BioLiP

>protein
MFENITAAPAADLFRADINLGIGVYKDETGKTPVLTSVKKAEQYLLENETTKNYLGIDGIPEFGRCTQELLFGKGSALIN
DKRARTAQTPGGTGALRVAADFLAKNTSVKRVWVSNPSWPNHKSVFNSAGLEVREYAYYDAENHTLDFDALINSLNEAQA
GDVVLFHGCCHNPTGIDPTLEQWQTLAQLSVEKGWLPLFDFAYQGFARGLEEDAEGLRAFAAMHKELIVASSYSKNFGLY
NERVGACTLVAADSETVDRAFSQMKAAIRANYSNPPAHGASVVATILSNDALRAIWEQELTDMRQRIQRMRQLFVNTLQE
KGANRDFSFIIKQNGMFSFSGLTKEQVLRLREEFGVYAVASGRVNVAGMTPDNMAPLCEAIVAVL

The query sequence (length=385) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8e9c:B	399	395	0.9870	0.9524	0.9620	0.0	4a00:A, 1aam:A, 1aaw:A, 2aat:A, 3aat:A, 1ahe:A, 1ahe:B, 1ahf:A, 1ahf:B, 1ahg:A, 1ahg:B, 1ahx:A, 1ahx:B, 1ahy:A, 1ahy:B, 1aia:A, 1aia:B, 1aib:A, 1aib:B, 1aic:A, 1aic:B, 1amq:A, 1amr:A, 1ams:A, 1arg:A, 1arg:B, 1arh:A, 1arh:B, 1ari:A, 1ari:B, 1ars:A, 1art:A, 1asa:A, 1asb:A, 1asc:A, 1asd:A, 1ase:A, 1asf:A, 1asg:A, 1asl:A, 1asl:B, 1asm:A, 1asm:B, 1asn:A, 1asn:B, 1b4x:A, 1c9c:A, 1cq6:A, 1cq7:A, 1cq8:A, 1czc:A, 1cze:A, 2d5y:A, 2d61:A, 2d63:A, 2d64:A, 2d65:A, 2d66:A, 2d7y:A, 2d7z:A, 4dbc:A, 8e9c:A, 8e9d:A, 8e9d:B, 8e9j:A, 8e9j:B, 8e9k:A, 8e9k:B, 8e9l:A, 8e9l:B, 8e9m:A, 8e9m:B, 8e9n:A, 8e9n:B, 8e9o:A, 8e9o:B, 8e9p:A, 8e9p:B, 8e9q:A, 8e9q:B, 8e9r:A, 8e9r:B, 8e9s:A, 8e9s:B, 8e9t:A, 8e9t:B, 8e9u:A, 8e9u:B, 8e9v:A, 8e9v:B, 5eaa:A, 1g4v:A, 1g4x:A, 1g7w:A, 1g7x:A, 1ix6:A, 1ix7:A, 1ix8:A, 3pa9:A, 3paa:A, 2q7w:A, 2qa3:A, 2qb2:A, 2qb3:A, 2qbt:A, 1qir:A, 1qis:A, 1qit:A, 3qpg:A, 1spa:A, 5t4l:A, 1tog:A, 1tog:B, 1toi:A, 1toj:A, 5vwq:A, 5vwq:D, 5vwq:G, 5vwq:J, 5vwr:A, 1x28:A, 1x28:B, 1x29:A, 1x29:B, 1x2a:A, 1x2a:B, 1yoo:A, 3zzj:A, 3zzk:A
2	1ay4:A	394	376	0.4416	0.4315	0.4521	1.27e-113	1ay4:B, 1ay5:A, 1ay5:B, 1ay8:A, 1ay8:B, 2ay1:A, 2ay1:B, 2ay2:A, 2ay2:B, 2ay3:A, 2ay3:B, 2ay4:A, 2ay4:B, 2ay5:A, 2ay5:B, 2ay6:A, 2ay6:B, 2ay7:A, 2ay7:B, 2ay8:A, 2ay8:B, 2ay9:A, 2ay9:B
3	3fsl:A	397	373	0.4182	0.4055	0.4316	7.06e-108	3fsl:B, 3fsl:C, 3fsl:D, 3fsl:E, 3fsl:F, 3tat:A, 3tat:B, 3tat:C, 3tat:D, 3tat:E, 3tat:F
4	4rkc:A	398	376	0.4000	0.3869	0.4096	1.86e-105	4rkc:B, 4rkd:A, 4rkd:B, 4rkd:C, 4rkd:D, 4rkd:E, 4rkd:F, 4rkd:G, 4rkd:H, 6t3v:A, 6zup:B, 6zup:A, 6zur:B, 6zur:A, 6zvg:A, 6zvg:B, 6zvg:C, 6zvg:D
5	7aat:A	401	382	0.4026	0.3865	0.4058	1.71e-99	7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
6	8skr:A	402	382	0.4052	0.3881	0.4084	1.57e-98	3pd6:A, 3pd6:B, 3pd6:C, 3pdb:B, 3pdb:D, 8skr:C
7	3ii0:C	407	381	0.4182	0.3956	0.4226	1.89e-96	6dna:A, 6dna:B, 6dna:C, 6dna:D, 6dna:E, 6dna:F, 3ii0:A, 3ii0:B, 3ii0:D
8	2cst:A	411	381	0.3948	0.3698	0.3990	1.33e-93	2cst:B
9	7tur:B	414	381	0.4000	0.3720	0.4042	7.33e-92	1ajs:A, 1ajs:B, 6dnb:A, 6dnd:A, 6dnd:B, 6lig:A, 6lig:B, 7tur:A, 5vjz:A, 5vjz:B
10	4w5k:A	380	375	0.3870	0.3921	0.3973	2.31e-91	4w5k:B
11	6ezl:A	392	398	0.4182	0.4107	0.4045	2.45e-91	6ezl:B
12	6jpk:A	409	397	0.3818	0.3594	0.3703	2.57e-90	6jpk:B
13	1yaa:A	412	406	0.4026	0.3762	0.3818	2.48e-89	1yaa:B, 1yaa:C, 1yaa:D
14	3meb:A	426	400	0.3662	0.3310	0.3525	2.06e-71	3meb:B
15	3k7y:A	405	379	0.3169	0.3012	0.3219	1.18e-61
16	3rq1:A	414	387	0.2597	0.2415	0.2584	2.14e-18	3rq1:B, 3rq1:C
17	4emy:A	409	383	0.2234	0.2103	0.2245	1.14e-14	4emy:B, 4emy:C, 4emy:D
18	2x5f:A	428	268	0.1714	0.1542	0.2463	4.04e-11	2x5f:B
19	3ele:A	398	155	0.1117	0.1080	0.2774	4.82e-05	3ele:B, 3ele:C, 3ele:D
20	2zc0:A	405	179	0.1247	0.1185	0.2682	0.008	2zc0:B, 2zc0:C, 2zc0:D
21	3if2:A	437	169	0.1169	0.1030	0.2663	0.013	3if2:B
22	6l1l:B	393	226	0.1584	0.1552	0.2699	0.020	6l1l:A, 6l1n:A, 6l1n:B, 6l1o:B, 6l1o:A
23	1j32:A	388	77	0.0649	0.0644	0.3247	0.026	1j32:B
24	3qgu:A	406	117	0.0857	0.0813	0.2821	0.11
25	3a3u:A	270	44	0.0416	0.0593	0.3636	0.27	2czl:A
26	4r2n:A	353	106	0.0753	0.0822	0.2736	0.45	4r2n:C, 4r2n:B, 4r2n:D, 4r5z:A, 4r5z:B, 4r5z:C, 4r5z:D
27	6sga:F7	662	46	0.0416	0.0242	0.3478	0.46	7pua:F7, 7pub:F7, 6sgb:F7
28	4fl0:B	409	82	0.0571	0.0538	0.2683	1.3	4fl0:A
29	2f8j:A	335	164	0.1091	0.1254	0.2561	3.3	2f8j:B, 2f8j:C, 2f8j:D, 1h1c:A, 1h1c:B, 1h1c:C, 1h1c:D, 1uu0:A, 1uu0:B, 1uu0:C, 1uu0:D, 1uu1:A, 1uu1:B, 1uu1:C, 1uu1:D, 1uu2:A, 1uu2:B
30	6g1h:A	342	57	0.0494	0.0556	0.3333	5.9	6g1m:A, 6g1m:B, 6g1m:C, 6g1m:D
31	4m2j:A	382	119	0.0779	0.0785	0.2521	6.0	4m2k:A, 4m2m:A
32	8aaf:e	1527	48	0.0442	0.0111	0.3542	7.1	8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
33	8jyq:E	164	32	0.0312	0.0732	0.3750	7.3	8jyq:B
34	5bk7:H	369	115	0.0831	0.0867	0.2783	7.8	5bk7:A, 5bk7:B, 5bk7:C, 5bk7:D, 5bk7:E, 5bk7:F, 5bk7:G, 6c8t:A, 6c8t:B, 6c8t:C, 6c92:A, 6c92:B, 6c92:C, 6c92:D, 6c9b:B, 5dj3:A, 5dj3:B, 5dj3:C, 5dj3:D
35	7alp:U	1935	54	0.0494	0.0098	0.3519	8.0
36	3ei9:A	412	40	0.0338	0.0316	0.3250	8.9	3ei5:A, 3ei5:B, 3ei6:A, 3ei6:B, 3ei8:A, 3ei8:B, 3ei9:B, 3eia:A, 3eia:B, 3eib:A, 3eib:B, 2z1z:A, 2z1z:B, 2z20:A, 2z20:B
37	7u7h:A	423	104	0.0727	0.0662	0.2692	9.4	7u7h:B

[Back]