BioLiP

>protein
MFENITAAPADPILGLADLFRADERPGKINLGIGVYKDETGKTPVLTSVKKAEQYLLENETTKNYLGIDGIPEFGRCTQE
LLFGKGSALINDKRARTAQTPGGTGALRVAADFLAKNTSVKRVWVSNPSWPNHKSVFNSAGLEVREYAYYDAENHTLDFD
ALINSLNEAQAGDVVLFHGCCHNPTGIDPTLEQWQTLAQLSVEKGWLPLFDFAFQGFARGLEEDAEGLRAFAAMHKELIV
ASSYSKNFGLYNERVGACTLVAADSETVDRAFSQMKAAIRANYSNPPAHGASVVATILSNDALRAIWEQELTDMRQRIQR
MRQLFVNTLQEKGANRDFSFIIKQNGMFSFSGLTKEQVLRLREEFGVYAVASGRVNVAGMTPDNMAPLCEAIVAVL

The query sequence (length=396) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8e9c:B	399	395	0.9848	0.9774	0.9873	0.0	4a00:A, 1aam:A, 1aaw:A, 2aat:A, 3aat:A, 1ahe:A, 1ahe:B, 1ahf:A, 1ahf:B, 1ahg:A, 1ahg:B, 1ahx:A, 1ahx:B, 1ahy:A, 1ahy:B, 1aia:A, 1aia:B, 1aib:A, 1aib:B, 1aic:A, 1aic:B, 1amq:A, 1amr:A, 1ams:A, 1arg:A, 1arg:B, 1arh:A, 1arh:B, 1ari:A, 1ari:B, 1ars:A, 1art:A, 1asa:A, 1asb:A, 1asc:A, 1asd:A, 1ase:A, 1asf:A, 1asg:A, 1asl:A, 1asl:B, 1asm:A, 1asm:B, 1asn:A, 1asn:B, 1b4x:A, 1c9c:A, 1cq6:A, 1cq7:A, 1cq8:A, 1czc:A, 1cze:A, 2d5y:A, 2d61:A, 2d63:A, 2d64:A, 2d65:A, 2d66:A, 2d7y:A, 2d7z:A, 4dbc:A, 8e9c:A, 8e9d:A, 8e9d:B, 8e9j:A, 8e9j:B, 8e9k:A, 8e9k:B, 8e9l:A, 8e9l:B, 8e9m:A, 8e9m:B, 8e9n:A, 8e9n:B, 8e9o:A, 8e9o:B, 8e9p:A, 8e9p:B, 8e9q:A, 8e9q:B, 8e9r:A, 8e9r:B, 8e9s:A, 8e9s:B, 8e9t:A, 8e9t:B, 8e9u:A, 8e9u:B, 8e9v:A, 8e9v:B, 5eaa:A, 1g4v:A, 1g4x:A, 1g7w:A, 1g7x:A, 1ix6:A, 1ix7:A, 1ix8:A, 3pa9:A, 3paa:A, 2q7w:A, 2qa3:A, 2qb2:A, 2qb3:A, 2qbt:A, 1qir:A, 1qis:A, 1qit:A, 3qpg:A, 1spa:A, 5t4l:A, 1tog:A, 1tog:B, 1toi:A, 1toj:A, 5vwq:A, 5vwq:D, 5vwq:G, 5vwq:J, 5vwr:A, 1x28:A, 1x28:B, 1x29:A, 1x29:B, 1x2a:A, 1x2a:B, 1yoo:A, 3zzj:A, 3zzk:A
2	1ay4:A	394	395	0.4495	0.4518	0.4506	7.42e-120	1ay4:B, 1ay5:A, 1ay5:B, 1ay8:A, 1ay8:B, 2ay1:A, 2ay1:B, 2ay2:A, 2ay2:B, 2ay3:A, 2ay3:B, 2ay4:A, 2ay4:B, 2ay5:A, 2ay5:B, 2ay6:A, 2ay6:B, 2ay7:A, 2ay7:B, 2ay8:A, 2ay8:B, 2ay9:A, 2ay9:B
3	3fsl:A	397	397	0.4293	0.4282	0.4282	3.49e-116	3fsl:B, 3fsl:C, 3fsl:D, 3fsl:E, 3fsl:F, 3tat:A, 3tat:B, 3tat:C, 3tat:D, 3tat:E, 3tat:F
4	4rkc:A	398	396	0.4167	0.4146	0.4167	4.25e-115	4rkc:B, 4rkd:A, 4rkd:B, 4rkd:C, 4rkd:D, 4rkd:E, 4rkd:F, 4rkd:G, 4rkd:H, 6t3v:A, 6zup:B, 6zup:A, 6zur:B, 6zur:A, 6zvg:A, 6zvg:B, 6zvg:C, 6zvg:D
5	7aat:A	401	396	0.4040	0.3990	0.4040	1.69e-106	7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
6	8skr:A	402	396	0.4066	0.4005	0.4066	6.10e-105	3pd6:A, 3pd6:B, 3pd6:C, 3pdb:B, 3pdb:D, 8skr:C
7	3ii0:C	407	388	0.4116	0.4005	0.4201	2.77e-99	6dna:A, 6dna:B, 6dna:C, 6dna:D, 6dna:E, 6dna:F, 3ii0:A, 3ii0:B, 3ii0:D
8	6jpk:A	409	397	0.3838	0.3716	0.3829	1.42e-96	6jpk:B
9	2cst:A	411	400	0.3939	0.3796	0.3900	2.30e-96	2cst:B
10	1yaa:A	412	406	0.3914	0.3762	0.3818	2.64e-95	1yaa:B, 1yaa:C, 1yaa:D
11	7tur:B	414	394	0.4040	0.3865	0.4061	6.44e-95	1ajs:A, 1ajs:B, 6dnb:A, 6dnd:A, 6dnd:B, 6lig:A, 6lig:B, 7tur:A, 5vjz:A, 5vjz:B
12	4w5k:A	380	380	0.3813	0.3974	0.3974	9.95e-94	4w5k:B
13	6ezl:A	392	399	0.4116	0.4158	0.4085	1.47e-93	6ezl:B
14	3meb:A	426	414	0.3737	0.3474	0.3575	2.15e-78	3meb:B
15	3k7y:A	405	400	0.3283	0.3210	0.3250	2.51e-64
16	3rq1:A	414	391	0.2525	0.2415	0.2558	3.78e-18	3rq1:B, 3rq1:C
17	4emy:A	409	385	0.2146	0.2078	0.2208	2.26e-14	4emy:B, 4emy:C, 4emy:D
18	2x5f:A	428	268	0.1641	0.1519	0.2425	1.38e-10	2x5f:B
19	3ele:A	398	183	0.1187	0.1181	0.2568	4.71e-05	3ele:B, 3ele:C, 3ele:D
20	3if2:A	437	169	0.1111	0.1007	0.2604	0.036	3if2:B
21	6l1l:B	393	226	0.1515	0.1527	0.2655	0.057	6l1l:A, 6l1n:A, 6l1n:B, 6l1o:B, 6l1o:A
22	1j32:A	388	77	0.0606	0.0619	0.3117	0.061	1j32:B
23	3qgu:A	406	117	0.0808	0.0788	0.2735	0.31
24	6sga:F7	662	46	0.0404	0.0242	0.3478	0.47	7pua:F7, 7pub:F7, 6sgb:F7
25	3a3u:A	270	44	0.0379	0.0556	0.3409	0.77	2czl:A
26	4r2n:A	353	106	0.0707	0.0793	0.2642	1.4	4r2n:C, 4r2n:B, 4r2n:D, 4r5z:A, 4r5z:B, 4r5z:C, 4r5z:D
27	5bk7:H	369	115	0.0833	0.0894	0.2870	3.4	5bk7:A, 5bk7:B, 5bk7:C, 5bk7:D, 5bk7:E, 5bk7:F, 5bk7:G, 6c8t:A, 6c8t:B, 6c8t:C, 6c92:A, 6c92:B, 6c92:C, 6c92:D, 6c9b:B, 5dj3:A, 5dj3:B, 5dj3:C, 5dj3:D
28	4fl0:B	409	82	0.0530	0.0513	0.2561	4.0	4fl0:A
29	5hdm:A	428	236	0.1288	0.1192	0.2161	4.1	5hdm:B
30	6g1h:A	342	57	0.0480	0.0556	0.3333	6.6	6g1m:A, 6g1m:B, 6g1m:C, 6g1m:D
31	8aaf:e	1527	48	0.0429	0.0111	0.3542	7.1	8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
32	4m2j:A	382	119	0.0758	0.0785	0.2521	7.2	4m2k:A, 4m2m:A
33	7vu2:A	435	133	0.0758	0.0690	0.2256	7.2	7vu3:A
34	7u7h:A	423	104	0.0707	0.0662	0.2692	7.4	7u7h:B
35	8jyq:E	164	32	0.0303	0.0732	0.3750	8.3	8jyq:B
36	7alp:U	1935	54	0.0480	0.0098	0.3519	9.2

[Back]