Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MFTLKIFVYSCVAFFCSLFIFGFLSNDPSRNPNR

The query sequence (length=34) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4yuu:I2 35 34 1.0000 0.9714 1.0000 4.24e-19 4yuu:I1, 4yuu:i1, 4yuu:i2
2 7y5e:IL 35 34 0.8529 0.8286 0.8529 7.47e-16 7y5e:I6, 7y5e:i6, 7y5e:iL, 7y7a:I9, 7y7a:i9, 7y7a:IE, 7y7a:iE, 7y7a:IO, 7y7a:iO, 7y7a:IZ, 7y7a:iZ, 7y7a:Im, 7y7a:im
3 6j3y:I 35 34 0.7941 0.7714 0.7941 3.00e-14 6j3y:i, 6j3z:I, 6j3z:i, 6j40:I, 6j40:i, 8j5k:I, 8j5k:i, 6jlu:I, 6jlu:i, 7vd5:I, 7vd5:i
4 8wb4:I 35 34 0.7941 0.7714 0.7941 6.40e-14 8wb4:i, 8xlp:i, 8xlp:I, 8xr6:i, 8xr6:I
5 8c29:I 36 34 0.7647 0.7222 0.7647 7.93e-14 8c29:i, 3jcu:I, 3jcu:i, 5mdx:i, 7oui:I, 7oui:i, 5xnl:I, 5xnl:i, 5xnm:I, 5xnm:i, 6yp7:i
6 6kac:I 35 34 0.7353 0.7143 0.7353 8.29e-13 8bd3:I, 8bd3:i, 6kac:i, 6kad:I, 6kad:i, 6kaf:i, 6kaf:I, 8kde:I, 7pi0:I, 7pi0:i, 7pi5:I, 7pi5:i, 7pin:I, 7pin:i, 7pin:I1, 7pin:i1, 7piw:I, 7piw:i, 7piw:I1, 7piw:i1, 7pnk:I, 7pnk:i, 8zee:I
7 8tow:I 37 34 0.7059 0.6486 0.7059 9.51e-12 7n8o:I, 7n8o:i, 7rcv:I, 7rcv:i, 8tow:i, 6wj6:I
8 8wql:ID 36 34 0.7353 0.6944 0.7353 2.13e-11 8wql:IE, 8wql:I1, 8wql:i1, 8wql:iD, 8wql:iE
9 8eqm:I 34 33 0.6765 0.6765 0.6970 4.36e-11 8eqm:i
10 7ymi:I 34 33 0.4706 0.4706 0.4848 1.46e-05 7ymi:i, 7ymm:1I, 7ymm:2I, 7ymm:3I, 7ymm:4I
11 5b5e:i 38 34 0.6765 0.6053 0.6765 0.001 3a0b:I, 3a0b:i, 3a0h:I, 3a0h:i, 2axt:I, 2axt:i, 5b5e:I, 5b66:I, 5b66:i, 7cji:I, 7cji:i, 7cjj:I, 7cjj:i, 7cou:I, 7cou:i, 7czl:I, 7czl:i, 7d1t:I, 7d1t:i, 7d1u:I, 7d1u:i, 6dhe:I, 6dhe:i, 6dhf:I, 6dhf:i, 6dhg:I, 6dhg:i, 6dhh:I, 6dhh:i, 6dho:I, 6dho:i, 6dhp:I, 6dhp:i, 5e79:I, 5e79:i, 5e7c:I, 5e7c:i, 7eda:I, 9evx:I, 9evx:i, 8ez5:I, 8ez5:i, 8f4c:I, 8f4c:i, 8f4d:I, 8f4d:i, 8f4e:I, 8f4e:i, 8f4f:I, 8f4f:i, 8f4g:I, 8f4g:i, 8f4h:I, 8f4h:i, 8f4i:I, 8f4i:i, 8f4j:I, 8f4j:i, 8f4k:I, 8f4k:i, 4fby:I, 4fby:a, 8gn0:I, 8gn0:i, 8gn1:I, 8gn1:i, 8gn2:I, 8gn2:i, 5gth:I, 5gth:i, 5gti:I, 5gti:i, 5h2f:I, 5h2f:i, 4il6:I, 4il6:i, 8ir5:I, 8ir5:i, 8ir6:I, 8ir6:i, 8ir7:I, 8ir7:i, 8ir8:I, 8ir8:i, 8ir9:I, 8ir9:i, 8ira:I, 8ira:i, 8irb:I, 8irb:i, 8irc:I, 8irc:i, 8ird:I, 8ird:i, 8ire:I, 8ire:i, 8irf:I, 8irf:i, 8irg:I, 8irg:i, 8irh:I, 8irh:i, 8iri:I, 8iri:i, 4ixq:I, 4ixq:i, 4ixr:I, 4ixr:i, 6jlj:I, 6jlj:i, 6jlk:I, 6jlk:i, 6jll:I, 6jll:i, 6jlm:I, 6jlm:i, 6jln:I, 6jln:i, 6jlo:I, 6jlo:i, 6jlp:I, 6jlp:i, 5kaf:I, 5kaf:i, 5kai:I, 5kai:i, 3kzi:I, 5mx2:I, 5mx2:i, 7nho:I, 4pbu:I, 4pbu:i, 4pj0:I, 4pj0:i, 7rf1:I, 7rf1:i, 7rf2:I, 7rf2:i, 7rf3:I, 7rf3:i, 7rf4:I, 7rf4:i, 7rf5:I, 7rf5:i, 7rf6:I, 7rf6:i, 7rf7:I, 7rf7:i, 7rf8:I, 7rf8:i, 4rvy:I, 4rvy:i, 1s5l:i, 5tis:I, 5tis:i, 4tnh:I, 4tnh:i, 4tni:I, 4tni:i, 4tnj:I, 4tnj:i, 4tnk:I, 4tnk:i, 4ub6:I, 4ub6:i, 4ub8:I, 4ub8:i, 5v2c:I, 5v2c:i, 4v62:AI, 4v62:BI, 4v82:AI, 4v82:BI, 6w1o:I, 6w1o:i, 6w1p:I, 6w1p:i, 6w1q:I, 6w1q:i, 6w1r:I, 6w1r:i, 6w1t:I, 6w1t:i, 6w1u:I, 6w1u:i, 6w1v:I, 6w1v:i, 5ws5:I, 5ws5:i, 5ws6:I, 5ws6:i, 3wu2:I, 3wu2:i, 7yq2:I, 7yq2:i, 7yq7:I, 7yq7:i, 5zzn:I, 5zzn:i
12 4hg6:A 747 32 0.3235 0.0147 0.3438 1.8 5eiy:A, 5ej1:A, 5ejz:A, 4p00:A, 4p02:A
13 7jx0:A 801 16 0.2059 0.0087 0.4375 6.6 3qjz:A
14 3zw3:A 831 16 0.2059 0.0084 0.4375 6.6 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
15 1e8w:A 851 16 0.2059 0.0082 0.4375 6.6 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
16 1e7u:A 872 16 0.2059 0.0080 0.4375 6.6 4anv:A, 3ibe:A
17 8sod:A 941 16 0.2059 0.0074 0.4375 6.6 8soe:A
18 8sob:A 1005 16 0.2059 0.0070 0.4375 6.6 8soa:A, 8soc:A
19 4pe3:A 315 13 0.2353 0.0254 0.6154 7.5
20 2dw4:A 634 26 0.2941 0.0158 0.3846 7.8
21 4bay:A 670 26 0.2941 0.0149 0.3846 7.8 3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
22 8b8m:B 682 23 0.2353 0.0117 0.3478 8.0
23 6t58:A 524 16 0.2353 0.0153 0.5000 8.8 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
24 8a3y:A 1426 21 0.2941 0.0070 0.4762 9.6 8oeu:A, 8oev:A, 8oew:A, 8of0:A, 7okx:A, 7oky:A, 7ol0:A, 7pks:A, 8rbx:A, 6ted:A, 8uhg:A, 8ui0:A, 7unc:A, 7und:A
25 7ena:PA 1475 21 0.2941 0.0068 0.4762 9.6 7b0y:A, 8b3d:A, 8b3f:A, 7enc:PA, 6gmh:A, 6gml:A, 8gxq:PA, 8gxs:PA, 7lbm:A, 5oik:A, 7oo3:A, 7oob:A, 7oop:A, 7opc:A, 7opd:A, 8p4a:A, 8p4b:A, 8p4c:A, 8p4d:A, 8p4e:A, 8p4f:A, 8s51:A, 8s52:A, 8s54:A, 8s55:A, 8uha:A, 8uhd:A, 8uis:A, 8w8e:A, 8w8f:A, 7ycx:1
26 6o9l:A 1476 21 0.2941 0.0068 0.4762 9.6 8a40:A, 8bvw:A, 8byq:A, 8bz1:A, 7edx:o, 7eg7:o, 7eg8:o, 7eg9:o, 7ega:o, 7egb:o, 7egc:o, 6exv:A, 5flm:A, 5iy6:A, 5iy7:A, 5iy8:A, 5iy9:A, 5iya:A, 5iyb:A, 5iyc:A, 5iyd:A, 7nvr:A, 7nvs:A, 7nvt:A, 7nvu:A, 7nvy:A, 7nvz:A, 7nw0:A, 8s5n:A, 8wak:o, 8wal:o, 8wan:o, 8wao:o, 8wap:o, 8waq:o, 8war:o, 8was:o, 8wat:o, 8wau:o, 8wav:o, 8waw:o, 8wax:o, 8way:o, 8waz:o, 8wb0:o, 6xre:A, 7zwd:A, 7zx7:A, 7zx8:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218