BioLiP

>protein
MHPMLNIAVRAARKAGNLIAKNYETPDANDFVTNVDKAAEAVIIDTIRKSYPQHTIITEESGELEGTDQDVQWVIDPLDG
TTNFIKRLPHFAVSIAVRIKGRTEVAVVYDPMRNELFTATRGQGAQLNGYRLRGSTARDLDGTILATGFPFKAKQYATTY
INIVGKLFNECADFRRTGSAALDLAYVAAGRVDGFFEIGLRPWDFAAGELLVREAGGIVSDFTGGHNYMLTGNIVAGNPR
VVKAMLANMRDELSD

The query sequence (length=255) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ib8:B	270	263	1.0000	0.9444	0.9696	0.0	6ib7:A, 6ib8:A, 2qfl:A, 6tqn:T, 6tqn:S, 6tqo:T, 6tqo:S
2	8wdq:A	273	265	0.5725	0.5348	0.5509	9.45e-97	8wdq:B
3	3lv0:A	258	246	0.4118	0.4070	0.4268	1.55e-59	3luz:A, 3lv0:B
4	3luz:B	234	238	0.3961	0.4316	0.4244	7.17e-56
5	2p3n:A	256	245	0.3529	0.3516	0.3673	1.53e-45	2p3n:B, 2p3n:C, 2p3n:D
6	6giu:A	275	256	0.3255	0.3018	0.3242	6.05e-45	4as4:A, 4as4:B, 1awb:A, 1awb:B, 6giu:B, 6gj0:A, 6gj0:B, 2hhm:A, 2hhm:B, 1ima:A, 1ima:B, 1imb:A, 1imb:B, 1imc:A, 1imc:B, 1imd:A, 1imd:B, 1ime:A, 1ime:B, 6zk0:AAA, 6zk0:BBB
7	2czi:A	259	246	0.3412	0.3359	0.3537	1.54e-43	2czh:B
8	4as5:A	274	248	0.3137	0.2920	0.3226	2.04e-42	4as5:B, 4as5:C, 4as5:D
9	2bji:A	274	224	0.2941	0.2737	0.3348	1.86e-40	2bji:B
10	5dw8:A	260	216	0.3059	0.3000	0.3611	1.76e-36	5dw8:B, 5j16:A, 5j16:B, 5j16:C, 5j16:D
11	5eyg:B	265	183	0.2078	0.2000	0.2896	9.55e-24	5eyg:A, 5eyh:A, 5eyh:B, 5f24:A, 5f24:B, 4g61:A, 4g61:B, 4i3e:A, 4i3e:B, 4i3y:A, 4i3y:B, 4i40:A, 4i40:B, 4ptk:A, 4ptk:B, 3ryd:A, 3ryd:C
12	5eq9:B	260	225	0.2588	0.2538	0.2933	1.97e-22	5eq8:A, 5eq9:A, 5eq9:C, 5eq9:D, 5t3j:A
13	1dk4:A	252	194	0.2118	0.2143	0.2784	1.94e-17	1dk4:B, 1g0h:A, 1g0h:B, 1g0i:A, 1g0i:B
14	5zon:A	256	202	0.2353	0.2344	0.2970	1.13e-13	5yht:A, 5yht:B, 5zon:B, 5zon:C, 5zon:D
15	6b5z:A	252	229	0.2745	0.2778	0.3057	2.19e-13	6b5z:B, 6b60:A, 6b60:B, 6b61:A, 6b61:B, 6b62:A, 6b62:B, 6b63:A, 6b63:B, 6b64:A, 6b64:B, 6b65:A, 6b65:B, 6b66:A, 6b66:B, 1lbx:A, 1lbx:B, 1lby:A, 1lby:B, 1lbz:A, 1lbz:B
16	4hxv:A	317	206	0.2157	0.1735	0.2670	2.61e-09	4o7i:A
17	8f9y:A	352	236	0.2431	0.1761	0.2627	7.11e-08
18	2wef:A	303	240	0.2471	0.2079	0.2625	1.03e-07	1jp4:A
19	1k9y:A	354	351	0.3020	0.2175	0.2194	6.18e-06	1k9z:A, 1ka0:A, 1ka1:A, 1qgx:A
20	5djj:A	257	87	0.0980	0.0973	0.2874	0.016	5djg:A, 5djh:A, 5dji:A, 5djk:A
21	8de5:A	338	126	0.1451	0.1095	0.2937	0.25
22	5q0c:A	328	59	0.0588	0.0457	0.2542	0.35	5et6:A, 5et6:C, 5et6:B, 5et6:D, 4he0:A, 4he1:A, 4he2:A, 3ifa:A, 3ifa:B, 3ifa:C, 3ifa:D, 3ifc:A, 3ifc:B, 3ifc:C, 3ifc:D, 5k56:A, 5l0a:A, 5q0c:B, 5q0c:C, 5q0c:D, 5q0c:E, 5q0c:F, 5q0c:G, 5q0c:H
23	2wnb:A	273	126	0.1255	0.1172	0.2540	0.64	2wnf:A
24	5o9z:L	459	51	0.0667	0.0370	0.3333	2.0
25	1ee9:A	317	64	0.0745	0.0599	0.2969	3.0
26	9enp:A	1072	135	0.1529	0.0364	0.2889	3.0	9enq:A, 8oja:A
27	8v1t:A	1064	147	0.1647	0.0395	0.2857	3.7
28	3dou:A	175	31	0.0431	0.0629	0.3548	3.8
29	5fm6:A	426	40	0.0588	0.0352	0.3750	3.8	5fm7:A, 4ww4:A
30	8av6:C	459	40	0.0588	0.0327	0.3750	4.1	8av6:A, 8av6:B, 6fhs:A, 6fhs:B, 6fhs:C, 6fml:A, 6fml:B, 6fml:C, 8oo7:A, 8oo7:B, 8oo7:C, 8ooc:A, 8ooc:B, 8ooc:C, 8oop:A, 8oop:B, 8oop:C, 8oor:A, 8oor:B, 8oor:C, 4wvy:A
31	5yjl:B	415	69	0.1059	0.0651	0.3913	5.1	5yjl:A
32	8v1q:A	1097	149	0.1647	0.0383	0.2819	5.6	8exx:A, 7luf:A, 7luf:B, 8oj6:A, 8oj7:A, 8ojb:A, 8ojd:A, 8v1r:A, 8v1s:A, 8vq2:A, 8vq2:B
33	3e4d:A	278	19	0.0392	0.0360	0.5263	6.6	3e4d:B, 3e4d:C, 3e4d:E, 3e4d:D, 3e4d:F
34	3ojl:A	418	84	0.0784	0.0478	0.2381	9.0	3ojl:B, 3ojo:A, 3ojo:B
35	5k55:A	290	53	0.0510	0.0448	0.2453	10.0	5et8:A

[Back]