Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MENSFKAALKAGRPQIGLWLGLSSSYSAELLAGAGFDWLLIDGEHAPNNVQTVLTQLQAIAPYPSQPVVAPSWNDPVQIK
QLLDVGTQTLLVPMVQNADEAREAVRATRYPPAGIRGVGSALARASRWNRIPDYLQKANDQMCVLVQIETREAMKNLPQI
LDVEGVDGVFIGPADLSADMGYAGNPQHPEVQAAIEQAIVQIRESGKAPGILIANEQLAKRYLELGALFVAVGVDTTLLA
RAAEALAARFGA

The query sequence (length=252) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2v5k:A 260 251 0.9921 0.9615 0.9960 0.0 4b5s:A, 4b5s:B, 4b5t:A, 4b5t:B, 4b5u:A, 4b5u:B, 4b5v:A, 4b5v:B, 4b5w:A, 4b5w:B, 4b5w:C, 4b5w:D, 4b5w:E, 4b5w:F, 2v5k:B
2 7et9:A 254 248 0.6032 0.5984 0.6129 2.14e-109 7et9:B, 7et9:C, 7eta:A, 7eta:B, 7eta:C, 7etb:A, 7etb:B, 7etb:C, 7etc:A, 7etc:C, 7etc:B, 7etd:A, 7etd:B, 7etd:C, 7ete:A, 7ete:C, 7ete:B, 7etf:A, 7etf:B, 7etf:C, 7etg:A, 7etg:B, 7etg:C, 7eth:A, 7eth:B, 7eth:C, 7eti:A, 7eti:B, 7eti:C
3 2vwt:A 256 250 0.5516 0.5430 0.5560 3.15e-98 2vwt:B, 2vwt:C
4 1dxe:A 253 248 0.4722 0.4704 0.4798 4.04e-76 1dxe:B, 1dxf:A, 1dxf:B
5 8adq:A 252 251 0.3532 0.3532 0.3546 4.19e-39 7nnk:A, 7nnk:B, 7nr1:A, 7nuj:A, 7nuj:B, 7o5r:A, 7o5r:B, 7o5v:AAA, 7o5v:BBB, 7o5w:AAA, 7o5w:BBB, 7o87:AAA, 7o87:BBB, 7o9r:AAA, 7o9r:BBB, 7obu:A, 7obu:B, 6r62:A
6 4tv5:A 245 204 0.2103 0.2163 0.2598 6.33e-19 4tv6:A
7 1izc:A 299 174 0.1825 0.1538 0.2644 4.18e-14
8 4r43:A 601 89 0.0952 0.0399 0.2697 0.25 5i67:A, 4rcg:A, 4wie:A, 4wiu:A, 4wl8:A, 4wou:A, 4wpt:A, 4wpu:A, 4wpv:A
9 4en4:A 310 40 0.0595 0.0484 0.3750 0.44 2ajp:A, 2ajp:B, 4en4:B, 4eoh:A, 4eoh:B, 3fhx:A, 3fhx:B, 3fhy:A, 3fhy:B, 3keu:A, 3keu:B, 8wr2:A, 8wr2:B, 2yxt:A, 2yxt:B, 2yxu:A, 2yxu:B
10 8fuz:A 390 106 0.1111 0.0718 0.2642 0.66 8foz:A, 8foz:B, 8foz:C, 8foz:D, 8foz:E, 8foz:F, 8foz:G, 8foz:H, 8fuz:B, 8fuz:C, 8fuz:D, 8fuz:E, 8fuz:F, 8fuz:G, 8fuz:H, 1jr1:B, 6u8e:A, 6u8e:B, 6u8e:C, 6u8e:D, 6u8e:E, 6u8e:F, 6u8e:G, 6u8e:H, 6u8s:A, 6u8s:B, 6u8s:C, 6u8s:D, 6u8s:E, 6u8s:F, 6u8s:G, 6u8s:H, 6ua5:A, 6ua5:B, 6ua5:C, 6ua5:D, 6ua5:E, 6ua5:F, 6ua5:G, 6ua5:H, 6udp:A, 6udp:B, 6udp:C, 6udp:D, 6udp:E, 6udp:F, 6udp:G, 6udp:H
11 1nf7:A 454 106 0.1111 0.0617 0.2642 0.78 1jr1:A, 1nf7:B
12 8g8f:A 491 106 0.1111 0.0570 0.2642 0.87 8g8f:B, 8g8f:C, 8g8f:D, 8g8f:E, 8g8f:F, 8g8f:G, 8g8f:H, 8g9b:A, 8g9b:B, 8g9b:C, 8g9b:D, 8g9b:E, 8g9b:F, 8g9b:G, 8g9b:H, 6i0m:A, 6i0o:B, 6u8n:A, 6u8n:B, 6u8n:C, 6u8n:D, 6u8n:E, 6u8n:F, 6u8n:G, 6u8n:H, 6u8r:D, 6u8r:A, 6u8r:B, 6u8r:C, 6u8r:H, 6u8r:E, 6u8r:F, 6u8r:G, 6u9o:A, 6u9o:B, 6u9o:C, 6u9o:D, 6u9o:E, 6u9o:F, 6u9o:G, 6u9o:H, 6ua2:B, 6ua2:A, 6ua2:D, 6ua2:C, 6ua2:F, 6ua2:E, 6ua2:H, 6ua2:G, 6ua4:B, 6ua4:A, 6ua4:D, 6ua4:C, 6ua4:F, 6ua4:E, 6ua4:H, 6ua4:G, 6uaj:A, 6uaj:B, 6uaj:C, 6uaj:D, 6uaj:E, 6uaj:F, 6uaj:G, 6uaj:H, 6udo:A, 6udo:B, 6udo:C, 6udo:D, 6udo:E, 6udo:F, 6udo:G, 6udo:H, 6udq:A, 6udq:B, 6udq:C, 6udq:D, 6udq:E, 6udq:F, 6udq:G, 6udq:H
13 1b3o:B 410 106 0.1111 0.0683 0.2642 0.91
14 1nfb:A 396 106 0.1111 0.0707 0.2642 0.93 1nfb:B
15 1lq8:G 330 55 0.0675 0.0515 0.3091 1.1 3dy0:A, 1lq8:A, 1lq8:C, 1lq8:E
16 6uc2:A 453 70 0.0833 0.0464 0.3000 1.7 6i0m:B, 6i0o:A, 6uc2:B, 6uc2:C, 6uc2:D, 6uc2:E, 6uc2:F, 6uc2:G, 6uc2:H
17 7d58:A 1387 41 0.0476 0.0087 0.2927 1.8 7a6h:A, 7ae1:A, 7ae3:A, 7aea:A, 7fji:A, 7fjj:A, 8ity:A, 8iue:A, 8iuh:A
18 7dn3:A 1293 41 0.0476 0.0093 0.2927 1.8 7du2:A
19 7rer:A 389 105 0.1032 0.0668 0.2476 2.1 7rer:D, 7rer:C, 7rer:B, 7rer:E, 7rer:H, 7rer:G, 7rer:F, 8u8y:A, 8u8y:B, 8u8y:C, 8u8y:D, 8u8y:E, 8u8y:F, 8u8y:G, 8u8y:H
20 7rgi:A 357 105 0.1032 0.0728 0.2476 2.3 7rgi:B, 7rgi:C, 7rgi:D, 7rgi:E, 7rgi:H, 7rgi:F, 7rgi:G
21 1b3o:A 304 70 0.0833 0.0691 0.3000 2.3
22 1sgj:A 231 74 0.0833 0.0909 0.2838 2.5 1sgj:B, 1sgj:C
23 7rbw:A 381 58 0.0714 0.0472 0.3103 2.5 7rbw:B
24 7rfi:A 422 105 0.1032 0.0616 0.2476 2.5 7rfi:B, 7rfi:C, 7rfi:D, 7rfi:E, 7rfi:F, 7rfi:G, 7rfi:H, 7rgl:A, 7rgl:B, 7rgl:C, 7rgl:D, 7rgl:E, 7rgl:F, 7rgl:G, 7rgl:H
25 1rfu:A 312 40 0.0556 0.0449 0.3500 3.0 1lhr:A, 1lhr:B, 1rft:A, 1rfu:B, 1rfu:C, 1rfu:D, 1rfu:E, 1rfu:F, 1rfu:G, 1rfu:H, 1rfv:A, 1rfv:B, 1ygj:A, 1ygk:A, 1yhj:A
26 8u7m:A 451 105 0.1032 0.0576 0.2476 3.0 8u7m:B, 8u7m:C, 8u7m:D, 8u7m:E, 8u7m:F, 8u7m:G, 8u7m:H
27 7rgd:A 519 105 0.1032 0.0501 0.2476 3.0 7res:A, 7res:B, 7res:C, 7res:D, 7res:E, 7res:F, 7res:G, 7res:H, 7rfe:A, 7rfe:B, 7rfe:C, 7rfe:D, 7rfe:E, 7rfe:F, 7rfe:G, 7rfe:H, 7rfg:A, 7rfg:B, 7rfg:C, 7rfg:D, 7rfg:E, 7rfg:F, 7rfg:G, 7rfg:H, 7rgd:B, 7rgd:C, 7rgd:D, 7rgd:E, 7rgd:F, 7rgd:G, 7rgd:H, 7rgm:A, 7rgm:B, 7rgm:C, 7rgm:D, 7rgm:E, 7rgm:F, 7rgm:G, 7rgm:H, 7rgq:A, 7rgq:B, 7rgq:C, 7rgq:D, 7rgq:E, 7rgq:F, 7rgq:G, 7rgq:H, 8u7q:A, 8u7q:B, 8u7q:C, 8u7q:D, 8u7q:E, 8u7q:F, 8u7q:G, 8u7q:H, 8u7v:A, 8u7v:B, 8u7v:C, 8u7v:D, 8u7v:E, 8u7v:F, 8u7v:G, 8u7v:H, 8u8o:A, 8u8o:B, 8u8o:C, 8u8o:D, 8u8o:E, 8u8o:F, 8u8o:G, 8u8o:H
28 1jcn:A 395 105 0.1032 0.0658 0.2476 3.9 1jcn:B
29 7rfh:H 451 69 0.0794 0.0443 0.2899 4.7 7rfh:A, 7rfh:B, 7rfh:C, 7rfh:D, 7rfh:E, 7rfh:F, 7rfh:G
30 3m84:A 348 45 0.0556 0.0402 0.3111 4.9 3qty:A, 3qty:B
31 6g3n:A 445 43 0.0595 0.0337 0.3488 6.5 6g3n:B, 5ohz:A, 5ohz:B, 5ohz:C, 5ohz:D, 5oi0:A, 5oi0:B, 5oi1:A, 5oi1:B, 5oie:A, 5oie:B, 5oiv:A, 5oiv:B, 5oiw:A, 5oiw:B, 5oj4:A, 5oj4:B, 5oju:A, 5oju:B, 5ojv:A, 5ojv:B, 5ont:A, 5ont:B, 5onz:A, 5onz:B, 5oo2:A, 5oo2:B
32 8cav:A 860 70 0.0833 0.0244 0.3000 7.1 8cav:B
33 6yk0:A 309 40 0.0516 0.0421 0.3250 7.3 6yk0:B, 6yk0:C, 6yk0:D, 6yk1:A, 6yk1:B, 6yk1:C, 6yk1:D
34 8ix8:A 264 48 0.0635 0.0606 0.3333 7.4 8ixx:A, 8iy4:A
35 8c51:A 449 66 0.0714 0.0401 0.2727 8.2 8c51:B, 8c53:A, 8c53:B, 8cgy:A, 8cgy:B, 6rfu:A, 6rfu:B
36 5t25:A 293 54 0.0754 0.0648 0.3519 8.6 2ats:A, 2ats:B, 3i7s:A, 3i7s:B, 7jz8:A, 7jz8:B, 7jza:A, 7jza:B, 7jzb:A, 7jzb:B, 7jzg:A, 7jzg:B, 5t25:B, 1yxd:A, 1yxd:B
37 1jqn:A 874 40 0.0476 0.0137 0.3000 9.7 1fiy:A, 1qb4:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218