Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
METPLEKALTTMVTTFHKYSGREGSKLTLSRKELKELIKKELCLGEMKESSIDDLMKSLDKNSDQEIDFKEYSVFLTMLC
MAYNDFFLEDNK

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2kay:A 92 92 1.0000 1.0000 1.0000 1.25e-62 4dir:A, 4dir:B, 2kay:B, 6wn7:A, 6wn7:B, 6wn7:C, 6wn7:D, 6wn7:F, 6wn7:E
2 1k96:A 89 83 0.4891 0.5056 0.5422 5.50e-28 1k9k:A, 1k9k:B, 4p2y:B, 4ybh:B
3 4duq:B 90 88 0.5109 0.5222 0.5341 8.27e-27 4duq:A
4 7psq:G 108 90 0.5217 0.4444 0.5333 5.72e-26 4cfr:B, 4eto:A, 3ko0:F, 3ko0:G, 3ko0:Q, 3m0w:J, 3m0w:B, 3m0w:C, 3m0w:D, 3m0w:F, 3m0w:G, 7psq:E, 3zwh:B
5 6t58:A 524 87 0.5109 0.0897 0.5402 5.42e-23 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
6 6t58:A 524 85 0.4891 0.0859 0.5294 3.32e-21 3c1v:A, 3c1v:B, 3c1v:C, 3c1v:D, 4cfq:A, 4cfq:B, 4cfq:C, 4cfq:D, 4cfr:A, 3cga:A, 3cga:B, 7eq7:A, 4eto:B, 4hre:A, 4hre:C, 4hre:B, 4hre:D, 4hsz:A, 4hsz:B, 4hsz:C, 4hsz:D, 2hyu:A, 2hyv:A, 2hyw:A, 2hyw:B, 3ko0:A, 3ko0:C, 3ko0:B, 3ko0:D, 3ko0:J, 3ko0:I, 3ko0:E, 3ko0:H, 3ko0:K, 3ko0:S, 3ko0:L, 3ko0:N, 3ko0:M, 3ko0:P, 3ko0:O, 3ko0:R, 3ko0:T, 5lpu:A, 5lpu:B, 5lpu:C, 5lpu:D, 5lpx:A, 5lq0:A, 5lq0:B, 5lq2:A, 5lq2:B, 3m0w:I, 3m0w:A, 3m0w:E, 3m0w:H, 5n7g:B, 7psp:A, 7psp:B, 7psq:A, 7psq:C, 2q91:A, 2q91:B, 6t58:B, 4x9p:A, 1xjl:A, 1xjl:B, 7zvn:A, 7zvx:A, 7zvx:B, 3zwh:A
7 2k2f:A 93 92 0.4348 0.4301 0.4348 2.38e-21 2k2f:B, 5k89:A, 5k89:C, 5k89:H, 2kbm:A, 2kbm:B, 2lp2:A, 2lp2:B, 2lp3:A, 2lp3:B, 2lux:A, 2lux:B, 8vk4:I, 8vk4:J, 8vk4:K, 8vk4:L, 8vk4:N, 8vk4:M, 8vk4:O, 8vk4:P, 1zfs:A, 1zfs:B
8 5csn:A 94 88 0.4348 0.4255 0.4545 2.77e-20 3cr2:A, 3cr4:X, 3cr5:X, 5csf:A, 5csf:B, 5csi:A, 5csi:B, 5csj:A, 5csj:B, 5csn:B, 3czt:X, 3d0y:A, 3d0y:B, 3d10:A, 3d10:B, 5d7f:A, 5d7f:B, 5dkn:A, 5dkq:A, 5dkr:A, 5dkr:B, 1dt7:A, 1dt7:B, 5er4:X, 5er5:A, 8fj8:A, 4fqo:A, 3gk1:A, 3gk2:A, 3gk4:X, 2h61:A, 2h61:B, 2h61:C, 2h61:D, 2h61:E, 2h61:F, 2h61:G, 2h61:H, 3hcm:A, 3hcm:B, 3iqo:A, 3iqo:B, 3iqq:A, 2k7o:A, 2k7o:B, 3lk0:A, 3lk0:B, 3lk0:C, 3lk0:D, 3lk1:A, 3lle:A, 3lle:B, 1mho:A, 1mq1:A, 1mq1:B, 1mwn:A, 1mwn:B, 4pdz:A, 4pdz:B, 4pe0:X, 4pe0:A, 4pe1:A, 4pe1:B, 4pe4:X, 4pe4:A, 4pe7:A, 1psb:A, 1psb:B, 1qlk:A, 1qlk:B, 3rlz:A, 3rlz:B, 3rm1:A, 1xyd:A, 1xyd:B, 4xyn:A, 4xyn:B, 4xyn:C, 4xyn:D
9 2y5i:C 98 93 0.4239 0.3980 0.4194 1.48e-19 2y5i:A, 2y5i:B, 2y5i:D, 2y5i:E, 2y5i:F
10 7nmi:B 488 85 0.3804 0.0717 0.4118 2.36e-15 1j55:A
11 7nmi:B 488 88 0.3913 0.0738 0.4091 9.13e-14 1j55:A
12 2wc8:D 93 83 0.3587 0.3548 0.3976 9.25e-14 1e8a:A, 1e8a:B, 1gqm:A, 1gqm:B, 1gqm:C, 1gqm:F, 1gqm:D, 1gqm:E, 1gqm:G, 1gqm:H, 1gqm:I, 1gqm:J, 1gqm:L, 1gqm:K, 1odb:B, 1odb:A, 1odb:C, 1odb:D, 1odb:E, 1odb:F, 2wc8:A, 2wc8:B, 2wc8:C, 2wcb:A, 2wcb:B
13 6zdy:A 108 91 0.3261 0.2778 0.3297 1.25e-13 6zfe:A
14 8s9w:A 98 88 0.3478 0.3265 0.3636 8.90e-12 8s9w:B
15 2kot:A 98 70 0.3370 0.3163 0.4429 2.16e-11 2egd:A, 2egd:B, 2h2k:A, 2h2k:B, 2kot:B, 1yut:A, 1yut:B, 1yuu:A, 1yuu:B
16 7ui5:A 114 85 0.3043 0.2456 0.3294 3.98e-10 6ds2:B, 6ds2:D, 6ds2:F, 6ds2:H, 4ggf:C, 4ggf:L, 4ggf:T, 4ggf:V, 1irj:A, 1irj:B, 1irj:C, 1irj:D, 1irj:E, 1irj:F, 1irj:G, 1irj:H, 7quv:B, 8sjb:C, 8sjb:D, 8sjc:C, 8sjc:D, 7ui5:B, 5w1f:B, 5w1f:D, 5w1f:H, 5w1f:F, 4xjk:B, 4xjk:D, 4xjk:F, 4xjk:H, 4xjk:J, 1xk4:C, 1xk4:D, 1xk4:G, 1xk4:H, 1xk4:K, 1xk4:L
17 4hrg:A 114 91 0.3261 0.2632 0.3297 5.49e-10 1bt6:A, 1bt6:B, 4drw:A, 4drw:B, 4drw:C, 4drw:D, 4ftg:A, 4ftg:B, 4hre:E, 4hre:F, 4hre:I, 4hre:J, 4hrg:B, 4hrh:A, 4hrh:B
18 5hlo:C 93 80 0.2826 0.2796 0.3250 1.27e-09 6ds2:A, 6ds2:C, 6ds2:E, 6ds2:G, 4ggf:A, 4ggf:K, 4ggf:S, 4ggf:U, 5hlo:A, 5hlo:B, 5hlo:D, 5hlv:A, 5hlv:D, 5hlv:B, 5hlv:H, 5hlv:C, 5hlv:E, 5hlv:F, 5hlv:G, 1mr8:A, 1mr8:B, 7quv:A, 8sjb:A, 8sjb:B, 8sjc:A, 8sjc:B, 5w1f:A, 5w1f:C, 5w1f:G, 5w1f:E, 4xjk:A, 4xjk:C, 4xjk:E, 4xjk:G, 4xjk:I, 1xk4:A, 1xk4:B, 1xk4:E, 1xk4:F, 1xk4:I, 1xk4:J
19 1qls:A 95 90 0.2717 0.2632 0.2778 5.33e-09
20 2l51:A 102 80 0.2935 0.2647 0.3375 1.65e-05 2l51:B
21 1qx2:A 76 63 0.2174 0.2632 0.3175 1.91e-04 1qx2:B
22 1ht9:A 76 74 0.2717 0.3289 0.3378 0.008 1b1g:A, 1ht9:B, 3icb:A, 4icb:A, 1ig5:A, 1igv:A, 1n65:A
23 1ncy:A 162 42 0.2065 0.1173 0.4524 0.027 1a2x:A, 1avs:A, 1avs:B, 1cta:A, 1cta:B, 1ctd:A, 1ctd:B, 1jc2:A, 1npq:A, 1smg:A, 1tnq:A, 4tnc:A, 5tnc:A, 1top:A, 2w49:0, 2w49:3, 2w49:6, 2w49:9, 1ytz:C, 1yv0:C
24 4mvf:A 408 51 0.1848 0.0417 0.3333 0.031 3pm8:A, 3pm8:B
25 4qox:A 462 26 0.1413 0.0281 0.5000 0.042
26 1omr:A 201 79 0.2500 0.1144 0.2911 0.065 2het:A, 2het:B, 2het:C, 2het:D, 2i94:A, 1jsa:A, 1la3:A, 4m2o:A, 4m2p:A, 4m2q:A, 4mlw:A, 1omv:A, 1rec:A, 4yi8:A, 4yi9:A
27 4aqi:A 96 22 0.1087 0.1042 0.4545 0.14 4aqj:A, 2psr:A, 3psr:A, 3psr:B, 2wnd:A, 2wor:A, 2wos:A
28 2m28:A 72 35 0.1413 0.1806 0.3714 0.34
29 1s6i:A 182 25 0.0978 0.0495 0.3600 0.39
30 1s6i:A 182 45 0.1739 0.0879 0.3556 8.5
31 1la0:A 161 28 0.1413 0.0807 0.4643 0.51 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
32 5dvr:A 386 26 0.1196 0.0285 0.4231 0.54
33 3khe:B 191 69 0.1739 0.0838 0.2319 0.67 3khe:A
34 3ox5:A 153 44 0.1413 0.0850 0.2955 0.69 2k7b:A, 2k7d:A, 2lan:A, 2lap:A, 3ox5:B, 3ox5:C, 3ox5:D, 3ox5:E, 3ox5:F, 3ox6:A, 3ox6:B, 3ox6:C, 3ox6:D, 3ox6:F
35 2scp:A 174 62 0.1739 0.0920 0.2581 1.1 2scp:B
36 1tn4:A 157 45 0.1848 0.1083 0.3778 1.2 1tcf:A, 2tn4:A
37 3q5i:A 470 51 0.1630 0.0319 0.2941 2.0
38 2aao:A 147 71 0.2174 0.1361 0.2817 2.0 2aao:B
39 3hzt:A 421 54 0.2065 0.0451 0.3519 2.1
40 2lv7:A 100 56 0.1739 0.1600 0.2857 2.5
41 1m46:A 148 31 0.1196 0.0743 0.3548 4.0 1m45:A
42 4ieb:A 472 26 0.1196 0.0233 0.4231 4.1 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
43 3lij:A 465 37 0.0978 0.0194 0.2432 4.3 3l19:A, 3l19:B
44 1bjf:A 181 50 0.1413 0.0718 0.2600 4.4 1bjf:B
45 3k21:A 178 19 0.0978 0.0506 0.4737 4.5
46 5g4p:A 184 24 0.0978 0.0489 0.3750 4.6 5g4p:E, 5g58:A, 5g58:E, 5m6c:A, 5m6c:E
47 5elm:B 235 49 0.1413 0.0553 0.2653 4.8 5elm:C, 5elm:D, 5hra:A, 5hra:B, 5hrc:A, 5hrc:B
48 1s6j:A 87 45 0.1739 0.1839 0.3556 5.4
49 6k31:A 1109 38 0.1630 0.0135 0.3947 6.3 6k31:B
50 3o4y:A 172 24 0.0978 0.0523 0.3750 6.5
51 1jba:A 189 28 0.0978 0.0476 0.3214 6.7
52 2lhi:A 176 29 0.0870 0.0455 0.2759 7.6 1f55:A, 2lhh:A, 6oqq:B, 6oqq:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218