:A, 4nb8:A, 4nb8:B, 4nb8:C, 4nb9:A, 4nb9:B, 4nb9:C, 4nba:A, 4nba:B, 4nba:C, 4nbb:A, 4nbb:B, 4nbb:C, 4nbc:A, 4nbc:B, 4nbc:C, 4nbd:A, 4nbd:B, 4nbd:C, 4nbe:A, 4nbe:B, 4nbe:C, 4nbf:A, 4nbf:B, 4nbf:C, 4nbg:A, 4nbg:B, 4nbg:C, 4nbh:A, 4nbh:B, 4nbh:C, 3vmg:A, 3vmg:B, 3vmg:C, 3vmh:A, 3vmh:B, 3vmh:C, 3vmi:A, 3vmi:B, 3vmi:C, 1ww9:A
64 2r4h:C 98 46 0.1136 0.1020 0.2174 4.2
65 1ihj:B 95 76 0.2045 0.1895 0.2368 5.4 1ihj:A
66 6q0m:B 94 46 0.1477 0.1383 0.2826 5.4
67 4od5:A 274 17 0.1250 0.0401 0.6471 5.5 4od5:B, 4od5:C, 4od5:D, 4od5:E
68 6thk:A 466 19 0.1023 0.0193 0.4737 6.6
69 6ktq:A 399 84 0.2500 0.0551 0.2619 7.6 6ktq:B
70 1rzx:A 98 41 0.1364 0.1224 0.2927 7.7 5i7z:A, 1x8s:A
71 5obv:A 520 47 0.1705 0.0288 0.3191 7.8 5obu:A, 5obw:A, 5oby:A
72 6qud:A 837 78 0.2500 0.0263 0.2821 8.6
73 7nit:D 1253 78 0.2500 0.0176 0.2821 8.8 5dmy:A, 5dmy:B, 5dmy:C, 7nit:A, 7nit:B, 7nit:C, 7nit:E, 7nit:F, 6qub:A, 6qub:B, 6quc:A, 6quc:B
74 3a65:A 384 50 0.1591 0.0365 0.2800 9.0 3a66:A, 2dcf:A, 3vwp:A, 3vwq:A, 3vwr:A, 2zm7:A, 2zm8:A, 2zm9:A, 2zma:A
75 7bm0:A 427 37 0.1477 0.0304 0.3514 9.0 7blv:A, 7nxu:A
76 7v4r:A 437 47 0.1932 0.0389 0.3617 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218