Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MIHEDFCSVCRKSGQLLMCDTCSRVYHLDCLDPPLKTIPKGMWICPRCQDQMLKKEEAI

The query sequence (length=59) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2puy:B 60 59 1.0000 0.9833 1.0000 1.74e-39 2puy:A
2 2yql:A 56 49 0.8305 0.8750 1.0000 1.08e-32
3 2l5u:A 61 52 0.3898 0.3770 0.4423 6.90e-17
4 6q3m:C 219 46 0.4576 0.1233 0.5870 2.46e-15 6q3m:A, 6q3m:B
5 6ryr:W 708 46 0.4576 0.0381 0.5870 2.70e-15 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
6 6guu:B 204 46 0.4576 0.1324 0.5870 5.19e-15 6guu:A
7 2ke1:A 66 53 0.4237 0.3788 0.4717 5.32e-15 2kft:A, 1xwh:A
8 1mm3:A 61 54 0.4576 0.4426 0.5000 2.85e-14
9 8hxx:N 375 49 0.4237 0.0667 0.5102 1.62e-13 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
10 8hxx:N 375 31 0.1695 0.0267 0.3226 1.9 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
11 8ihn:M 357 49 0.4237 0.0700 0.5102 2.34e-13 8kd4:E
12 8ihn:M 357 31 0.1695 0.0280 0.3226 2.2 8kd4:E
13 8w9c:F 156 53 0.4237 0.1603 0.4717 3.33e-13 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
14 7yi2:D 321 49 0.4237 0.0779 0.5102 3.66e-13 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
15 7yi2:D 321 31 0.1695 0.0312 0.3226 2.6 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
16 8kd6:E 301 49 0.4237 0.0831 0.5102 4.79e-13 8kd2:E
17 8kd6:E 301 31 0.1695 0.0332 0.3226 2.8 8kd2:E
18 6ieu:A 170 50 0.4068 0.1412 0.4800 3.03e-12 6iet:A
19 7ebk:A 183 48 0.4068 0.1311 0.5000 6.28e-12 7ebj:A
20 3o36:A 184 48 0.3898 0.1250 0.4792 8.02e-12 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
21 7yi0:F 120 50 0.3898 0.1917 0.4600 1.14e-11
22 6oie:B 111 47 0.4068 0.2162 0.5106 2.32e-11 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
23 1f62:A 51 46 0.3898 0.4510 0.5000 3.59e-11
24 4lk9:A 126 47 0.4068 0.1905 0.5106 3.74e-11 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
25 3u5m:E 173 48 0.3898 0.1329 0.4792 4.23e-11
26 3u5o:C 195 48 0.3898 0.1179 0.4792 5.95e-11 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
27 2miq:A 94 55 0.3898 0.2447 0.4182 2.02e-10
28 5vab:A 54 44 0.3559 0.3889 0.4773 3.37e-10
29 2e6r:A 92 51 0.3898 0.2500 0.4510 1.02e-09
30 7klo:A 59 43 0.3559 0.3559 0.4884 1.08e-09 7klr:A
31 8bpa:C 213 56 0.3898 0.1080 0.4107 4.15e-09 8c60:C
32 8bpa:C 213 44 0.3220 0.0892 0.4318 9.68e-08 8c60:C
33 2mny:A 55 46 0.3559 0.3818 0.4565 5.27e-09 2mnz:A
34 5b73:A 313 44 0.3559 0.0671 0.4773 1.95e-08 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
35 8bpb:C 126 56 0.3220 0.1508 0.3393 2.67e-08 8bpc:C
36 5hh7:A 192 45 0.3729 0.1146 0.4889 2.88e-08
37 1fp0:A 88 54 0.3729 0.2500 0.4074 4.29e-08
38 5b79:A 118 55 0.3729 0.1864 0.4000 4.78e-08 5vdc:A
39 6g8r:B 164 49 0.3898 0.1402 0.4694 4.81e-08 2md7:B, 2md8:C
40 5szb:A 115 45 0.3220 0.1652 0.4222 5.87e-08 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
41 8i02:G 284 45 0.3051 0.0634 0.4000 7.71e-08 8ifg:P
42 8i02:G 284 56 0.3559 0.0739 0.3750 1.65e-06 8ifg:P
43 6fhq:A 58 46 0.3390 0.3448 0.4348 1.60e-07 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
44 8i02:F 235 47 0.3390 0.0851 0.4255 1.75e-07
45 2ysm:A 111 46 0.3220 0.1712 0.4130 2.10e-07
46 2ysm:A 111 46 0.3051 0.1622 0.3913 2.92e-04
47 4gnd:C 107 47 0.3729 0.2056 0.4681 2.42e-07 4gnd:A, 4gne:A, 4gnf:A, 4gng:A, 4gng:D
48 9atn:A 98 46 0.3220 0.1939 0.4130 3.34e-07
49 9atn:A 98 46 0.2881 0.1735 0.3696 1.38e-04
50 2ro1:A 189 43 0.3220 0.1005 0.4419 3.60e-07
51 2naa:A 94 60 0.4407 0.2766 0.4333 1.53e-06
52 4q6f:A 56 55 0.3390 0.3571 0.3636 1.56e-06 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
53 4gy5:A 215 34 0.2881 0.0791 0.5000 1.75e-06 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
54 2e6s:A 77 34 0.2712 0.2078 0.4706 5.19e-06
55 2lv9:A 80 54 0.3220 0.2375 0.3519 1.85e-05 4l58:A
56 7xga:A 126 34 0.2712 0.1270 0.4706 3.86e-05 6vfo:A
57 1wev:A 88 57 0.3390 0.2273 0.3509 1.12e-04
58 4tvr:A 222 33 0.2542 0.0676 0.4545 1.29e-04
59 4ptb:A 178 53 0.3051 0.1011 0.3396 1.59e-04 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
60 2l43:A 80 54 0.3390 0.2500 0.3704 2.69e-04 2ku3:A
61 6u04:A 168 37 0.2542 0.0893 0.4054 0.002 5erc:A
62 2mum:A 50 39 0.2542 0.3000 0.3846 0.004
63 1weu:A 91 41 0.2712 0.1758 0.3902 0.007 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
64 1x4i:A 70 45 0.2373 0.2000 0.3111 0.037 7zmx:A, 7zmx:B
65 7duf:A 62 36 0.2373 0.2258 0.3889 0.044 7duf:B
66 2qic:A 51 41 0.2203 0.2549 0.3171 0.095
67 2k16:A 75 55 0.2373 0.1867 0.2545 0.13 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
68 1wes:A 71 39 0.2203 0.1831 0.3333 0.14 2g6q:A
69 8eii:B 439 32 0.1695 0.0228 0.3125 0.25 8eih:A, 8eih:B, 8eih:C, 8eii:A, 8eii:C, 8eij:A, 8eij:B, 8eik:A, 8eik:B, 6kda:A, 6kda:D, 6kdb:A, 6kdb:D, 6kdl:A, 6kdl:D, 6kdp:A, 6kdp:D, 6kdt:A, 6kdt:D, 7o45:A, 7o45:B, 7o45:C, 6u8p:A, 6u8p:D, 6u8v:A, 6u8v:D, 6u8w:A, 6u8w:D, 6u8x:A, 6u8x:D, 6u90:A, 6u90:D, 6u91:A, 6u91:D, 7v0e:A, 7v0e:B, 7v0e:C, 7v0e:D, 7v0e:E, 7v0e:F, 7v0e:G, 7v0e:H, 7x9d:A, 7x9d:D
70 8eik:E 378 32 0.1695 0.0265 0.3125 0.25
71 8eih:D 256 32 0.1695 0.0391 0.3125 0.27
72 8eik:C 407 32 0.1695 0.0246 0.3125 0.31
73 5xfo:A 315 53 0.2881 0.0540 0.3208 0.40 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
74 5zbu:A 74 52 0.2881 0.2297 0.3269 0.44 5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
75 2yk0:A 698 15 0.1695 0.0143 0.6667 0.98 2xu0:A
76 5jul:A 1233 19 0.1525 0.0073 0.4737 1.0 5jul:B, 5jul:C, 5jul:D, 5jul:E, 5jul:F, 5jul:G, 5jul:H, 5jul:I, 5jul:J, 5jul:K, 5jul:L, 5jul:M, 5jul:N, 5jul:O, 5jul:P
77 3e74:A 429 46 0.2203 0.0303 0.2826 1.8 3e74:C, 3e74:D
78 6j2p:A 98 60 0.3051 0.1837 0.3000 2.2 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
79 8ge0:A 188 47 0.2203 0.0691 0.2766 2.2 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
80 1wil:A 89 33 0.1864 0.1236 0.3333 2.3 5xht:A
81 8hfd:A 452 46 0.2203 0.0288 0.2826 2.4 3e74:B, 8hfd:B, 8hfd:C, 8hfd:D
82 7qcd:D 326 46 0.1695 0.0307 0.2174 2.8
83 2lri:C 66 46 0.2034 0.1818 0.2609 2.8
84 2yt5:A 66 50 0.2034 0.1818 0.2400 3.3
85 2jmi:A 60 37 0.2034 0.2000 0.3243 3.4 2jmj:A
86 5g3z:A 215 40 0.1864 0.0512 0.2750 4.1 5g40:A, 5g41:A
87 9c0o:A 63 37 0.1864 0.1746 0.2973 5.2
88 2pv0:B 347 54 0.2542 0.0432 0.2778 5.4 2pv0:A, 2pv0:C, 2pvc:B, 2pvc:A, 2pvc:C
89 5ijl:A 943 45 0.1864 0.0117 0.2444 5.5
90 8ppt:B 1191 45 0.1864 0.0092 0.2444 5.5 8ppu:B, 8ppv:B, 6t8h:B
91 8qca:B 756 26 0.1525 0.0119 0.3462 5.5
92 8h1j:A 362 32 0.1695 0.0276 0.3125 7.3 8ex9:A, 8exa:A
93 5y20:A 52 34 0.2034 0.2308 0.3529 7.3
94 8suc:A 282 25 0.2034 0.0426 0.4800 7.4
95 8ujg:A 530 15 0.1525 0.0170 0.6000 8.2 8uhz:A, 8ui1:A, 8ui6:A, 8uje:A, 8ujf:A, 8ujf:B, 8ujg:B, 8ujh:A
96 7yym:A 1281 33 0.2373 0.0109 0.4242 8.2 4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
97 8jwu:C 412 26 0.1864 0.0267 0.4231 8.9 8jwj:A, 8jwj:C, 8jws:A, 8jws:B, 8jws:C, 8jwu:A, 8jwu:B
98 5zal:A 1314 33 0.2373 0.0107 0.4242 9.9 2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218