Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MHHHHHHENLYFQGTVVTTESGLKYEDLTEGSGAEARAGQTVSVHYTGWLTDGQKFDSSKDRNDPFAFVLGGGMVIKGWD
EGVQGMKVGGVRRLTIPPQLGYGARGAGGVIPPNATLVFEVELLDV

The query sequence (length=126) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8p3c:B 126 126 1.0000 1.0000 1.0000 6.00e-91
2 4giv:A 192 112 0.8810 0.5781 0.9911 8.25e-77 4dz2:A, 4dz2:B, 4dz3:A, 4dz3:B, 4fn2:A, 4fn2:B, 4g50:A, 4g50:B, 4ggq:C, 4ggq:A, 4ggq:B, 4ggq:D, 4giv:B, 5klx:A, 5klx:B, 5klx:D, 5klx:C, 2ko7:A, 2l2s:A, 6o49:A, 6o49:B, 6o4a:A, 6o4a:B, 6o4a:C, 6o4a:D, 3uf8:A, 3uqa:A, 3uqb:A, 5v8t:A, 5v8t:B, 3vaw:A
3 8xi9:A 201 111 0.4683 0.2935 0.5315 4.66e-35 1a7x:A, 1a7x:B, 1bkf:A, 1bl4:A, 1bl4:B, 8chi:A, 8chi:B, 8chj:A, 8chj:B, 8chj:C, 8chj:D, 8chk:A, 8chk:B, 8chk:C, 8chl:A, 8chl:B, 8chm:A, 1d7i:A, 1d7i:B, 1d7j:A, 1d7j:B, 2dg3:A, 2dg4:A, 2dg9:A, 4dh0:A, 8er6:A, 8er6:C, 8er6:E, 8er7:A, 8er7:C, 8er7:E, 8era:B, 1f40:A, 1fap:A, 2fap:A, 3fap:A, 4fap:A, 1fkb:A, 1fkd:A, 1fkf:A, 1fkg:A, 1fkh:A, 1fki:A, 1fki:B, 1fkj:A, 1fkl:A, 2fke:A, 1j4h:A, 1j4i:A, 1j4r:A, 1j4r:B, 1j4r:D, 6m4u:A, 6m4u:E, 6m4v:B, 6m4v:D, 6m4w:D, 6m4w:E, 6m4w:F, 1nsg:A, 6oqa:A, 6oqa:B, 6oqa:E, 6oqa:F, 8pdf:A, 8ppz:A, 1qpf:A, 1qpf:D, 1qpl:A, 1qpl:C, 1tco:C, 7u0t:B, 7u8d:A, 7u8d:B, 6vcu:A, 6vcu:C, 6vcu:D, 6vcu:B, 6yf0:A, 6yf1:A, 6yf2:A, 6yf3:A
4 7u0s:A 124 107 0.4841 0.4919 0.5701 1.52e-33 5hwc:A, 6tz7:C, 7u0s:B, 7u0u:B, 6vcv:A, 6vcv:B
5 5hua:A 113 110 0.4683 0.5221 0.5364 1.87e-33 1yat:A
6 1c9h:A 107 106 0.4365 0.5140 0.5189 3.84e-33 5hkg:A
7 7f2j:A 117 114 0.4921 0.5299 0.5439 3.36e-32 7f2j:B, 6j2m:A
8 4nnr:A 102 92 0.4206 0.5196 0.5761 6.50e-31 4nnr:B
9 6tz8:C 111 106 0.4286 0.4865 0.5094 8.79e-31 6tz8:F
10 4lax:A 237 97 0.4444 0.2363 0.5773 1.13e-30 4drj:A, 4lay:A, 6rcy:A, 4tw8:A, 4tw8:B
11 6mke:A 117 109 0.4365 0.4701 0.5046 1.11e-29 6mke:B, 6mke:C, 6mke:D
12 6vrx:A 108 106 0.4048 0.4722 0.4811 7.97e-28 6vct:A, 6vrx:B, 6vrx:C, 6vrx:D
13 5njx:A 413 96 0.4127 0.1259 0.5417 2.47e-26 7a6w:AAA, 7a6w:BBB, 7a6x:AAA, 7aot:A, 7aou:A, 7apq:A, 7aps:A, 7aps:B, 7apt:A, 7apw:A, 7awf:A, 7awx:A, 7awx:B, 7b9y:A, 7b9z:A, 7ba0:A, 8ba6:A, 8baj:A, 5bxj:A, 8cca:A, 8ccb:A, 8ccc:A, 8ccd:A, 8cce:A, 8ccf:A, 8ccg:A, 8cch:A, 8chn:A, 8chp:A, 8chq:A, 8chr:A, 5dit:A, 5diu:A, 5div:A, 4drh:A, 4drh:D, 4dri:A, 4drk:A, 4drk:B, 4drm:A, 4drn:A, 4dro:A, 4drp:A, 4drq:A, 7ett:A, 7etu:A, 7etv:A, 9eu6:A, 9eu7:A, 9eu7:B, 9eu8:A, 9eu8:B, 9eu9:A, 9eu9:B, 9eua:A, 9eua:B, 9eub:A, 9eub:B, 9euc:A, 9euc:B, 9eud:A, 9eud:B, 9eue:A, 9eue:B, 9ey3:A, 9ey4:A, 4jfi:A, 4jfj:A, 4jfk:A, 4jfl:A, 4jfm:A, 3o5f:A, 3o5r:A, 5obk:A, 8pc2:G, 8pc2:H, 8pj8:A, 8pja:A, 7r0l:A, 8r5k:A, 6saf:A, 4tw6:A, 4tw7:A, 4tx0:A, 6tx4:A, 6tx5:A, 6tx6:A, 6tx7:A, 6tx9:A, 6txx:A, 4w9o:A, 4w9o:E, 4w9p:A, 4w9p:E, 4w9q:A
14 5njx:A 413 121 0.2778 0.0847 0.2893 0.018 7a6w:AAA, 7a6w:BBB, 7a6x:AAA, 7aot:A, 7aou:A, 7apq:A, 7aps:A, 7aps:B, 7apt:A, 7apw:A, 7awf:A, 7awx:A, 7awx:B, 7b9y:A, 7b9z:A, 7ba0:A, 8ba6:A, 8baj:A, 5bxj:A, 8cca:A, 8ccb:A, 8ccc:A, 8ccd:A, 8cce:A, 8ccf:A, 8ccg:A, 8cch:A, 8chn:A, 8chp:A, 8chq:A, 8chr:A, 5dit:A, 5diu:A, 5div:A, 4drh:A, 4drh:D, 4dri:A, 4drk:A, 4drk:B, 4drm:A, 4drn:A, 4dro:A, 4drp:A, 4drq:A, 7ett:A, 7etu:A, 7etv:A, 9eu6:A, 9eu7:A, 9eu7:B, 9eu8:A, 9eu8:B, 9eu9:A, 9eu9:B, 9eua:A, 9eua:B, 9eub:A, 9eub:B, 9euc:A, 9euc:B, 9eud:A, 9eud:B, 9eue:A, 9eue:B, 9ey3:A, 9ey4:A, 4jfi:A, 4jfj:A, 4jfk:A, 4jfl:A, 4jfm:A, 3o5f:A, 3o5r:A, 5obk:A, 8pc2:G, 8pc2:H, 8pj8:A, 8pja:A, 7r0l:A, 8r5k:A, 6saf:A, 4tw6:A, 4tw7:A, 4tx0:A, 6tx4:A, 6tx5:A, 6tx6:A, 6tx7:A, 6tx9:A, 6txx:A, 4w9o:A, 4w9o:E, 4w9p:A, 4w9p:E, 4w9q:A
15 1q6i:A 210 123 0.4444 0.2667 0.4553 1.20e-25 1q6i:B
16 5hw8:B 122 102 0.3968 0.4098 0.4902 1.31e-25 5hw8:A, 5hw8:C, 5hw8:D, 5hw8:E, 5hw8:F, 5hw8:G, 5hw8:H, 6tz6:C, 6tz6:F
17 8bk4:A 163 115 0.4127 0.3190 0.4522 2.18e-23 8p3d:A, 8p42:A, 8p42:D
18 3pa7:A 124 112 0.3810 0.3871 0.4286 9.28e-22 3ihz:A, 3ihz:B, 4itz:A, 4itz:B, 4j4o:A, 4mgv:A
19 4msp:A 189 95 0.3413 0.2275 0.4526 6.08e-21 4msp:B
20 8bjd:A 208 111 0.3571 0.2163 0.4054 8.72e-21 8bje:A, 8bk5:A, 2vcd:A
21 8z38:B 113 94 0.3810 0.4248 0.5106 1.05e-20 8z38:A
22 4qt3:A 125 117 0.3889 0.3920 0.4188 1.53e-20 4j4n:A, 4j4n:B, 4j4n:C, 4qt2:A, 2vn1:A, 2vn1:B
23 5b8i:C 119 112 0.3889 0.4118 0.4375 6.93e-20
24 5d75:A 120 116 0.3810 0.4000 0.4138 3.98e-19 5gpg:A, 3kz7:A, 1pbk:A
25 5mgx:G 266 103 0.2619 0.1241 0.3204 1.33e-07 5mgx:F, 5mgx:E, 5mgx:H
26 4odq:A 106 87 0.1984 0.2358 0.2874 2.16e-04 4odp:A, 4odr:A, 4odr:B, 7oxg:A, 7oxg:B
27 3ddd:A 281 27 0.1111 0.0498 0.5185 5.10e-04
28 2ig6:A 143 39 0.1429 0.1259 0.4615 0.006 2ig6:B
29 3gyd:B 180 42 0.1349 0.0944 0.4048 0.007 3gyd:A
30 7d80:5 432 60 0.1587 0.0463 0.3333 0.011 7d6z:h, 1w2b:5
31 5k1s:A 358 13 0.0952 0.0335 0.9231 0.012 5k1s:C, 5k1s:B, 5k1s:D
32 4yo8:B 242 13 0.0952 0.0496 0.9231 0.014 4bmx:B, 4bmz:A, 4bmz:B, 5ccd:A, 5cce:A, 6dyu:A, 6dyu:B, 6dyv:A, 6dyv:B, 6dyw:A, 6dyw:B, 6dyy:A, 6dyy:B, 6dyy:C, 6dyy:D, 4ffs:A, 5jpc:A, 5k1z:A, 5kb3:A, 3nm5:A, 3nm5:B, 3nm6:B, 4ojt:A, 4oy3:A, 4p54:A, 4wkn:A, 4wko:A, 4wkp:A, 4wkp:B, 4wkp:C, 4wkp:D, 4ynb:A, 4yo8:A
33 7uor:A 379 11 0.0873 0.0290 1.0000 0.015 1f4t:A, 1f4t:B, 1f4u:A, 1f4u:B, 1io7:A, 1io7:B, 1io8:A, 1io8:B, 1io9:A, 1io9:B, 4tt5:A, 4tuv:A, 7uor:B, 7uor:C, 7uor:D, 7uor:E, 7uor:F, 4wpd:A, 4wpd:B, 4wqj:A
34 7xij:A 131 12 0.0952 0.0916 1.0000 0.015
35 6vgl:A 305 12 0.0952 0.0393 1.0000 0.030 6aaj:A, 6aaj:B, 5aep:A, 4aqc:A, 4aqc:B, 2b7a:A, 2b7a:B, 4bbe:A, 4bbe:B, 4bbe:C, 4bbe:D, 4bbf:A, 4bbf:B, 4bbf:C, 4bbf:D, 6bbv:A, 8bm2:A, 8bm2:B, 8bpv:A, 8bpw:A, 8bpw:B, 8bx6:A, 8bx9:A, 8bx9:B, 8bxc:A, 8bxc:B, 8bxh:A, 4c61:A, 4c61:B, 4c62:A, 4c62:B, 5cf4:A, 5cf4:B, 5cf5:A, 5cf5:B, 5cf6:A, 5cf6:B, 5cf8:A, 5cf8:B, 4d0w:A, 4d0x:A, 4d1s:A, 6drw:A, 4e4m:A, 4e4m:B, 4e4m:D, 4e4m:E, 3e62:A, 3e63:A, 3e64:A, 4e6d:A, 4e6d:B, 4e6q:A, 4e6q:B, 4f08:A, 4f08:B, 4f09:A, 3fup:A, 3fup:B, 8g6z:A, 8g6z:B, 8g8o:A, 8g8o:B, 8g8x:A, 8g8x:B, 4gfm:A, 4gl9:A, 4gl9:B, 4gl9:C, 4gl9:D, 4gmy:A, 5hez:A, 5hez:C, 5hez:B, 5hez:D, 4hge:A, 4hge:B, 3io7:A, 3iok:A, 4iva:A, 4ji9:A, 4ji9:B, 4jia:A, 3jy9:A, 3kck:A, 3krr:A, 5l3a:A, 7ll4:A, 7ll5:A, 3lpb:A, 3lpb:B, 4p7e:A, 4p7e:B, 3q32:A, 3q32:B, 7q7i:A, 7q7k:A, 7q7l:A, 7q7w:A, 7ree:A, 7rn6:A, 3rvg:A, 7teu:A, 3tjc:A, 3tjc:B, 3tjd:A, 3tjd:B, 6tpd:A, 5tq3:A, 5tq3:B, 5tq4:A, 5tq5:A, 5tq6:A, 5tq6:B, 5tq7:A, 5tq7:B, 5tq8:A, 3ugc:A, 5usy:A, 5usy:B, 7uyw:A, 6vgl:D, 6vgl:B, 6vgl:C, 6vn8:B, 6vn8:A, 6vnb:B, 6vnb:A, 6vnc:B, 6vnc:A, 6vne:B, 6vne:A, 6vnf:B, 6vnf:A, 6vng:B, 6vng:A, 6vnh:B, 6vnh:A, 6vni:B, 6vni:A, 6vnj:B, 6vnj:A, 6vnk:D, 6vnk:B, 6vnk:C, 6vnk:A, 6vnl:D, 6vnl:B, 6vnl:C, 6vnl:A, 6vnm:B, 6vnm:A, 6vs3:A, 6vs3:B, 6vsn:D, 6vsn:B, 6vsn:C, 6vsn:A, 2w1i:A, 5wev:A, 6wtn:A, 6wto:A, 6wtp:A, 6wtq:A, 6x8e:A, 6x8e:B, 2xa4:A, 2xa4:B, 4ytc:A, 4ytf:A, 4yth:A, 4yti:A, 4zim:A, 4zim:B, 3zmm:A, 3zmm:B
36 4guh:B 265 114 0.2540 0.1208 0.2807 0.11 4gug:A, 4gug:B, 4guh:A, 4gui:A, 4gui:B, 4guj:A, 4guj:B, 4iuo:A, 4iuo:B, 3m7w:A, 3m7w:B, 3m7w:C, 3m7w:D, 3m7w:E, 3m7w:F, 3nnt:A, 3nnt:B
37 8joj:A 523 38 0.1429 0.0344 0.4737 0.13 4c3x:A, 4c3x:B, 4c3x:C, 4c3x:D, 4c3x:E, 4c3x:F, 4c3x:G, 4c3x:H, 4c3y:A, 4c3y:B, 4c3y:C, 4c3y:D, 4c3y:E, 4c3y:F, 4c3y:G, 4c3y:H, 8jbz:AAA, 8ju4:A, 8kcz:A
38 4bo4:C 255 12 0.0794 0.0392 0.8333 0.17 4ag3:A, 4ag3:B, 4ag3:C, 4bnt:B, 4bnt:C, 4bnt:D, 4bnu:A, 4bnu:B, 4bnu:C, 4bnu:D, 4bnv:A, 4bnv:B, 4bnv:C, 4bnv:D, 4bnx:A, 4bnx:B, 4bnx:C, 4bnx:D, 4bny:A, 4bny:B, 4bny:C, 4bny:D, 4bnz:A, 4bnz:B, 4bnz:C, 4bnz:D, 4bo0:A, 4bo0:B, 4bo0:C, 4bo0:D, 4bo1:A, 4bo1:B, 4bo1:C, 4bo1:D, 4bo2:A, 4bo2:B, 4bo2:C, 4bo2:D, 4bo3:A, 4bo3:B, 4bo3:C, 4bo3:D, 4bo4:A, 4bo4:B, 4bo4:D, 4bo5:A, 4bo5:B, 4bo5:C, 4bo5:D, 4bo6:A, 4bo6:B, 4bo6:C, 4bo6:D, 4bo7:A, 4bo7:B, 4bo7:C, 4bo7:D, 4bo8:A, 4bo8:B, 4bo8:C, 4bo8:D, 4bo9:A, 4bo9:B, 4bo9:C, 4bo9:D
39 5m6d:A 346 14 0.0873 0.0318 0.7857 0.42 6fzh:A, 6fzh:B, 6ite:P, 6ite:Q, 6ite:R, 6ite:O
40 4ayg:A 1028 66 0.1429 0.0175 0.2727 0.48 4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
41 6i79:A 271 10 0.0794 0.0369 1.0000 0.74 7dsf:A, 7dsf:B, 4hwk:A, 4hwk:B, 4hwk:C, 4hwk:D, 6i6c:A, 6i6c:B, 6i6f:A, 6i6f:B, 6i6p:A, 6i6p:B, 6i6t:A, 6i6t:B, 6i6v:A, 6i6v:B, 6i79:B, 4j7u:A, 4j7u:B, 4j7u:C, 4j7u:D, 4j7x:A, 4j7x:B, 4j7x:F, 4j7x:J, 6usn:A, 6usn:B, 6usn:C, 6usn:D, 4xwy:A, 4xwy:B, 4xwy:C, 4xwy:D, 4z3k:A, 4z3k:B, 4z3k:C, 4z3k:D, 1z6z:A, 1z6z:B, 1z6z:C, 1z6z:D, 1z6z:E, 1z6z:F
42 2r6v:A 182 10 0.0794 0.0549 1.0000 1.2 3zoc:A, 3zod:A, 3zog:A
43 8rhf:B 327 26 0.0952 0.0367 0.4615 1.4 8rhe:A, 8rhe:B, 8rhf:A, 8rhi:A, 8rhi:B
44 2hxv:A 349 68 0.1508 0.0544 0.2794 1.9
45 3bgu:A 106 22 0.0794 0.0943 0.4545 4.4
46 3k6j:A 430 17 0.0794 0.0233 0.5882 7.5
47 3cpx:B 311 15 0.0794 0.0322 0.6667 7.5 3cpx:A, 3cpx:C
48 5y5w:B 195 14 0.0794 0.0513 0.7143 8.2 7ea1:C, 6i8b:B, 6i8b:E, 6i8l:B, 6i8y:A, 6qpl:B
49 1vlj:B 400 12 0.0635 0.0200 0.6667 9.8 1vlj:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218