Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MIDNLTPEERDARTVFCMQLAARIRPRDLEEFFSTVGKVRDVRMISDRNSRRSKGIAYVEFVDVSSVPLAIGLTGQRVLG
VPIIVQASQAEKNRAAA

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7zap:A 97 97 1.0000 1.0000 1.0000 5.27e-67
2 2rra:A 99 38 0.1959 0.1919 0.5000 5.88e-06 2kxn:B
3 6n7p:A 186 75 0.2165 0.1129 0.2800 8.55e-06 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
4 2cjk:A 167 60 0.1649 0.0958 0.2667 1.08e-05 2km8:C
5 2cjk:A 167 40 0.1443 0.0838 0.3500 0.021 2km8:C
6 5ith:A 80 66 0.2062 0.2500 0.3030 1.16e-05 5o3j:A
7 6g90:B 193 75 0.2165 0.1088 0.2800 1.21e-05
8 7s7b:C 79 75 0.2577 0.3165 0.3333 1.25e-05 7s7b:G, 7s7c:C
9 6xlv:A 203 84 0.2474 0.1182 0.2857 1.36e-04 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
10 7b9v:Y 88 83 0.2577 0.2841 0.3012 1.46e-04 6bk8:r, 7dco:p, 6exn:Y, 6g90:Y, 5gmk:a, 6j6g:a, 6j6h:a, 6j6n:a, 6j6q:a, 5lj3:Y, 5lj5:Y, 5mq0:Y, 5nrl:Y, 7oqb:Y, 7oqe:Y, 5wsg:X, 5y88:p, 5ylz:p, 5zwm:p, 5zwo:p
11 2xb2:D 89 76 0.1959 0.2135 0.2500 1.84e-04 2xb2:Z
12 7csz:A 175 52 0.1856 0.1029 0.3462 2.61e-04
13 7csz:A 175 44 0.1443 0.0800 0.3182 0.44
14 2mgz:B 105 52 0.1546 0.1429 0.2885 2.93e-04 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
15 1fnx:H 174 80 0.2474 0.1379 0.3000 5.97e-04 1fxl:A, 1g2e:A
16 2xs2:A 87 57 0.2062 0.2299 0.3509 8.78e-04 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
17 6hpj:B 84 49 0.1753 0.2024 0.3469 0.001
18 4bs2:A 174 49 0.1649 0.0920 0.3265 0.001 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
19 8xxm:3G 84 51 0.1546 0.1786 0.2941 0.001 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
20 2rs2:A 84 53 0.1546 0.1786 0.2830 0.002
21 7dvq:Y 140 77 0.1959 0.1357 0.2468 0.002 8i0p:Y, 8i0r:Y
22 9gpj:A 184 55 0.1546 0.0815 0.2727 0.002 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
23 2mkc:A 118 77 0.2268 0.1864 0.2857 0.002 2my3:A
24 7dco:X 128 74 0.2268 0.1719 0.2973 0.002 5gm6:V, 5zwm:X
25 8y6o:W 167 54 0.1753 0.1018 0.3148 0.003
26 2x1f:A 94 46 0.1856 0.1915 0.3913 0.003 2km8:B, 2x1a:A
27 2leb:A 101 45 0.1753 0.1683 0.3778 0.004 2lec:A
28 4a8x:A 88 32 0.1649 0.1818 0.5000 0.006
29 8i0v:4 161 81 0.2268 0.1366 0.2716 0.010
30 2mb0:B 95 47 0.1443 0.1474 0.2979 0.011
31 5kw6:A 201 61 0.1340 0.0647 0.2131 0.011 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
32 5kw6:A 201 48 0.1340 0.0647 0.2708 3.8 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
33 1rk8:A 87 81 0.2062 0.2299 0.2469 0.012
34 5en1:A 184 55 0.1443 0.0761 0.2545 0.013 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
35 5en1:A 184 64 0.1753 0.0924 0.2656 0.020 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
36 1fje:B 175 52 0.1959 0.1086 0.3654 0.014 1rkj:A
37 7ohx:o 112 56 0.1134 0.0982 0.1964 0.019
38 6c0f:o 133 56 0.1134 0.0827 0.1964 0.024 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
39 4lmz:A 176 53 0.1753 0.0966 0.3208 0.033 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
40 4ed5:B 169 80 0.2268 0.1302 0.2750 0.036 4ed5:A
41 4ed5:B 169 52 0.1649 0.0947 0.3077 0.12 4ed5:A
42 4f02:A 175 62 0.2165 0.1200 0.3387 0.064 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
43 8h6e:4R 106 75 0.2062 0.1887 0.2667 0.074 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
44 7q33:A 93 54 0.1546 0.1613 0.2778 0.076 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
45 5x8p:v 190 65 0.1959 0.1000 0.2923 0.093 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
46 6jvx:A 87 49 0.1237 0.1379 0.2449 0.17 6jvy:A
47 8esq:o 137 43 0.1546 0.1095 0.3488 0.18 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
48 7slp:B 321 55 0.1649 0.0498 0.2909 0.19 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
49 7dco:4 174 67 0.1649 0.0920 0.2388 0.25 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
50 8ro0:O 342 41 0.1340 0.0380 0.3171 0.35 8ro1:O
51 8ch6:V 285 47 0.1546 0.0526 0.3191 0.65 7qtt:V
52 8pv1:CI 152 44 0.1134 0.0724 0.2500 0.66 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
53 6m75:A 167 42 0.1134 0.0659 0.2619 0.75
54 6m75:A 167 80 0.1753 0.1018 0.2125 1.5
55 8fkp:SH 150 53 0.1856 0.1200 0.3396 1.2 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
56 8i0s:Y 320 47 0.1546 0.0469 0.3191 1.4 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
57 9c57:G 878 45 0.1237 0.0137 0.2667 2.7
58 1wtb:A 79 55 0.1031 0.1266 0.1818 2.8 1x0f:A
59 3hpe:A 164 32 0.1237 0.0732 0.3750 2.9 3hpe:B
60 4qqb:A 169 36 0.1134 0.0651 0.3056 3.6 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
61 7sla:A 585 39 0.1237 0.0205 0.3077 6.9 7sl8:A
62 3fyo:D 261 59 0.1649 0.0613 0.2712 6.9 3fyp:D
63 8b6s:A 517 17 0.0928 0.0174 0.5294 7.3 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218