BioLiP

>protein
MEALVLVGHGSRLPYSKELLVKLAEKVKERNLFPIVEIGLMEFSEPTIPQAVKKAIEQGAKRIIVVPVFLAHGIHTTRDI
PRLLGLIELEIPEDVEIIYREPIGADDRIVDIIIDRAFGR

The query sequence (length=120) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6m29:A	122	122	1.0000	0.9836	0.9836	3.25e-79	8i57:A, 8i57:B, 8i58:A, 8i58:B, 6m27:A, 6m27:B, 6m28:A, 6m28:B, 6m29:B, 6m2e:A, 6m2e:B, 6m2f:A, 6m2f:B, 6m2g:A, 6m2g:B, 6m2h:A, 6m2h:B
2	5zt7:A	254	115	0.3250	0.1535	0.3391	7.55e-16	6jv6:A, 5zt7:B, 5zta:A, 5zta:B
3	2xwq:A	126	121	0.3083	0.2937	0.3058	3.25e-11	2xwq:B, 2xwq:C, 2xwq:D
4	2jh3:A	459	132	0.3167	0.0828	0.2879	0.012	2jh3:B, 2jh3:C, 2jh3:D
5	8qa6:A	553	88	0.2250	0.0488	0.3068	0.19	8qa6:B
6	6fcx:A	596	88	0.2250	0.0453	0.3068	0.24	6fcx:B, 8qa4:A, 8qa4:B, 8qa5:A, 8qa5:B
7	6jrs:A	3488	139	0.2583	0.0089	0.2230	0.34	6jrs:D, 6jrs:G, 6jrs:J
8	4rkc:A	398	111	0.2083	0.0628	0.2252	0.38	4rkc:B, 4rkd:A, 4rkd:B, 4rkd:C, 4rkd:D, 4rkd:E, 4rkd:F, 4rkd:G, 4rkd:H, 6t3v:A, 6zup:B, 6zup:A, 6zur:B, 6zur:A, 6zvg:A, 6zvg:B, 6zvg:C, 6zvg:D
9	2wzm:A	274	44	0.1000	0.0438	0.2727	0.95	2wzm:B
10	3aqi:A	359	70	0.1667	0.0557	0.2857	1.2	3aqi:B, 7ct7:A, 7ct7:B, 7ctc:A, 7ctc:D, 4f4d:A, 4f4d:B, 3hcn:A, 3hcn:B, 3hco:A, 3hco:B, 3hcp:A, 3hcp:B, 3hcr:A, 3hcr:B, 1hrk:A, 1hrk:B, 2hrc:A, 2hrc:B, 2hre:A, 2hre:B, 2hre:C, 2hre:D, 4kla:A, 4kla:B, 4klc:A, 4klc:B, 4klr:A, 4klr:B, 4kmm:A, 4kmm:B, 4mk4:A, 4mk4:B, 2pnj:A, 2pnj:B, 2po5:A, 2po5:B, 2po7:A, 2po7:B, 2qd1:A, 2qd1:B, 2qd1:C, 2qd1:D, 2qd2:A, 2qd2:B, 2qd3:A, 2qd3:B, 2qd4:A, 2qd4:B, 2qd5:A, 2qd5:B, 3w1w:A, 3w1w:B
11	6ide:B	228	44	0.1250	0.0658	0.3409	1.7	6ide:A, 6kju:A, 6kju:B, 6ugl:B
12	6ugl:A	200	44	0.1250	0.0750	0.3409	2.4
13	4mva:A	255	41	0.1250	0.0588	0.3659	2.8	4mva:B
14	7kwg:e	165	39	0.1083	0.0788	0.3333	3.2	7aso:D, 7asp:m, 7bgd:e, 8bh6:e, 8bh7:e, 8byv:e, 6fxc:Ae, 6fxc:Be, 5li0:e, 5nd8:e, 5nd9:e, 5ngm:Ae, 7nhl:f, 7nhm:f, 8p2f:f, 8p2g:f, 8p2h:f, 7p48:e, 6s0x:e, 6s13:e, 5t7v:SD, 5tcu:SD, 8y38:e, 8y39:e, 6yef:e
15	5myj:AE	156	31	0.0917	0.0705	0.3548	3.8
16	3c9u:B	312	91	0.1917	0.0737	0.2527	4.6	3c9r:A, 3c9r:B, 3c9s:A, 3c9s:B, 3c9t:A, 3c9t:B, 3c9u:A
17	3v0s:A	287	63	0.1667	0.0697	0.3175	5.4	3v0t:A
18	8bx8:C	3947	44	0.1500	0.0046	0.4091	6.1	7k58:C, 7k5b:C, 7kek:C
19	1rxm:A	245	49	0.1417	0.0694	0.3469	6.4	1rxz:A
20	6hqv:A	1555	67	0.1667	0.0129	0.2985	7.9	6hqv:B

[Back]