Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MEKNFVISDPRLPDNPIIFASDSFLELTEYSREEILGRNCRFLQGPETDQATVQKIRDAIRDQREITVQLINYTKSGKKF
WNLFHLQPMRDQKGELQYFIGVQLDGEFIPNPLLGL

The query sequence (length=116) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7qf2:AAA 117 116 0.9569 0.9487 0.9569 1.44e-79 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
2 4hhd:A 152 106 0.8103 0.6184 0.8868 5.27e-69 4hhd:B
3 2wkp:A 320 106 0.8190 0.2969 0.8962 1.94e-67 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
4 7tbq:A 375 106 0.8103 0.2507 0.8868 5.09e-67 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
5 5hzh:A 320 106 0.8103 0.2938 0.8868 4.95e-66
6 4eeu:A 109 106 0.8017 0.8532 0.8774 7.33e-66 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
7 7tcd:A 436 106 0.7931 0.2110 0.8679 1.48e-64 4wf0:A, 4wf0:B
8 5hzi:A 476 106 0.8103 0.1975 0.8868 1.50e-64 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
9 1g28:A 104 101 0.6379 0.7115 0.7327 3.59e-55 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
10 3ue6:E 138 102 0.4914 0.4130 0.5588 2.21e-38 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
11 6t74:B 141 103 0.4655 0.3830 0.5243 3.75e-37 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
12 6i21:A 135 102 0.4569 0.3926 0.5196 5.03e-37 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
13 2z6d:A 118 105 0.4138 0.4068 0.4571 1.62e-34 2z6d:B
14 8qi8:A 110 105 0.4224 0.4455 0.4667 1.88e-34 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
15 6ph4:B 460 100 0.4397 0.1109 0.5100 1.19e-33 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
16 6gb3:A 120 102 0.4052 0.3917 0.4608 7.88e-31 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
17 2z6c:A 121 104 0.3707 0.3554 0.4135 2.55e-30 2z6c:B
18 2mwg:A 261 100 0.4138 0.1839 0.4800 1.62e-29 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
19 8pm1:A 109 103 0.3966 0.4220 0.4466 3.06e-29 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
20 4gcz:B 378 100 0.4138 0.1270 0.4800 2.38e-28 4gcz:A
21 8j68:A 129 104 0.3707 0.3333 0.4135 8.95e-28 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
22 8a5r:AAA 206 100 0.3879 0.2184 0.4500 4.04e-27 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
23 3hjk:A 150 112 0.3707 0.2867 0.3839 6.36e-26 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
24 4r3a:A 318 102 0.3448 0.1258 0.3922 3.43e-25 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
25 6hmj:A 359 99 0.3534 0.1142 0.4141 1.74e-24 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
26 7oo9:A 106 104 0.4138 0.4528 0.4615 2.87e-24 7oo9:B
27 8c05:A 305 101 0.3362 0.1279 0.3861 1.40e-22
28 4wuj:C 145 108 0.3534 0.2828 0.3796 4.43e-22 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
29 4r3a:B 278 102 0.3276 0.1367 0.3725 5.46e-22
30 7wa4:B 107 102 0.3707 0.4019 0.4216 2.52e-21
31 7r5n:B 151 101 0.3448 0.2649 0.3960 2.77e-20 7r5n:A
32 7a6p:A 149 101 0.3190 0.2483 0.3663 1.32e-19 7a6p:B
33 7r56:A 137 101 0.3276 0.2774 0.3762 1.07e-18 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
34 8a6x:B 368 100 0.3190 0.1005 0.3700 3.28e-18 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
35 5svu:B 135 110 0.3362 0.2889 0.3545 1.59e-17 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
36 4hj6:B 178 101 0.3190 0.2079 0.3663 9.82e-17 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
37 7yx0:A 166 101 0.3017 0.2108 0.3465 1.25e-16 7yx0:C
38 7yid:A 660 114 0.2155 0.0379 0.2193 2.26e-11 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
39 3ewk:A 227 89 0.1810 0.0925 0.2360 2.27e-06
40 3ewk:A 227 95 0.1724 0.0881 0.2105 0.003
41 2gj3:A 119 89 0.1897 0.1849 0.2472 2.82e-06 2gj3:B
42 6pl0:B 608 78 0.1724 0.0329 0.2564 9.48e-05 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
43 7x0l:A 409 43 0.1466 0.0416 0.3953 0.28 7x0j:A, 7x0j:B, 7x0k:A, 7x0k:B, 7x0l:B, 7x0m:A, 7x0m:B, 7x0n:A, 7x0n:B
44 3wsy:A 662 72 0.1466 0.0257 0.2361 0.92 3wsz:A
45 3tvi:E 439 27 0.0948 0.0251 0.4074 1.6 3tvi:A, 3tvi:B, 3tvi:C, 3tvi:D, 3tvi:G, 3tvi:H, 3tvi:I, 3tvi:L
46 4kr6:B 388 47 0.1207 0.0361 0.2979 2.1 4kr6:A, 4kr7:A, 4kr7:B, 4kr9:A, 4kr9:B
47 4c5s:C 642 49 0.1724 0.0312 0.4082 2.2 4c5r:A, 4c5r:B, 4c5r:C, 4c5r:D, 4c5s:A, 4c5s:B, 4c5s:D
48 6m5r:B 689 83 0.1983 0.0334 0.2771 3.3 6m5s:B, 6m5u:B, 6m5v:B
49 3ldf:A 380 23 0.0948 0.0289 0.4783 4.6
50 7q0n:A 386 61 0.1638 0.0492 0.3115 6.6 7q0n:B, 6s7l:A, 6s7l:B
51 7ol3:B 425 50 0.1207 0.0329 0.2800 8.4 6b9e:A, 6b9f:A, 6b9f:B, 6b9g:B, 6b9g:C, 6b9g:D, 6b9g:A, 4idn:A, 4idn:B, 4ido:A, 4ido:B, 4idp:A, 4idp:B, 4idp:C, 4idp:D, 4idq:A, 4idq:B, 4idq:C, 4idq:D, 7ol3:A, 3q5d:A, 3q5e:A, 3q5e:C, 3qnu:A, 3qof:A, 3qof:B, 3qof:C, 3qof:D, 6xjn:A
52 8ofi:C 415 27 0.1207 0.0337 0.5185 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218