BioLiP

>protein
MDTFVLDTSVFTNPDVYHQFEEDQLGAIENFISLASHTNANFFMPTSVYYEFTKMVSLGDLAPKFELVVRIRSPRKWGLM
VPAEFLYEFIEEVRYRINKGLRIAEEHTKEAGKLAEEEVGRVVNRLREKYREALRAGIIDSKEDVDVLLLSYELDAILVS
GDEGLRKWADRVGIKLIDPKNLRYIMENL

The query sequence (length=189) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8kda:E	189	189	1.0000	1.0000	1.0000	1.01e-138	8kda:G, 8kda:H, 8kda:F, 8kda:C, 8kda:D, 8kda:I, 8kda:J, 8kda:K, 8kda:A
2	8kd9:C	189	188	0.6825	0.6825	0.6862	4.94e-93	8kd9:E, 8kd9:G, 8kd9:H, 8kd9:D, 8kd9:F, 8kd9:J, 8kd9:I, 8kd9:A
3	7e8o:A	194	187	0.4444	0.4330	0.4492	1.05e-51	7e8o:B, 7e8o:C, 7e8o:D
4	2zzr:A	397	86	0.1534	0.0730	0.3372	0.13
5	8c01:o	314	42	0.0952	0.0573	0.4286	0.76
6	8h1r:D	789	84	0.1217	0.0292	0.2738	4.2	8h1r:A, 5iva:A
7	3g58:D	345	60	0.0899	0.0493	0.2833	4.6	7a8q:A, 7a8q:B, 7a8q:C, 7a8q:D, 7a9v:A, 7a9v:B, 7a9v:C, 7a9v:D, 7aag:A, 7aag:B, 7aag:C, 7aag:D, 7ab9:A, 7ab9:B, 7ab9:C, 7ab9:D, 7abd:A, 7abd:B, 7abd:C, 7abd:D, 7abe:A, 7abe:B, 7abe:C, 7abe:D, 7abj:A, 7abj:B, 7abj:C, 7abj:D, 6akr:A, 6akr:B, 6akr:C, 6akr:D, 7ay6:A, 7ay6:B, 7b9h:A, 7b9h:B, 6boj:A, 6boj:B, 6boj:C, 6boj:D, 7cbj:A, 7cbj:B, 7cbq:A, 7cbq:B, 7f2k:A, 7f2k:B, 7f2l:A, 7f2l:B, 7f2m:A, 7f2m:B, 6f6u:A, 6f6u:B, 6f8r:A, 6f8r:B, 6f8t:A, 6f8t:B, 6f8u:A, 6f8u:B, 6f8v:A, 6f8v:B, 6f8w:A, 6f8w:B, 6f8x:A, 6f8x:B, 6fdc:A, 6fdc:B, 6fdi:A, 6fdi:B, 6fdi:C, 6fdi:D, 6fe7:A, 6fe7:B, 6fe7:C, 6fe7:D, 6feb:A, 6feb:B, 6fet:A, 6fet:B, 6fet:C, 6fet:D, 2fm0:A, 2fm0:B, 2fm0:C, 2fm0:D, 2fm5:A, 2fm5:B, 2fm5:C, 2fm5:D, 6ft0:A, 6ft0:B, 6ft0:C, 6ft0:D, 6fta:A, 6fta:B, 6fta:C, 6fta:D, 6ftw:A, 6ftw:B, 6ftw:C, 6ftw:D, 6fw3:A, 6fw3:B, 6fw3:C, 6fw3:D, 3g4g:A, 3g4g:B, 3g4g:C, 3g4g:D, 3g4i:A, 3g4i:B, 3g4i:C, 3g4i:D, 3g4k:A, 3g4k:B, 3g4k:C, 3g4k:D, 3g4l:A, 3g4l:B, 3g4l:C, 3g4l:D, 3g58:A, 3g58:B, 3g58:C, 6hwo:A, 6hwo:B, 6hwo:C, 6hwo:D, 3iad:A, 3iad:B, 3iad:C, 3iad:D, 3iak:A, 6iag:A, 6iag:B, 6iag:C, 6iag:D, 6ibf:A, 6ibf:B, 6ibf:C, 6ibf:D, 6im6:A, 6im6:B, 6imb:A, 6imb:B, 6imd:A, 6imd:B, 6imi:A, 6imi:B, 6imo:A, 6imo:B, 6imr:A, 6imr:B, 6imt:A, 6imt:B, 6ind:A, 6ind:B, 6ink:A, 6ink:B, 6inm:A, 6inm:B, 5k1i:A, 5k1i:B, 5k1i:C, 5k1i:D, 5k1i:E, 5k1i:F, 5k1i:G, 5k1i:H, 5k32:A, 5k32:B, 3k4s:A, 8k4c:A, 8k4c:B, 8k4h:A, 8k4h:B, 6kjz:A, 6kjz:B, 6kk0:A, 6kk0:B, 5lbo:A, 5lbo:B, 5lbo:C, 5lbo:D, 6lrm:A, 6lrm:B, 1mkd:A, 1mkd:B, 1mkd:C, 1mkd:D, 1mkd:E, 1mkd:F, 1mkd:G, 1mkd:H, 1mkd:I, 1mkd:J, 1mkd:K, 1mkd:L, 6njh:A, 6njh:B, 6njh:C, 6njh:D, 6nji:A, 6nji:B, 6njj:A, 6njj:B, 6njj:C, 6njj:D, 4ogb:A, 4ogb:B, 4ogb:C, 4ogb:D, 1oyn:A, 1oyn:B, 1oyn:C, 1oyn:D, 1ptw:A, 1ptw:B, 1ptw:C, 1ptw:D, 2pw3:A, 2pw3:B, 1q9m:A, 1q9m:B, 1q9m:C, 1q9m:D, 2qyn:A, 2qyn:B, 6rcw:A, 6rcw:B, 6rcw:C, 6rcw:D, 3sl3:A, 3sl3:B, 3sl3:C, 3sl3:D, 3sl4:A, 3sl4:B, 3sl4:C, 3sl4:D, 3sl5:A, 3sl5:B, 3sl5:C, 3sl5:D, 3sl6:A, 3sl6:B, 3sl6:C, 3sl6:D, 3sl8:A, 3sl8:B, 3sl8:C, 3sl8:D, 1tb7:A, 1tb7:B, 1tbb:A, 1tbb:B, 5tkb:A, 5tkb:B, 5tkb:C, 5tkb:D, 3v9b:A, 3v9b:B, 3v9b:C, 3v9b:D, 4w1o:A, 4w1o:B, 4w1o:C, 4w1o:D, 7w4x:A, 7w4x:B, 7w4y:A, 7w4y:B, 8w4q:A, 8w4q:B, 8w4r:A, 8w4r:B, 4wcu:A, 4wcu:B, 4wcu:C, 4wcu:D, 8wdn:A, 8wdn:B, 8wdo:A, 8wdo:B, 5wh5:A, 5wh5:B, 5wh6:A, 5wh6:B, 5wqa:A, 5wqa:B, 7xaa:A, 7xaa:B, 7xab:A, 7xab:B, 7xbb:A, 7xbb:B, 1xom:A, 1xom:B, 1xon:A, 1xon:B, 1xoq:A, 1xoq:B, 1xor:A, 1xor:B, 1y2b:A, 1y2b:B, 1y2c:A, 1y2c:B, 1y2d:A, 1y2d:B, 1y2e:A, 1y2e:B, 1y2k:A, 1y2k:B, 8ylc:A, 8ylc:B, 7yqf:A, 7yqf:B, 7ysx:A, 7ysx:B, 6zba:AAA, 6zba:BBB, 6zba:CCC, 6zba:DDD, 1zkn:A, 1zkn:B, 1zkn:C, 1zkn:D
8	2lmt:A	148	89	0.1376	0.1757	0.2921	6.8	2lmu:A, 2lmv:A
9	2lcq:A	161	35	0.0688	0.0807	0.3714	9.4

[Back]