Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MHIDNIENLSDREFDYIVVGGGSAGAAVAARLSEDPAVSVALVEAGPDDRGVPEVLQLDRWMELLESGYDWDYPIEPQEN
GNSFMRHARAKVMGGCSSHNACIAFWAPREDLDEWEAKYGATGWNAEAAWPLYKRLETNEDAGPDAPHHGDSGPVHLMNV
PPKDPTGVALLDACEQAGIPRAKFNTGTTVVNGANFFQINRRADGTRSSSSVSYIHPIVEQENFTLLTGLRARQLVFDAD
RRCTGVDIVDSAFGHTHRLTARNEVVLSTGAIDTPKLLMLSGIGPAAHLAEHGIEVLVDSPGVGEHLQDHPEGVVQFEAK
QPMVAESTQWWEIGIFTPTEDGLDRPDLMMHYGSVPFDMNTLRHGYPTTENGFSLTPNVTHARSRGTVRLRSRDFRDKPM
VDPRYFTDPEGHDMRVMVAGIRKAREIAAQPAMAEWTGRELSPGVEAQTDEELQDYIRKTHNTVYHPVGTVRMGAVEDEM
SPLDPELRVKGVTGLRVADASVMPEHVTVNPNITVMMIGERCADLIRSAR

The query sequence (length=530) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4mjw:A 532 530 0.9981 0.9944 0.9981 0.0 2jbv:A, 2jbv:B, 3ljp:A, 3ljp:B, 4mjw:B, 3nne:A, 3nne:B, 3nne:C, 3nne:D, 3nne:E, 3nne:F, 3nne:G, 3nne:H
2 8b7s:A 458 519 0.3415 0.3952 0.3487 7.62e-70
3 5ncc:A 578 578 0.3453 0.3166 0.3166 1.80e-67 7av4:AAA, 5ncc:B, 5ncc:C, 5ncc:D, 5ncc:E, 5ncc:F, 7r33:A, 7r33:B, 7r34:A, 7r34:B, 7r35:A, 7r35:B, 7r36:A, 7r36:B, 6yru:AAA, 6yrv:AAA, 6yrx:AAA, 6yrz:AAA, 6ys1:AAA, 6ys2:AAA, 6zh7:A, 6zh7:B
4 3t37:A 509 524 0.3038 0.3163 0.3073 1.33e-57 4ha6:A
5 3fim:B 565 579 0.3189 0.2991 0.2919 4.57e-56 5oc1:A
6 8bxl:B 590 584 0.3094 0.2780 0.2808 2.05e-55 8bxl:C, 8bxl:D, 8bxl:A, 8bxl:F, 8bxl:E
7 4udq:A 525 553 0.3396 0.3429 0.3255 4.27e-53 6f97:A, 6f97:B, 4udp:A, 4udp:B, 4udq:B, 4udr:A, 4udr:B
8 6xut:A 589 600 0.3189 0.2869 0.2817 4.06e-46 6xuu:A, 6xuv:A
9 4h7u:A 577 567 0.2830 0.2600 0.2646 1.35e-44
10 4ynt:A 570 582 0.3094 0.2877 0.2818 4.95e-40 7vkd:A, 7vkf:A, 7vzp:A, 7vzp:B, 7vzs:A, 7vzs:B, 4ynu:A
11 8il5:B 595 600 0.2868 0.2555 0.2533 1.68e-37
12 3q9t:A 577 315 0.2038 0.1872 0.3429 2.06e-36 3q9t:B, 3q9t:C, 5zu2:A, 5zu2:B, 5zu2:C, 5zu3:A, 5zu3:B, 5zu3:C
13 3q9t:A 577 167 0.0943 0.0867 0.2994 4.56e-12 3q9t:B, 3q9t:C, 5zu2:A, 5zu2:B, 5zu2:C, 5zu3:A, 5zu3:B, 5zu3:C
14 1cf3:A 581 574 0.2849 0.2599 0.2631 4.31e-35 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
15 5hsa:A 662 640 0.3226 0.2583 0.2672 9.64e-35 5hsa:B, 5hsa:C, 5hsa:D, 5hsa:E, 5hsa:F, 5hsa:G, 5hsa:H, 5i68:A
16 6h3o:F 650 314 0.1925 0.1569 0.3248 4.35e-33 6h3g:A, 6h3g:B, 6h3g:C, 6h3g:F, 6h3g:D, 6h3g:E, 6h3g:G, 6h3g:H, 6h3o:A, 6h3o:B, 6h3o:C, 6h3o:D, 6h3o:E, 6h3o:G, 6h3o:H, 8il5:A
17 6h3o:F 650 79 0.0434 0.0354 0.2911 9.31e-05 6h3g:A, 6h3g:B, 6h3g:C, 6h3g:F, 6h3g:D, 6h3g:E, 6h3g:G, 6h3g:H, 6h3o:A, 6h3o:B, 6h3o:C, 6h3o:D, 6h3o:E, 6h3o:G, 6h3o:H, 8il5:A
18 6ze7:B 586 324 0.1811 0.1638 0.2963 6.92e-30 7aa2:A, 7aa2:B, 6ze2:A, 6ze2:B, 6ze3:A, 6ze4:A, 6ze4:B, 6ze5:A, 6ze5:B, 6ze6:A, 6ze6:B, 6ze7:A
19 6ze7:B 586 146 0.1038 0.0939 0.3767 6.40e-13 7aa2:A, 7aa2:B, 6ze2:A, 6ze2:B, 6ze3:A, 6ze4:A, 6ze4:B, 6ze5:A, 6ze5:B, 6ze6:A, 6ze6:B, 6ze7:A
20 3gdn:A 521 536 0.2604 0.2649 0.2575 1.32e-29 3gdn:B, 3gdp:A, 3gdp:B, 1ju2:A, 1ju2:B
21 8il4:C 619 306 0.1887 0.1616 0.3268 4.56e-29 8il4:A, 8il4:B, 8il4:D
22 8il4:C 619 79 0.0434 0.0372 0.2911 2.47e-04 8il4:A, 8il4:B, 8il4:D
23 1gpe:B 587 573 0.2604 0.2351 0.2408 5.47e-27 1gpe:A
24 3red:A 521 546 0.2566 0.2610 0.2491 7.10e-27 3red:B, 3red:C, 3red:D, 3red:E, 3red:F, 3red:G, 3red:H, 3red:I, 3red:J, 3red:K, 3red:L
25 6jby:A 521 555 0.2698 0.2745 0.2577 3.54e-25 7bwp:A, 7cgs:A, 5eb4:A, 5eb4:B, 5eb5:A, 5eb5:B, 8jm0:A, 8jm1:A, 8jm2:A, 8jm3:A, 8jm4:A, 8jm5:B, 8jm6:A, 8jm7:A, 8jm8:A, 6lqy:A, 6lr8:A
26 6o9n:A 613 335 0.1679 0.1452 0.2657 1.88e-17 6o9n:B
27 6o9n:A 613 151 0.1019 0.0881 0.3576 2.68e-14 6o9n:B
28 8orh:A 649 436 0.1943 0.1587 0.2362 5.39e-08 8orh:B, 8ors:A, 8ors:B, 7yx3:A, 7yx3:B, 4z24:A, 4z24:B, 4z25:A, 4z25:B, 4z25:C, 4z25:D, 4z25:E, 4z25:F, 4z25:G, 4z25:H, 4z25:I, 4z25:J, 4z25:K, 4z25:L, 4z26:A, 4z26:B, 4z26:C, 4z26:D, 4z26:E, 4z26:F, 4z26:G, 4z26:H
29 1kdg:B 546 582 0.2396 0.2326 0.2182 8.48e-08 1kdg:A, 1naa:A, 1naa:B
30 7yx4:A 650 364 0.1679 0.1369 0.2445 2.21e-07 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
31 7yx4:A 650 80 0.0509 0.0415 0.3375 0.11 7ptv:A, 7ptv:B, 7yx4:B, 7yx5:A
32 4qi7:A 805 364 0.1623 0.1068 0.2363 1.14e-05 4qi7:B
33 7dve:A 498 337 0.1642 0.1747 0.2582 1.81e-04
34 3b3r:A 503 119 0.0623 0.0656 0.2773 4.79e-04 1b4v:A, 3b6d:A, 1b8s:A, 1cbo:A, 1cc2:A, 3cnj:A, 2gew:A, 3gyi:A, 3gyj:A, 1ijh:A, 5kwf:A, 1mxt:A, 1n1p:A, 1n4u:A, 1n4v:A, 1n4w:A, 4rek:A, 4u2l:A, 4u2s:A, 4u2t:A, 4xwr:A, 4xxg:A
35 1coy:A 501 65 0.0472 0.0499 0.3846 6.05e-04 3cox:A
36 8jej:A 540 88 0.0566 0.0556 0.3409 6.51e-04 8jek:A, 8k6j:A, 8k6k:A, 7w2j:A, 7w2j:D, 7wsq:A, 7wsq:D, 8xcm:A, 8xcn:A
37 8qve:A 495 61 0.0453 0.0485 0.3934 0.005
38 8qve:A 495 38 0.0321 0.0343 0.4474 1.0
39 7qfd:A 458 61 0.0434 0.0502 0.3770 0.016 7qva:A
40 7qfd:A 458 52 0.0396 0.0459 0.4038 0.53 7qva:A
41 7qf8:A 494 61 0.0434 0.0466 0.3770 0.019
42 7qf8:A 494 52 0.0396 0.0425 0.4038 0.59
43 4qi6:A 800 364 0.1585 0.1050 0.2308 0.080 4qi3:A, 4qi3:B, 4qi4:A, 4qi5:A
44 1rp0:A 278 32 0.0302 0.0576 0.5000 0.095 1rp0:B
45 8grj:B 531 104 0.0547 0.0546 0.2788 1.4 6a2u:B, 6a2u:D, 8grj:D, 8hdd:A
46 8ear:A 2389 75 0.0396 0.0088 0.2800 1.4 8eaq:A, 8eaq:B, 8eaq:C, 8eaq:D, 8ear:D, 8ear:B, 8ear:C
47 4mif:B 581 102 0.0528 0.0482 0.2745 1.7 4mif:A, 4mif:C, 4mif:D, 4mig:A, 4mig:B, 4mig:C, 4mig:D, 4mih:A, 4mih:B, 4mih:C, 4mih:D, 4mih:E, 4mih:F, 4mih:G, 4mih:H
48 7fco:A 433 33 0.0302 0.0370 0.4848 1.8 7fco:B
49 6pbc:A 1070 51 0.0340 0.0168 0.3529 2.0
50 7z3j:A 1119 51 0.0340 0.0161 0.3529 2.2 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
51 7t8t:A 1086 51 0.0340 0.0166 0.3529 2.2
52 2esd:A 474 119 0.0566 0.0633 0.2521 2.6 2esd:B, 2esd:C, 2esd:D, 2euh:A, 2euh:B, 2euh:C, 2euh:D, 2id2:A, 2id2:B, 2id2:C, 2id2:D, 2qe0:A, 2qe0:B, 2qe0:C, 2qe0:D, 1qi1:A, 1qi1:B, 1qi1:C, 1qi1:D
53 2dki:A 615 57 0.0358 0.0309 0.3333 2.9 2dkh:A
54 8jze:j 98 51 0.0358 0.1939 0.3725 3.3 8jzf:j
55 6h6c:A 151 88 0.0434 0.1523 0.2614 3.7 5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
56 6n7f:A 451 18 0.0245 0.0288 0.7222 3.7 6n7f:B, 6n7f:C, 6n7f:D
57 3atq:A 452 42 0.0245 0.0288 0.3095 3.7 3atr:A, 4opc:A, 4opd:A, 4opd:B, 4opg:A, 4opi:A, 4opl:A, 4opt:A, 4opu:A
58 3he3:A 366 20 0.0208 0.0301 0.5500 4.1 3hdq:A, 3hdq:B, 3hdq:C, 3hdq:D, 3hdq:E, 3hdq:F, 3hdq:G, 3hdq:H, 3hdq:I, 3hdq:J, 3hdy:A, 3hdy:B, 3hdy:C, 3hdy:D, 3hdy:E, 3hdy:F, 3hdy:G, 3hdy:H, 3hdy:I, 3hdy:J, 3he3:B, 3he3:C, 3he3:D, 3he3:E, 3he3:F, 3he3:G, 3he3:H, 3he3:I, 3he3:J, 3mj4:A, 3mj4:B, 3mj4:C, 3mj4:D, 3mj4:E, 3mj4:F, 3mj4:G, 3mj4:H, 3mj4:I, 3mj4:J
59 7kw6:A 697 89 0.0434 0.0330 0.2584 4.5
60 2z5x:A 513 32 0.0283 0.0292 0.4688 5.1 2bxr:A, 2bxr:B, 2bxs:A, 2bxs:B, 2z5y:A
61 6mu1:A 2149 101 0.0453 0.0112 0.2376 5.2 6mu1:C, 6mu1:B, 6mu1:D
62 5gug:A 1721 93 0.0472 0.0145 0.2688 5.5 5gug:B, 1n4k:A, 3t8s:B, 3uj0:A, 3uj0:B, 5xa1:A, 5xa1:B
63 6yw5:AA 372 88 0.0509 0.0726 0.3068 5.7 6ywe:AA, 6ywx:AA, 6ywy:AA
64 7jyp:A 305 77 0.0396 0.0689 0.2727 6.1
65 4rm4:A 364 40 0.0245 0.0357 0.3250 6.4
66 6ioh:A 375 82 0.0396 0.0560 0.2561 6.5 6ioh:B, 6ioi:A, 6ioi:B
67 5dbj:E 437 35 0.0245 0.0297 0.3714 6.5 5dbj:A, 5dbj:B, 5dbj:C, 5dbj:D
68 7koe:C 438 34 0.0283 0.0342 0.4412 6.9 7koe:G
69 1o5w:C 512 32 0.0283 0.0293 0.4688 7.3 1o5w:A, 1o5w:B, 1o5w:D
70 8i6i:A 448 31 0.0321 0.0379 0.5484 9.8 8i6i:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218