Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MDPIPICSFCLGTKESNREKKPEELLSCADCGSSGHPSCLKFCPELTTNVKALRWQCIECKTCSACRVQGRNADNMLFCD
SCDRGFHMECCDPPLSRMPKGMWICQVCRPK

The query sequence (length=111) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6oie:B 111 111 1.0000 1.0000 1.0000 7.35e-79 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
2 4lk9:A 126 110 0.8739 0.7698 0.8818 6.39e-71 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
3 5szb:A 115 107 0.5045 0.4870 0.5234 4.75e-36 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
4 5b79:A 118 104 0.5045 0.4746 0.5385 1.91e-35 5vdc:A
5 9atn:A 98 86 0.3243 0.3673 0.4186 1.48e-16
6 2ysm:A 111 91 0.3153 0.3153 0.3846 8.47e-14
7 2puy:B 60 47 0.2162 0.4000 0.5106 4.37e-11 2puy:A
8 2yql:A 56 49 0.2162 0.4286 0.4898 6.15e-11
9 2e6r:A 92 53 0.1982 0.2391 0.4151 9.13e-09
10 4q6f:A 56 50 0.1982 0.3929 0.4400 1.98e-08 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
11 1f62:A 51 48 0.1712 0.3725 0.3958 3.24e-08
12 6ryr:W 708 43 0.1532 0.0240 0.3953 7.40e-08 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
13 6ryr:W 708 45 0.1622 0.0254 0.4000 1.7 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
14 5vab:A 54 51 0.1802 0.3704 0.3922 1.03e-07
15 5hh7:A 192 53 0.2072 0.1198 0.4340 1.42e-07
16 2miq:A 94 40 0.1622 0.1915 0.4500 3.42e-07
17 7klo:A 59 51 0.1892 0.3559 0.4118 3.90e-07 7klr:A
18 6fhq:A 58 49 0.1802 0.3448 0.4082 1.09e-06 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
19 2ke1:A 66 38 0.1441 0.2424 0.4211 1.32e-06 2kft:A, 1xwh:A
20 2mny:A 55 40 0.1622 0.3273 0.4500 1.70e-06 2mnz:A
21 2l5u:A 61 39 0.1261 0.2295 0.3590 1.01e-05
22 7yi0:F 120 51 0.1982 0.1833 0.4314 1.30e-05
23 4gy5:A 215 52 0.2072 0.1070 0.4423 1.54e-05 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
24 8bpa:C 213 65 0.2072 0.1080 0.3538 1.75e-05 8c60:C
25 8bpa:C 213 102 0.3063 0.1596 0.3333 1.88e-05 8c60:C
26 8w9c:F 156 51 0.1982 0.1410 0.4314 2.13e-05 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
27 8bpb:C 126 48 0.1802 0.1587 0.4167 2.57e-05 8bpc:C
28 8hxx:N 375 68 0.2252 0.0667 0.3676 2.98e-05 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
29 7yi2:D 321 51 0.1982 0.0685 0.4314 3.84e-05 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
30 8ihn:M 357 51 0.1982 0.0616 0.4314 3.99e-05 8kd4:E
31 8kd6:E 301 51 0.1982 0.0731 0.4314 4.37e-05 8kd2:E
32 6ieu:A 170 38 0.1441 0.0941 0.4211 6.42e-05 6iet:A
33 2e6s:A 77 54 0.1982 0.2857 0.4074 6.50e-05
34 7xga:A 126 52 0.1892 0.1667 0.4038 9.21e-05 6vfo:A
35 7xga:A 126 49 0.1712 0.1508 0.3878 0.37 6vfo:A
36 3o36:A 184 39 0.1441 0.0870 0.4103 1.07e-04 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
37 2l43:A 80 40 0.1351 0.1875 0.3750 2.25e-04 2ku3:A
38 3u5m:E 173 39 0.1441 0.0925 0.4103 3.32e-04
39 6guu:B 204 38 0.1261 0.0686 0.3684 3.72e-04 6guu:A
40 3u5o:C 195 39 0.1441 0.0821 0.4103 4.21e-04 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
41 7ebk:A 183 38 0.1351 0.0820 0.3947 4.55e-04 7ebj:A
42 6q3m:C 219 38 0.1261 0.0639 0.3684 4.62e-04 6q3m:A, 6q3m:B
43 4tvr:A 222 53 0.1892 0.0946 0.3962 0.002
44 1mm3:A 61 38 0.1171 0.2131 0.3421 0.003
45 8i02:G 284 47 0.1622 0.0634 0.3830 0.010 8ifg:P
46 8i02:G 284 45 0.1261 0.0493 0.3111 0.13 8ifg:P
47 6u04:A 168 37 0.1261 0.0833 0.3784 0.015 5erc:A
48 8ge0:A 188 39 0.1171 0.0691 0.3333 0.015 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
49 8i02:F 235 51 0.1712 0.0809 0.3725 0.018
50 1fp0:A 88 48 0.1351 0.1705 0.3125 0.060
51 7duf:A 62 40 0.1441 0.2581 0.4000 0.14 7duf:B
52 2ro1:A 189 48 0.1351 0.0794 0.3125 0.16
53 6g8r:B 164 43 0.1532 0.1037 0.3953 0.34 2md7:B, 2md8:C
54 2yt5:A 66 51 0.1351 0.2273 0.2941 0.58
55 7d87:A 202 110 0.2252 0.1238 0.2273 0.60 7d86:A, 7d8a:A
56 4ptb:A 178 50 0.1892 0.1180 0.4200 0.98 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
57 2xb1:C 97 53 0.1351 0.1546 0.2830 1.3 4up0:A, 4up5:A, 2xb1:A
58 5xfr:A 309 35 0.1081 0.0388 0.3429 2.5 5xfr:B
59 8jwu:C 412 72 0.1892 0.0510 0.2917 3.2 8jwj:A, 8jwj:C, 8jws:A, 8jws:B, 8jws:C, 8jwu:A, 8jwu:B
60 1weq:A 85 61 0.1892 0.2471 0.3443 3.3
61 7c4c:A 332 42 0.1622 0.0542 0.4286 3.5 7c42:A, 7c43:A, 7c45:A, 7c47:A, 7c4b:A
62 1iym:A 55 34 0.0991 0.2000 0.3235 3.6
63 3cxl:A 402 19 0.0811 0.0224 0.4737 6.4
64 5ygf:A 215 35 0.1261 0.0651 0.4000 6.5 5ygd:A
65 6mlc:C 85 62 0.1802 0.2353 0.3226 7.7 6mlc:A, 6mlc:B, 6mlc:D
66 1gu6:A 441 22 0.0991 0.0249 0.5000 8.4 1gu6:G, 1gu6:C, 1gu6:E, 3l1t:A, 3l1t:B, 3l1t:C, 3l1t:D, 2rdz:A, 2rdz:B, 2rdz:C, 2rdz:D, 2rf7:A, 2rf7:B, 2rf7:C, 2rf7:D, 3tor:A, 3tor:D, 3tor:B, 3tor:C, 4wjy:A, 4wjy:B
67 1wes:A 71 24 0.0991 0.1549 0.4583 8.6 2g6q:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218