Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MHAKLKCIKEKSTWNCCPIDWRAFQSNCYFPLTDNKTWAESERNCSGMGAHLMTISTEAEQNFIIQFLDRRLSYFLGLRD
ENAKGQWRWVDQTPFNPRRVFWHKNEPDNSQGENCVVLVYNQDKWAWNDVPCNFEASRICKIPGTTLN

The query sequence (length=148) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3whd:C 148 148 1.0000 1.0000 1.0000 1.29e-111 3whd:A
2 4zes:A 147 141 0.4257 0.4286 0.4468 1.64e-42 4zes:B, 4zet:A, 4zet:B
3 5vyb:A 143 138 0.4054 0.4196 0.4348 7.14e-42
4 3vyk:A 128 127 0.4189 0.4844 0.4882 3.10e-41
5 5b1w:A 130 128 0.3784 0.4308 0.4375 6.07e-37 5b1w:B, 5b1w:C, 5b1w:D, 5b1x:A, 5b1x:B, 5b1x:C, 5b1x:D
6 6lfj:A 133 129 0.3851 0.4286 0.4419 1.78e-35 6kzr:A, 6kzr:B, 6lfj:B, 6lkr:A, 6lkr:B
7 8h4v:A 148 134 0.3851 0.3851 0.4254 3.58e-35 8h4v:B, 8hb5:A, 5kth:A, 5kti:A, 4kzv:A, 4kzv:B, 4kzw:A, 4kzw:B, 4zrv:A, 4zrv:C, 4zrv:B, 4zrw:A
8 3wh2:A 132 132 0.3851 0.4318 0.4318 4.87e-35 3wh3:A
9 6jjj:A 151 129 0.3176 0.3113 0.3643 2.42e-23 6jjj:B, 6jjj:C, 6jjj:D, 6jjj:E, 6jjj:F
10 1sl6:A 168 132 0.3378 0.2976 0.3788 4.24e-23 1k9j:A, 1sl6:B, 1sl6:C, 1sl6:D, 1sl6:E, 1sl6:F, 1xph:A
11 6ghv:D 133 128 0.3311 0.3684 0.3828 6.74e-23 6ghv:A, 6ghv:B, 6ghv:C, 6ghv:E, 6ghv:F, 2it5:A, 2it6:A, 1k9i:A, 1k9i:C, 1k9i:D, 1k9i:E, 1k9i:H, 1k9i:B, 1k9i:F, 1k9i:G, 1k9i:I, 1k9i:J, 7nl6:A, 7nl7:A, 1sl4:A, 1sl5:A, 2xr5:A, 2xr6:A
12 1tdq:B 126 127 0.3041 0.3571 0.3543 2.21e-21
13 5k8y:A 136 126 0.3176 0.3456 0.3730 5.97e-20 5k8y:B, 5m62:A, 5m62:B
14 3kqg:A 169 125 0.2905 0.2544 0.3440 8.02e-19 4ak8:A, 4ak8:B, 4ak8:C, 4ak8:D, 3c22:A, 3c22:B, 3c22:C, 3c22:D, 5g6u:A, 5g6u:B, 5g6u:D, 5g6u:C, 3kqg:B, 3kqg:C, 3kqg:D, 3kqg:E, 3kqg:F, 4n32:A, 4n32:B, 4n32:C, 4n32:D, 4n33:A, 4n33:B, 4n33:C, 4n33:D, 4n34:A, 4n34:B, 4n34:C, 4n34:D, 4n35:A, 4n35:B, 4n35:C, 4n35:D, 4n36:A, 4n36:B, 4n36:C, 4n36:D, 4n37:A, 4n37:B, 4n37:C, 4n37:D, 4n38:A, 4n38:B, 4n38:C, 4n38:D, 3p5d:A, 3p5d:B, 3p5d:C, 3p5d:D, 3p5e:A, 3p5e:B, 3p5e:C, 3p5e:D, 3p5f:B, 3p5f:C, 3p5f:A, 3p5f:D, 3p5g:A, 3p5g:B, 3p5g:C, 3p5g:D, 3p5h:B, 3p5h:D, 3p5h:A, 3p5h:C, 3p5i:A, 3p5i:B, 3p5i:C, 3p5i:D, 3p7f:A, 3p7f:B, 3p7f:C, 3p7f:D, 3p7g:A, 3p7g:B, 3p7g:C, 3p7g:D, 3p7h:A, 3p7h:B, 3p7h:C, 3p7h:D, 7ytq:A, 7ytq:B, 7ytq:C, 7ytq:D
15 4c9f:D 134 130 0.2703 0.2985 0.3077 3.00e-18 4c9f:A, 4c9f:B, 4c9f:C, 4caj:A, 4caj:B, 4caj:C, 4caj:D, 3zhg:A, 3zhg:B, 3zhg:C, 3zhg:D
16 6pwr:A 129 122 0.2770 0.3178 0.3361 2.28e-16 6pws:A, 6pwt:A
17 8urf:A 128 122 0.2905 0.3359 0.3525 4.56e-16
18 6py1:A 130 131 0.2770 0.3154 0.3130 4.63e-16 6puv:A, 6w12:A, 6xiy:A
19 2ox9:C 131 130 0.2500 0.2824 0.2846 6.61e-16 2ox9:A, 2ox9:B, 2ox9:D
20 2ox8:A 129 130 0.2635 0.3023 0.3000 9.07e-16 2ox8:B, 2ox8:C, 2ox8:D
21 5jq1:A 130 133 0.2568 0.2923 0.2857 1.77e-14 1dv8:A, 5jpv:A, 5jpv:B, 5jq1:B, 8ts0:A, 6yau:A
22 4gko:L 136 120 0.2635 0.2868 0.3250 4.26e-14 4g9a:A, 4g9a:B, 4g9a:C, 4g9a:D, 4gko:G, 4gko:H, 4gko:I, 4gko:J, 4gko:K, 2h2t:B
23 2py2:A 127 128 0.2500 0.2913 0.2891 4.65e-14 2py2:B, 2py2:C, 2py2:D, 2py2:E, 2py2:F
24 6jk4:A 126 125 0.2432 0.2857 0.2880 3.47e-13
25 6a7s:B 138 132 0.2838 0.3043 0.3182 3.49e-13 6a7t:B, 6m5m:B
26 5e4k:A 424 128 0.2635 0.0920 0.3047 1.97e-12
27 5e4k:A 424 139 0.2703 0.0943 0.2878 1.26e-11
28 5e4l:B 386 139 0.2703 0.1036 0.2878 9.52e-12
29 5e4l:B 386 107 0.2027 0.0777 0.2804 0.068
30 5e4l:A 428 139 0.2703 0.0935 0.2878 1.05e-11
31 5e4l:A 428 111 0.2230 0.0771 0.2973 4.27e-09
32 2vuv:A 129 131 0.2770 0.3178 0.3130 2.68e-11 2vuz:A
33 5f2q:B 135 134 0.2703 0.2963 0.2985 3.89e-11 5f2q:A, 5f2q:C, 5f2q:D, 5f2q:E, 5f2q:F, 5f2q:G, 5f2q:H, 5f2q:I, 5f2q:J, 1jzn:A, 1jzn:B, 1jzn:C, 1jzn:D, 1jzn:E, 1muq:B, 1muq:A, 1muq:C, 1muq:D, 1muq:E
34 1qdd:A 144 131 0.2297 0.2361 0.2595 7.74e-11
35 2bpe:A 128 131 0.2770 0.3203 0.3130 9.20e-11 2bpe:B, 2bph:A, 2bph:B, 2cl8:A, 2cl8:B
36 1iod:B 123 133 0.2027 0.2439 0.2256 4.15e-09 1wt9:B, 1y17:B
37 1ukm:B 124 131 0.2365 0.2823 0.2672 4.70e-09
38 5xts:A 460 144 0.2635 0.0848 0.2708 8.84e-09 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
39 5xts:A 460 131 0.2635 0.0848 0.2977 1.21e-07 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
40 3t3a:A 122 82 0.1622 0.1967 0.2927 8.93e-09 3t3a:B
41 1bj3:A 129 77 0.1689 0.1938 0.3247 1.28e-08 1j34:A, 1j35:A, 1x2t:A, 1x2t:C
42 1afa:1 154 97 0.2095 0.2013 0.3196 1.41e-08 1afa:2, 1afa:3, 1afb:1, 1afb:2, 1afb:3, 1afd:1, 1afd:2, 1afd:3, 1bch:1, 1bch:2, 1bch:3, 1bcj:1, 1bcj:2, 1bcj:3, 1fif:A, 1fif:B, 1fif:C, 1fih:A, 1fih:B, 1fih:C, 1kmb:1, 1kmb:2, 1kmb:3, 2kmb:1, 2kmb:2, 2kmb:3, 3kmb:1, 3kmb:3, 3kmb:2, 4kmb:1, 4kmb:2, 4kmb:3, 1kwt:A, 1kwt:B, 1kwt:C, 1kwu:A, 1kwu:B, 1kwu:C, 1kwv:A, 1kwv:B, 1kwv:C, 1kww:A, 1kww:B, 1kww:C, 1kwx:A, 1kwx:B, 1kwx:C, 1kwy:A, 1kwy:B, 1kwy:C, 1kwz:A, 1kwz:B, 1kwz:C, 1kx0:A, 1kx0:B, 1kx0:C, 1kx1:C, 1kx1:F, 1kx1:A, 1kx1:B, 1kx1:D, 1kx1:E, 2msb:B, 2msb:A, 1rtm:1, 1rtm:2, 1rtm:3
43 6tl9:F 130 83 0.1689 0.1923 0.3012 2.02e-08 6tl9:B, 6tl9:C, 6tl9:G
44 1bj3:B 123 78 0.1419 0.1707 0.2692 2.10e-08 1ixx:B, 1ixx:D, 1ixx:F, 1j34:B, 1j35:B, 1x2t:B, 1x2t:D
45 1htn:A 156 148 0.2500 0.2372 0.2500 2.67e-08 1tn3:A
46 1hup:A 141 86 0.2162 0.2270 0.3721 3.26e-08
47 1iod:A 129 77 0.1486 0.1705 0.2857 4.42e-08 1wt9:A, 1y17:A
48 1ixx:A 129 70 0.1554 0.1783 0.3286 5.67e-08 1ixx:C, 1ixx:E
49 4wqq:A 141 139 0.2230 0.2340 0.2374 6.79e-08 1wmy:A, 1wmy:B, 1wmz:A, 1wmz:B, 1wmz:C, 1wmz:D, 4wqq:B, 4wqq:C, 4wqq:D
50 1egg:B 144 136 0.2635 0.2708 0.2868 7.42e-08 1egg:A, 1egi:A, 1egi:B, 7jub:A, 7juc:A, 7jud:A, 7jud:B, 7jue:A, 7juf:A, 7juf:B, 7jug:A, 7juh:A, 7l61:A, 7l62:A, 7l63:A, 7l64:A, 7l65:A, 7l66:A, 7l67:A, 7l68:A, 7l68:B
51 6a7t:A 137 117 0.2095 0.2263 0.2650 1.06e-07 6m5m:A
52 8umo:K 113 82 0.1554 0.2035 0.2805 1.83e-07
53 7odu:A 129 83 0.1554 0.1783 0.2771 2.25e-07
54 8ea6:B 124 84 0.1419 0.1694 0.2500 2.29e-07 8ea5:A, 8ea5:B, 8ea6:A, 8ea7:A, 8ea7:B, 8ea8:B, 8ea8:A, 8ea9:B, 8ea9:A, 8eaa:B, 8eaa:A, 8eab:A, 8eab:B, 8se5:B, 8se5:A, 8se6:A, 8se6:B
55 3vpp:B 122 84 0.1622 0.1967 0.2857 3.28e-07 3vpp:A
56 1kza:1 115 84 0.2095 0.2696 0.3690 3.90e-07 1kza:2, 1kzb:1, 1kzb:2, 1kzc:1, 1kzc:2, 1kzd:1, 1kzd:2, 1kze:1, 1kze:2, 1rdi:1, 1rdi:2, 1rdj:1, 1rdj:2, 1rdk:1, 1rdk:2, 1rdl:1, 1rdl:2, 1rdm:1, 1rdm:2, 1rdn:1, 1rdn:2, 1rdo:1, 1rdo:2
57 4mth:A 139 137 0.2297 0.2446 0.2482 2.97e-06 1uv0:A
58 2e3x:B 129 132 0.2027 0.2326 0.2273 3.24e-06
59 4c16:A 280 123 0.2297 0.1214 0.2764 5.88e-06 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
60 1fvu:B 121 85 0.1554 0.1901 0.2706 6.15e-06 1fvu:D
61 3wsr:A 120 79 0.1554 0.1917 0.2911 6.99e-06 3wsr:B
62 6ryj:A 122 128 0.2162 0.2623 0.2500 2.93e-05 6ryg:A, 6rym:A, 6ryn:A
63 3j82:A 131 79 0.1554 0.1756 0.2911 4.63e-05
64 3cdg:J 123 80 0.1351 0.1626 0.2500 1.34e-04 3cdg:E, 3cii:G, 3cii:I
65 3alu:A 157 148 0.1892 0.1783 0.1892 2.00e-04 3als:A, 3als:B, 3als:C, 3als:D, 3alt:A, 3alt:B, 3alt:C, 3alt:D, 3alu:B, 3alu:C, 3alu:D
66 3cfw:A 156 108 0.1959 0.1859 0.2685 4.08e-04 5vc1:A
67 2ric:C 158 111 0.1824 0.1709 0.2432 0.006 1b08:A, 1b08:B, 1b08:C, 3dbz:A, 3dbz:B, 3dbz:C, 4e52:B, 4e52:C, 4e52:A, 3g81:A, 3g81:B, 3g81:C, 3g83:A, 3g83:B, 3g83:C, 3g84:A, 3g84:B, 3g84:C, 2ggu:A, 2ggu:B, 2ggu:C, 2ggx:A, 2ggx:B, 2ggx:C, 3ikn:A, 3ikn:B, 3ikn:C, 3ikp:A, 3ikp:B, 3ikp:C, 3ikq:A, 3ikq:B, 3ikq:C, 3ikr:A, 3ikr:B, 3ikr:C, 4m17:A, 4m17:B, 4m17:C, 4m17:D, 4m17:E, 4m17:F, 4m17:G, 4m17:H, 4m17:I, 4m17:J, 4m17:K, 4m17:L, 4m18:A, 4m18:E, 4m18:B, 4m18:C, 4m18:D, 4m18:L, 4m18:F, 4m18:G, 4m18:H, 4m18:I, 4m18:J, 4m18:K, 2orj:A, 2orj:B, 2orj:C, 2ork:A, 2ork:B, 2ork:C, 2os9:A, 2os9:B, 2os9:C, 5oxr:B, 5oxr:C, 5oxr:A, 5oxs:A, 5oxs:B, 5oxs:C, 1pw9:A, 1pw9:B, 1pw9:C, 1pwb:A, 1pwb:B, 1pwb:C, 2ria:A, 2ria:B, 2ria:C, 2rib:A, 2rib:B, 2rib:C, 2ric:B, 2ric:A, 2rid:A, 2rid:B, 2rid:C, 2rie:A, 2rie:B, 2rie:C
68 5z0c:A 367 23 0.0811 0.0327 0.5217 2.0
69 6vu9:A 631 27 0.0608 0.0143 0.3333 4.5
70 5lnk:L 599 50 0.1081 0.0267 0.3200 8.7
71 6k20:A 465 41 0.0946 0.0301 0.3415 9.0 6iii:A, 6iny:A, 6lna:A, 6lna:B
72 1b90:A 516 44 0.0878 0.0252 0.2955 9.4 1b9z:A, 5bca:A, 5bca:B, 5bca:C, 5bca:D, 1itc:A, 1j0y:A, 1j0y:B, 1j0y:C, 1j0y:D, 1j0z:A, 1j0z:B, 1j0z:C, 1j0z:D, 1j10:A, 1j10:B, 1j10:C, 1j10:D, 1j11:A, 1j11:B, 1j11:C, 1j11:D, 1j12:A, 1j12:B, 1j12:C, 1j12:D, 1j18:A, 1vem:A, 1ven:A, 1veo:A, 1vep:A, 8zrz:A
73 1be3:A 446 49 0.1014 0.0336 0.3061 9.5 2a06:A, 1bgy:A, 1bgy:M, 4d6t:N, 4d6u:A, 4d6u:N, 7dgq:k, 7dgq:w, 7dgr:k, 7dgr:w, 7dgs:k, 7dgs:w, 7dkf:A1, 7dkf:M1, 6fo0:N, 6fo0:A, 6fo2:N, 6fo2:A, 5luf:c, 5luf:l, 5nmi:N, 5nmi:A, 1pp9:A, 1ppj:A, 6qbx:a3, 6qc3:a1, 7tz6:A, 7tz6:N, 2ybb:a, 2ybb:A
74 3l0d:A 332 38 0.0676 0.0301 0.2632 9.6 3l0d:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218