Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MHLKIVCLSDEVREMYKNHKGDSGLDLFIVKDEVLKPKSTTFVKLGIKAIALQYKSNYYYKSNIVNTSFLLFPRSSISKT
PLRLANSIGLIDAGYRGEIIAALDNTSDQEYHIKKNDKLVQLVSFTGEPLSFELVEELDETSRGEGGFGS

The query sequence (length=150) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3t64:A 153 154 0.9933 0.9739 0.9675 6.82e-104 3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
2 2y8c:C 136 150 0.9067 1.0000 0.9067 5.93e-92 2y8c:B
3 8hrv:B 145 131 0.3133 0.3241 0.3588 2.21e-16 8hrv:A, 8hrv:C
4 6hde:B 152 132 0.2933 0.2895 0.3333 7.24e-14 1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
5 6lj3:A 164 143 0.3200 0.2927 0.3357 5.57e-11 6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
6 4gcy:A 163 150 0.3133 0.2883 0.3133 7.33e-11 8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
7 7n6s:C 147 131 0.2933 0.2993 0.3359 2.58e-10 7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
8 6mao:A 137 123 0.2400 0.2628 0.2927 4.53e-09
9 4oop:B 142 62 0.1800 0.1901 0.4355 5.59e-09 4oop:A, 4oop:C
10 6mjk:A 144 128 0.2467 0.2569 0.2891 6.29e-09
11 1f7r:A 133 132 0.2533 0.2857 0.2879 1.12e-07 1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
12 5cct:A 169 176 0.3133 0.2781 0.2670 1.80e-07 5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
13 3f4f:A 138 86 0.1867 0.2029 0.3256 2.83e-07 3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
14 4wrk:A 158 166 0.3000 0.2848 0.2711 1.10e-05 4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
15 6ljj:A 150 142 0.2600 0.2600 0.2746 1.99e-05 3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
16 5f9k:B 130 142 0.2467 0.2846 0.2606 2.33e-04 5f9k:A, 5f9k:C
17 4aoo:A 143 157 0.3067 0.3217 0.2930 8.22e-04 4ao5:A, 4ao5:B, 4ao5:C, 4ao5:D, 4ao5:E, 4ao5:F, 4aoo:B, 4aoo:C, 4aoo:D, 4aoz:A, 4aoz:B, 4aoz:C, 4apz:1, 4apz:Y, 4apz:2, 4apz:3, 4apz:4, 4apz:5, 4apz:7, 4apz:6, 4apz:8, 4apz:9, 4apz:a, 4apz:A, 4apz:C, 4apz:B, 4apz:D, 4apz:E, 4apz:F, 4apz:G, 4apz:I, 4apz:H, 4apz:J, 4apz:K, 4apz:L, 4apz:M, 4apz:N, 4apz:O, 4apz:P, 4apz:R, 4apz:Q, 4apz:S, 4apz:U, 4apz:T, 4apz:V, 4apz:W, 4apz:X, 4apz:Z, 4apz:b, 4apz:d, 4apz:c, 4apz:e, 4apz:g, 4apz:f, 4apz:h, 4apz:j, 4apz:i, 4apz:k, 4apz:m, 4apz:l, 4b0h:A, 4b0h:B, 4b0h:C, 2xce:A, 2xce:B, 2xce:C, 2xce:D, 2xce:E, 2xce:F, 2xy3:A, 2xy3:B, 2xy3:C, 2xy3:D, 2xy3:E, 2xy3:F
18 2ol1:C 125 121 0.1667 0.2000 0.2066 0.013 2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
19 2bt1:A 254 109 0.1800 0.1063 0.2477 0.020 2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
20 2bt1:A 254 92 0.1467 0.0866 0.2391 2.7 2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
21 4bju:A 548 32 0.0933 0.0255 0.4375 0.18 4bju:B, 5o9x:A, 5oaw:A, 5oaw:B
22 4xjc:A 177 57 0.1200 0.1017 0.3158 1.3 4xjc:E, 4xjc:C, 4xjc:B, 4xjc:F, 4xjc:D
23 5y5p:D 171 84 0.1533 0.1345 0.2738 1.9 5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
24 3gf0:A 199 50 0.1067 0.0804 0.3200 2.2 2hxd:A, 1pkj:B, 1pkk:B
25 2pfy:A 301 96 0.1467 0.0731 0.2292 4.5 2pfy:B, 2pfy:C, 2pfy:D
26 1ug9:A 1019 25 0.0933 0.0137 0.5600 5.1 1ulv:A
27 8tx9:A 190 108 0.1533 0.1211 0.2130 5.2 8tx9:B, 8tx9:C, 8tx9:D
28 7thm:A 860 73 0.1067 0.0186 0.2192 5.3
29 8gwe:A 931 73 0.1067 0.0172 0.2192 5.5 7aap:A, 7b3b:A, 7b3c:A, 7b3d:A, 7btf:A, 7bv1:A, 7bv2:A, 7bw4:A, 7bzf:A, 7c2k:A, 7ctt:A, 7cxm:A, 7cxn:A, 7cyq:A, 7d4f:A, 7dfg:A, 7dfh:A, 7doi:A, 7dok:A, 7dte:A, 7ed5:A, 7egq:A, 7egq:N, 7eiz:A, 8gw1:A, 8gwb:A, 8gwf:A, 8gwg:A, 8gwi:A, 8gwk:A, 8gwm:A, 8gwn:A, 8gwo:A, 8gy6:A, 7krn:A, 7kro:A, 7krp:A, 7l1f:A, 6nur:A, 7oyg:A, 7oyg:D, 7ozu:A, 7ozv:A, 7rdx:A, 7rdy:A, 7rdz:A, 7re0:A, 7re1:A, 7re2:A, 7re3:A, 7re3:G, 8sq9:A, 8sqj:A, 8sqk:A, 7uo4:A, 7uo7:A, 7uo9:A, 7uob:A, 7uoe:A, 6xez:A, 6xqb:A, 6yyt:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218