BioLiP

>protein
MFKAVLFDLDGVITDTAEYHFRAWKALAEEIGINGVDRQFNEQLKGVSREDSLQKILDLADKKVSAEEFKELAKRKNDNY
VKMIQDVSPADVYPGILQLLKDLRSNKIKIALASASKNGPFLLERMNLTGYFDAIADPAEVAASKPAPDIFIAAAHAVGV
APSESIGLEDSQAGIQAIKDSGALPIGVGRPEDLGDDIVIVPDTSHYTLEFLKEVWLQ

The query sequence (length=218) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5olw:A	224	218	1.0000	0.9732	1.0000	3.23e-159	4c4r:A, 4c4s:A, 4c4t:A, 3fm9:A, 6h8u:A, 6h8v:A, 6h8v:B, 6h8w:A, 6h8x:A, 6h8x:B, 6h8y:A, 6h8z:A, 6h90:A, 6h91:A, 6h91:B, 6h92:A, 6h92:B, 6h93:A, 6h93:B, 6h94:A, 6hdg:A, 6hdh:A, 6hdh:B, 6hdi:A, 6hdi:B, 6hdj:A, 6hdk:A, 6hdl:A, 6hdm:A, 6i03:A, 1lvh:A, 1lvh:B, 1o03:A, 1o08:A, 5o6p:A, 5o6r:A, 5ojz:A, 5ok0:A, 5ok1:A, 5ok2:A, 5olw:B, 5olx:A, 5oly:A, 5oly:G, 8q1c:A, 8q1c:B, 8q1d:A, 8q1e:A, 8q1f:A, 8q1f:B, 6qzg:A, 6qzg:B, 2wf5:A, 2wf6:A, 2wf7:A, 2wf8:A, 2wf9:A, 2wfa:A, 2whe:A, 6ydj:A, 6ydk:A, 6ydl:A, 6ydm:A, 6ydm:B, 1z4n:A, 1z4n:B, 1z4o:A, 1z4o:B, 3zi4:A, 1zol:A
2	4g9b:A	227	217	0.4404	0.4229	0.4424	5.44e-57
3	6w04:A	223	191	0.2523	0.2466	0.2880	2.38e-17
4	4uau:A	226	189	0.2294	0.2212	0.2646	1.15e-13	4uas:A, 4uas:B, 4uat:A, 4uat:B, 4uau:B
5	7ocn:A	690	185	0.2156	0.0681	0.2541	7.01e-13	7ocn:B, 7ocp:A, 7ocp:B, 7ocq:A, 7ocq:B, 7ocr:A, 7ocr:B, 7ocs:A, 7ocs:B, 7ocs:C, 7ocs:D, 7oct:A, 7oct:B, 7ocu:A, 7ocu:B
6	3dv9:A	243	194	0.2431	0.2181	0.2732	1.88e-12
7	3qyp:B	228	192	0.2156	0.2061	0.2448	9.46e-11	3qu2:A, 3qu2:B, 3qu2:C, 3qu2:D, 3qu4:A, 3qu4:B, 3qu4:C, 3qu4:D, 3qu4:E, 3qu4:F, 3qu4:G, 3qu4:H, 3qu7:A, 3qu7:B, 3qu9:A, 3quq:A, 3qut:A, 3qx7:A, 3qxg:A, 3qxg:B, 3qyp:A
8	1te2:A	218	197	0.2294	0.2294	0.2538	4.00e-10	1te2:B
9	4een:A	229	175	0.2018	0.1921	0.2514	2.04e-08
10	4ygr:A	215	214	0.2844	0.2884	0.2897	2.10e-08	4ygs:A
11	3s6j:E	220	200	0.2110	0.2091	0.2300	2.05e-07	3s6j:A, 3s6j:B, 3s6j:C, 3s6j:D, 3s6j:F
12	2fdr:A	222	189	0.2294	0.2252	0.2646	4.15e-07
13	4ex6:A	219	215	0.2431	0.2420	0.2465	3.12e-06	4ex7:A
14	4knv:A	241	221	0.2248	0.2033	0.2217	4.38e-06	4knv:B, 4knw:A, 4knw:B, 4knw:C
15	8wbq:B	244	218	0.2477	0.2213	0.2477	1.05e-05	8wbq:A
16	4uav:A	246	211	0.2615	0.2317	0.2701	3.24e-05
17	4rn3:A	210	197	0.1881	0.1952	0.2081	2.19e-04	4rn3:B
18	4dfd:A	205	195	0.2110	0.2244	0.2359	7.53e-04	4dfd:B, 4f71:A, 4f71:B
19	8wbt:A	237	180	0.2202	0.2025	0.2667	0.001	8wbt:B, 8wbt:C, 8wbt:D
20	8bp1:A	231	124	0.1284	0.1212	0.2258	0.007	4ffd:A, 6q7n:A, 6q7o:A, 6q7p:A, 6q7r:A, 6z1k:A
21	4uw9:A	228	207	0.2431	0.2325	0.2560	0.007
22	4hai:A	548	207	0.2431	0.0967	0.2560	0.008	7a7g:A, 7a7g:B, 5ai0:A, 5ai4:A, 5ai5:A, 5ai6:A, 5ai8:A, 5ai9:A, 5aia:A, 5aib:A, 5aic:A, 5ak3:A, 5ak4:A, 5ak5:A, 5ak6:A, 5ake:A, 5akg:A, 5akh:A, 5aki:A, 5akj:A, 5akk:A, 5akl:A, 5akx:A, 5aky:A, 5akz:A, 5ald:A, 5ale:A, 5alf:A, 5alg:A, 5alh:A, 5ali:A, 5alk:A, 5all:A, 5alm:A, 5aln:A, 5alo:A, 5alp:A, 5alq:A, 5alr:A, 5als:A, 5alt:A, 5alu:A, 5alv:A, 5alw:A, 5alx:A, 5aly:A, 5alz:A, 5am0:A, 5am1:A, 5am2:A, 5am3:A, 5am4:A, 5am5:A, 3ans:A, 3ans:B, 3ant:A, 3ant:B, 6aum:A, 4c4x:A, 4c4x:B, 4c4y:A, 4c4z:A, 4c4z:B, 7eba:A, 7eba:B, 5fp0:A, 6fr2:A, 6hgv:A, 6hgw:A, 6hgx:A, 3i1y:A, 3i28:A, 6i5g:A, 6i5g:B, 4j03:A, 4jnc:A, 3koo:A, 5mwa:A, 4ocz:A, 4od0:A, 3otq:A, 7p4k:A, 7p4k:B, 3pdc:A, 3pdc:B, 8qmz:A, 8qmz:B, 8qmz:C, 8qmz:D, 8qn0:A, 8qn0:B, 8qvf:A, 8qvg:A, 8qvh:A, 8qvk:A, 8qvl:A, 8qwi:A, 8qzd:A, 1vj5:A, 3wk4:A, 3wk5:A, 3wk6:A, 3wk7:A, 3wk8:A, 3wk9:A, 3wka:A, 3wkb:A, 3wkc:A, 3wkd:A, 3wke:A, 4x6x:A, 4x6x:B, 4x6y:A, 4x6y:B, 4y2j:A, 4y2p:A, 4y2q:A, 4y2r:A, 4y2s:A, 4y2t:A, 4y2u:A, 4y2v:A, 4y2x:A, 4y2y:A, 6yl4:A, 1zd2:P, 1zd3:A, 1zd4:A, 1zd5:A
23	5alj:A	523	199	0.2156	0.0899	0.2362	0.010
24	3ddh:A	229	107	0.1376	0.1310	0.2804	0.20	3ddh:B
25	1cr6:B	541	61	0.0734	0.0296	0.2623	0.40	1cr6:A, 1ek1:A, 1ek1:B, 1ek2:A, 1ek2:B
26	2yn4:A	225	137	0.1422	0.1378	0.2263	0.68	2yn4:B
27	3vay:A	230	242	0.2661	0.2522	0.2397	0.86	3vay:B
28	4z1d:A	256	78	0.0917	0.0781	0.2564	1.8	4z1d:B
29	7q2x:A	431	53	0.0780	0.0394	0.3208	2.4	7q2y:A
30	4esv:C	434	42	0.0688	0.0346	0.3571	3.0	4esv:A, 4esv:B, 4esv:D, 4esv:E, 4esv:F, 4esv:G, 4esv:H, 4esv:I, 4esv:J, 4esv:K, 4esv:L, 2vye:A, 2vye:B
31	8ywo:A	240	171	0.1789	0.1625	0.2281	3.1
32	3r09:A	197	197	0.2294	0.2538	0.2538	3.1	2ybd:A
33	6p8v:G	320	104	0.1468	0.1000	0.3077	3.4	6p80:A, 6u7b:A, 6u7b:C
34	1rdf:A	263	138	0.1606	0.1331	0.2536	3.5	1fez:A, 1fez:B, 1fez:C, 1fez:D, 2iof:A, 2iof:K, 2ioh:A, 2ioh:B, 2ioh:C, 2ioh:D, 1rdf:B, 1rdf:C, 1rdf:D, 1rdf:E, 1rdf:F, 1rql:A, 1rql:B, 1rqn:A, 1rqn:B, 1swv:A, 1swv:B, 1sww:A, 1sww:B
35	6iah:A	240	51	0.0826	0.0750	0.3529	3.7
36	7ajt:UM	762	116	0.1422	0.0407	0.2672	4.3	7aju:UM, 7d4i:B3, 7d5s:B3, 7d5t:B3, 7d63:B3, 6ke6:B3, 6lqp:B3, 6lqq:B3, 6lqr:B3, 6lqs:B3, 6lqt:B3, 6lqu:B3, 6lqv:B3, 7suk:LR, 6zqa:UM, 6zqb:UM, 6zqc:UM, 6zqd:UM, 6zqf:UM
37	7k9d:A	89	58	0.1009	0.2472	0.3793	5.2	7k9e:A, 7k9e:C, 7kkv:A
38	4psx:B	361	49	0.0734	0.0443	0.3265	5.4	4psx:E
39	7mq8:SH	368	74	0.1009	0.0598	0.2973	7.5	7mqa:SH
40	7dqg:A	161	35	0.0505	0.0683	0.3143	7.9
41	5gvx:A	386	43	0.0780	0.0440	0.3953	8.5
42	7qen:A	465	44	0.0642	0.0301	0.3182	8.8

[Back]