Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDLLVRILLLAACISFVLAWFEE
GEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVP
ADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAVALAVAAIPEGLPAVITTCLA
LGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDK
PVNCHQYDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK
KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGVKQKIMSVIREWGSGSDTLRC
LALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLDPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGI
FGQDEDVTSKAFTGREFDELNPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGFPEALIPVQLLWVNLVTDG
LPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNP
DFEGVDCAIFESPYPMTMALSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYL

The query sequence (length=991) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7w7t:A 1021 991 1.0000 0.9706 1.0000 0.0 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
2 5ztf:A 972 991 0.9677 0.9866 0.9677 0.0
3 5zmw:A 1000 992 0.8416 0.8340 0.8407 0.0 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
4 6zhh:A 883 846 0.3179 0.3567 0.3723 2.12e-155 6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
5 8iwp:A 896 989 0.3391 0.3750 0.3397 6.54e-153 8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
6 7efl:A 987 1040 0.3158 0.3171 0.3010 3.03e-118 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
7 8k1l:A 979 855 0.2644 0.2676 0.3064 1.03e-112
8 8d3x:A 989 860 0.2725 0.2730 0.3140 2.60e-111 8d3u:A, 8d3w:A
9 7x20:A 986 877 0.2765 0.2779 0.3124 3.21e-109 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
10 7wyu:A 993 1045 0.3088 0.3082 0.2928 3.85e-108 3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
11 3b8e:A 998 1048 0.3068 0.3046 0.2901 5.04e-108 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
12 7nxf:A 829 345 0.1029 0.1230 0.2957 4.50e-32 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
13 7nxf:A 829 182 0.0605 0.0724 0.3297 1.01e-20 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
14 5ksd:A 833 287 0.0918 0.1092 0.3171 2.28e-29 5ksd:B
15 5ksd:A 833 281 0.0908 0.1080 0.3203 7.88e-25 5ksd:B
16 7vh6:A 768 179 0.0656 0.0846 0.3631 2.50e-27 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
17 7vh6:A 768 324 0.0949 0.1224 0.2901 7.66e-27 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
18 7op8:A 1118 859 0.1948 0.1726 0.2247 1.51e-24 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
19 7vpk:A 1055 761 0.1695 0.1592 0.2208 1.82e-22 8iek:P, 8ies:P, 7m5v:A, 7n70:A, 7n72:A, 7n73:A, 7n74:A, 7n77:A, 7n78:A, 7vpi:A, 7vpj:A, 7vpl:A
20 7m5x:A 1000 755 0.1736 0.1720 0.2278 8.90e-21 7fjp:B, 7fjq:A, 8ien:P, 7m5y:A
21 7si6:A 873 231 0.0696 0.0790 0.2987 2.33e-19 7si3:A, 7si7:A
22 7si6:A 873 339 0.0716 0.0813 0.2094 5.83e-07 7si3:A, 7si7:A
23 8ioy:A 816 177 0.0565 0.0686 0.3164 2.98e-17
24 8ioy:A 816 340 0.0737 0.0895 0.2147 6.82e-07
25 6xmt:A 1092 703 0.1705 0.1548 0.2404 1.28e-16 6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A
26 4bbj:A 664 184 0.0575 0.0858 0.3098 3.93e-16 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
27 4bbj:A 664 298 0.0656 0.0979 0.2181 1.02e-08 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
28 7r0h:A 654 190 0.0636 0.0963 0.3316 5.94e-16 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
29 7r0h:A 654 287 0.0656 0.0994 0.2265 6.14e-04 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
30 8q74:A 783 178 0.0494 0.0626 0.2753 1.92e-15 8q75:A, 8q76:A
31 8q74:A 783 290 0.0646 0.0817 0.2207 8.33e-09 8q75:A, 8q76:A
32 3sky:A 261 162 0.0515 0.1954 0.3148 6.58e-14
33 4umv:A 605 172 0.0535 0.0876 0.3081 8.69e-14 4umw:A
34 4umv:A 605 276 0.0716 0.1174 0.2572 2.42e-09 4umw:A
35 6k7l:A 992 481 0.1090 0.1089 0.2245 1.19e-13 6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
36 8ieo:P 1031 374 0.0878 0.0844 0.2326 2.31e-13 8iem:P
37 8ieo:P 1031 234 0.0585 0.0563 0.2479 2.17e-07 8iem:P
38 7qbz:A 638 161 0.0484 0.0752 0.2981 5.63e-12 7qc0:A
39 7qbz:A 638 309 0.0848 0.1317 0.2718 1.14e-11 7qc0:A
40 7nnl:B 682 178 0.0505 0.0733 0.2809 6.79e-12 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
41 7nnl:B 682 306 0.0767 0.1114 0.2484 1.79e-05 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
42 8oxa:A 1035 806 0.1766 0.1691 0.2171 5.62e-11 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
43 8ox4:A 870 553 0.1231 0.1402 0.2206 2.88e-10
44 8ox8:A 1125 831 0.1796 0.1582 0.2142 1.16e-08 8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
45 7rd6:A 929 724 0.1493 0.1593 0.2044 1.51e-08 7rd7:A, 7rd8:A
46 6roh:A 1112 344 0.0838 0.0746 0.2413 3.06e-08 7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
47 6lkn:A 1064 632 0.1413 0.1316 0.2215 2.91e-06 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
48 6lkn:A 1064 162 0.0363 0.0338 0.2222 0.61 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
49 7bsp:A 1028 862 0.1857 0.1790 0.2135 3.36e-06 7bsq:A, 7vsh:A
50 2yj4:B 252 174 0.0363 0.1429 0.2069 4.41e-05 2iye:A, 2iye:C, 2yj3:A, 2yj4:A, 2yj5:A, 2yj5:B, 2yj6:A, 2yj6:B
51 7vgh:B 1183 147 0.0383 0.0321 0.2585 9.86e-05 7vgi:B
52 7vgh:B 1183 592 0.1282 0.1074 0.2145 0.005 7vgi:B
53 8ox6:A 575 146 0.0373 0.0643 0.2534 1.56e-04
54 7kyc:A 1178 153 0.0383 0.0323 0.2484 0.002 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
55 7kyc:A 1178 214 0.0535 0.0450 0.2477 0.17 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
56 7kyc:A 1178 283 0.0696 0.0586 0.2438 4.8 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
57 1q3i:A 192 208 0.0484 0.2500 0.2308 0.004
58 7kya:A 1174 101 0.0252 0.0213 0.2475 0.031 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
59 7kya:A 1174 635 0.1423 0.1201 0.2220 0.13 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
60 6lcp:A 1140 109 0.0283 0.0246 0.2569 0.042 6lcr:A
61 6lcp:A 1140 78 0.0242 0.0211 0.3077 0.19 6lcr:A
62 6lcp:A 1140 284 0.0656 0.0570 0.2289 0.85 6lcr:A
63 3r4c:A 268 59 0.0232 0.0858 0.3898 0.19
64 7bss:A 816 162 0.0363 0.0441 0.2222 0.54 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
65 7bss:A 816 80 0.0252 0.0306 0.3125 7.5 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
66 2rar:A 261 41 0.0182 0.0690 0.4390 0.64 2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
67 4dwo:A 268 54 0.0172 0.0634 0.3148 0.75 3niw:A
68 7moq:C 4159 120 0.0303 0.0072 0.2500 2.2 6zyy:C
69 6zyw:C 4433 120 0.0303 0.0068 0.2500 2.2
70 8bwy:C 4264 120 0.0303 0.0070 0.2500 2.3
71 8bx8:A 4453 120 0.0303 0.0067 0.2500 2.4 7k58:A, 7k5b:A, 7kek:A
72 5ovk:A 242 60 0.0182 0.0744 0.3000 3.6 5ovk:B, 5ovk:C, 5ovk:D, 5ovl:A, 5ovl:B, 5ovl:C, 5ovl:D
73 4ap9:A 200 35 0.0172 0.0850 0.4857 4.2 4ap9:B, 4ap9:C, 4ap9:D
74 7r21:T 304 120 0.0313 0.1020 0.2583 5.8 7tr6:O, 7tr8:O, 7tr9:O, 7tra:N
75 8bvt:A 508 115 0.0272 0.0531 0.2348 8.7 8bvs:A, 8bw7:A, 8sdz:A
76 8sod:A 941 65 0.0161 0.0170 0.2462 9.3 8soe:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218