Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MEFRSLGRSGLSVSEIVYGNLLTPDEVVLSSIRAALDAGVTTFDTADVYGMFRSESLLGRALAGTPREELVLCTKVGMPT
GFGPNGRGLSRKHVMESVDGSLRRLRVDHIDVYTAHRYDPATPLEELMWTFSDLVRAGKILYVGMSEWPVERIAEAAGIG
ARLGVPVICHMPRYSMLWRAPEAEVIPACRDLGIGQICYFTLEQGVLTGKRRWLDDDKVLGRVERLRPLAEEAGLTTAQL
ALAWVLQNPGVSGAVIGSFNAEQVLANAESAGVRLETDLLVRIDEVLGDSVVHDEE

The query sequence (length=296) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6ow0:B 301 301 1.0000 0.9834 0.9834 0.0 6ovx:A, 6ovx:B
2 6ow0:A 323 323 0.9932 0.9102 0.9102 0.0
3 8hw0:A 329 323 0.3750 0.3374 0.3437 4.32e-51
4 8jwo:L 311 302 0.3919 0.3730 0.3841 5.32e-51 8jwk:H, 8jwo:A, 8jwo:C, 8jwo:D, 8jwo:E, 8jwo:G, 8jwo:I, 8jwo:K, 8jwo:M, 8jwo:O
5 8jwm:B 331 319 0.3986 0.3565 0.3699 1.36e-49 8jwk:D, 8jwk:J, 8jwk:L, 8jwk:N, 8jwk:P, 8jwl:C, 8jwl:H, 8jwm:A, 8jwm:C, 8jwm:D, 8jwm:E, 8jwm:F, 8jwm:G, 8jwm:H, 8jwn:A, 8jwn:B, 8jwn:C, 8jwn:D, 8jwn:E, 8jwn:F, 8jwn:G, 8jwn:H, 8jwo:B, 8jwo:F, 8jwo:H, 8jwo:J, 8jwo:N, 8jwo:P, 8xr4:A, 8xr4:B, 8xr4:C, 8xr4:D, 8xr4:E, 8xr4:F, 8xr4:G, 8xr4:H
6 7wf3:C 328 322 0.3547 0.3201 0.3261 4.92e-47 2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
7 5t79:A 315 278 0.3446 0.3238 0.3669 1.76e-45 3erp:A, 3erp:B
8 4aub:B 335 316 0.3345 0.2955 0.3133 4.63e-44 4aub:A, 4aub:C, 4aub:G, 3n6q:D
9 6hg6:A 313 283 0.3277 0.3099 0.3428 2.99e-43
10 3v0s:A 287 287 0.3378 0.3484 0.3484 2.56e-42 3v0t:A
11 4aub:F 298 300 0.3176 0.3154 0.3133 1.40e-39 4aub:E, 4aub:H
12 1pz1:A 333 319 0.3176 0.2823 0.2947 5.18e-36 1pz1:B
13 1pz0:A 311 313 0.3142 0.2990 0.2971 1.04e-33
14 6kik:A 275 296 0.2736 0.2945 0.2736 1.58e-29 5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B
15 1ynp:B 298 278 0.2939 0.2919 0.3129 3.57e-23 1ynp:A, 1ynq:A, 1ynq:B
16 7ezi:A 323 294 0.2973 0.2724 0.2993 1.50e-21 7ezl:A
17 8usu:A 316 307 0.2736 0.2563 0.2638 8.27e-21 8usu:B
18 1lqa:A 346 341 0.2973 0.2543 0.2581 1.40e-20 1lqa:B
19 5c7h:A 281 262 0.2568 0.2705 0.2901 5.37e-19 4pmj:A
20 8hnq:A 286 241 0.2432 0.2517 0.2988 2.12e-18
21 6cia:A 284 258 0.2534 0.2641 0.2907 2.33e-18 4wgh:A
22 1og6:C 298 265 0.2534 0.2517 0.2830 2.91e-18 1og6:A, 1og6:B
23 7bc1:A 295 286 0.2601 0.2610 0.2692 3.12e-18
24 7svq:A 315 295 0.2466 0.2317 0.2475 2.52e-17 7svq:B
25 7twz:A 298 252 0.2399 0.2383 0.2817 1.15e-15 7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
26 1gve:A 324 191 0.1959 0.1790 0.3037 1.34e-15
27 2c91:A 325 189 0.1926 0.1754 0.3016 7.93e-15 2bp1:A, 2bp1:B, 2bp1:C, 2bp1:D, 2c91:B, 2c91:C, 2c91:D, 2c91:E, 2c91:F, 2c91:G, 2c91:H, 2c91:I, 2c91:J
28 2clp:A 323 188 0.1824 0.1672 0.2872 7.93e-13 2clp:B, 2clp:C, 2clp:D, 2clp:E, 2clp:F, 2clp:G, 2clp:H, 2clp:I, 2clp:J, 2clp:K
29 2wzm:A 274 254 0.2331 0.2518 0.2717 2.55e-08 2wzm:B
30 3wbw:A 271 282 0.2297 0.2509 0.2411 4.06e-08 3wbw:B, 3wby:A, 3wby:B
31 3krb:A 307 300 0.2264 0.2182 0.2233 1.05e-07 3krb:B
32 4exa:F 259 289 0.2601 0.2973 0.2664 6.32e-07 4exa:A, 4exa:B, 4exa:C, 4exa:D, 4exa:E
33 5jh2:A 257 296 0.2399 0.2763 0.2399 2.15e-06
34 3d3f:A 275 287 0.2466 0.2655 0.2544 2.75e-06 3d3f:B
35 1vbj:A 281 216 0.1689 0.1779 0.2315 6.77e-06 1vbj:B
36 4l1w:A 325 302 0.2331 0.2123 0.2285 1.43e-05 6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
37 3cv6:A 323 279 0.2230 0.2043 0.2366 2.23e-05 3cv6:B, 2he5:A, 2he5:B, 2he5:C, 2he5:D, 2hej:A, 2hej:B, 2ipf:A, 2ipf:B, 2ipg:A, 2ipg:B, 2p5n:A, 2p5n:B
38 1vp5:A 284 247 0.1858 0.1937 0.2227 3.01e-05 1vp5:B
39 2bgs:A 308 241 0.2027 0.1948 0.2490 8.38e-05 2vdg:A
40 1q13:A 322 289 0.2230 0.2050 0.2284 1.72e-04 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
41 3h7r:A 307 249 0.1993 0.1922 0.2369 1.99e-04
42 4zfc:B 320 287 0.2128 0.1969 0.2195 2.59e-04 6a7b:A, 6a7b:B, 8bbs:B, 8bbs:A, 7c7f:A, 7c7f:B, 7c7g:A, 7c7g:B, 7c7h:A, 7c7h:B, 4dbs:A, 4dbs:B, 4dbu:A, 4dbu:B, 4dbw:A, 4dbw:B, 4dz5:A, 6f2u:A, 6f2u:B, 2f38:A, 6f78:A, 6f78:B, 4fa3:A, 4fal:A, 4fam:A, 4fam:B, 9ffd:A, 9ffd:B, 2fgb:A, 6gxk:A, 6gxk:B, 4h7c:A, 4hmn:A, 5hnt:A, 5hnt:C, 5hnu:A, 5hnu:C, 8i0c:A, 8i0c:B, 8jp1:A, 8jp1:B, 3r43:A, 3r58:A, 3r6i:A, 3r7m:A, 3r8g:A, 3r8h:A, 3r94:A, 8rb6:A, 8rb6:B, 1ry0:A, 1ry0:B, 1ry8:A, 1ry8:B, 1s1p:A, 1s1r:A, 1s2a:A, 1s2c:A, 3ufy:A, 3ug8:A, 3ugr:A, 3uwe:A, 4wdt:A, 4wdu:A, 4wdw:A, 4wdw:B, 4wdx:A, 4wdx:B, 7wqm:A, 7wqm:B, 7wqr:A, 7wqr:B, 7wqs:A, 7wqs:B, 4wrh:A, 7x3l:A, 7x3l:B, 7x3m:A, 7x3m:B, 7x3o:A, 7x3o:B, 1xf0:A, 4xvd:A, 4xvd:B, 4xve:A, 4yvv:A, 4yvv:B, 4yvx:A, 4yvx:B, 4zfc:A, 1zq5:A
43 2fvl:A 323 282 0.2196 0.2012 0.2305 4.43e-04 2fvl:B, 2fvl:C
44 3b3d:A 280 284 0.2297 0.2429 0.2394 4.53e-04 3b3d:B, 3b3d:C
45 4h8n:A 303 235 0.2027 0.1980 0.2553 8.44e-04 4h8n:B
46 4g5d:A 283 94 0.0946 0.0989 0.2979 0.001 4g5d:B
47 3ln3:A 319 293 0.2331 0.2163 0.2355 0.001 6m7k:A, 5uxf:A
48 5z6t:A 317 278 0.2027 0.1893 0.2158 0.004 5z6t:B
49 5ket:A 328 213 0.1858 0.1677 0.2582 0.008 5ket:B
50 1k8c:B 319 267 0.1892 0.1755 0.2097 0.008 1k8c:A, 1k8c:C, 1k8c:D, 1mi3:A, 1mi3:B, 1mi3:C, 1mi3:D, 1r38:A, 1r38:B, 1r38:C, 1r38:D, 1sm9:A, 1sm9:B, 1sm9:C, 1sm9:D, 1ye4:A, 1ye4:B, 1ye4:C, 1ye4:D, 1ye6:A, 1ye6:B, 1ye6:C, 1ye6:D, 1z9a:A, 1z9a:B, 1z9a:C, 1z9a:D
51 4gie:A 288 265 0.1824 0.1875 0.2038 0.009 4fzi:A, 4fzi:B
52 3wcz:A 307 95 0.0946 0.0912 0.2947 0.014
53 1afs:A 319 272 0.2061 0.1912 0.2243 0.016 1afs:B, 1lwi:A, 1lwi:B
54 7s5f:B 309 245 0.1824 0.1748 0.2204 0.024 7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
55 1a80:A 277 207 0.1791 0.1913 0.2560 0.026 1m9h:A
56 3o3r:A 315 53 0.0642 0.0603 0.3585 0.21 3o3r:B, 3qkz:A, 3qkz:B
57 4ydv:H 220 78 0.0845 0.1136 0.3205 0.30 4ydv:B
58 3bur:A 325 283 0.2162 0.1969 0.2261 0.41 3bur:B, 3buv:B, 3buv:A, 3bv7:A, 3bv7:B, 3caq:A, 3caq:B, 3cas:A, 3cas:B, 3cav:A, 3cav:B, 3cmf:A, 3cmf:B, 3cot:A, 3cot:B, 3dop:A, 3dop:B, 3g1r:A, 3g1r:B, 3uzw:A, 3uzw:B, 3uzx:A, 3uzx:B, 3uzy:A, 3uzy:B, 3uzz:A, 3uzz:B
59 6hiw:DC 1095 81 0.0912 0.0247 0.3333 0.55
60 2bb3:A 194 136 0.1149 0.1753 0.2500 0.72 2bb3:B
61 6ici:A 585 81 0.0777 0.0393 0.2840 1.0
62 1deh:A 374 120 0.1081 0.0856 0.2667 1.2 1deh:B, 1hdx:A, 1hdx:B, 1hdy:A, 1hdy:B, 1hdz:A, 1hdz:B, 1hso:A, 1hso:B, 1hsz:A, 1hsz:B, 1ht0:A, 1ht0:B, 1htb:A, 1htb:B, 3hud:A, 3hud:B, 1u3t:A, 1u3t:B, 1u3u:A, 1u3u:B, 1u3v:A, 1u3v:B, 1u3w:A, 1u3w:B
63 3ug4:C 484 108 0.0912 0.0558 0.2500 1.5 3ug4:A, 3ug4:B, 3ug4:D, 3ug4:E, 3ug4:F, 3ug5:A, 3ug5:B, 3ug5:C, 3ug5:D, 3ug5:E, 3ug5:F
64 7f7k:B 310 308 0.2230 0.2129 0.2143 1.6 7f7k:A, 7f7l:A, 7f7l:B, 7f7m:A, 7f7m:B, 7w1w:A, 7w1w:B, 7w1x:A, 7w1x:B
65 6yxg:H 236 35 0.0439 0.0551 0.3714 6.8 6ks1:L, 6yxf:H
66 7ou8:AAA 714 71 0.0642 0.0266 0.2676 7.7 5abe:A, 5abe:B, 5abf:A, 5abf:B, 5abg:A, 5abg:B, 5abh:A, 5abh:B, 4ais:A, 4ais:B, 4aiu:A, 2chn:A, 2chn:B, 2cho:A, 2cho:B, 5fky:A, 5fky:B, 5fl0:A, 5fl0:B, 5fl1:A, 5fl1:B, 2j47:A, 2j4g:A, 2j4g:B, 2jiw:A, 2jiw:B, 7k41:A, 5mi4:A, 5mi5:A, 5mi6:A, 5mi7:A, 7ou8:BBB, 4ur9:A, 4ur9:B, 2vvn:A, 2vvn:B, 2vvs:A, 2w4x:A, 2w66:A, 2w66:B, 2w67:A, 2w67:B, 2wca:A, 2wzh:A, 2wzi:A, 2wzi:B, 2x0h:A, 2x0h:B, 2xj7:A, 2xj7:B, 2xm1:A, 2xm1:B, 2xm2:A, 2xm2:B
67 1ddz:A 481 41 0.0507 0.0312 0.3659 8.6 1ddz:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218