BioLiP

>protein
MFENITAAPADPILGLADLFRADERPGKINLGIGVYKDETGKTPVLTSVKKAEQYLLENETTKNYLGIDGIPEFGRCTQE
LLFGKGSALINDKRARTAQTPGGTGALRVAADFLAKNTSVKRVWVSNPSWPNHKSVFNSAGLEVREYAYYDAENHTLDFD
ALINSLNEAQAGDVVLFHGCCHNPTGIDPTLEQWQTLAQLSVEKGWLPLFAFAYQGFARGLEEDAEGLRAFAAMHKELIV
ASSYSKNFGLYNERVGACTLVAADSETVDRAFSQMKAAIRANYSNPPAHGASVVATILSNDALRAIWEQELTDMRQRIQR
MRQLFVNTLQEKGANRDFSFIIKQNGMFSFSGLTKEQVLRLREEFGVYAVASGRVNVAGMTPDNMAPLCEAIVAVL

The query sequence (length=396) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8e9c:B	399	395	0.9848	0.9774	0.9873	0.0	4a00:A, 1aam:A, 1aaw:A, 2aat:A, 3aat:A, 1ahe:A, 1ahe:B, 1ahf:A, 1ahf:B, 1ahg:A, 1ahg:B, 1ahx:A, 1ahx:B, 1ahy:A, 1ahy:B, 1aia:A, 1aia:B, 1aib:A, 1aib:B, 1aic:A, 1aic:B, 1amq:A, 1amr:A, 1ams:A, 1arg:A, 1arg:B, 1arh:A, 1arh:B, 1ari:A, 1ari:B, 1ars:A, 1art:A, 1asa:A, 1asb:A, 1asc:A, 1asd:A, 1ase:A, 1asf:A, 1asg:A, 1asl:A, 1asl:B, 1asm:A, 1asm:B, 1asn:A, 1asn:B, 1b4x:A, 1c9c:A, 1cq6:A, 1cq7:A, 1cq8:A, 1czc:A, 1cze:A, 2d5y:A, 2d61:A, 2d63:A, 2d64:A, 2d65:A, 2d66:A, 2d7y:A, 2d7z:A, 4dbc:A, 8e9c:A, 8e9d:A, 8e9d:B, 8e9j:A, 8e9j:B, 8e9k:A, 8e9k:B, 8e9l:A, 8e9l:B, 8e9m:A, 8e9m:B, 8e9n:A, 8e9n:B, 8e9o:A, 8e9o:B, 8e9p:A, 8e9p:B, 8e9q:A, 8e9q:B, 8e9r:A, 8e9r:B, 8e9s:A, 8e9s:B, 8e9t:A, 8e9t:B, 8e9u:A, 8e9u:B, 8e9v:A, 8e9v:B, 5eaa:A, 1g4v:A, 1g4x:A, 1g7w:A, 1g7x:A, 1ix6:A, 1ix7:A, 1ix8:A, 3pa9:A, 3paa:A, 2q7w:A, 2qa3:A, 2qb2:A, 2qb3:A, 2qbt:A, 1qir:A, 1qis:A, 1qit:A, 3qpg:A, 1spa:A, 5t4l:A, 1tog:A, 1tog:B, 1toi:A, 1toj:A, 5vwq:A, 5vwq:D, 5vwq:G, 5vwq:J, 5vwr:A, 1x28:A, 1x28:B, 1x29:A, 1x29:B, 1x2a:A, 1x2a:B, 1yoo:A, 3zzj:A, 3zzk:A
2	1ay4:A	394	395	0.4495	0.4518	0.4506	2.86e-119	1ay4:B, 1ay5:A, 1ay5:B, 1ay8:A, 1ay8:B, 2ay1:A, 2ay1:B, 2ay2:A, 2ay2:B, 2ay3:A, 2ay3:B, 2ay4:A, 2ay4:B, 2ay5:A, 2ay5:B, 2ay6:A, 2ay6:B, 2ay7:A, 2ay7:B, 2ay8:A, 2ay8:B, 2ay9:A, 2ay9:B
3	3fsl:A	397	397	0.4293	0.4282	0.4282	1.71e-115	3fsl:B, 3fsl:C, 3fsl:D, 3fsl:E, 3fsl:F, 3tat:A, 3tat:B, 3tat:C, 3tat:D, 3tat:E, 3tat:F
4	4rkc:A	398	396	0.4167	0.4146	0.4167	1.60e-114	4rkc:B, 4rkd:A, 4rkd:B, 4rkd:C, 4rkd:D, 4rkd:E, 4rkd:F, 4rkd:G, 4rkd:H, 6t3v:A, 6zup:B, 6zup:A, 6zur:B, 6zur:A, 6zvg:A, 6zvg:B, 6zvg:C, 6zvg:D
5	7aat:A	401	396	0.4040	0.3990	0.4040	8.77e-106	7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
6	8skr:A	402	396	0.4066	0.4005	0.4066	2.64e-104	3pd6:A, 3pd6:B, 3pd6:C, 3pdb:B, 3pdb:D, 8skr:C
7	3ii0:C	407	388	0.4116	0.4005	0.4201	1.12e-98	6dna:A, 6dna:B, 6dna:C, 6dna:D, 6dna:E, 6dna:F, 3ii0:A, 3ii0:B, 3ii0:D
8	2cst:A	411	400	0.3939	0.3796	0.3900	7.63e-96	2cst:B
9	6jpk:A	409	397	0.3838	0.3716	0.3829	8.26e-96	6jpk:B
10	1yaa:A	412	406	0.3914	0.3762	0.3818	1.35e-94	1yaa:B, 1yaa:C, 1yaa:D
11	7tur:B	414	394	0.4040	0.3865	0.4061	2.51e-94	1ajs:A, 1ajs:B, 6dnb:A, 6dnd:A, 6dnd:B, 6lig:A, 6lig:B, 7tur:A, 5vjz:A, 5vjz:B
12	4w5k:A	380	380	0.3813	0.3974	0.3974	6.61e-93	4w5k:B
13	6ezl:A	392	399	0.4116	0.4158	0.4085	1.02e-92	6ezl:B
14	3meb:A	426	414	0.3737	0.3474	0.3575	9.07e-78	3meb:B
15	3k7y:A	405	400	0.3283	0.3210	0.3250	7.45e-64
16	3rq1:A	414	391	0.2525	0.2415	0.2558	1.26e-17	3rq1:B, 3rq1:C
17	4emy:A	409	385	0.2146	0.2078	0.2208	6.60e-14	4emy:B, 4emy:C, 4emy:D
18	2x5f:A	428	265	0.1540	0.1425	0.2302	2.83e-10	2x5f:B
19	3ele:A	398	183	0.1187	0.1181	0.2568	3.22e-05	3ele:B, 3ele:C, 3ele:D
20	1j32:A	388	77	0.0581	0.0593	0.2987	0.057	1j32:B
21	3if2:A	437	170	0.1136	0.1030	0.2647	0.093	3if2:B
22	6l1l:B	393	226	0.1515	0.1527	0.2655	0.16	6l1l:A, 6l1n:A, 6l1n:B, 6l1o:B, 6l1o:A
23	3a3u:A	270	44	0.0404	0.0593	0.3636	0.39	2czl:A
24	6sga:F7	662	46	0.0404	0.0242	0.3478	0.46	7pua:F7, 7pub:F7, 6sgb:F7
25	3qgu:A	406	117	0.0808	0.0788	0.2735	1.1
26	6g1h:A	342	57	0.0480	0.0556	0.3333	6.8	6g1m:A, 6g1m:B, 6g1m:C, 6g1m:D
27	8aaf:e	1527	48	0.0429	0.0111	0.3542	7.0	8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
28	7u7h:A	423	104	0.0707	0.0662	0.2692	7.8	7u7h:B
29	7alp:U	1935	54	0.0480	0.0098	0.3519	7.9
30	8jyq:E	164	32	0.0303	0.0732	0.3750	8.1	8jyq:B

[Back]