BioLiP

>protein
MDKIKQLFANNYSWAQRMKEELADHQTPHYLWIACSDSRVPAEKLTNLEPGELFVHRNVANQVIHTDFNCLSVVQYAVDV
LKIEHIIICGHTNCGGIHAAMADKDLGLINNWLLHIRDIWFKHGHLLGKLSPEKRADMLTKINVAEQVYNLGRTSIVKSA
WERGQKLSLHGWVYDVNDGFLVDQGVMATSRETLEISYRNAIARLSILDEEN

The query sequence (length=212) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2a8c:A	221	219	0.9953	0.9548	0.9635	2.30e-157	2a8c:B, 2a8c:C, 2a8c:D, 2a8c:E, 2a8c:F, 2a8d:A, 2a8d:B, 2a8d:C, 2a8d:D, 2a8d:E, 2a8d:F, 3e1v:A, 3e1v:B, 3e1w:A, 3e1w:B, 3e24:A, 3e24:B, 3e28:A, 3e28:B, 3e28:C, 3e28:D, 3e28:E, 3e28:F, 3e2a:A, 3e2a:B, 3e2a:C, 3e2a:D, 3e2a:E, 3e2a:F, 3e2w:A, 3e2w:B, 3e2w:C, 3e2w:D, 3e2w:E, 3e2w:F, 3e2x:A, 3e2x:B, 3e31:A, 3e31:B, 3e3f:A, 3e3f:B, 3e3g:A, 3e3g:B, 3e3g:C, 3e3g:D, 3e3g:E, 3e3g:F, 3e3i:A, 3e3i:B, 3e3i:C, 3e3i:D, 3e3i:E, 3e3i:F, 3e3i:G, 3e3i:H, 3e3i:I, 3e3i:J, 3e3i:K, 3e3i:L, 3mf3:A, 3mf3:B, 3mf3:C, 3mf3:D, 3mf3:E, 3mf3:F, 4waj:A, 4waj:B, 4wak:A, 4wak:B, 4wam:A, 4wam:B
2	3qy1:B	216	211	0.6274	0.6157	0.6303	1.24e-96	2esf:A, 2esf:B, 1i6o:A, 1i6o:B, 1i6p:A, 3qy1:A, 7sev:A, 1t75:A, 1t75:B, 1t75:D, 1t75:E, 4znz:A
3	5cxk:A	222	212	0.5708	0.5450	0.5708	3.89e-86	5cxk:B, 5cxk:H, 5cxk:G, 5cxk:D, 5cxk:C, 5cxk:F, 5cxk:E
4	5bq1:A	209	204	0.4717	0.4785	0.4902	8.48e-69	6d2j:A, 6d2m:A, 6d2n:A, 6d2o:A, 5jj8:A, 5jj8:B, 4rxy:A
5	6yjn:A	212	212	0.4717	0.4717	0.4717	6.80e-68	6yl7:A
6	1ddz:A	481	207	0.4717	0.2079	0.4831	5.45e-62	1ddz:B
7	1ddz:A	481	197	0.4434	0.1954	0.4772	5.90e-59	1ddz:B
8	4o1k:A	211	189	0.4057	0.4076	0.4550	4.60e-57
9	7cxy:A	214	187	0.3962	0.3925	0.4492	3.02e-53	7cxy:B
10	3ucj:A	222	187	0.3538	0.3378	0.4011	1.69e-45	3ucj:B, 3uck:A, 3uck:B, 3ucm:A, 3ucm:B, 3ucn:A, 3ucn:B, 3uco:A, 3uco:B
11	7coj:A	211	188	0.3538	0.3555	0.3989	5.95e-44	7coi:A, 7coi:B, 7coi:C, 7coi:D, 7coj:B, 7coj:C, 7coj:D
12	4o1j:A	197	188	0.3160	0.3401	0.3564	2.45e-36	4o1j:B
13	6gwu:A	208	159	0.3113	0.3173	0.4151	2.43e-33	6gwu:B, 6gwu:C, 6gwu:D
14	2w3n:A	230	200	0.3019	0.2783	0.3200	5.76e-28	2w3n:B, 2w3n:C, 2w3q:A
15	3eyx:A	197	186	0.2642	0.2843	0.3011	6.40e-23	3eyx:B
16	5swc:A	223	195	0.3019	0.2870	0.3282	2.84e-21	5swc:B, 5swc:C, 5swc:D, 5swc:E, 5swc:F
17	6lai:A	172	145	0.2311	0.2849	0.3379	1.15e-20	6jqe:A, 6jqe:B, 6lac:A, 6lac:B, 6lai:B
18	1ekj:G	220	86	0.1698	0.1636	0.4186	2.04e-15	1ekj:A, 1ekj:B, 1ekj:C, 1ekj:D, 1ekj:E, 1ekj:F, 1ekj:H
19	2a5v:A	210	166	0.2547	0.2571	0.3253	2.24e-15	2a5v:B, 2a5v:C, 2a5v:D, 1ym3:A
20	4yf4:A	163	174	0.2123	0.2761	0.2586	7.11e-07	4yf4:B, 4yf4:C, 4yf4:D, 4yf5:A, 4yf5:C, 4yf6:A, 4yf6:C, 1ylk:A, 1ylk:B, 1ylk:C, 1ylk:D
21	1g5c:A	169	186	0.2311	0.2899	0.2634	1.71e-04	1g5c:B, 1g5c:C, 1g5c:D, 1g5c:E, 1g5c:F
22	3vqj:A	213	63	0.0943	0.0939	0.3175	0.003	3vrk:A
23	3ten:A	201	66	0.0896	0.0945	0.2879	0.029	3ten:B, 3ten:C, 3ten:D, 3ten:E, 3ten:F, 3ten:G, 3ten:H
24	6y04:A	182	106	0.1274	0.1484	0.2547	0.18	6y04:B
25	7z15:K	224	77	0.0802	0.0759	0.2208	0.75	7z15:L
26	6rmg:A	1026	74	0.0849	0.0175	0.2432	1.0	6dmb:A, 6dmy:A, 7k65:A, 6mg8:A, 6n7g:A, 6n7g:B, 6n7g:D, 6n7g:E, 6n7h:A, 6n7h:B, 6n7k:A, 6n7k:B, 6n7k:D, 6n7k:E, 6rtw:A, 6rvd:A, 6rvd:B, 7v6y:A, 7v6z:A
27	6rxt:UQ	789	13	0.0425	0.0114	0.6923	2.2	6rxu:UQ, 6rxv:UQ, 6rxx:UQ, 6rxy:UQ, 6rxz:UQ
28	5oql:M	284	13	0.0425	0.0317	0.6923	2.3
29	6jqc:A	164	74	0.0849	0.1098	0.2432	2.4	6jqc:B, 6jqd:A, 6jqd:B
30	7qwt:A	352	86	0.0943	0.0568	0.2326	4.0	7qwt:B, 7qwt:C, 7qwt:D, 7qwt:E, 7qwt:F, 7qwt:G, 7qwt:H, 7qwt:I
31	3gcf:A	367	14	0.0472	0.0272	0.7143	5.0	3gcf:B, 3gcf:C, 3gcf:D, 3gcf:E, 3gcf:F, 3gcf:G, 3gcf:H, 3gcf:I, 3gcf:J, 3gcf:K, 3gcf:L, 3gcf:M, 3gcf:N, 3gcf:O
32	3las:A	166	64	0.0755	0.0964	0.2500	6.3	3las:B
33	7kgb:m	116	67	0.0991	0.1810	0.3134	7.0	7msc:m, 7msh:m, 7msm:m, 7msz:m, 7mt2:m, 7mt3:m, 7mt7:m, 7sfr:m, 5v93:m

[Back]