BioLiP

>protein
MHLKIVCLSDEVREMYKNHKTHHEGDSGLDLFIVKDEVLKPKSTTFVKLGIKAIALQYKSNYYYKNIVNTSFLLFPRSSI
SKTPLRLANSIGLIDAGYRGEIIAALDNTSDQEYHIKKNDKLVQLVSFTGEPLSFELVEELDETSRGEGGFGS

The query sequence (length=153) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3t64:A	153	153	1.0000	1.0000	1.0000	1.30e-111	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
2	2y8c:C	136	153	0.8889	1.0000	0.8889	2.29e-91	2y8c:B
3	8hrv:B	145	135	0.3137	0.3310	0.3556	9.52e-17	8hrv:A, 8hrv:C
4	6hde:B	152	131	0.2876	0.2895	0.3359	5.59e-14	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
5	6lj3:A	164	141	0.3007	0.2805	0.3262	6.93e-11	6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
6	7n6s:C	147	138	0.2941	0.3061	0.3261	8.60e-11	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
7	4gcy:A	163	132	0.2810	0.2638	0.3258	1.25e-10	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
8	6mao:A	137	123	0.2353	0.2628	0.2927	1.42e-09
9	6mjk:A	144	127	0.2484	0.2639	0.2992	2.87e-09
10	4oop:B	142	62	0.1765	0.1901	0.4355	6.50e-09	4oop:A, 4oop:C
11	1f7r:A	133	131	0.2484	0.2857	0.2901	9.21e-08	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
12	3f4f:A	138	90	0.2026	0.2246	0.3444	3.23e-07	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
13	5cct:A	169	179	0.3137	0.2840	0.2682	2.25e-06	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
14	6ljj:A	150	123	0.2353	0.2400	0.2927	8.37e-05	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
15	4wrk:A	158	169	0.3007	0.2911	0.2722	1.44e-04	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
16	5f9k:B	130	74	0.1634	0.1923	0.3378	2.30e-04	5f9k:A, 5f9k:C
17	2ol1:C	125	110	0.1765	0.2160	0.2455	0.005	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
18	2bt1:A	254	109	0.2026	0.1220	0.2844	0.065	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
19	2bt1:A	254	91	0.1438	0.0866	0.2418	1.2	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
20	4aoo:A	143	138	0.2614	0.2797	0.2899	0.082	4ao5:A, 4ao5:B, 4ao5:C, 4ao5:D, 4ao5:E, 4ao5:F, 4aoo:B, 4aoo:C, 4aoo:D, 4aoz:A, 4aoz:B, 4aoz:C, 4apz:1, 4apz:Y, 4apz:2, 4apz:3, 4apz:4, 4apz:5, 4apz:7, 4apz:6, 4apz:8, 4apz:9, 4apz:a, 4apz:A, 4apz:C, 4apz:B, 4apz:D, 4apz:E, 4apz:F, 4apz:G, 4apz:I, 4apz:H, 4apz:J, 4apz:K, 4apz:L, 4apz:M, 4apz:N, 4apz:O, 4apz:P, 4apz:R, 4apz:Q, 4apz:S, 4apz:U, 4apz:T, 4apz:V, 4apz:W, 4apz:X, 4apz:Z, 4apz:b, 4apz:d, 4apz:c, 4apz:e, 4apz:g, 4apz:f, 4apz:h, 4apz:j, 4apz:i, 4apz:k, 4apz:m, 4apz:l, 4b0h:A, 4b0h:B, 4b0h:C, 2xce:A, 2xce:B, 2xce:C, 2xce:D, 2xce:E, 2xce:F, 2xy3:A, 2xy3:B, 2xy3:C, 2xy3:D, 2xy3:E, 2xy3:F
21	5y5p:D	171	155	0.2353	0.2105	0.2323	0.57	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
22	4xjc:A	177	57	0.1176	0.1017	0.3158	1.0	4xjc:E, 4xjc:C, 4xjc:B, 4xjc:F, 4xjc:D
23	3gf0:A	199	50	0.1046	0.0804	0.3200	2.3	2hxd:A, 1pkj:B, 1pkk:B
24	4bju:A	548	21	0.0719	0.0201	0.5238	3.0	4bju:B, 5o9x:A, 5oaw:A, 5oaw:B
25	8dd5:A	272	71	0.1242	0.0699	0.2676	3.7	1m36:A, 2ozu:A, 2rc4:A
26	8a22:Bc	289	79	0.1503	0.0796	0.2911	4.3	8apn:Bc, 8apo:Bc
27	5thx:A	257	127	0.1895	0.1128	0.2283	5.1
28	1ug9:A	1019	25	0.0915	0.0137	0.5600	5.4	1ulv:A
29	8eg0:A	230	33	0.0588	0.0391	0.2727	6.6	3ckk:A, 8cth:A, 8cti:A, 8d59:A, 8d5b:A, 8d9l:A, 7ogj:A, 7ogj:B, 7pl1:A
30	8dh6:b	236	41	0.0980	0.0636	0.3659	7.5	8e7s:P, 8e7s:p, 8ec0:P, 6giq:b, 6hu9:b, 6hu9:n, 6t0b:b, 6t0b:o, 6t15:b, 6ymx:b, 6ymy:b, 7z10:b
31	6ldk:A	813	48	0.1046	0.0197	0.3333	8.0

[Back]