Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MHREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGIFVQLVQANSPASLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTI
R

The query sequence (length=81) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8blu:B 195 79 0.9753 0.4051 1.0000 1.31e-53 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
2 8blu:B 195 78 0.2840 0.1179 0.2949 0.035 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
3 3jxt:A 96 72 0.3333 0.2812 0.3750 2.39e-06 3jxt:B
4 2l4t:A 124 58 0.2346 0.1532 0.3276 2.66e-06 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
5 8b82:A 108 68 0.2840 0.2130 0.3382 4.83e-06 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
6 5wou:A 95 57 0.2716 0.2316 0.3860 8.22e-06
7 5heb:A 119 55 0.2840 0.1933 0.4182 1.16e-05 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
8 7qqm:A 413 66 0.3086 0.0605 0.3788 5.13e-04
9 8sxg:A 366 68 0.2716 0.0601 0.3235 5.28e-04 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
10 2os6:A 89 81 0.3086 0.2809 0.3086 5.38e-04
11 2m0u:A 117 31 0.1728 0.1197 0.4516 5.47e-04
12 7x2e:A 163 47 0.2099 0.1043 0.3617 0.001 2kbs:A
13 7w6z:A 414 46 0.2099 0.0411 0.3696 0.001 7w6y:A
14 1ihj:B 95 49 0.1975 0.1684 0.3265 0.001 1ihj:A
15 3tsz:A 341 39 0.2469 0.0587 0.5128 0.001 3shw:A
16 7qqn:C 414 82 0.3333 0.0652 0.3293 0.003 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
17 1n7t:A 103 57 0.2593 0.2039 0.3684 0.003 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
18 6ezi:A 86 84 0.3086 0.2907 0.2976 0.003 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
19 6hks:B 94 83 0.2840 0.2447 0.2771 0.004 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
20 1zub:A 109 51 0.2099 0.1560 0.3333 0.005
21 2egn:A 83 32 0.1852 0.1807 0.4688 0.005
22 3ch8:A 190 57 0.2593 0.1105 0.3684 0.006 2qbw:A
23 5f67:A 98 52 0.2099 0.1735 0.3269 0.007 5f67:B
24 4c2c:A 433 69 0.2963 0.0554 0.3478 0.007 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
25 8bv7:A 95 49 0.2099 0.1789 0.3469 0.008 8buw:A, 8buw:B
26 6q0m:B 94 77 0.2840 0.2447 0.2987 0.011
27 2ejy:A 85 32 0.1605 0.1529 0.4062 0.011
28 6x23:A 89 71 0.2593 0.2360 0.2958 0.015
29 2kqf:A 96 66 0.2593 0.2188 0.3182 0.016 2kyl:A
30 2koh:A 111 51 0.2222 0.1622 0.3529 0.016 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
31 7w6x:A 447 51 0.1852 0.0336 0.2941 0.018
32 4ynn:A 400 28 0.1852 0.0375 0.5357 0.019 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
33 2r4h:C 98 47 0.1728 0.1429 0.2979 0.019
34 3pv3:A 392 28 0.1852 0.0383 0.5357 0.021 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
35 2m0v:A 128 29 0.1481 0.0938 0.4138 0.035
36 7p73:A 420 36 0.1852 0.0357 0.4167 0.037 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
37 2i0i:A 81 80 0.3086 0.3086 0.3125 0.047 2i0i:B, 2i0i:C
38 3cs0:A 392 54 0.2099 0.0434 0.3148 0.049 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
39 3cs0:A 392 33 0.1481 0.0306 0.3636 1.7 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
40 4e34:A 87 76 0.2716 0.2529 0.2895 0.059 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
41 6xa7:B 96 60 0.2593 0.2188 0.3500 0.061 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
42 5ez0:D 95 61 0.2346 0.2000 0.3115 0.11 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
43 4wyu:A 201 46 0.1728 0.0697 0.3043 0.14 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
44 6o1e:A 431 33 0.1605 0.0302 0.3939 0.18 5ix1:B, 5ix2:A, 5ix2:B, 4qq4:A, 4qq4:B, 5svi:A, 5svi:B, 5svx:A, 5svy:A
45 2pdz:A 86 88 0.2716 0.2558 0.2500 0.25
46 6ar4:B 87 78 0.2840 0.2644 0.2949 0.32 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
47 2kaw:A 90 61 0.2099 0.1889 0.2787 0.39 6lcb:A, 2mx6:A
48 5ix1:A 414 33 0.1481 0.0290 0.3636 0.47
49 6nid:B 88 64 0.1728 0.1591 0.2188 0.47 6nid:A, 6nid:C
50 4c9d:A 262 34 0.1605 0.0496 0.3824 0.60 4c9d:B
51 9bh5:CF 213 20 0.1358 0.0516 0.5500 0.61 9cai:CF
52 4xh7:A 110 61 0.1975 0.1455 0.2623 0.66
53 5h3z:B 1113 43 0.1975 0.0144 0.3721 0.68 5h40:A, 5h40:B, 5h41:A, 5h41:B, 5h42:A, 5h42:B
54 4gvc:A 94 59 0.2346 0.2021 0.3220 0.71 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
55 3u24:A 546 49 0.1975 0.0293 0.3265 0.76
56 2qt5:A 194 56 0.1975 0.0825 0.2857 1.6 2qt5:B
57 1l6o:A 95 48 0.1852 0.1579 0.3125 1.6 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
58 4c98:A 242 59 0.1852 0.0620 0.2542 1.6
59 6zbq:A 89 38 0.1728 0.1573 0.3684 1.8 6zc4:A
60 5t63:A 283 30 0.1358 0.0389 0.3667 1.9 5b6l:A, 5gnd:A
61 8pv1:LF 248 19 0.1111 0.0363 0.4737 2.4 8i9p:LF, 8i9p:CM, 8i9r:LF, 8i9r:CM, 8i9t:LF, 8i9t:CM, 8i9v:LF, 8i9v:CM, 8i9w:LF, 8i9w:CM, 8i9x:CM, 8i9x:LF, 8i9y:CM, 8i9y:LF, 8i9z:CM, 8i9z:LF, 8ia0:CM, 8ia0:LF, 7olc:LF, 7old:LF, 8oo0:LF, 8pv1:CM, 8pv2:LF, 8pv3:CM, 8pv3:LF, 8pv4:LF, 8pv4:CM, 8pv5:LF, 8pv6:CM, 8pv6:LF, 8pv7:CM, 8pv7:LF, 8pv8:LF, 8pvk:CM, 8pvk:LF, 8pvl:CM, 8pvl:LF, 7z3n:LF, 7z3o:LF
62 2joa:A 105 47 0.1605 0.1238 0.2766 2.5
63 5hy5:A 511 38 0.1728 0.0274 0.3684 2.5 5hy5:B
64 3ca1:A 257 45 0.2099 0.0661 0.3778 2.8 3ca4:A, 3ca5:A, 3cah:A
65 7pcb:A 415 65 0.2469 0.0482 0.3077 3.0 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
66 8ori:D 341 74 0.2346 0.0557 0.2568 4.2 8cly:AAA, 8cly:BBB, 8clz:BBB, 8clz:AAA, 8col:AAA, 8col:BBB, 8col:CCC, 8col:DDD, 8ori:A, 8ori:B, 8ori:C, 8osw:A, 8osw:B
67 5a22:A 2002 73 0.2469 0.0100 0.2740 4.7
68 6u1x:A 2059 73 0.2469 0.0097 0.2740 4.7
69 5eom:J 286 27 0.1481 0.0420 0.4444 5.5
70 7p70:A 407 41 0.1481 0.0295 0.2927 5.7 7pc4:A, 7qql:A
71 1u38:A 89 35 0.1481 0.1348 0.3429 6.8
72 6kz1:A 97 34 0.1235 0.1031 0.2941 7.7 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
73 6yx0:B 112 30 0.1235 0.0893 0.3333 7.9 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
74 4n4r:C 533 20 0.1111 0.0169 0.4500 8.2 4n4r:A
75 7xs0:A 376 27 0.1358 0.0293 0.4074 9.1
76 7d6f:A 87 47 0.1852 0.1724 0.3191 9.2
77 5yrf:B 142 53 0.1975 0.1127 0.3019 10.0 5yrf:A, 5yrg:A, 5yrg:B, 5yri:B, 5yri:A, 5yrj:A, 5yrj:B, 5yrl:A, 5yrl:B, 5yrm:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218