MDTTVPTFSLAELQQGLHQDEFRRCLRDKGLFYLTDCGLTDTELKSAKDLVIDFFEHGSEAEKRAVTSPVPTMRRGFTGL
SMCYSMGTADNLFPSGDFERIWTQYFDRQYTASRAVAREVLRATGTEPDGGVEAFLDCEPLLRFRYFPQRMAPHYDLSMV
TLIQQTPCANGFVSLQAEVGGAFTDLPYRPDAVLVFCGAIATLVTGGQVKAPRHHVAAPGSSRTSSVFFLRPNADFTFSV
PLARECGFDVSLDGETATFQDWIGGNYVNIRRT
The query sequence (length=273) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # | Hit | Hit length |
Aligned length |
Identity (normalized by query) |
Identity (normalized by hit) |
Identity (normalized by aligned length) |
E-value | Homologs to hit |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1unb:A | 288 | 287 | 1.0000 | 0.9479 | 0.9512 | 0.0 | 1e5h:A, 1hjf:A, 2jb8:A, 1rxg:A, 1uo9:A, 1uob:A, 1w2a:X, 1w2n:A, 1w2o:A |
| 2 | 1uof:A | 267 | 274 | 0.9670 | 0.9888 | 0.9635 | 0.0 | 1e5i:A, 1hjg:A, 1rxf:A, 1uog:A |
| 3 | 6kwa:A | 267 | 248 | 0.1722 | 0.1760 | 0.1895 | 5.65e-04 | 6kwa:B, 6kwb:A, 6kwb:B |
| 4 | 8bbb:A | 331 | 78 | 0.0806 | 0.0665 | 0.2821 | 0.002 | 8a4g:A, 8ali:A, 8alj:A, 4bb3:A, 8bb9:A, 8bba:A, 8bbc:A, 8bbd:A, 2bjs:A, 1bk0:A, 1blz:A, 8bsv:A, 8bsw:A, 8bsx:A, 8bsy:A, 2bu9:A, 1hb1:A, 1hb2:A, 1hb3:A, 1hb4:A, 1ips:A, 1ips:B, 2ivi:B, 2ivj:A, 2jb4:A, 1obn:A, 1oc1:A, 1odm:A, 1odn:A, 7p3l:A, 8p46:A, 8p47:A, 8p48:A, 8p7o:A, 8p7p:A, 7poy:A, 7psw:A, 8ptv:A, 8py5:A, 8py6:A, 8py7:A, 8py8:A, 8py9:A, 8pya:A, 1qiq:A, 1qje:A, 1qjf:A, 1uzw:A, 2vau:A, 2vbb:A, 2vbd:A, 2vbp:A, 2vcm:A, 2ve1:A, 1w03:A, 1w04:A, 1w05:A, 1w06:A, 1w3v:A, 1w3x:A, 2wo7:A, 6y0o:A, 6y0p:A, 2y60:A, 2y6f:A, 6zae:A, 6zaf:A, 6zag:A, 6zah:A, 6zai:A, 6zaj:A, 6zak:A, 6zal:A, 6zam:A, 6zan:A, 6zao:A, 6zap:A, 6zaq:A, 3zku:A, 3zky:A, 3zoi:A, 7zoe:A, 6zw8:A |
| 5 | 8y4u:A | 298 | 251 | 0.1685 | 0.1544 | 0.1833 | 0.002 | |
| 6 | 6xjj:A | 291 | 169 | 0.1429 | 0.1340 | 0.2308 | 0.003 | |
| 7 | 5o9w:A | 356 | 118 | 0.0989 | 0.0758 | 0.2288 | 0.040 | |
| 8 | 5tcv:A | 299 | 83 | 0.0842 | 0.0769 | 0.2771 | 0.69 | 1wa6:X |
| 9 | 6d0j:C | 90 | 36 | 0.0513 | 0.1556 | 0.3889 | 0.76 | 6d0k:C, 6d0n:C |
| 10 | 6ku3:B | 318 | 81 | 0.0842 | 0.0723 | 0.2840 | 1.0 | 6ku3:A, 6ku3:D, 6ku3:C |
| 11 | 6ux8:B | 86 | 36 | 0.0513 | 0.1628 | 0.3889 | 1.1 | |
| 12 | 5gja:A | 299 | 87 | 0.0806 | 0.0736 | 0.2529 | 1.5 | 5gj9:A, 5gj9:B, 5gja:B, 5gja:C, 5gja:D, 5gja:E, 5gja:F, 5gja:G, 5gja:H |
| 13 | 4qnw:A | 369 | 217 | 0.1758 | 0.1301 | 0.2212 | 1.6 | |
| 14 | 5a43:C | 96 | 36 | 0.0476 | 0.1354 | 0.3611 | 1.6 | |
| 15 | 5v7p:D | 95 | 36 | 0.0476 | 0.1368 | 0.3611 | 2.0 | |
| 16 | 8vxu:E | 90 | 36 | 0.0476 | 0.1444 | 0.3611 | 2.1 | 7szt:F, 8tgy:C, 8tgy:D, 6wk9:C, 6wk9:G |
| 17 | 4pev:A | 370 | 53 | 0.0659 | 0.0486 | 0.3396 | 2.3 | 4pev:B, 4pev:C |
| 18 | 4lxo:A | 184 | 140 | 0.1319 | 0.1957 | 0.2571 | 2.6 | 4lxo:B |
| 19 | 5v2z:A | 349 | 44 | 0.0549 | 0.0430 | 0.3409 | 2.8 | 6cba:A, 6cf3:A, 5lsq:A, 5lun:A, 5lun:B, 5lun:C, 5lun:D, 5mof:A, 8uc2:A, 5v2t:A, 5v2x:A, 5v2x:B, 5v2y:A, 5v31:A, 5v32:A, 5v34:A, 5vka:A, 5vkb:A, 6vp4:A, 6vp4:B, 6vp4:C, 6vp4:D, 6vp5:A, 6vp5:B, 6vp5:C, 6vp5:D |
| 20 | 3csb:A | 464 | 36 | 0.0476 | 0.0280 | 0.3611 | 3.7 | |
| 21 | 6uvn:B | 498 | 71 | 0.0769 | 0.0422 | 0.2958 | 3.9 | 8fuk:G |
| 22 | 8f0m:B | 91 | 36 | 0.0476 | 0.1429 | 0.3611 | 4.5 | |
| 23 | 2ahv:A | 512 | 79 | 0.0733 | 0.0391 | 0.2532 | 4.9 | 2ahv:B, 2ahv:C, 2ahv:D, 2ahw:A, 2ahw:B, 2ahw:C |
| 24 | 3ch8:A | 190 | 36 | 0.0476 | 0.0684 | 0.3611 | 4.9 | 2qbw:A |
| 25 | 7agj:A | 731 | 53 | 0.0659 | 0.0246 | 0.3396 | 7.3 | 7agj:B |
| 26 | 7p7w:BBB | 306 | 36 | 0.0366 | 0.0327 | 0.2778 | 7.8 | 7p7i:AAA, 7p7i:BBB, 7p7w:AAA, 7p9l:AAA, 7p9l:BBB, 7p9p:AAA, 7p9p:BBB, 7p9y:AAA, 7p9y:BBB, 7pa1:AAA, 7pa1:BBB |
| 27 | 6sga:F8 | 513 | 80 | 0.1062 | 0.0565 | 0.3625 | 7.8 | 6sgb:F8 |
| 28 | 8t7j:A | 365 | 84 | 0.0879 | 0.0658 | 0.2857 | 9.2 | 8t7j:B, 8t7j:C, 8t7j:D |
umich.edu