BioLiP

>protein
MDPETVRIALGLEERTAAWLTELDELGPPAEPVRLPRGEEARDLLRRLEVPELDAEEIVAAAPDPDRDPALWWLLERTHH
AIVRHMGDHRAKPRGGPPLPYEGGAAARYFHVYVFLATVPAVRRFHAERGIPDEVGWETLTQLGELVAIHRRKYGQGGMN
MQWWTTYHLRGILYRLGRLQFSLATGKDGTPHLGLAVPEWGGPLLPKAYDESLHRARPFFDRHFPEHGARVAWGSSWMLD
PQLEEYLTEDSNIIQLARFWTLTDSAPEPGNADGDSSILEFVFRYNGQPLDELPQRSSLERAVIAHLKAGRHWHMRTGFV
KLP

The query sequence (length=323) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6iix:A	323	323	0.9969	0.9969	0.9969	0.0	4mfk:A, 4mfl:A, 4mfp:A, 4mfq:A, 4q36:A, 4q38:A
2	4mfz:A	319	323	0.7090	0.7179	0.7090	3.40e-165
3	6j18:A	272	71	0.0712	0.0846	0.3239	0.72
4	8hz5:A	350	83	0.0836	0.0771	0.3253	0.74
5	5hzi:A	476	70	0.0588	0.0399	0.2714	2.7	5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
6	2wkp:A	320	70	0.0588	0.0594	0.2714	2.9	6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
7	5hzh:A	320	70	0.0588	0.0594	0.2714	3.0
8	6n6a:A	181	84	0.0774	0.1381	0.2976	3.2	6n6c:A, 6n6d:A, 6n6e:A, 6n6f:A, 6n6g:A, 6n6h:A
9	3q08:A	241	70	0.0619	0.0830	0.2857	3.9	3q08:B, 3q08:C, 3q08:D, 3q08:E, 3q08:F, 3q08:G, 3q08:H, 3q08:I, 3q08:J, 3q08:K, 3q08:L, 3q08:M, 3q08:N, 3q08:O, 3q08:P, 3q08:Q, 3q08:R, 3q08:S, 3q08:T, 3q09:A, 3q09:B, 3q09:C, 3q09:D, 3q09:E, 3q09:F, 3q09:G, 3q09:H, 3q09:I, 3q09:J, 3q09:K, 3q09:L, 3q09:M, 3q09:N, 3q09:O, 3q09:P, 3q09:Q, 3q09:R, 3q09:S, 3q09:T, 2vxh:A, 2vxh:B, 2vxh:C, 2vxh:D, 2vxh:E, 2vxh:F
10	6xkw:p	254	61	0.0557	0.0709	0.2951	4.1	6xkx:p, 6xkz:p
11	7zkq:T	351	102	0.0774	0.0712	0.2451	5.0
12	7acs:A	140	31	0.0402	0.0929	0.4194	5.3	7act:A, 8iv3:D, 8j6x:A, 8j6x:D, 6vyo:A, 6vyo:B, 6vyo:C, 6vyo:D, 6wkp:B, 6wkp:C, 6wkp:D, 7xwz:A, 7xwz:B, 7xx1:A, 7xx1:B, 7xx1:C, 7xx1:D
13	8pv4:CW	550	78	0.0805	0.0473	0.3333	7.0	8pv6:CW, 8pv8:CW
14	5g31:A	105	60	0.0557	0.1714	0.3000	7.7

[Back]