Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MEKYNPHAIEAKWQRFWEEKGFMKAKDLPGGRGKQYVLVMFPYPSGDLHMGHLKNYTMGDVLARFRRMQGYEVLHPMGWD
AFGLPAENAALKFGVHPKDWTYANIRQAKESLRLMGILYDWDREVTTCEPEYYRWNQWIFLKMWEKGLAYRAKGLVNWCP
KCQTVLANEQVVEGRCWRHEDTPVEKRELEQWYLRITAYAERLLKDLEGLNWPEKVKAMQRAWIGRSEGAEILFPVEGKE
VRIPVFTTRPDTLFGATFLVLAPEHPLTLELAAPEKREEVLAYVEAAKRKTEIERQAEGREKTGVFLGAYALNPATGERI
PIWTADYVLFGYGTGAIMAVPAHDQRDYEFARKFGLPIKKVIERPGEPLPEPLERAYEEPGIMVNSGPFDGTESEEGKRK
VIAWLEEKGLGKGRVTYRLRDWLISRQRYWGTPIPMVHCEACGVVPVPEEELPVLLPDLKDVEDIRPKGKSPLEAHPEFY
ETTCPKCGGPAKRDTDTMDTFFDSSWYYLRYTDPHNDRLPFDPEKANAWMPVDQYIGGVEHAVLHLLYSRFFTKFLHDLG
MVKVEEPFQGLFTQGMVLAWTDFGPVEVEGSVVRLPEPTRIRLEIPESALSLEDVRKMGAELRPHEDGTLHLWKPAVMSK
SKGNGVMVGPFVKEQGADIARITILFAAPPENEMVWTEEGVQGAWRFLNRIYRRVAEDREALLETSGVFQAEALEGKDRE
LYGKLHETLKKVTEDLEALRFNTAIAALMEFLNALYEYRKDRPVTPVYRTAIRYYLQMLFPFAPHLAEELWHWFWPDSLF
EAGWPELDEKALEK

The query sequence (length=814) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2bte:A 876 814 1.0000 0.9292 1.0000 0.0 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
2 1obh:A 762 814 0.9361 1.0000 0.9361 0.0
3 7nu2:A 875 838 0.4754 0.4423 0.4618 0.0 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
4 6q89:A 852 842 0.4730 0.4519 0.4572 0.0 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
5 3zgz:D 867 816 0.4509 0.4233 0.4498 0.0 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
6 4ari:A 821 816 0.4238 0.4202 0.4228 0.0 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
7 5ah5:A 789 816 0.4066 0.4195 0.4056 0.0 5ah5:B
8 3ziu:A 621 230 0.1327 0.1739 0.4696 3.31e-63 3ziu:B
9 3ziu:A 621 411 0.1585 0.2077 0.3139 1.68e-49 3ziu:B
10 7bzj:A 183 187 0.1192 0.5301 0.5187 1.68e-55 4k47:A
11 3pz0:B 211 182 0.1216 0.4692 0.5440 4.97e-53
12 7pqk:A 195 202 0.1290 0.5385 0.5198 1.02e-48 5agr:A, 5ags:A, 5agt:A
13 7n12:B 188 198 0.1143 0.4947 0.4697 2.73e-45 7n12:A
14 1gax:A 862 640 0.2076 0.1961 0.2641 1.02e-35 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
15 1gax:A 862 183 0.0577 0.0545 0.2568 0.049 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
16 1wz2:A 948 375 0.1351 0.1160 0.2933 9.95e-33 1wz2:B
17 1wz2:A 948 177 0.0651 0.0559 0.2994 3.14e-12 1wz2:B
18 8pos:A 168 186 0.0835 0.4048 0.3656 8.44e-32 8por:A, 8pos:B
19 8c9e:A 921 844 0.2297 0.2030 0.2216 7.62e-29 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
20 1ile:A 821 893 0.2703 0.2680 0.2464 5.50e-28 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
21 1ffy:A 917 847 0.2260 0.2007 0.2172 9.39e-28 1qu2:A, 1qu3:A
22 6ldk:A 813 806 0.2088 0.2091 0.2109 7.50e-16
23 5k0s:C 497 177 0.0614 0.1006 0.2825 9.50e-14 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
24 1a8h:A 500 164 0.0577 0.0940 0.2866 3.01e-12 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
25 8c8v:A 1032 152 0.0577 0.0455 0.3092 5.24e-12 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
26 8c8v:A 1032 432 0.1229 0.0969 0.2315 3.36e-11 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
27 8c8v:A 1032 43 0.0197 0.0155 0.3721 0.65 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
28 1rqg:A 606 225 0.0737 0.0990 0.2667 1.14e-11
29 1rqg:A 606 129 0.0405 0.0545 0.2558 6.7
30 2x1l:A 511 176 0.0541 0.0861 0.2500 6.82e-11 2x1m:A
31 3kfl:A 530 171 0.0602 0.0925 0.2865 2.98e-10 6swx:A
32 7wpi:A 520 182 0.0602 0.0942 0.2692 8.13e-10 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
33 7wpi:A 520 187 0.0590 0.0923 0.2567 6.92e-05 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
34 5k0t:B 468 174 0.0541 0.0940 0.2529 1.51e-09
35 8wnf:A 918 502 0.1241 0.1100 0.2012 1.66e-09 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
36 8wnf:A 918 29 0.0160 0.0142 0.4483 2.1 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
37 7wpt:A 483 118 0.0455 0.0766 0.3136 1.43e-08 7wpn:A
38 7wpt:A 483 187 0.0590 0.0994 0.2567 7.98e-05 7wpn:A
39 7d5c:A 919 146 0.0479 0.0424 0.2671 1.87e-08
40 7d5c:A 919 168 0.0577 0.0511 0.2798 0.041
41 7d5c:A 919 79 0.0233 0.0207 0.2405 5.6
42 2x1l:C 476 118 0.0405 0.0693 0.2797 2.78e-08 2x1l:B
43 1pfu:A 547 197 0.0565 0.0841 0.2335 2.52e-07 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
44 6ax8:A 509 175 0.0577 0.0923 0.2686 4.66e-07 5xet:C
45 1pg0:A 492 115 0.0381 0.0630 0.2696 1.17e-06 1pg2:A
46 2ct8:A 465 117 0.0369 0.0645 0.2564 1.45e-06 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
47 2ct8:A 465 126 0.0418 0.0731 0.2698 0.31 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
48 6lpf:B 1006 174 0.0541 0.0437 0.2529 2.07e-06 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
49 6lpf:B 1006 421 0.1143 0.0924 0.2209 2.43e-06 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
50 6wq6:A 547 146 0.0504 0.0750 0.2808 5.62e-06 6wqi:A, 6wqi:B, 6wqs:A, 6wqt:A
51 5urb:A 546 202 0.0614 0.0916 0.2475 7.39e-06 5urb:B
52 4eg6:B 515 163 0.0479 0.0757 0.2393 6.60e-05 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
53 8qhp:A 410 145 0.0528 0.1049 0.2966 7.65e-05 8qhp:B
54 8qhp:A 410 94 0.0319 0.0634 0.2766 0.42 8qhp:B
55 7ulz:A 521 114 0.0369 0.0576 0.2632 1.05e-04
56 4eg7:B 536 171 0.0479 0.0728 0.2281 1.10e-04 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
57 2zue:A 628 55 0.0270 0.0350 0.4000 8.76e-04 2zuf:A
58 3tqo:A 387 48 0.0221 0.0465 0.3750 0.11
59 4q2t:A 590 72 0.0270 0.0373 0.3056 0.29 4q2t:B, 4q2x:A, 4q2x:B
60 1irx:B 508 52 0.0197 0.0315 0.3077 0.45 1irx:A
61 4j7g:A 448 64 0.0233 0.0424 0.2969 2.0 4j7g:B, 4j7h:A, 4j7h:B
62 3sp1:B 439 35 0.0147 0.0273 0.3429 3.5 3sp1:A
63 4ix3:B 350 113 0.0369 0.0857 0.2655 3.5 4ix3:A, 4ix4:A, 4ix4:B, 4ix5:A, 4ix5:B, 4ix6:A, 4ix6:B
64 5iy6:M 260 54 0.0184 0.0577 0.2778 3.9 8bvw:M, 8byq:M, 8bz1:M, 7edx:R, 7eg7:R, 7eg8:R, 7eg9:R, 7ega:R, 7egb:R, 7egc:R, 7ena:BA, 7enc:BA, 8gxq:BA, 8gxs:BA, 5iya:M, 7lbm:O, 7nvr:M, 7nvs:M, 7nvt:M, 7nvy:M, 7nvz:M, 7zwd:M, 7zx7:M
65 5m0p:A 424 85 0.0307 0.0590 0.2941 4.1 4l40:A, 4l54:A, 5m0n:A, 5m0o:A, 5m0o:C, 5m0p:B
66 7mgm:A 2274 115 0.0332 0.0119 0.2348 5.5
67 8dzz:A 2363 115 0.0332 0.0114 0.2348 6.1 8dzz:D, 8e00:A
68 6ao8:A 569 48 0.0197 0.0281 0.3333 7.6
69 5b63:C 553 43 0.0160 0.0235 0.3023 7.7 5yyn:C
70 5yym:A 581 43 0.0160 0.0224 0.3023 8.0 5b63:A, 4oby:A, 5yym:B, 5yyn:A
71 8dmu:A 476 78 0.0209 0.0357 0.2179 9.0 8dmu:B, 8dmu:C, 8dmu:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218