BioLiP

>protein
MDPPTFTFNFNNEPWVRGRHETYLCYEVERMHNDTWVLLNQRRGFLCNQAPHKHGFLEGRHAELCFLDVIPFWKLDLDQD
YRVTCFTSWSPCFSCAQEMAKFISKNKHVSLCIFTARIYDDQGRCQEGLRTLAEAGAKISIMTYSEFKHCWDTFVDHQGC
PFQPWDGLDEHSQDLSGRLRAILQNQEN

The query sequence (length=188) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8cx1:A	381	185	0.9840	0.4856	1.0000	2.85e-140	8cx0:A, 8cx1:F, 8cx2:A, 8cx2:F, 3e1u:A, 3iqs:A, 3ir2:A, 3ir2:B, 2jyw:A, 6k3j:A, 6k3k:A, 2kbo:A, 2kem:A, 4rov:A, 4rov:B, 4row:A, 3v4j:A, 3v4j:B, 3v4k:A, 3v4k:B
2	8cx1:A	381	189	0.3564	0.1759	0.3545	2.63e-25	8cx0:A, 8cx1:F, 8cx2:A, 8cx2:F, 3e1u:A, 3iqs:A, 3ir2:A, 3ir2:B, 2jyw:A, 6k3j:A, 6k3k:A, 2kbo:A, 2kem:A, 4rov:A, 4rov:B, 4row:A, 3v4j:A, 3v4j:B, 3v4k:A, 3v4k:B
3	6bwy:B	346	185	0.9255	0.5029	0.9405	1.22e-129	6bwy:A, 6bwy:G, 6bwy:E, 1qzg:A, 1qzg:B, 1qzh:A, 1qzh:B, 1qzh:F, 1qzh:C, 1qzh:D, 1qzh:E
4	6wmc:A	362	186	0.9096	0.4724	0.9194	3.97e-126	6bux:A, 8h0i:A, 8h0i:B, 2mzz:A, 7uxd:A, 6wma:A, 6wmb:A
5	6wmc:A	362	186	0.4787	0.2486	0.4839	2.07e-51	6bux:A, 8h0i:A, 8h0i:B, 2mzz:A, 7uxd:A, 6wma:A, 6wmb:A
6	7uu5:A	379	188	0.8138	0.4037	0.8138	1.43e-110	8e40:A, 8edj:A, 5k81:A, 5k81:B, 5k81:C, 5k81:D, 5k81:E, 5k81:F, 5k82:A, 5k82:B, 5k82:C, 5k82:D, 5k83:C, 5k83:E, 5k83:A, 5k83:D, 5k83:F, 5k83:B, 6p3x:A, 6p3x:B, 6p3y:A, 6p3y:B, 6p3z:A, 6p3z:B, 6p40:A, 6p40:B, 7uu3:A, 7uu3:B, 7uu4:A, 7uu5:B
7	7uu5:A	379	189	0.3989	0.1979	0.3968	6.93e-35	8e40:A, 8edj:A, 5k81:A, 5k81:B, 5k81:C, 5k81:D, 5k81:E, 5k81:F, 5k82:A, 5k82:B, 5k82:C, 5k82:D, 5k83:C, 5k83:E, 5k83:A, 5k83:D, 5k83:F, 5k83:B, 6p3x:A, 6p3x:B, 6p3y:A, 6p3y:B, 6p3z:A, 6p3z:B, 6p40:A, 6p40:B, 7uu3:A, 7uu3:B, 7uu4:A, 7uu5:B
8	2nbq:A	197	190	0.6489	0.6193	0.6421	1.71e-83	5cqd:A, 5cqd:C, 5cqh:A, 5cqi:A, 5cqk:A, 6nfl:A, 7rw6:B, 7rw6:D, 5sxg:A, 5sxg:B, 5sxh:A, 5sxh:B
9	7d3v:B	199	190	0.6489	0.6131	0.6421	2.59e-80	7d3v:A, 7d3w:A, 7d3x:A, 8fii:B, 8fii:A, 8fij:A, 8fij:B, 8fik:A, 8fik:B, 8fil:A, 8fil:B, 8fim:B, 8fim:A, 5keg:A, 2m65:A, 5sww:A, 5sww:B, 5sww:C, 5sww:D, 5td5:A, 4xxo:A, 4xxo:B
10	8j62:A	180	186	0.5106	0.5333	0.5161	6.81e-64	8j62:B
11	5zva:B	185	186	0.4734	0.4811	0.4785	4.27e-51	4j4j:A, 4j4j:B, 5w2m:A, 5w2m:B, 5w2m:C, 5w2m:D, 5w2m:M, 5w2m:J, 5w2m:K, 5w2m:L, 3wus:A, 3wus:B, 5zva:A, 5zvb:A, 5zvb:B
12	5w0r:A	548	186	0.4787	0.1642	0.4839	1.07e-48	5jj4:C, 5jj4:A, 5jj4:B, 5w0r:B, 5w0u:B, 5w0u:A, 5w0z:B, 5w0z:A, 5w1c:B, 5w1c:A
13	4iou:B	179	185	0.4149	0.4358	0.4216	5.66e-43	5hx5:A, 5hx5:B, 4iou:A, 4iou:C, 4iou:D
14	3vm8:A	187	185	0.4043	0.4064	0.4108	2.08e-38	3vm8:B, 3vow:A, 3vow:B
15	5tkm:A	184	185	0.3777	0.3859	0.3838	6.52e-35	5tkm:B
16	5w45:A	181	186	0.3351	0.3481	0.3387	1.60e-28	6b0b:A, 6b0b:E, 6bbo:A, 6bbo:E, 8fvi:A, 5w45:B
17	5w3v:A	186	186	0.3511	0.3548	0.3548	3.96e-27	5w3v:B, 5w3v:C, 5w3v:D
18	5z98:B	182	146	0.2872	0.2967	0.3699	4.98e-25	5z98:A
19	2rpz:A	192	188	0.3298	0.3229	0.3298	1.28e-24
20	2nyt:B	190	183	0.3085	0.3053	0.3169	9.21e-21	2nyt:A, 2nyt:C, 2nyt:D
21	6x91:A	592	78	0.1809	0.0574	0.4359	4.87e-16	6x91:B, 6x91:C, 6x91:E, 6x91:F, 6x91:G
22	6x91:H	558	78	0.1809	0.0609	0.4359	5.34e-15	6x91:D
23	3s9c:A	234	77	0.1011	0.0812	0.2468	1.7	3sbk:A
24	4ohf:B	458	63	0.1064	0.0437	0.3175	2.3	4ohf:A, 4ohf:C, 4ohf:D
25	7vtn:A	692	34	0.0691	0.0188	0.3824	3.0
26	8anv:B	67	20	0.0532	0.1493	0.5000	6.4	8anv:A
27	2z4t:A	493	78	0.0957	0.0365	0.2308	8.7

[Back]