BioLiP

>protein
MDVRLAFPLSRAEEALPRLQALGLGAEVYLDPALLEEDALFQSLRRRFSGKLSVHLPFWNLDLLSPDPEVRGLTLRRLLF
GLDRAAELGADRAVFHSGIPHGRTPEEALERALPLAEALGLVVRRARTLGVRLLLENSHEPHPEALRPVLEAHAGELGFC
FDAAHARVFSRTPDPGPWLALAPEHLHLNDTDGVYDRHWNLGRGVLGHGAWLRPYLDRTMVLEVREDPEASLAFLQALAG
EGR

The query sequence (length=243) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3ayv:D	244	243	1.0000	0.9959	1.0000	3.51e-171	3ayt:A, 3ayt:B, 3ayt:C, 3ayt:D, 3ayv:A, 3ayv:B, 3ayv:C
2	3wqo:A	271	194	0.2140	0.1919	0.2680	1.20e-09	3wqo:B
3	6n98:A	379	134	0.1646	0.1055	0.2985	0.011
4	1qtw:A	285	155	0.1687	0.1439	0.2645	0.19	4k1g:A, 4k1g:B, 2nq9:A, 2nqh:A, 2nqj:A, 2nqj:B, 1qum:A
5	3ju2:A	275	97	0.1276	0.1127	0.3196	0.76	3qc0:A
6	4duo:A	388	186	0.1893	0.1186	0.2473	0.86	4a8i:A, 4a8l:A, 4a8n:A, 4a8r:A, 5avn:A, 5avn:B, 8aw8:A, 8aw8:B, 8aw9:A, 8aw9:B, 8awb:A, 8awc:A, 8awd:A, 8awe:A, 8awf:A, 8awf:B, 8aws:A, 8awu:A, 8awv:A, 8awx:A, 8awy:A, 7bjz:A, 7bjz:B, 7bvl:A, 7bvn:A, 7cjo:A, 7cjo:B, 7ck0:A, 1clk:A, 7cvk:A, 7cvm:A, 3cwh:A, 7dfj:A, 7dfk:A, 7dmm:A, 4dvo:A, 1dxi:A, 1dxi:B, 7e03:A, 4e3v:A, 2g4j:A, 2glk:A, 3gnx:A, 3gnx:E, 2gve:A, 1gw9:A, 2gyi:A, 2gyi:B, 4hhl:A, 4hhl:B, 4hhm:A, 4hhm:B, 4hhm:C, 4hhm:D, 4hhm:E, 4hhm:F, 4hhm:G, 4hhm:H, 6irk:A, 4j4k:A, 3kbm:A, 3kbn:A, 3kbs:A, 3kbv:A, 3kbw:A, 3kcl:A, 3kco:A, 6kca:A, 6kcc:A, 6kd2:A, 6ll2:A, 4lnc:A, 1mnz:A, 1muw:A, 3n4a:A, 6n99:A, 6n99:B, 6n99:C, 6n99:D, 7njg:A, 1o1h:A, 1o1h:B, 1oad:A, 1oad:B, 6oqz:A, 4qdp:A, 4qdw:A, 4qe1:A, 4qe4:A, 4qe5:A, 4qee:A, 4qeh:A, 6qnc:A, 6qnd:A, 6qnh:A, 6qni:A, 6qnj:A, 6qrr:A, 6qrs:A, 6qrt:A, 6qru:A, 6qrv:A, 6qrw:A, 6qrx:A, 6qry:A, 1qt1:A, 1qt1:B, 6quf:A, 6quk:A, 6quk:B, 3qza:A, 6rnd:A, 6rnf:A, 1s5m:A, 1s5n:A, 3u3h:A, 4us6:A, 4us6:B, 5vr0:A, 6vrs:A, 6vrs:B, 6vrs:C, 6vrs:D, 4w4q:A, 8wdg:A, 8wdh:A, 1xib:A, 1xic:A, 1xid:A, 1xie:A, 1xif:A, 1xig:A, 1xih:A, 1xii:A, 1xij:A, 1xis:A, 2xis:A, 3xis:A, 4xis:A, 8xia:A, 9xia:A, 1xya:A, 1xya:B, 1xyb:A, 1xyb:B, 1xyc:A, 1xyc:B, 1xyl:A, 1xyl:B, 1xym:A, 1xym:B, 5y4i:A, 5y4j:A, 6ybo:A, 6ybr:A, 8yud:A, 8yud:B, 8yud:C, 8yud:D, 8yud:E, 8yud:F, 4zb0:A, 4zb0:B, 4zb2:A, 4zb5:A, 4zbc:A, 4zbc:B, 5zyc:A, 5zyd:A, 5zye:A
7	8hsi:A	405	59	0.0905	0.0543	0.3729	1.7	8htt:B
8	4ggm:X	277	87	0.1070	0.0939	0.2989	3.0	4j6e:A
9	5ykt:A	453	94	0.1070	0.0574	0.2766	3.0	5ykt:B
10	7vb3:B	414	42	0.0535	0.0314	0.3095	3.4	7vb3:A, 7vb3:C, 7vb3:D, 7vb5:A, 7vb5:B, 7vb5:C, 7vb5:D, 7vb6:A, 7vb6:B, 7vb6:C, 7vb6:D
11	3rf6:B	352	39	0.0576	0.0398	0.3590	3.8	3kc2:A, 3rf6:A
12	1xp3:A	297	189	0.1811	0.1481	0.2328	3.9
13	3kc2:B	319	39	0.0576	0.0439	0.3590	4.0
14	8a6x:B	368	94	0.1193	0.0788	0.3085	4.6	8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
15	3c0s:A	281	72	0.1070	0.0925	0.3611	5.7	3bzj:A, 3c0q:A, 2j6v:A, 2j6v:B
16	3qxb:A	297	27	0.0453	0.0370	0.4074	6.1	3qxb:B, 3qxb:C, 3qxb:D
17	3wy9:A	416	74	0.0864	0.0505	0.2838	6.9	3wy9:B, 3wya:A
18	1did:A	393	160	0.1687	0.1043	0.2562	7.1	1did:B, 1die:A, 1die:B, 4xia:A, 4xia:B, 5xia:A, 5xia:B, 1xlb:A, 1xlb:B, 1xlc:A, 1xlc:B, 1xld:A, 1xld:B, 1xle:A, 1xle:B, 1xlf:A, 1xlf:B, 1xlg:A, 1xlg:B, 1xli:A, 1xli:B, 1xlj:A, 1xlj:B, 1xlk:A, 1xlk:B, 1xll:A, 1xll:B, 1xlm:A, 1xlm:B
19	8ffm:A	623	140	0.1235	0.0482	0.2143	8.5	8ffm:B, 8ffm:C, 8ffm:D, 7n0m:A, 7n0m:D, 7n0m:B, 7n0m:C, 8slx:A, 8slx:B, 8slx:C, 8slx:D, 8sly:A, 8sly:D, 8sly:B, 8sly:C, 7t37:A, 7t37:B, 7t37:C, 7t37:D, 6u88:A, 6u88:D, 6u88:B, 6u88:C, 6u8a:A, 6u8a:B, 6u8a:D, 6u8a:C, 6wkn:A, 6wkn:B, 6wkn:C, 6wkn:D, 7xem:A, 7xem:B, 7xem:C, 7xem:D, 7xer:A, 7xer:B, 7xer:C, 7xer:D, 7xeu:A, 7xeu:B, 7xeu:C, 7xeu:D, 7xev:A, 7xev:B, 7xev:C, 7xev:D, 7yep:A, 7yep:B, 7yep:C, 7yep:D

[Back]