Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MFFKDKNVLIIGGTGTIGKSILSNVLQEKPKVVRVFSRSEYNQFLLQEEFRDKNRNIRYLIGDIRNYDRVFSAMENIDYV
FHVAAMKHVSFCEYNPFEAVLTNIFGTQNVIKAAIAQKVKKVVFTSSNAAISPTNNYGATKLTAERLITSAEYSKGSSET
TFTSVRFGNVMGSRGSVIPLFENQIKENQKITVTDLSMSRFMMTLNQATMLTIEAMKIAKGGETFILKMPVISLNDLSEV
MIEEVTKLYGENIKIEEIGLKPGEKMYEELMTHDESLQAFELPDMFIIPSPLAKRAKAGFYRSDNQNAISKEELRNLILN
QQLL

The query sequence (length=324) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6bwc:C 327 326 1.0000 0.9908 0.9939 0.0 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
2 4j2o:C 316 317 0.3580 0.3671 0.3659 2.15e-72 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
3 2gn4:A 329 286 0.3519 0.3465 0.3986 3.80e-72 2gn4:B, 2gn6:A, 2gn6:B, 2gn8:A, 2gn8:B, 2gn9:A, 2gn9:B, 2gna:A, 2gna:B
4 3w1v:A 347 332 0.3827 0.3573 0.3735 7.01e-72 4g5h:A, 3vvc:A, 3w1v:B
5 3vvb:A 270 317 0.3086 0.3704 0.3155 8.36e-50
6 5bju:A 340 277 0.3179 0.3029 0.3718 1.72e-48 5bju:B, 5bjv:A, 5bjv:B, 5bjw:A, 5bjw:B, 5bjx:A, 5bjx:B, 5bjy:A, 5bjy:B
7 4tqg:A 297 327 0.3179 0.3468 0.3150 8.94e-40
8 3pvz:A 372 246 0.2068 0.1801 0.2724 8.95e-21 3pvz:C, 3pvz:D
9 3pvz:B 300 195 0.1790 0.1933 0.2974 1.18e-16
10 6vlo:A 319 270 0.2068 0.2100 0.2481 7.21e-11 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
11 4zrn:A 309 212 0.1605 0.1683 0.2453 3.46e-10 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
12 6dnt:A 310 310 0.2346 0.2452 0.2452 3.96e-10
13 6nbr:A 316 101 0.1049 0.1076 0.3366 4.87e-10 6nbr:B, 6nbr:C, 6nbr:D
14 1sb8:A 341 257 0.2130 0.2023 0.2685 7.12e-10 1sb9:A
15 7kn1:A 336 188 0.1543 0.1488 0.2660 7.71e-10 7kn1:B
16 6jkh:A 212 149 0.1296 0.1981 0.2819 1.45e-09 6jkh:B
17 4lis:A 364 164 0.1481 0.1319 0.2927 1.95e-09 4lis:B, 4lis:C
18 1gy8:C 370 203 0.1636 0.1432 0.2611 2.58e-09 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
19 3ehe:A 290 197 0.1698 0.1897 0.2792 1.10e-08 3ehe:B
20 6pnl:A 336 273 0.2222 0.2143 0.2637 1.40e-08 6pmh:A
21 1a9y:A 338 186 0.1451 0.1391 0.2527 1.60e-08 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
22 2c20:A 329 184 0.1512 0.1489 0.2663 1.96e-08 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
23 6kv9:A 299 181 0.1605 0.1739 0.2873 5.44e-08 6kvc:A
24 6k0g:A 335 188 0.1543 0.1493 0.2660 8.47e-08 6k0h:A, 6k0i:A
25 7k3p:A 329 182 0.1358 0.1337 0.2418 2.15e-07 7k3p:B
26 4twr:A 325 183 0.1512 0.1508 0.2678 2.91e-07 4wok:A
27 4r1s:A 319 160 0.1389 0.1411 0.2812 8.35e-07 4r1s:B
28 2q1w:A 300 272 0.2099 0.2267 0.2500 1.32e-06 2q1w:B, 2q1w:C
29 1wvg:A 352 353 0.2500 0.2301 0.2295 2.51e-06 1wvg:B
30 6vo6:D 311 176 0.1358 0.1415 0.2500 4.17e-06 6vo6:A, 6vo6:B, 6vo6:C, 6vo8:A, 6vo8:B
31 3lu1:A 336 286 0.2037 0.1964 0.2308 5.52e-06 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
32 6jyg:D 307 184 0.1389 0.1466 0.2446 6.28e-06 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
33 3a1n:A 315 157 0.1389 0.1429 0.2866 7.06e-06 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
34 4id9:B 328 169 0.1204 0.1189 0.2308 7.14e-06 4id9:A, 4idg:A, 4idg:B
35 2pzm:A 316 226 0.1605 0.1646 0.2301 7.14e-06 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
36 1rkx:C 351 315 0.2284 0.2108 0.2349 1.07e-05 1rkx:A, 1rkx:B, 1rkx:D
37 3aw9:A 304 275 0.2160 0.2303 0.2545 1.08e-05 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
38 7xpo:A 344 272 0.2006 0.1890 0.2390 1.20e-05 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
39 2b69:A 312 130 0.0988 0.1026 0.2462 1.87e-05 4gll:A, 4gll:B
40 8wov:B 341 191 0.1605 0.1525 0.2723 2.14e-05 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
41 6wj9:B 308 284 0.1914 0.2013 0.2183 2.27e-05 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
42 5u4q:B 304 186 0.1451 0.1546 0.2527 2.38e-05
43 1r66:A 322 157 0.1173 0.1180 0.2420 2.56e-05 1r6d:A
44 5u4q:A 321 186 0.1420 0.1433 0.2473 4.03e-05
45 1z45:A 674 193 0.1543 0.0742 0.2591 4.72e-05
46 6bwl:A 313 273 0.1883 0.1949 0.2234 5.40e-05
47 5tqm:A 315 161 0.1389 0.1429 0.2795 6.22e-05 5tqm:B
48 5z75:A 306 236 0.1667 0.1765 0.2288 9.08e-05 5z75:B, 5z75:D
49 1ker:B 347 112 0.0988 0.0922 0.2857 1.06e-04 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
50 4lk3:B 274 130 0.0988 0.1168 0.2462 1.17e-04 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
51 6zll:A 321 185 0.1481 0.1495 0.2595 1.45e-04 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
52 2hun:A 329 159 0.1142 0.1125 0.2327 1.65e-04 2hun:B
53 8vr2:B 321 172 0.1173 0.1184 0.2209 2.79e-04 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
54 2pk3:A 309 107 0.1142 0.1197 0.3458 3.71e-04 2pk3:B
55 6kwt:A 338 175 0.1327 0.1272 0.2457 3.89e-04
56 6h0n:A 377 356 0.2469 0.2122 0.2247 6.10e-04 6h0n:B, 6h0p:A, 6h0p:B
57 1bxk:B 344 114 0.1019 0.0959 0.2895 8.31e-04 1bxk:A
58 8v4h:B 342 123 0.1019 0.0965 0.2683 0.001 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
59 7c1e:A 342 168 0.1481 0.1404 0.2857 0.002 7c1e:B, 7c3v:A, 5z2x:A, 5z2x:B, 8zav:A, 8zav:B, 5zec:A, 5zec:B, 5zed:A, 5zed:B
60 5u9c:A 288 159 0.1235 0.1389 0.2516 0.004 5u9c:C
61 7yst:A 312 157 0.1235 0.1282 0.2548 0.004 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
62 4m55:E 164 128 0.0957 0.1890 0.2422 0.004
63 8fip:A 338 135 0.1204 0.1154 0.2889 0.005 8fio:A, 8fio:B, 8fip:B
64 3sxp:D 314 201 0.1389 0.1433 0.2239 0.005 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
65 3enk:A 340 186 0.1481 0.1412 0.2581 0.005 3enk:B
66 3rfv:A 265 181 0.1327 0.1623 0.2376 0.006 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
67 1keu:A 361 112 0.0988 0.0886 0.2857 0.009 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
68 1bdb:A 267 165 0.1296 0.1573 0.2545 0.010
69 7us5:A 346 146 0.1204 0.1127 0.2671 0.017 7us5:B, 7us5:C, 7us5:D
70 4pvd:A 342 135 0.1173 0.1111 0.2815 0.017 4pvd:B
71 2ydx:A 312 156 0.1142 0.1186 0.2372 0.020 2ydx:C, 2ydx:B, 2ydx:D, 2ydx:E
72 7cgv:A 310 161 0.1235 0.1290 0.2484 0.020 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
73 2c59:A 364 127 0.1019 0.0907 0.2598 0.022 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
74 2p5u:A 311 211 0.1512 0.1576 0.2322 0.029 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
75 7csh:A 312 100 0.0926 0.0962 0.3000 0.031
76 5y1f:A 311 234 0.1667 0.1736 0.2308 0.035 5y1e:A, 5y1g:A
77 6ql9:D 1765 37 0.0617 0.0113 0.5405 0.046 3hmj:A, 3hmj:B, 3hmj:C, 8prv:A, 8prv:B, 8prw:A, 8prw:B, 8prw:C, 8prw:D, 8prw:E, 8prw:F, 8ps1:A, 6ql6:F, 6ql6:E, 6ql6:D, 6ql6:C, 6ql6:B, 6ql6:A, 6ql9:F, 6ql9:A, 6ql9:E, 6ql9:B, 6ql9:C, 6ta1:A, 6ta1:B, 6ta1:D, 6ta1:K, 6ta1:F, 6ta1:I, 6u5u:A, 2vkz:A, 2vkz:B, 2vkz:C, 2wat:A, 2wat:B, 2wat:C, 2wat:D, 2wat:E, 2wat:F
78 8du1:A 361 111 0.0957 0.0859 0.2793 0.057 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
79 2ggs:A 273 151 0.1142 0.1355 0.2450 0.057 2ggs:B
80 6xyw:Ai 138 43 0.0432 0.1014 0.3256 0.063
81 1i3k:A 347 166 0.1265 0.1182 0.2470 0.071 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
82 1o5i:B 234 142 0.1080 0.1496 0.2465 0.083
83 5ywn:A 333 172 0.1358 0.1321 0.2558 0.088 5yw4:A
84 7cs6:F 300 90 0.0741 0.0800 0.2667 0.16 7cs3:A, 7cs3:B, 7cs3:C, 7cs3:D, 7cs3:E, 7cs3:F, 7cs4:E, 7cs4:A, 7cs4:F, 7cs4:D, 7cs4:C, 7cs4:B, 7cs5:E, 7cs5:A, 7cs5:F, 7cs5:D, 7cs5:C, 7cs5:B, 7cs6:A, 7cs6:B, 7cs6:C, 7cs6:D, 7cs6:E, 7cs7:A, 7cs7:B, 7cs7:C, 7cs7:D, 7cs7:E, 7cs7:F, 7cs8:A, 7cs8:B, 7cs8:C, 7cs8:D, 7cs8:E, 7cs8:F
85 9cly:B 242 152 0.1204 0.1612 0.2566 0.18 9cly:A
86 8sk0:B 330 154 0.1019 0.1000 0.2143 0.23 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
87 5gt9:B 263 149 0.1204 0.1483 0.2617 0.35 5gt9:A
88 6u5w:A 1435 49 0.0617 0.0139 0.4082 0.48
89 7csa:A 310 90 0.0864 0.0903 0.3111 0.51 7csa:B, 7csa:C, 7csa:D, 7csb:C, 7csb:D, 7csb:A, 7csb:B, 7csc:E, 7csc:F, 7csc:A, 7csc:B, 7csc:C, 7csc:D, 7csd:C, 7csd:D, 7csd:A, 7csd:B, 7cse:E, 7cse:F, 7cse:A, 7cse:B, 7cse:C, 7cse:D, 7csf:C, 7csf:D, 7csf:A, 7csf:B
90 1orr:A 338 157 0.1111 0.1065 0.2293 0.72 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
91 2q1s:A 336 289 0.1975 0.1905 0.2215 0.98 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
92 6x3b:A 300 172 0.1111 0.1200 0.2093 1.00 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
93 8gjb:A 320 110 0.0926 0.0938 0.2727 1.4 8gjb:B
94 3c3x:A 310 81 0.0648 0.0677 0.2593 1.5 3c3x:B, 2qw8:A, 2qw8:B, 2qx7:A, 2qx7:B, 2qzz:A, 2qzz:B, 2r2g:A, 2r2g:B, 2r6j:A, 2r6j:B
95 3qvo:A 197 76 0.0556 0.0914 0.2368 1.8
96 6uh2:B 255 31 0.0401 0.0510 0.4194 2.1 6uh2:A
97 7wbc:A 250 158 0.1173 0.1520 0.2405 2.2 7wbc:B
98 5ilg:A 265 189 0.1327 0.1623 0.2275 2.4 5ilg:B, 5ilo:A, 5ilo:B
99 6a2f:A 358 44 0.0370 0.0335 0.2727 2.6 6a2f:B
100 5ts3:A 265 160 0.1358 0.1660 0.2750 3.1 5ts3:B
101 6vtj:A 472 335 0.2377 0.1631 0.2299 3.1
102 6bge:A 323 69 0.0525 0.0526 0.2464 3.3 6bge:B, 1g6o:A, 1g6o:B, 1nly:A, 1nly:B
103 2jbh:B 213 35 0.0494 0.0751 0.4571 3.4 2jbh:A
104 6aqz:A 334 85 0.0772 0.0749 0.2941 3.4 6aqz:B, 6aqz:C, 6aqz:E, 6aqz:F
105 3c1t:B 326 133 0.0988 0.0982 0.2406 3.4 3bxx:A, 3bxx:B, 3bxx:C, 3bxx:D, 3bxx:E, 3bxx:F, 3c1t:A, 3c1t:C, 3c1t:D, 2c29:D, 2c29:F, 2iod:A, 2iod:B, 2iod:C, 2iod:D, 2nnl:D, 2nnl:F
106 7epr:B 310 129 0.1080 0.1129 0.2713 3.6 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
107 7s04:A 396 52 0.0525 0.0429 0.3269 3.7
108 3c1o:A 314 115 0.0957 0.0987 0.2696 4.0
109 3sc6:D 283 180 0.1265 0.1449 0.2278 4.1 3sc6:A, 3sc6:B, 3sc6:C, 3sc6:E, 3sc6:F
110 3ay6:B 267 68 0.0556 0.0674 0.2647 4.8 3aut:B, 3auu:A, 3auu:B, 3ay6:A, 3ay6:C, 3ay6:D
111 7l5u:A 520 33 0.0432 0.0269 0.4242 5.2 7l5u:B, 7l5u:C, 7l5u:D, 7l5u:E, 7l5u:F, 7l5u:G, 7l5u:H, 7l5u:I, 7l5u:J, 7l5u:K, 7l5u:L, 7l5u:M, 7l5u:N, 7l5u:O, 7l5u:P, 7l5u:Q, 7l5u:R, 7l5u:S, 7l5u:T, 7l5u:U, 7l5u:V, 7l5u:W, 7l5u:X, 7l5u:Y, 7l5u:Z, 7l5u:a, 7l5u:b, 7l5u:c, 7l5u:d, 7l5u:e, 7l5u:f, 7l5u:g, 7l5u:h, 7l5u:i, 7l5u:j, 7l5u:k, 7l5u:l, 7l5u:m, 7l5u:n, 7l5u:o, 7l5u:p, 7l5u:q, 7l5u:r, 7l5u:s, 7l5u:t, 7l5u:u, 7l5u:v, 7l5u:w, 7l5u:x, 7l5u:y, 7l5u:z, 7l5u:1, 7l5u:2, 7l5u:3, 7l5u:4, 7l5u:5, 7l5u:6, 7l5u:7, 7l5u:8
112 5itv:A 255 81 0.0617 0.0784 0.2469 5.8 5itv:B, 5itv:C
113 6dzi:C 275 74 0.0648 0.0764 0.2838 6.6 6dzp:C, 7f0d:C, 8fr8:K, 8kab:C, 7kgb:C, 7msc:C, 7msh:C, 7msm:C, 7msz:C, 7mt2:C, 7mt3:C, 7mt7:C, 5o60:C, 5o61:C, 7s0s:D, 7sfr:C, 5v7q:C, 5v93:C, 8v9j:C, 8v9k:C, 8v9l:C, 8whx:E, 8why:E, 8wi7:E, 8wi8:E, 8wib:E, 8wic:E, 7xam:C, 5xym:C, 8xz3:C, 7y41:C, 5zeb:C, 5zep:C, 5zet:C
114 5itv:D 227 81 0.0617 0.0881 0.2469 6.8
115 6bul:B 327 102 0.0710 0.0703 0.2255 9.8 6aqj:A, 6aqj:B, 6bul:A, 6c55:A, 6c55:B, 6c5n:A, 6c5n:B, 7ke2:B, 7ke2:A, 7kh7:A, 7kh7:B, 6vo2:A, 6vo2:B, 5w3k:A, 5w3k:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218