BioLiP

>protein
MHLTARGLTLDLSRPQVMGILNVTPDSFSDGGCHNNLDQALQHAQRMLSAGATLIDIGGESTRPGAAEVSEQEELDRVVP
VVEALAQRFDVWLSVDTSKAAVITESAHAGAHLINDIRSLQEPGALEAAAKTGLPVCLMHMQGQPKNMQHSPYYDDLMTD
INRFFQHHIERCVAAGIAKNKLLLDPGFGFGKNLAHNYQLLAHLSELHHFELPLLVGMSRKSMVGQLLNVPPQQRVIGSV
ACAVIAAMQGAQIIRVHDVKETVEAMCIVEATRSA

The query sequence (length=275) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3tyz:B	276	275	1.0000	0.9964	1.0000	0.0	5jq9:A, 5jq9:B, 3tyu:A, 3tyz:A, 3tzf:A, 3tzf:B
2	3tyu:B	238	275	0.8545	0.9874	0.8545	1.87e-162
3	1aj0:A	282	275	0.7491	0.7305	0.7491	1.70e-154	1aj2:A, 7tq1:A, 7tq1:B, 5u0v:A, 5u0w:A, 5u0w:B, 5u0y:A, 5u0y:B, 5u0z:A, 5u0z:B, 5u10:A, 5u10:B, 5u11:A, 5u11:B, 5u12:A, 5u12:B, 5u13:A, 5u13:B, 5u14:A, 5u14:B, 5v79:A, 5v79:B, 5v7a:A, 5v7a:B
4	5u0v:B	249	275	0.6582	0.7269	0.6582	5.11e-117
5	6day:D	273	274	0.4909	0.4945	0.4927	4.99e-87	6day:A, 6day:B, 6day:C, 6ofw:A, 6ofw:B, 6q62:A, 6q62:C, 6q62:D, 6q62:B
6	6pz2:A	263	260	0.4145	0.4335	0.4385	3.44e-76
7	3tr9:A	277	266	0.4218	0.4188	0.4361	4.08e-73	3tr9:B, 3tr9:C, 3tr9:D
8	2y5s:B	281	276	0.4582	0.4484	0.4565	1.10e-65	2y5s:A
9	6omz:A	274	267	0.3782	0.3796	0.3895	4.29e-58
10	2dza:B	257	271	0.3964	0.4241	0.4022	6.24e-56	2dzb:A, 2dzb:B
11	3h2a:B	277	255	0.3673	0.3646	0.3961	7.13e-54	4d8a:A, 4d8a:B, 4d8z:A, 4d8z:B, 4d9p:A, 4d9p:B, 4daf:A, 4daf:B, 4dai:A, 4dai:B, 4db7:A, 4db7:B, 3h21:A, 3h21:B, 3h22:A, 3h22:B, 3h23:A, 3h23:B, 3h24:A, 3h24:B, 3h26:A, 3h26:B, 3h2a:A, 3h2c:A, 3h2c:B, 3h2e:B, 3h2f:A, 3h2f:B, 3h2m:A, 3h2m:B, 3h2n:A, 3h2n:B, 3h2o:A, 3h2o:B, 4nil:A, 4nir:A, 4nir:B, 4nl1:A, 4nl1:B, 1tww:A, 1tww:B, 1twz:A, 1twz:B, 1tx0:A, 1tx0:B, 1tx2:A, 1tx2:B, 3tya:A, 3tya:B, 3tyb:A, 3tyb:B, 3tyc:A, 3tyc:B, 3tyd:A, 3tyd:B, 3tye:A, 3tye:B
12	1eye:A	256	268	0.3564	0.3828	0.3657	2.66e-47
13	8d5h:B	274	255	0.3200	0.3212	0.3451	8.74e-45	8d5g:A, 8d5g:B, 8d5h:A, 8d5i:A, 8d5i:B
14	8scd:A	264	262	0.3127	0.3258	0.3282	3.27e-44	7s2m:A, 7s2m:B, 7s2m:C
15	6clv:C	257	251	0.3200	0.3424	0.3506	3.07e-41	1ad4:A, 6clv:A, 6clv:B
16	6ucz:B	265	253	0.3055	0.3170	0.3320	1.54e-38	6ucz:A
17	7s2k:A	268	261	0.3127	0.3209	0.3295	5.45e-36	7s2k:B
18	6jwz:B	565	270	0.3164	0.1540	0.3222	3.75e-32	6jwr:A, 6jwr:B, 6jwv:A, 6jww:A, 6jww:B, 6jwx:A, 6jwy:A, 6kcl:A, 6kcm:A
19	5z79:B	562	280	0.3091	0.1512	0.3036	4.03e-32
20	6jwq:B	590	282	0.3164	0.1475	0.3085	4.31e-32	6jwq:A, 6jws:A, 6jws:B, 6jwt:A, 6jwt:B, 6jwu:A, 6jwz:A, 6kck:A, 6kck:B, 6kcm:B
21	5z79:C	599	296	0.3200	0.1469	0.2973	1.57e-30	5z79:A, 5z79:D, 5z79:E, 5z79:F
22	2vef:A	279	287	0.3491	0.3441	0.3345	1.70e-30	2veg:A
23	2bmb:A	513	320	0.3200	0.1715	0.2750	2.03e-30
24	7s2i:A	264	257	0.2764	0.2879	0.2957	5.20e-29	7s2i:B
25	6kcl:B	545	264	0.2909	0.1468	0.3030	3.26e-25	6jwu:B, 6jwv:B, 6jwx:B, 6jwy:B
26	8sl9:A	422	216	0.2291	0.1493	0.2917	1.53e-18	4pzv:A
27	3mco:A	397	216	0.2145	0.1486	0.2731	2.48e-13	3mcn:B, 3mco:B
28	3mcm:A	368	217	0.2109	0.1576	0.2673	1.01e-07	3mcn:A
29	4kpu:B	263	62	0.0691	0.0722	0.3065	0.44	4l2i:B
30	5mcp:E	387	66	0.0727	0.0517	0.3030	1.1	5mcp:G
31	7kdf:A	270	24	0.0436	0.0444	0.5000	6.3
32	8c7f:A	772	70	0.0691	0.0246	0.2714	6.8	7zb3:A, 7zb3:B, 7zdy:W, 7zdy:Y, 7zgz:Y
33	7zgz:X	753	70	0.0691	0.0252	0.2714	7.2	8c7f:B
34	4g8s:A	182	43	0.0509	0.0769	0.3256	8.8	4g8s:B

[Back]